KEGG   Viruses: 10328986
Entry
10328986          CDS       T40000                                 
Symbol
Syn1_094
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn1; virion structural protein
Virus
444861  Prochlorococcus phage Syn1
SSDB
Motif
Pfam: YHYH Baseplate_wedge X25_BaPul_like nSTAND1
Other DBs
NCBI-GeneID: 10328986
NCBI-ProteinID: YP_004324465
RS: NC_015288
UniProt: E3SPH9
LinkDB
Position
NC_015288:66199..76023
AA seq 3274 aa
MAETRRISTLIESQLPEFISSDYENFSKIVEKYYEQLELRGQPLDVIQNITKYRDIDFYE
KSLLAQGTELAVAVSASDTTIELIDASSFPVENGYIKINDEILFYKERNGNTLSDVSRGV
SGNTKLGDLYEASNFVTTLAVGHNSGVAVQNISNLFLYAIVKNFESDYLASFPEKYLNEK
VDKRTLIKNITSFYRAKGTDRSIKFIFNTLVGNDTPEVVRPKDFTVKASTSDWITSYSLK
VKVLSGNVTDLIGEEIVQGVDSFNPNAGFASAIVDNVFGAGTVDGEQLYEIALDTSSINN
TFKIASKTELTADFDNGLTVGDRINVFSTEGFSSTGRFVIRGEEFEYSDKSVTQFLVSDR
ESNIVYATGESVYSFSTVTSGNVKLLVLGVLYNLSTDAPVPYSEEGDRIQVSGGGFETRD
PIIMTPQNTIRWILSQENAEAANPTIQSQIGDLPGDVAAIYEDSNYYYICSSSFPTRPIL
LANTQQTLQDQKTMRLIRKNPQVITESYKTTQRDVGILVDGTLAFSYRDFDQVKFGPITK
FNISQKGAGFQDPPNVLINNVPGRARSFLAGEVVDSIELLDQTAYTVPPTVTITSGRNGK
ASATVTFGRITSIQVIDAGEYYTTPPTVRIIDRLGRGRFAEYNTVLENGKIVDFEQVDEG
KFYSKGNVLVDILPVGDGASVTSDIVTYTKDRYKKLQSELDSSNGYAFQNYNPTKGYGYG
IVANPSDLRTDLNDDGTSHSPILGFAYDGNPIYGPYGYENPLDAGSAVSRLSSAYYLKSN
RLGGPNPSEFPLGTFIEDYEWRPSTQTGKLELDENNGRFCATPEYPAGVYAYFITIDTNG
NPAFPYILGSNYYSLPVDSNYNADLSQDDLPKYAKRLKTLGMPSNGGNTVLKINKTTSGS
ISALNVEDSPASFKVGNKFIVNDTGTEGSGAAAIVAEVTGKTITSLKSNDLDPTNTLAVS
YIETITPCYLFEGDTVTQEDSNYTGRVVGDISNRNEFVLENVSGTYQSDKNLNSSSNIIS
IILSGNGSFSAEATLLLTDGDDDVIARGRILESVSNQNSIRVEVTEGEFVVPESATRNYF
LQSTVLGDTVGLEVVIYNELSKNIEAFVVDNNYALVSTSEPHNVGVGSAVNMDIIPSEAD
TTTTYYVRKRFYQQITLRSPSFTTVMTDSGVGKSEVLNGGIAYQAGTYEDVELIFFDQSK
VRTDIGSVGDPDNARATIVVSDYNNTGYGSVSIVTITTKGQNYIKGDILSVADASLNRLD
STNSTQRLALEVDHVGFSLTNTVLQLRTIQKLSENDYLQINSEIVKVISIDNNARTATVQ
RGQFDTVVTNHFDNTTVKLYNGIYRFQEDSRPLGDGVNDPYIIDYDATTQKVTLAYNYGA
PSPREVTNSSIFQDDSSPRKSINISSSTPGQNNLEFSKDVNFATYGRNTDIRIQKYYRYL
FDTSHVSMNGVFLDFSASRTGTIFTEEKEVSGIQPGNAGSFVAITLGFGPKIAGLDQQRY
PVNFDTYYYFIKASSDVNTDNASLQVIDDPLTGPKTVKFTTSTKFAYQLPDVPDYQGTGT
ITYTTSSPFAEGKITKTTINNLGAGYKRSPIVEGCLVTDNNEPLLTVEWDSITQSIQGIQ
INNGGKNYINPKAIVTNGDGVGAHFNVVSDQGRITRIDILSGGSGYTFTPTVSVYEGAID
AFFESESIGLPQDISIISNGGSFHNDATIESTYRSNYAIIYKGDAKFFKGERVEQRVGSS
LIFSGYVSDKGWRTGSNILRLNKVSGVVDTTLNLYSAMDPSRSIEVSDVLFTEFDSDIRT
YFDNLGRYASDKGKVGSRYQKVTDSYYYQDFSYVIQSRTAIDVWRDLIKQTTHPAGFQLF
GEVLIDSEQEATMPTDQTPTTSISYIELAPKTVTVERKSTRITNSFVTVADTNLIRGQGS
ISIDEYDTEGIISRELTILEPFTGRYASKEDYVGSIRSITKAADNTFVSTSFGGGVTVPS
GAYAHWIKFKLVSNSNNQPAVGPFVGAGSSTQAWDTNDNYTLLPNDEYVTTGSGIFDLTK
IIRMDIGYLFSFGEFTSNPSSDDYEFGGLVQSTESDFSNIAYEFEVGDEITLYENAASYI
TVEILEVKSPAYDVVEGVIGNGNILGRKTFTLVDKANYLAYSPYNEQELFLTINGIAQEP
GKSFKVSGSQITFSEPPLGPLFPQTGENLDDTYETEPASLICKAFKFKEDTFNSRYLRKL
KDISPNFDGIANQFDLYWEDGTVVKADPGEKFLIFINGILQEAKESAEAPLGNAYNILRR
NGTQPDAIVFAEPPRNFADDIDPVPVQLDQRETFFGYGVGSYDRFKIDDRLIPYRGTGPY
LIFGEVDGRVKNITDGRFVLVFVDGVLQNPDSYTINGPNITFTSNLTRYIPETGEAVQNN
VRLISLYGRDVPKTLSFYDYDRVGLTNEIIVRCQRVIDTSAGNEEYNDFQSRLYSFDPST
PKNLFTITSDGTRKLLGKISLLRFDLLADGTANGSSKIGVTPVDFTFTVLNAANLDFTEL
SYDPTQNVADDTRVSTLYVSDKSDFTDAISFNKINSVFSIDISYPVDDEGRRLLARDLPA
WLRGSENGNSVYDLRNNTELEIIAGDEILVDGENEFRTIEYVPGKANLRNFGLGQTAKYE
HFSKVDVSNYNGLVRGEGLSVTSQIDGTGRVVSLGFNDLEWNKRDLALFFNTGILLQPTA
YQYFVPPQLKFVPVDTNGGGARAEVLTKDGQVLDVVLTSGGFGYTQPPKVVVTRGYFVKR
NPTRVVKSETIISVNTEVAGGGALSVVQTEILLFGEGAVSSVLSIIALGGLAGDQVDSDS
VFVTELHTTAREAGTELRKAEFYQYTKREASGAFDQVASELNINELTITVTLDSPTAVIT
DISPEMGVDVITSTLHKQINAPIVYAAQDTYSVTGAFLDAPLSPTAVTAYIGNTSLFPSQ
GKLQIGKEIVAYNSTLEDRFVDLTRGIEGSTAQAHPAGQYLRTLPTFVTVLPAGPSTILI
TESAVRITDAKLVELKTQVVTEQEVKTTEDPYIEVEREQQIEINPVMSAVEEEIIIIPPA
KLLDVTQSANLHSTITVVAASLAAISSDSVKVKKIDRFIDVTLERTITLDFQADTVITSV
AAGPTTTTSFSSVLGATESVVQVLVDSEDDKVMGALTTLTTIESILDLSELVAVSFPTGR
DGGVSGGFTENGPTNIINRITLFAETSDVRTISVIETNVDLSVNSISSTYSVASDLPIVN
GRSKPADVMLLRQMGVIDYFEELVVLETSIKTRN
NT seq 9825 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcagagactaggagaatatctactctaatcgagagtcaactacctgagttcatttct
tctgactacgaaaatttttctaaaattgtagaaaaatattacgagcagttagaacttagg
ggtcaacctctcgacgtgattcagaatatcacgaaatatcgtgatatcgatttttatgaa
aaaagtcttctagcacaaggcacagaactagcagtagcagtatctgcgagtgatactact
attgaattgattgatgcatcctctttccctgtggaaaatggttacatcaagattaacgat
gagatcttgttttacaaagagagaaatggtaacactctcagtgatgtctctcgtggcgtc
agtggcaatacaaaactaggtgacctatacgaagcaagcaacttcgtaacaacgcttgct
gtgggtcacaactcaggtgttgcagttcagaacatcagcaacctgttcttgtatgctatt
gttaagaactttgagtctgactaccttgcatccttcccagaaaaatatctgaatgagaag
gtagacaagcgaactctaatcaagaatattactagtttctatcgtgcaaaaggcactgat
aggtcaatcaagtttattttcaacactctggtaggaaatgacactccagaggttgtaaga
ccaaaagattttactgtaaaagcatccacatccgattggatcacctcttactcattgaaa
gtaaaagttctatcgggtaatgtaactgatctcattggagaagagattgttcaaggcgta
gactcatttaatcctaatgcaggttttgcatctgctattgtagacaatgttttcggtgct
ggcacagttgatggagagcaactatatgaaattgctctagatacatcttcgattaacaat
acattcaagattgcatctaaaactgagttgacagcagactttgataatggtcttactgtt
ggagatcgtatcaatgtgttctccacagaaggattttcttctacaggcagattcgtaatc
cgtggagaagaatttgagtatagtgataaaagtgttactcagtttctagtcagcgacaga
gaaagcaatattgtttatgctactggagaatctgtttacagtttttccacagttacctct
ggaaatgtcaaacttctagtccttggtgtcctttataacttgagcactgatgctcctgtt
ccttattctgaggaaggagatcgtattcaggtatctggtggaggtttcgagaccagagat
cctattattatgactccacagaataccatccgttggattctgagtcaagagaatgctgaa
gcagcaaatcctactattcagtctcagattggagatttgcctggtgatgttgctgctata
tacgaagatagcaactattactacatctgttcgtcttctttcccaactagacctattctt
cttgcaaatactcagcagacactgcaagatcagaagacgatgagattgattcgtaagaat
cctcaagttattactgaatcgtataaaacaacacaaagagatgttggcatcttggttgat
ggaactcttgctttcagttatagagattttgatcaagtcaaatttggtcctatcaccaag
ttcaatatttcacaaaaaggtgctggattccaggatcctcctaatgttctgattaataat
gtcccaggaagagcaagatctttcttggcaggtgaggttgttgacagtattgaacttctc
gatcaaactgcatatactgttccaccaacggtaactattacttctggtagaaatggaaaa
gcatctgctactgttacttttggtagaatcacaagtattcaagtaattgatgctggtgaa
tactacactacaccacctacagtaagaattatcgatcgtcttggtagaggtcgttttgca
gaatacaatactgttttagaaaatggtaaaattgttgactttgagcaagtagacgaaggt
aagttctactccaaaggaaatgtgttggtcgatattcttcctgttggtgatggagcatca
gtaacatctgatatcgttacatataccaaagatcgctataagaaactacagtctgagtta
gactcgtctaatggttatgcatttcagaactacaaccctactaaagggtatggttatggt
attgttgccaatccttctgatctcagaactgatctgaatgatgatggaacttcacactct
cctattttgggatttgcttatgatggcaatccaatttatggtccttatggttatgaaaac
cctctagatgctggtagtgctgtcagtagactgtcatcagcgtattatctaaagagcaac
agactaggtggtccaaatccatctgagttcccacttggaacttttattgaagattatgag
tggagacctagcactcagactggtaaattagaattagacgaaaataatggaagattctgt
gcaacaccagaatatccagctggagtctatgcatactttattacaatcgatactaatggt
aatcctgcattcccatatatcctaggatcaaattattattcactacctgttgattctaac
tataatgcagatctatctcaggatgacttgccaaagtatgccaagagattaaaaactcta
ggaatgcctagcaatggtggcaatactgttctgaagatcaacaaaaccactagtggtagt
atctctgcattgaatgtagaggattctccagcatcattcaaagttggtaataaattcatt
gttaatgacactggaaccgaaggatctggcgcagctgcgattgtcgcagaggttactggt
aagactattacatcactcaaatcaaatgatttagatcctactaatactcttgcagtctct
tatattgagactattaccccttgctatctgtttgaaggagatactgttactcaagaagat
agcaactacactggtagggttgttggagacatttctaatagaaatgagtttgttcttgag
aatgtatcaggaacatatcagtctgacaaaaatctaaactcctctagcaacattatcagc
attatcttgtctggtaatggatcgtttagtgcagaagcaacactactcttaacagatggc
gatgatgatgtcatcgctagaggcagaattcttgagtctgtatcaaaccaaaactctatt
agagtcgaagtgactgaaggagagtttgttgttcctgaaagtgctactaggaactatttt
ctccagagcacagttcttggagacaccgtaggtctagaagttgttatctacaacgaatta
agtaagaacatcgaagcatttgttgtggataacaactatgctttggtatctacatccgaa
ccacacaatgttggtgttggtagtgctgtaaatatggatattattcctagtgaagcagat
actacaacaacgtattatgtaaggaagagattctaccaacagattacactgagatcacct
tctttcactacagttatgactgatagtggtgttggtaagtcagaagttcttaatggtggt
atagcatatcaagcaggaacatatgaagatgttgaacttatctttttcgatcaaagcaaa
gtaagaactgatattggatctgttggagatcctgataatgcgagagcaactattgttgtt
agtgattacaacaatactggatatggaagtgtcagtatagttactatcacaactaaagga
cagaactacattaagggtgacatcctatcagttgctgatgcatctctcaatagactagat
tctaccaattcaacccaaaggttggcattggaagttgatcatgttggtttttctttaact
aacaccgtattacaactaagaactattcagaaactgtctgaaaatgactatctgcaaatt
aatagtgagattgtaaaagtcatatctattgacaataatgcaagaactgctactgttcaa
aggggtcagtttgacactgttgttaccaatcactttgataatactacagtaaaactgtat
aatggcatctacagattccaagaagactcaagacctcttggcgatggtgtcaatgatcca
tatatcattgattatgatgcaaccactcaaaaagtaactctagcatacaactatggtgct
ccctctcctagagaagttactaacagtagtattttccaggatgatagttctcctagaaag
tctatcaatatttcttcatctactcctggtcagaacaacttggagttctctaaggatgtc
aattttgcaacgtatggtagaaatactgacattcgtattcagaaatactatcgttatttg
tttgacaccagtcatgtttctatgaatggtgtgttccttgatttctctgctagcagaact
ggaactatcttcactgaagagaaagaagtaagtggcattcaaccaggaaacgctggttca
tttgttgctataacattaggttttggtcctaagattgctggtcttgatcaacagagatac
ccagtcaactttgacacatactactactttatcaaggcatctagtgatgtcaataccgac
aatgcttcgttgcaagtcattgatgatcctttgactggacctaagacagttaagttcaca
acatctacgaagtttgcatatcagttgcctgacgttcctgattatcaaggaactggcact
atcacatatactacatcttcgccttttgctgaaggtaagatcactaagactacaatcaac
aaccttggagcaggatataagagatctcctattgttgagggttgtcttgtaactgataat
aacgaaccactactgactgtggagtgggattctatcactcagtcaattcaaggcatccaa
attaataatggtggtaagaactacatcaatcctaaagcaattgttaccaatggagatggt
gttggtgctcactttaatgtagtaagtgatcaaggaagaattactagaattgacatattg
tcaggtggtagtggttatacttttactcctactgtatctgtatatgaaggtgctattgat
gcattctttgaatctgagagcattggtctaccacaagatattagcatcatcagtaatggt
ggttctttccacaatgatgcgactattgagtctacttatagatcaaactacgctatcatt
tacaaaggagatgctaagttcttcaagggagagcgagtagagcagcgtgttggttcttca
ctaatcttcagtggttatgtttctgacaaaggttggagaacaggatcaaatattcttaga
cttaacaaagtaagtggtgttgtagacaccaccctaaatctttattctgcgatggatcct
agtagatctattgaagtatctgatgttctgtttactgagtttgattctgatatcagaact
tattttgacaaccttggtagatatgcatctgacaaaggtaaagttggcagtagatatcaa
aaggtaactgattcttattattaccaagacttctcatatgtcattcagtctagaactgct
attgatgtatggagagatctaatcaagcagactacacaccctgcaggttttcaactgttt
ggtgaagttctaattgattctgaacaggaagcaacaatgccgactgatcagactcctact
acatctatcagttatattgaacttgctcctaagacagtaactgtagagaggaagagcaca
aggattacaaattcttttgtaacagtagcagatacaaacttgattagaggtcaaggttct
atctctattgatgagtatgatactgaaggaattatttctagagaactgactatcctagaa
ccttttactggtcgctatgcaagcaaggaagattatgtaggttctatcagatcaatcact
aaagcagctgataatacgtttgtttctacttcttttggtggtggtgtaactgttccatct
ggtgcttatgctcactggattaaatttaaactggtaagcaatagcaacaaccaacctgct
gttggtccttttgttggtgctggatcttctacccaagcttgggatactaatgataattac
actcttcttcctaatgatgagtatgtaactactgggtcaggtatctttgatctgaccaag
atcattcgtatggatattggttacctattctcatttggtgaatttacttctaatccatcc
agtgatgactatgagtttggtggattggttcagtctactgaatcagatttttctaatatt
gcatatgagtttgaggttggtgatgagatcactctttatgaaaatgcagcatcttatatt
actgttgaaattctcgaagttaaatctcctgcatatgatgtagttgaaggtgttattggt
aatggcaacattctcggtagaaaaacatttactcttgtagataaagcaaactatcttgca
tactccccatacaatgagcaagaattgttccttactataaatggaattgcacaggaacct
ggcaaatcatttaaagtatctggttcacagataacatttagtgaacctcctcttggtcct
ctctttccacaaacaggagagaacttagatgatacttacgagactgaacctgcatcacta
atctgtaaagcatttaagttcaaagaagatactttcaactctcgctatttaagaaaactt
aaggatatctctcctaattttgatggaattgcaaatcagtttgatttatattgggaagat
ggcactgttgtaaaagcagatcctggtgagaaattcttgatctttatcaatggtattctg
caagaagcaaaagagtctgcagaagcaccattgggtaatgcatataatattttaagaaga
aatggcacacaaccagatgctattgtatttgcagaaccacctagaaactttgcagacgat
attgatcctgttccagttcaactggatcaaagggagactttctttggttatggagtcggt
agttacgatagattcaagattgatgatcgtttgattccatatagaggaacaggtccttat
ctaatcttcggtgaagttgatggtagagttaagaacatcactgatggcagatttgtcttg
gtgtttgttgatggagttctgcaaaatccagactcttatacaatcaatggtccaaatatc
acattcacatcaaatcttactcgttatattcctgaaactggcgaagcagttcagaacaat
gtaagattgatttctctatatggtagagatgttcccaagactctatcattctatgattat
gatcgtgttggtcttactaatgagattattgttagatgtcagcgagttatcgatacatct
gctggaaatgaagaatataatgacttccagagtagattgtatagtttcgatccatctact
cctaagaatttgtttaccatcacttcagatggaactagaaaactcttaggaaagatttct
ctattaagatttgatttacttgcggatggaactgcaaatggatcttcaaaaattggtgta
acaccagttgactttacattcacagttttgaatgcagctaaccttgattttactgagttg
tcatatgatccaacacaaaacgttgctgatgacactagagtttctacactttatgtttcc
gataaatcagatttcacggatgcaatttctttcaataagatcaacagtgttttctcaatt
gatatttcatatccagtagatgatgaaggtaggcgtttgcttgctagagatcttcctgca
tggttgagaggttctgagaatggaaactcagtatatgatctaagaaataatactgaatta
gaaattattgctggagatgaaatcctagttgatggtgagaatgaattcagaacaattgag
tatgttcctggcaaagcaaatctaagaaactttggattgggtcagactgctaagtatgag
cacttctctaaagtcgatgtaagtaattacaatggtctggttagaggagagggtctcagc
gtaaccagtcaaattgatggaactggacgtgttgtttctcttggtttcaatgatcttgag
tggaacaaaagggatcttgctttattcttcaatactggtattctattacaaccaacagca
tatcaatactttgttccaccacaactcaagtttgttcctgttgatactaatggtggtggt
gctagagcagaagttcttacgaaagatggacaggttctagatgtcgtattaacaagtggt
ggttttggttacactcaaccacctaaagtagttgttactagaggatattttgttaagagg
aatcctactagagtagttaagtctgaaactattattagtgtaaatacggaagttgcaggc
ggtggtgctctatctgttgttcaaacagaaatcttgctctttggtgaaggtgctgtttcc
agtgttctttctattattgcacttggtggtcttgctggcgaccaagttgattctgattct
gtctttgtcacagaactccatactactgctcgtgaagcaggaacagaacttaggaaagca
gaattctatcagtataccaagagagaagcatctggtgcattcgatcaagtagcatcagaa
cttaatatcaatgaacttactattacagtaactcttgattcaccaactgctgttattaca
gatatttctcctgaaatgggtgtagatgtaattacatcgacattacataagcaaatcaat
gctcctattgtttatgctgctcaggatacctacagtgtaacaggtgcattccttgatgca
cctctgtctccaacagcagtaactgcatatattggaaatacaagtctattcccatcgcaa
ggcaagttgcagattggaaaagagattgttgcttacaattctacgcttgaagacagattc
gttgatctcactagaggtatcgaaggatctacagcacaagcgcaccctgctggtcaatat
ctgagaacactgcctacattcgttactgttctacctgctggtccttcaactattctcatc
actgagtctgcggtaagaattaccgacgctaagttggttgaacttaagactcaagttgta
actgagcaagaagtcaagactactgaagatccttatattgaagttgaaagagagcaacag
attgagattaatccagtaatgagtgctgttgaggaggaaattataattattcctccagca
aaactccttgatgtaacacaatccgcaaatcttcatagcactatcactgtagttgctgct
tctcttgctgctatcagttctgattctgtaaaagttaagaagattgatagatttattgat
gttacacttgaaagaactattacacttgatttccaggctgatacagtcattacgtctgtc
gctgctggacctacaactaccacatcattctctagtgttcttggtgctacagagagtgtc
gttcaggtcttggttgactcggaagacgataaagttatgggagcacttacaactctcaca
acaattgaaagtatcctcgacctttctgaacttgttgcagtctccttcccaacaggtaga
gatggtggagtttctggaggatttaccgagaacggacctactaatattattaaccgtatc
acactatttgctgagacatcagatgtccgcacaatctccgtcattgaaacaaatgttgac
ctcagtgttaacagtatctcgtctacatacagtgtggcttcagatttacctattgtcaac
ggtagatcaaaaccagcagatgtcatgctcctcagacagatgggtgttattgactacttc
gaggaacttgtcgttctagaaacatctattaagactagaaactaa

DBGET integrated database retrieval system