Viruses: 10328925
Help
Entry
10328925 CDS
T40000
Symbol
gp12, Syn1_033
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn1; short tail fiber protein
Virus
444861
Prochlorococcus phage Syn1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Collar
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10328925
NCBI-ProteinID:
YP_004324404
RS:
NC_015288
UniProt:
E3SPB8
LinkDB
All DBs
Position
NC_015288:33243..34946
Genome browser
AA seq
567 aa
AA seq
DB search
MSFYQEIRTAKAAAIGTIMPWVGNISDIPDGWIVCDGTQVSAKDFPLLARAIGDTYNLST
TVTQGLINTFANNASTEAGRIPDTYIYSPIDGSGGGATFAVIVADAGTQAGGAPNGVGGT
VTVQRLQQGANYEINDVLTIPSGNSGGGSDILITVATVEEGSVSTFGGEFPSYQGEIVLP
ALINRPLVDMEQDYLGPGSPTGRVFDLDSTSVSEISSFIGVNSDTGVPTSFNDVATDVVF
ELNERTTAPAGDSGEISYYYSGKLQANTIVTGSGQGNRVMFFGPRKLGRGHIKGHGHGGR
IDTIVKDPETQPGEGVIPWSNINYNFDAQVDTSDSDIFIINDNEFQLEYNMSDQLRGRSG
FGGGIPGRVIGAINAENPPVNWTPQNVAWTPIKSVLTHPLTHRTFNEGVGLKKGALSGGI
AGFNKGPGQREAVDYGQNGQQITQFSNGLTNWYPDLLEYNGDAEAGALADPSAFNTYDTF
NSNAGWDFKRTTIGVAASRDIILAHTHDEFDVSFDLSGLRPLNSLNVYVTAPAGNLNLDN
ARNVGVFQINFNTTQPGMTSVYVIRAY
NT seq
1704 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctttctatcaagagatcagaaccgcaaaggcagctgccatcggaacaatcatgcca
tgggtcgggaatatctcagatattcctgacggttggattgtatgcgatggaactcaagtc
agtgccaaagactttccattgcttgcaagagcaattggagacacatacaatctatctact
acagttactcaaggtctaatcaatacctttgctaacaacgcatcaacagaagcaggaaga
attcctgatacgtatatttactcaccgattgatggtagtggtggtggtgcaacttttgct
gtcattgttgctgatgcaggaacacaagcaggtggtgctcctaatggtgttggtggaaca
gtaactgttcaaagattacagcaaggtgctaactatgaaattaatgatgttctaactatt
ccctcaggcaactctggtggtggatctgatattttaattactgtagctactgttgaagag
ggatctgtttctacatttggtggagagtttcctagttatcaaggagagattgttcttcct
gctctaatcaatagacctctggttgatatggagcaagattatcttggaccaggatctccc
actggtagagtgtttgatcttgattcaacttctgtatcagaaattagttcatttattggt
gtaaactcagacacaggtgttcctacatcatttaacgatgttgctactgacgttgtgttt
gaattaaatgagagaacaacagcaccagctggtgatagtggagagatttcatactactac
agtggtaaactacaggcaaacactattgtcacaggatctggtcagggtaatcgtgttatg
ttcttcggtcctagaaaactaggaagaggacacattaaaggtcatggtcatggcggtaga
attgatactatcgtaaaagatcctgaaacacaaccaggagaaggtgtgattccatggtca
aacatcaactacaactttgatgcacaggttgatacttcggatagcgacatctttatcata
aatgataacgagtttcaattagaatataacatgagtgatcagttgagaggtagatctggt
tttggtggtggtatccctggacgtgtcattggtgctattaatgcagaaaatccaccagtt
aactggaccccacaaaatgttgcgtggactcctatcaaatcagtcttgactcatccactc
acccatagaacatttaacgagggtgttggtctaaagaaaggtgcattgtctggtggtatt
gctggatttaacaagggtcctggacaaagagaagcagttgactatggtcagaatggtcag
cagataactcagttcagtaatggattgactaactggtatccagatcttcttgaatataat
ggtgatgcagaagcaggagcactagcagatccttcagcattcaatacttatgatacgttt
aatagtaatgctggttgggacttcaagagaacaactattggagttgctgcatcaagagat
attattctcgcacacactcatgacgaatttgatgtatcatttgatctttctggtctaaga
ccattaaatagtttgaacgtatatgttactgctccagcaggtaacttgaatttagataat
gcaagaaacgttggtgtattccagattaacttcaacacgactcaacctggaatgacttca
gtatatgtaatcagagcatactaa
DBGET
integrated database retrieval system