Viruses: 10328249
Help
Entry
10328249 CDS
T40000
Symbol
Syn33_099
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn33; structural protein
Virus
444878
Prochlorococcus phage Syn33
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Mtd_N
ACT_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10328249
NCBI-ProteinID:
YP_004323706
RS:
NC_015285
UniProt:
E3SQY6
LinkDB
All DBs
Position
NC_015285:88573..94296
Genome browser
AA seq
1907 aa
AA seq
DB search
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNT
PNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLST
ALSLINTLPHYLEGGLSTTTRTFTEVTVDQKGRVINARTPAQLNLADYGLDGSATSDTTL
AQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLVSLSVQA
NVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNATKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKY
AAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLA
SFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNY
LNYLKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGDLT
FQLSQNTATNRNFNILTTNAGDGTSNIIITAEDTVQISASEATGKVHVEDYRFQENYLGT
TDATMHLDPGDDRAITGLVRIHGNLQIDGTTTTVNSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNL
DRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNLK
LTTGTASSSNTTGDLVVAGGVGITGAVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTL
QLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIA
TFSNDIDANANMTLAGDLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSNDYGALRLDGGAYVAGDAL
IDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTTTIRAHGGAG
IERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDA
DFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFN
GTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNG
SAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGALR
LTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQN
ASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPI
ITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDG
NLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLL
DSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAG
VVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITL
TNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTG
DLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTN
LFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKD
TDDVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDK
LDNAFAQLSAMLNNLATATTLVLNLSGDPTPGDVTTLNNGTLSGGTLYNTGTAVATTSSG
SGTGLTVDITASGGAITAVAINAAGSGYVVGETITISTGGGDATINVSAVTEMAIGDTVT
GSTSGTTGVITAVGATSVTVDTVDGFFKKTETVSAGDVSTLTITSFA
NT seq
5724 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatagaatacagttaagacgcggtggtgctcaggaatgggcaaacgcgaatcca
actcttgcacagggtgaacttggaattgaacttgatactggtcggttcaaaatcggtgat
ggtgcaacggcatggaacacgctgagatatgagcgtcctgtagagtccaacactaatact
ccaaacagtcttgtacagagagacgcagacggaagtttttctgcgggtactattacatca
actcttattggtaatgcttcaacatcaactagacttgaacagactagacagattcagtta
tctaatgatgtaacagcgactggtaactttgatggttcccaaaacttaaatctaagtact
gctttatcactgatcaatactcttcctcattacttggaaggtggtctaagcactactact
agaacttttactgaggttactgttgatcagaaaggtagagttataaatgctagaactcct
gctcaactaaatcttgctgattatggtcttgatggttctgcaactagtgatacaacttta
gcacaaccttggaatgctaacttagaagcaatctcagacgaaactggtactggtttatat
tcaaaaactgcagctggtgttgttgagaccagacttattactggtgctgctggtcaaatt
gttatcactgacggcggtggtattagtggcaatcctcttgtctcattgtcggttcaagca
aacgttgttcctggagactataatacagaatctctcacttcagtatctcaagctggtagt
ggtggagaaccttttggtacagagactgttaatgctactaagttctctgttgacgataaa
ggacgtttaacaaccgtaacgaatgtacctattgctactgctaccgagggtagtaagtat
gcggcatatgcagcaggtacaacatatgttagatatgatatcattgaagatagtagtaga
gtatatcaagcaattacaggaattgctgcaggtggtggcgctccaactcatactgatggt
tcagatgctggtgggtggagatatcttgctgctgcagcagtagagcagaaaggacttgct
tcttttgcacaagaagattttgatgttgatgctaacggacatgtaactattgctgccgtt
ggtgttgataatacacaactacagaataatagagtttcttttgctgatggaaatacaaaa
gaagattttgaactggatcaggaacttactgcaaccactggatacagaggattcaattat
cttaactatcttaaagttaatgatacgagcggtaatctactgtttggcgctaataatacg
ggggacagcggagctggcgaacttgatgttaatgtacggtcgtatttctctgacgctgat
attactcttgacggcgctcttaatcagacactggataagactggggatggtgaccttacc
ttccagttaagtcagaatactgctacaaatagaaactttaatattctgacaactaatgct
ggagatggaaccagcaatattattattactgctgaagataccgtacagattagtgcatcg
gaagcaactggtaaggtccatgtagaggattatagattccaggaaaactaccttggaact
acagatgcaactatgcatttagatccaggtgatgatcgtgcgataactggtcttgttcgt
attcatggcaatctccagattgatggcactacaactacagtaaattctacacaactaact
gtagatgatgtcacaattttgcttggtggcgatactgtccctacaactgatgacaactta
gatcgtggtattgaattcaactattatgatactgaagcacgcttaggtttctacggttgg
gataccaattattccgatttaggtggtcatgcaggcggatatcgtttccttcatgctgcc
acaaataccaacgaagtctttacgggtactgattctggtattattgcaggtaatttaaaa
cttacaactggcacagcatcttcatcgaatacaactggtgatctggttgttgctggtggt
gtaggcatcactggtgcagtcaatatcggtggtcttctagatgttgatagtacattgcgt
gttactagcacctctcgtttcgacgataatgtagttctgcagggtgcttctaagacactg
caactgaataatggtagtggtacaactaagattgaattccaatctacaactggtaacgga
tctcttgctggtattctggatgtaactggaaacttcaatgttaatactaataagtttaat
gttgttgctgcttctggcaatacctctattgctggcacattgggtgttacaaacattgca
acgttctctaacgacattgatgctaacgccaacatgacattggctggtgacctccacatg
gagagcactaatgacattacggttgctaagaatgttggcactggtgtttgggagattcaa
tctaacgactatggtgctctccgtcttgatgggggcgcatatgttgctggtgatgcactg
attgatggcaccctacacgttaacggtgctattgaagttcaagatagtgcaacagagact
gaatctagactgaactggttgagagttaggtatagaggtcgtttcggtgacacttatcag
gcaactccttcctatgcatctcacaatactacaactatcagagcacatggtggtgctggt
attgaaagaactctacatgttggtggcacaggatctggtgaaggtctgtttgttggtaag
agatactctggtgatacagttaagtttagcgttttaggtgcaactggtaatactgacatt
caaggcacattcgatgttgctggtaactccgagttcaatggcacagttgatgttgatgca
gactttgctgtaagaaatggcacaacggataaattctttgttgataatgtaactggcaac
accgatatccaaggcactctggatgtcaatggtgcaactgagattacaaatactctggat
gttagcaacgctgttacattcgaccagacactgttagtccaaggcaactctgagtttaac
ggtactgttgatgttgatgctaacttcgctgtaagaagtggtagcacggataagatgacc
gttgcttcttcttcaggtaacattgcaactgacggcacactggttgtccaaggtcaaaca
accatcaacgattcactgattgttgatgctgctaatgaagtcttctctgtcagaaacgga
tctgctgttgagaagtttggtgttgatgctgataacggtaatacaaatatcatcggcaca
ctgaccgttggtgatgcaactcagattaatgacaccttcggtgcatctggtattgtcaca
cttaccaataacactgagcaaactctgacaggtagttatggtgctgatggtgctctaaga
cttactggtggtgctgctgtccaaagaaacctcgctgttggtggtgctgcaagagtctac
ggcaacactgaactgactggtactctcgaccttaacaatagtgcagacatctctggtgct
ttagtaacacatgacaatgttacgattactgcagacaataagacatttgcaattcagaat
gcatctgctgctaataaatttacggtagatactgataatggaaacactgatcttcgtggc
accttagacatcggtggtgatgtaactgctgagtccaatcttactgttactggaaatctt
actatcaatggaacgacaactactgtcaactctacggtcacaactatcgatgaccctatt
attactgtgggtggtgacacagcaccagcgtctaacgacggtaaggatcgtggtgttgag
ttccgttattacgacagctctgcgaaaattggtttcttcggatacgatagatccgccaac
caattcgcattcgtagtagacgcaactaattcatcagaagttctttctggtactgacggc
aatcttcgtgctggtagtttgaatcttactggtgctggaaccgcactcgatgttgatgca
aatgcaaatattgatggcactctgactgtagatggtcaaatcatctctcaggtttcttct
ggtgctgctctggtcattcctaacacaaccaagattaacaacctcaatgctgaccttctg
gacagcatgacaactgcttctgcagcaactgcaactactgttgttgctcgtgactctagt
ggagactttgctgcaaatatcattacggttgcttctggtgtaggtgccgctgctggtatt
caaggtaatgctcttactgcagatacacttaaaacggcaagaaacatcacagttgctggt
gttgtttctggagatgctgagtttaatggttctggtgatattacaatcaccacaacatat
gttgacgcagacatcactgcacttgctgcaatggcaggaactggttttgtttccagaact
gctgccaatacatatgctcaacgcacactcgctgtcacagcatcttctggtattacactg
acaaatgctgatggggtttctggcaatccaaccattaacgtcgcttctacagcaagtaac
tcagcaaacaacctcgtccttcgtgatgcatctggtgactttgctgctgggactattact
gcagcattagttggtaatgttactggtcaaacatctgatattagtaatcacgatactgga
gacctttctgagggatccaatctatactttactaatgagcgtgttgatgacagagttaat
gctctgattgttgcgggtacaggtgtcactaaggcatataacgattctgcaggcacctat
acgcttactgtaacgcaggcagacatcgataccgacaatgtaaccgaaggttccacaaac
ctctttacaaccgctgctaggacccgtacacacttcacatatggtacaggtattgaactt
agcggtgcaggtgctctgagtgtcactcaggcagacattgatactgataatgtaactgaa
ggttctactaatatcttctacacggaggcacgctttaatacaagtcttgcaactaaagat
accgatgatgtgagtgaaggttcttccaatctatacttcactaatactcgtgcagatacc
cgtgctgatttgagagttgcagcagcaactggtgcaaacctagatctttctagtaagtct
accaccaatctttctgagggtacaaatcagtactacactgaagcaagagttcaagataaa
ctcgataatgcgtttgctcaacttagtgcaatgctcaataatcttgcaaccgccactact
ttagtattaaatctatctggtgatcctacacctggtgacgtaactactttaaataatggc
acattatctggtggtacattgtataacactggaactgcagttgctaccacctctagcggt
agtggcactggattaacagtagatatcaccgcatctggtggtgctatcactgcagttgct
atcaacgcagcaggttctggttatgtagttggtgagacaattacaatctctactggtggt
ggagatgccacaataaatgtctctgctgttactgaaatggcaattggtgatactgtcaca
ggcagtacatcaggcaccacaggtgttatcactgctgttggtgcaacttcagttactgtt
gacactgttgatggattctttaagaagactgagacagtatctgctggagatgtttctaca
ttaacaatcacttcattcgcctga
DBGET
integrated database retrieval system
