Vagococcus fluvialis: K5K99_06280
Help
Entry
K5K99_06280 CDS
T07851
Name
(GenBank) PRD domain-containing protein
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
vfv
Vagococcus fluvialis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
vfv03000
]
K5K99_06280
Transcription factors [BR:
vfv03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
K5K99_06280
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
Mga
HTH_11
PTS_EIIA_2
HTH_DeoR
DUF2089
PuR_N
PTS_IIB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDM75173
LinkDB
All DBs
Position
1182175..1184022
Genome browser
AA seq
615 aa
AA seq
DB search
MSQIVMWYDLLNVFVTYGQIEEVELKEIIGKSYPTLRKNIELLNEEIKEIAAIYKHETSY
EMEILDYSAFDKILKGGLKESIDFNSSTKRIAFILKELIEAREYVLIDDLAEKLEVSRGT
ANRDLQEVKEIVQHFGVDLIGTPNKGLEIKGDEFELRLINLYHIHDFFPTHIFLEDINPF
VDKYAKHRNIPENSVNTWKKVLEITLDRISSKNNLTKPIPHYTNYQLNDEAFDELIYQIE
SLYRISLSQYDIDFISFPLNISNTGAVEKVYMNEPFVRDLYDKMLNHIFKITSVEFERDE
LYEKIRFHLLYLLNRLIFRIENYDYFYGEIEKKYPFAYEIGKVGMEKIEELVGRAASEAE
TSYLAVYFELMMRKDQNKEKEIAIVCNTGKGTAALMKQQITQVLGNNINLKTYTEEEYQQ
TNLSNYFAVFTTVPLKNVDKKVPLIRITNLFNNEWLHSEWERVKKVNQLHFENVSFIFTK
VSPDISYKAQLTSMIESMTYLDMIDKNFQKRIFNREDQQTTVFSNGVAFPHAINFGSKKI
IFHLGVLEKNPIENDDIEFIFMVGIPDQMNDKVESELLQLYDYMLSIVSNSQKASELHQI
NNSEEFSKWVRKEVF
NT seq
1848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtcacaaattgtaatgtggtatgacctattaaatgtatttgttacatatggtcaaatt
gaagaagttgagttaaaagaaattattggtaaaagttatccaactttaagaaaaaatatc
gagttattaaatgaagaaataaaagaaattgcagctatttataaacacgaaacaagttat
gaaatggaaatactggattattcggcctttgataaaatcttaaaaggtggtttgaaagaa
agtatcgattttaattcttctactaaacgaattgcatttattttaaaggaattaattgaa
gcaagagaatatgttttaattgatgatttagcagaaaaacttgaggttagtcgaggaaca
gctaatagagatttacaagaagtaaaagagattgtccaacattttggagtcgatttaatt
ggaacacctaataaaggattagaaattaaaggtgatgagtttgaactcagattgattaac
ttatatcatatccatgattttttcccaacacatatttttttagaagatataaatcctttt
gttgataaatatgctaaacatagaaatattcctgaaaatagcgtgaatacatggaaaaaa
gtattagaaattacacttgatagaatttccagtaaaaataatttaacaaaaccaattcct
cattataccaattatcaattaaacgatgaggcatttgatgaacttatttatcaaattgaa
tctttatatcgaattagtttaagtcagtatgatattgattttattagttttccactcaat
attagtaatactggggctgttgagaaagtttatatgaatgagccctttgttagagactta
tatgataagatgctaaatcatatttttaaaatcacaagtgttgagtttgaaagagatgag
ttatatgaaaaaattagatttcatttattatatttattaaatcgtttgatttttagaatt
gaaaactatgattatttctatggagaaattgaaaaaaaatacccttttgcatatgaaata
ggaaaagttggaatggaaaaaattgaagagttagtaggacgagcagcttctgaagccgaa
acaagttatttagccgtttattttgaattaatgatgcgtaaagaccaaaacaaagaaaaa
gaaatagcaattgtttgtaacacaggtaaaggaacagcagcacttatgaaacagcagatc
acgcaagttttaggcaataatatcaatttgaaaacatatacagaagaagaatatcaacaa
acaaatttgtctaattattttgcagtttttacaacagtgccactgaaaaatgttgataag
aaagtaccacttattagaattactaatttatttaataatgaatggttacattcagagtgg
gaaagagtaaaaaaagtaaatcaattacattttgaaaatgtttcatttatttttactaaa
gtatcgccagatatttcttataaagctcaactcacgtcaatgatagagtcgatgacgtac
ttagatatgatagacaaaaatttccaaaaaagaattttcaatcgtgaagatcaacaaaca
acagtttttagtaatggggtagcttttcctcacgcaattaattttggtagtaaaaaaatc
atttttcatctcggagttttagagaaaaatccaattgagaatgatgatattgagtttatt
tttatggttggtataccagatcaaatgaatgataaggttgaatcagaacttttacagtta
tatgattacatgcttagtattgtttctaactcacaaaaagcaagtgagttgcatcaaata
aataattcagaagagttctcaaaatgggtaaggaaagaggttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system