Viruses: 10328261
Help
Entry
10328261 CDS
T40000
Symbol
Syn33_087
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn33; baseplate wedge subunit
Virus
444878
Prochlorococcus phage Syn33
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
10328261
NCBI-ProteinID:
YP_004323694
RS:
NC_015285
UniProt:
E3SQX4
LinkDB
All DBs
Position
NC_015285:47973..50525
Genome browser
AA seq
850 aa
AA seq
DB search
MGCKTNYSSGESSPCFRTNHCSVNVPLPVNQATTVEFREYPLAEIRNSSINYQIDRRDSV
AIMHPSIALPAEPSPPADSGATCGKVFRAAGCTNISQWIYDYVPNELSFDLGFSDRYFSY
LYDTSDNAGHVGIACYYLETKNSTNTTASTPSSGTEGQPDYVAGTPGVSTTTSTTVCKPC
AAFTCATSKTTISYSGTENVTGDPEAPHPTLFAIGTDSDKVVVSYDSLSTTIPNGVTDME
FSYDGVTYTDVWDQTTQAGLVYDSPQNPFVTGQNQLTDFEIYDLDVGLATGFRIKVAITS
IADDTAEPGPTFSGVRWQITELMDPGADYAVGTVIPLTYAYTKPDNTVVNLTMNLKITGV
GPTTSVLSQAGFNILRVGDTLNGHTVTRAFHTDIDNFPYHVIYLNGSGSNFVKDTQYTSD
RNHVVTAHAGFGIIDRGILVGKYEFSDKSIQYSTVDVDKNAPDVFNTLKQPDVTLSVSNG
RVTGATIVSGGAGWKDGATLSVSSPQDAFKFELDDDGRVESVVTNSKNESNIAKLEGTFT
NGVLTAVTVVDGGKGYNTVLTNVDEDGNEYTEENLPTVFVSDIVNYKTSTAPNAAYEPEK
ADDYMDTLGKFPQDISPELENQIFSGFDQDPKYIDNIPASNINQKRDPERLKIDKQPQRL
YSAASVDEYRETYELKGDLTEDILAPDFDSSIKNAVLKGYNDEVNERKAHADALVQEVIP
ESTIGNEALIETVQGTFNDIPVASTYTKYFMKQYRPDPTSEVTLKVTLGCEVAQAGCGHV
PCSPVPSVGSTTNNPDGSTDVVTFTPQVGPLGGGCRNWSATGNLPILHDMTSSGNTFREA
CDAFGNPYAT
NT seq
2553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggatgcaagactaattattcttcaggggaaagcagtccatgttttagaacaaatcat
tgttcggtgaatgtaccattacctgtaaatcaagcaaccactgtagagtttcgtgagtat
ccacttgcagagattcgtaatagtagtatcaactatcaaattgatagaagagatagtgtt
gcgattatgcacccaagtattgcattaccagcagaaccttcgccgcctgcagatagtggt
gcaacttgtggcaaagtgtttagagcagcaggatgtactaatattagtcaatggatatat
gattatgtacctaatgagttatcgtttgacttaggatttagcgatcgatatttttcgtat
ctatatgacacatcagataatgctggtcatgttggtattgcttgttattacttagagact
aaaaatagtacaaataccactgctagcactccttcaagtggtacagaggggcaacctgat
tatgttgctggcactcctggtgtatcaactacaacttcaacgactgtttgtaaaccttgt
gcagcatttacatgtgctacaagtaagactactatatcctattctggcacagaaaatgta
acgggcgaccccgaagcgccgcatcccacattatttgcaattggtacagattcagataaa
gttgtagtatcatatgattcgttaagtaccacaataccaaatggtgttactgatatggag
ttttcatatgatggtgtaacttatactgatgtatgggatcagacaacacaagcaggtctt
gtatacgattcacctcaaaatccatttgtaactggtcaaaatcaattaactgactttgaa
atttatgacttagatgttggtcttgcgacaggattccgaattaaagttgctattacatca
attgcagatgacactgcagaacctggacccaccttttctggtgttagatggcagattaca
gaactcatggaccctggagcagattatgcagtaggtacagtaattcctttgacgtatgca
tataccaaaccagacaatacagttgttaatttaacaatgaatttaaagattactggagtt
ggtcctactacatcagtattatctcaggcaggatttaatattctaagagtaggtgatact
cttaatggacatacagtaactcgtgcttttcatactgatattgataattttccatatcat
gtcatttatttgaatggtagtggcagtaattttgttaaagatacgcaatatacatctgat
aggaatcatgtagttactgcacacgcaggatttggcattatagacagaggaatactagtt
ggaaagtatgaattttctgataaatccatacaatatagcactgtagatgttgataaaaat
gcaccagatgtgtttaatactcttaaacaaccagatgttactctatcagtatcaaatgga
cgagtaacaggtgccacaatcgtctctggaggtgctggatggaaagatggtgctactctt
tcggtaagttctccgcaagatgcttttaaatttgagctagatgatgacggtcgtgtggaa
tccgtagtaacaaactccaaaaacgagtctaatattgctaaattagaaggaacttttact
aatggagtgctaactgcggtaactgtagtcgatggcggtaaaggatataacacagtattg
acaaatgtggacgaagatggtaatgaatataccgaagaaaatctacctaccgtgtttgtg
agtgatattgtaaattataagacaagtactgctccaaatgcagcatatgaacccgaaaaa
gcggacgattatatggatacattgggtaaatttcctcaagatatctctccagaactagaa
aatcaaatttttagcggatttgaccaggatcctaagtatattgataatattcctgcatca
aatatcaatcaaaaacgcgatcctgagcgattaaaaatcgataaacaaccgcagagacta
tattctgcggcatctgtcgatgaatatagggaaacttatgagttaaaaggtgatttaaca
gaggatattctcgctcctgactttgatagtagtattaaaaatgctgtcttaaagggttat
aatgatgaagttaatgaaagaaaggcacatgctgatgcattagtgcaagaagtaatccct
gagtctacaattggtaatgaagcattgattgaaacagttcaaggtacatttaacgatatt
ccagttgcatcaacgtatactaaatattttatgaaacaatatcgtccagatccaacttcg
gaggttacactgaaagttactcttggttgtgaagttgctcaagcaggatgtggacatgtt
ccatgctctcctgtaccatctgtagggagcactacaaataatcctgatggttctacggat
gtggtcacatttactccacaagtaggacctttggggggtggttgtagaaactggagtgca
actggaaacttacctattttgcatgatatgacttcatctggcaatacttttcgtgaagca
tgtgatgcttttggaaatccttacgctacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
