Vagococcus fluvialis: K5K99_06495
Help
Entry
K5K99_06495 CDS
T07851
Name
(GenBank) BglG family transcription antiterminator
Organism
vfv
Vagococcus fluvialis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
HTH_11
Mga
HTH_DeoR
PTS_IIB
HTH_Mga
wHTH_Par
HTH_36
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDM75212
LinkDB
All DBs
Position
1220960..1222978
Genome browser
AA seq
672 aa
AA seq
DB search
MDSRRPELFLLICQQNNRYEIKVLAEKFQVSTRTIYNDIKKLNELLLAEGYEEIKIEKSI
IFYEKMIPLSFEQLINLDEDYILTHPKIRRLRLLGEVLMFQEQFSMDDLKEKLPLSRNTL
LSDLKWVKEELSFHQIEFLSRPFIGYQVLGDEKDIRHLLVLTLQEDPLVFEGNKKQQKEL
EQAEKLLNYCAEMLEITFSDSSFDTLLLTFWVTYSRIKLGKKLSFYPKNTKEEKLLLKSR
KLFEEEFGISFHSEELMYLAQKLTESSLINYNDDINEKWLDYHLMAADLIKKVSELSGNT
YFLEDDLLHQGIINHLRPAFNRVISHSEINNPMFDYITRTFKTLHNQVCQGMVLIEEQMK
ITFTEQEISFFTLFFIASVERRKSYPTKPKKIIIVCDAGVSTSQILRSKLEVNFDVIIQG
TFGKRTAGDWLRANKTDLIISTIPFNYPNVESIQVAPFVTEEDMKKLYLLFNTKKEKIDM
NEIVSIINQEVALTSEQKQTIKAELMTYFRLKNDQDSEKGVYQPMLVEVLNEKLIKVNYE
ASNRDEAVKASGQLLVDSGLAKQTYVDGMLENVEVNGTYIVIAPGIAMPHARPETGALDI
GLSIVTLKEPVVFGHPQNDPVNIVVGLCAVDHQSHLKALSELVEILGNEEKITQIKTAET
AEDIMTIIRGGN
NT seq
2019 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacagtcgacgaccagagctctttttacttatatgccaacaaaataatcgctatgaa
ataaaagtattagcagaaaaatttcaagtgagtactcgaacaatttataatgacataaaa
aaattaaatgagttactacttgcagaaggttatgaagaaataaaaattgagaaaagtatt
attttttatgaaaaaatgataccgctctcttttgaacaattgattaatttagatgaagat
tatattttaactcatccaaaaattcgtcgtttaagattacttggagaagtacttatgttt
caagaacaatttagtatggatgatttgaaagagaaattgcctctttcaaggaatacactt
ctttctgatcttaaatgggtaaaagaggagctaagttttcaccaaattgaatttttatct
agaccttttatagggtatcaggttttaggtgatgaaaaagatatacgtcacttattggtc
ttaacgttacaagaggatcctttagtgtttgaaggtaacaaaaaacaacaaaaagaatta
gaacaagccgaaaaattattaaattattgtgcggaaatgttagaaataacttttagtgat
agttcatttgatacgctactgttaactttttgggtgacatatagtcgtattaaattagga
aaaaaactaagcttttatcctaaaaacacaaaagaagaaaaactattattaaaaagccga
aagttatttgaagaagaatttggtatttcgtttcactcagaagaacttatgtatttggca
cagaaattaacagagtcgtctctgattaattacaatgatgacattaatgaaaaatggtta
gactaccatctaatggctgctgacttaatcaaaaaagtttctgaattaagtggtaatacc
tattttttagaagatgatctattacatcaaggaattattaatcatttgagacctgctttt
aaccgagttatctcacattcagaaattaacaatccgatgtttgattacattacaagaacg
tttaaaaccttacataatcaagtatgccaaggtatggtattgattgaagaacaaatgaaa
ataacttttaccgaacaagaaatatctttctttaccttattctttatagcatctgttgaa
agaagaaagagttatccgacaaaacctaaaaaaataattattgtttgcgatgctggagtt
agtacatcacaaatattacgttcaaaattggaagtcaattttgatgtaattattcaagga
acatttggaaaaagaactgctggtgattggttgagagctaataaaacagatttaattata
tcaactattccgtttaattatccaaatgtagaaagtattcaagtagcaccctttgttaca
gaagaagatatgaaaaaactctacttgctgtttaacactaaaaaagaaaaaattgatatg
aatgaaattgtttctattataaatcaagaagtagctctcacttcagagcagaaacaaaca
ataaaagccgaattaatgacctattttaggttgaaaaatgatcaggattcagagaaaggt
gtgtatcaaccaatgttagttgaagttttaaatgaaaaattaatcaaagttaattatgaa
gcaagtaatagagatgaggctgttaaagcaagtggccaattattagtagatagtggctta
gcaaaacaaacttatgtagacggcatgcttgaaaatgtagaagttaatggaacatatatt
gttattgctccaggtattgctatgccacatgctagaccagaaacaggggcactagatatt
ggattaagtattgtgactttgaaagaaccagttgtttttggtcatcctcaaaatgaccca
gtcaacattgttgtaggtctatgcgccgttgatcaccaatcacacttaaaagctctatca
gaacttgttgaaattttaggaaacgaagaaaaaattactcagattaaaactgctgaaaca
gcagaagatatcatgacaattattagaggaggaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system