KEGG   Viruses: 10328930
Entry
10328930          CDS       T40000                                 
Symbol
gp12, Syn1_038
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn1; short tail fiber protein
Virus
444861  Prochlorococcus phage Syn1
SSDB
Motif
Pfam: Collar
Other DBs
NCBI-GeneID: 10328930
NCBI-ProteinID: YP_004324409
RS: NC_015288
UniProt: E3SPC3
LinkDB
Position
NC_015288:42153..45326
AA seq 1057 aa
MPYQFSASPLYVEEGQSIQFRYEAPPLFNDITQVKIEIGELTVFWIIETKLEDFEPDPFF
LRNVDDAEPDTLLTYAATTDPDNGVAYTGLASDPDPLREGEEVITITGLDPGTQAPLIVS
SNVIDVNNWSYRLRLYNEGSSSYGAWGAWTRALNNTVSNLDQIQVRLVSSSSPSDTKNVV
VTVGTGSATWDVTTGAIPVNTPNPAPDFGSLNNLPLGQLVYSDIAQILGLTTSAIISVDN
GAEIAVSNFNTTFTNADGYEVLNNISNGWGNNLTVSNGQYVQLRGTSSATPTATINFSVT
VGDGAGISVWQITSGQGIDDNPTNFVFQDLVGQIPGQTGLRSETASGSSTSVAGRNVALV
GGLDAGLFVPVTVRPADTNIVPKISINGGSSGLINNVTVQNGDTIELVVDNSTDITNPVI
PGQGVVTVGINVGNRFIQTWTVANWTGPDTIPAFTPINQVINRTPGGASIIGPIGLTDFN
LPITISATNPESFNEFNFATNENIGDVLFSINGDSATVGPRTVNPDPGGDPVFITIIMQQ
PGNADLDPVQGLSNYGQTVITFGDASPFQLRSINYAVKPIPPAYLGVWYSEKNAYFDDTS
WAAAGEDPNNARDYYRAPKFDGYSIGTVVPITKETPLNDGNFGYGDIEERYPGFLPCDGA
TFAAADYPWLWEAIGNTYGGNGAYIPATKSYTGNFNVPDYRNVRMVGAGIVDSNRGSSSF
VPVTSAGGSFELTGSTGGYWYVDDVDVAGPDPLEQVVAPAGSSDGIESEYFTLGTPRTFG
TEELEADVEFTVTGEVVANIGPVSDVSVRPPQHEHEVISGQIDSDDGDPLIPWGTRAYYG
TSASGSQNWSGRPDSDTDAVDDGYWEDAGFWNFGQFNSEVENSGRGSLLDLLPGVGSSSV
AFGNYWGSPFSEISGLSDDYFTKNGNPNNGDCGVIDTTETRARIDNYLSIYTGTLNHSHL
LGTDPVTNPQTDFSYGNVNSDATAFRQGLATFNSIFALKFTQNASTDGGSGVDIELNPAT
FSWNNTSKPIPTAAMNPQRKVPIIAPFHKVKYIIKAY
NT seq 3174 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgccatatcagtttagtgccagtccgctgtatgttgaagagggacagtctatccagttt
cgttacgaagctcctcctctgttcaacgatattactcaagtcaagattgagattggcgag
cttactgtcttctggattattgagactaaactagaagattttgaacctgatccgttcttc
cttagaaatgttgatgatgcagaacccgatactctattaacatatgcagcaacaacagat
cctgataatggtgttgcatatactggactagcaagtgatcctgatccactaagagaaggt
gaagaagttattacaatcactggtcttgatcctggaacacaggcaccattgattgttagt
tccaatgttattgatgtaaacaactggtcttatcgtctaagactatacaatgaaggatcc
agtagttatggtgcttggggtgcatggactagagcacttaacaataccgtatctaatctt
gaccagattcaggtcagactagtatcttcttcttcaccatcagacacaaagaatgttgtt
gttactgttggaacaggttctgctacttgggatgttacaactggtgcaattccagtcaac
acaccaaatccagcaccagattttggttcgctaaacaatctaccactaggacaacttgta
tacagtgatattgcacaaattctaggattaactacttctgctatcattagtgttgataat
ggtgcagagattgcagtatctaattttaatactacatttactaatgctgatggatatgaa
gttctgaataatatttcaaatggatggggcaacaacctgacagtaagtaatggtcagtat
gttcagttaaggggcacatcatcagcaacaccaacagcaactattaacttcagtgttact
gttggtgatggtgctggtatttctgtatggcagattacatctggacaaggtattgatgat
aatccaactaattttgtattccaagatctagttggtcagattcctggacaaactggtctt
agatcagaaactgcatcaggttcttctacatcagttgctggcagaaatgtagcactggtt
ggtggacttgacgctggactatttgttcctgttacagtcagacctgctgatactaatatt
gttcctaagattagtattaatggtggttcttctggtctcatcaacaatgtcacagttcag
aatggtgatactatcgaactggttgttgataactctacagatatcactaaccctgtaatt
cctggtcaaggtgttgttactgttggtattaacgtaggaaacagatttattcagacatgg
actgtagcaaactggactggtccagatactattccagcattcacacctatcaaccaagtt
atcaatagaactcctggtggtgctagtatcattggtcctattggattgactgacttcaat
ctaccaatcactattagtgcaacaaatcctgaatcatttaatgaatttaactttgctacc
aatgagaacattggtgatgttctattctcaatcaatggtgattcagcaactgtaggacca
cgaacagttaatcctgatcctggtggtgatcctgtattcatcactattattatgcaacaa
cctgggaatgcagatcttgatcctgttcaaggactgtcaaattatggtcaaacagtcatt
acatttggtgatgcatctccatttcagttgagatctatcaactatgctgttaaacctatc
cctcctgcatatcttggtgtgtggtattctgagaagaatgcatattttgatgatacatca
tgggcagcagcaggcgaagatcctaacaatgctagagattactatagagcacctaagttt
gatggttactctattggaactgttgttcccatcactaaagaaacaccactaaatgatggt
aactttggttatggtgatattgaagaaagatatccaggattcttaccatgtgatggagca
acctttgctgcagcagattatccttggttgtgggaagcaattggtaacacatatggtggc
aatggtgcatatattcctgcaactaaatcctacactggaaacttcaatgttccagactat
cgtaatgttagaatggtaggtgctggtatcgttgactctaatagaggatcatcttctttt
gttcctgtaacaagtgctggtggttcatttgaactgactggatcaactggtggttactgg
tatgttgatgatgttgatgttgctggtccagatccactagaacaagttgttgcacctgct
ggatctagtgatggtatagaatcagaatactttacactaggaactccaagaacatttgga
actgaagaactagaggcagatgttgaatttactgtcactggtgaagttgttgctaacatt
ggtcctgttagtgatgtttctgttcgtcctccacagcacgaacacgaagtgattagtgga
caaattgatagtgatgatggtgatccactcattccatggggcactagagcatactatggc
acatctgctagtggttcacaaaactggagtggaagacctgatagtgatacagatgctgtt
gatgatggttactgggaagatgcaggattctggaactttggtcagtttaattcagaagtt
gaaaactctggcagaggatcacttttagatctgttgcctggtgtaggtagcagtagtgta
gcatttggtaactactggggttcaccattctcggagattagtggtctaagtgatgactac
ttcactaaaaatggtaatccaaataatggtgactgtggagttattgacacaacagaaact
cgtgctagaatagataactatctgtctatctacactggcacactaaatcactctcactta
ctaggaactgatcctgttactaatccacaaactgactttagttatggtaacgtcaactca
gacgctactgcattcagacaaggactagcaacattcaactctatattcgcacttaagttt
actcagaatgcatcgacagatggtggatcaggtgttgatattgagctcaatccagcaaca
ttctcatggaacaataccagcaaaccaattcctactgctgctatgaatccacagcgcaag
gttcctatcattgcaccattccataaagttaaatatataattaaggcatactaa

DBGET integrated database retrieval system