Viruses: 10328991
Help
Entry
10328991 CDS
T40000
Symbol
Syn1_099
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn1; virion structural protein
Virus
444861
Prochlorococcus phage Syn1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
10328991
NCBI-ProteinID:
YP_004324470
RS:
NC_015288
UniProt:
E3SPI4
LinkDB
All DBs
Position
NC_015288:87004..91860
AA seq
1618 aa
AA seq
DB search
MPAVNVAKSDTFEIQRQKINTIGSQIFSISAGGSDLSTGILKLGDGTKDAPSLAFTNDAS
LGFFKSNLGELAFVSTSKKVFGFDSSSQVAFQDFIVRKKSLETTGISISNTGAGYDEGTY
TGVTFIGGTGSNGVVTIVVTGFVGTVTTEGDNYNPGAYNGVILEGGTGSGATFSFNVNAT
LGSITDGGSSLSPGIYANVPLTNVSSSGSGAEATVTVTGTTDLTIGITTSGSGLSDETYT
DIPLLNTPDQTFVVTSIANPGTPPPDNVFSIDGTQQATLSVVEGRTYWFNTSDSSVETHP
LGFRDSDENELPSTYFSVTQYGAAGNAGSFTQLVIKPGATNVVTGLTYYCASHAGMGGTI
NLTSVGGATNYGTDGLATVVVATNAVSTVTVTTGGSGYQQGDSLTFAGIQLGGDGAVLSG
GVALTVSAATYNGVVTDVTVTDNGTGYEDGDVLTASTASIGGTGSSFQYTLSQDSGAISG
VAISAYGSGYTSGDVLTLPGSLTASTTVALVDDEPVITVSNLASSGIQVGYTITGATGIP
NGAVIQGVDTDTNTIAIDVDTTGTGTSNATYTPPWGAQTGATEFQYTIGNIGPVNSVTIT
DGGAGYDVSDVLTVSPSELSASINYAVTVGLVQTLTFSGTVADSAISVGDNLKVPDGAVT
SVTPAGNAGTPDGSYTAIAATGGSGSGATFDVTRDGLGAIDSVTASDGGGGLGYTSGNTL
TLAGALVGGADITLTVDEVTVSTLLPVYKVASTGGNIDSVTILAGGLAAAAVLQKDGTNN
TYTVATATADSNGFFLNGDFTPEFTIYEGNAYVFDYTSIVEEYDFALSESPDGSNTTVTG
ITSVATLGSTTLTVSSTAGIIPGMGVSVTAGDGAFPIGTIVESINGSDITVSANPSLGGA
VTLTFTGSSFLEGVTTVNGILTLNVNANTPDLYYFSPLNPGFGGNALLTFDANNPRVFGD
GAEFTVTSVLTQDLIKGEVASGNLLAESATITTNLNAVNLAASESVTALTATLTTLNATN
IQGSIISLSSSQTNINSIFNFGNGQLTIESATGDFTTAGELKTSGQLNVNDSLLVNSNVI
SAAAGLDIEFAPPVNQVAKVDASTAFGIASGSESDKPVTSYNGYIRFNTDSNQYEGYSES
NSSWSSLGGVRDLDGNTTILAEETVGADDNTLWFIQDGTNTLKFTPNYVEFIGVKKLKSL
NINAPAFEEWRANTSVDVGDYLKYGNDVYEVTGAGTTATSGNEPNDTSGNPFTNGSATLV
YNTTAVAPITIEETSEFRIAPQGGTDFVVNGELRFSGNKFSSDVSDIEIAPNSGQKVFIN
ATTSLVIPVGDNNSKGNPAQGAIRYNTDDTTFEGYDGVQWGSLGGVKDIDGDTLIKPESV
PNADEDTLFFVNANSESMRLTTNELQFDSVSTITSTTSNSLNITAGTLFLGNNTDTTLDN
TSSTSTFLHTSKEFFDIGLSVGLNVDPLLRLNDNGDILYNLGFGTASFSGVTLLDTDLRS
FELAHTRQFTTKYSLTKGTINQGAAILYNPTTDEAAKVTITAHDINSTHKEILEFTVIDR
GSDIFYTEIGNIKTGQEIISAEFDFNASGEVRVTTTLDSALINTNLINVTVVSQIIKK
NT seq
4857 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagcagttaacgtcgctaaatcggacacctttgaaattcaaaggcaaaaaatcaat
actattggatcgcagatcttttctatctccgctggtggaagtgacctatcgactggtatt
ctaaagttaggtgatggaactaaagatgctccgtcactagcatttactaatgatgcttct
cttggtttcttcaagtcgaatcttggagaattggcatttgtttccactagcaaaaaagtt
tttggatttgactcatctagtcaagttgcatttcaagattttattgtcagaaagaaaagt
ctagaaactactggtatttcgatctcaaatactggtgctgggtatgatgaaggaacttat
acaggtgtaacttttattggtggcacaggttctaatggagttgtcactattgttgtaact
ggatttgtaggaactgttactacagaaggtgataattataatccaggagcatataatgga
gtcattcttgaaggaggaacaggatcaggagcaactttctcttttaatgttaatgctacc
cttggttctattacagatggaggatcatctttatcaccaggaatttatgcaaatgttcct
ctaacaaatgtttctagtagcggatctggcgcagaagcaaccgttactgttactggaact
actgatttaacaattggtattactacatcaggatctggtttaagtgatgaaacttacaca
gatattcctctactcaatactccagatcagacatttgttgtaacatctattgctaatcct
ggaacccctcctccagacaacgtattttcaattgacggaactcagcaagcaacactttct
gttgtagaaggaagaacatattggtttaatactagtgattctagtgtagagactcatcct
cttggttttagagatagcgatgaaaatgagttgccatctacttacttttctgtaactcag
tatggtgctgctggtaatgcaggatctttcactcaattggtaattaaaccaggcgcaaca
aatgtagttacaggactgacatactattgcgcttcccatgcaggtatgggcggaactatt
aacttgacttcagttggaggtgcaactaactatggaactgatggattggcaactgttgta
gttgctacgaatgcagtttctactgtcactgtaactactggtggatctggatatcagcaa
ggagattctttgacctttgctggtattcaacttggtggtgacggtgctgttctatctggt
ggtgttgctctaacagttagtgctgctacttacaatggtgtggtaactgatgtcactgtt
actgacaatggaactggatatgaggatggtgatgttcttactgccagcactgcatccatt
ggaggaacaggatctagtttccaatacacactgtctcaggactcaggagcaatttctggt
gtagctataagtgcatatggttctggatatacatctggagatgttttgacacttccaggt
tcacttactgcaagcaccacggttgcactagtagatgatgaacctgtaattactgtttca
aacttagcatctagtggaattcaagttggttatacaatcacaggtgcaacaggaattcca
aacggagcagttattcagggagtggataccgataccaatactatcgcaattgatgttgat
actactggaactggaactagtaacgcaacatatactccaccttggggagcacaaactggt
gcaactgaattccaatacactattggaaatatcggtccagtaaattcagtaactattact
gatggtggtgcgggttatgacgtttcagatgttctgactgtttctccatctgaactatct
gcaagtattaattacgcagttactgttggtcttgttcaaacactaacatttagcggaacc
gtcgctgatagcgcaattagtgtaggagataatctaaaggttcctgatggtgctgtcact
tcagttactccagctggtaatgcaggaactcctgatggttcatacacagctattgctgct
actggtggatctggtagtggagcaacatttgatgtcactagagatggtcttggcgctatc
gatagcgtaactgcatcagatggtggcggtggactaggatatacatctggtaatacctta
acccttgctggtgctttggttggtggtgctgatattactctaactgttgatgaagtaact
gtatcaactctgcttcctgtatataaagtagcgtcaactggtggaaatattgacagtgtt
actattcttgctggtggtcttgctgcagctgctgttcttcaaaaagatggaaccaacaat
acatatacagttgctaccgctactgcagactcgaatggattctttttgaatggagacttt
acaccagagtttactatttacgaaggtaacgcatatgtctttgactatacttctattgta
gaagaatatgactttgctctatccgaatctccagatggatctaatactacagttactggt
attacttcagttgcaacactaggaagcactactcttacagtatccagcacagcaggtatt
attccaggaatgggagtttcggttactgctggtgatggagcattcccgattggaacaata
gttgagtctatcaatggaagtgatattactgtatctgctaatccatcactaggtggtgct
gtaacactaacattcactggatcatcattcctagagggcgtcacgacagtcaatggtatt
ttgactcttaatgtaaatgcaaatactccagatctatattacttctcaccactcaaccct
ggatttggtggcaatgctcttctgacgtttgacgcaaacaatccaagagtattcggtgat
ggagcagaatttacagtaactagtgttctcactcaagatctaatcaagggagaagtagca
tcagggaatctgctagcagaaagtgcaactattactactaatctcaatgctgtaaacctt
gctgcatcagaatcagtaactgcgttaacagcaacactaactaccctgaacgcaacaaac
attcaaggtagtattattagtttgtcatcttcacagactaatatcaattctatttttaac
tttggaaatggtcaactgacaattgaatctgcaactggagattttacaactgcaggagaa
cttaaaacatctggtcaactgaatgtaaatgattctctgcttgtaaattcaaatgtaatc
agtgcagctgctggtcttgatattgaatttgcaccgccagtaaaccaagttgcaaaggtt
gatgcatcaacagcatttggtattgcttctggttctgaatcagataaacctgttacttca
tacaatggttacattagatttaatactgatagcaatcagtatgaaggttatagtgaatca
aatagttcttggtcttctcttggtggtgttcgtgaccttgatggaaacacgactattctt
gctgaagaaactgtaggtgctgatgataacactctatggtttattcaagatggcacgaat
actctcaagtttactccgaactatgttgagtttattggtgtcaagaaactaaaatcattg
aatattaatgctcctgcttttgaagaatggagagcaaatactagtgtagatgttggtgat
tatctgaagtatggtaacgatgtttatgaagttactggagcaggaacgacagcaacatct
ggaaacgaaccaaatgatactagtggcaatccatttactaatggaagtgcaactcttgta
tataacacaactgctgttgccccaattaccattgaagaaacttcggaatttagaattgct
ccacaaggtggaactgattttgtagttaatggagaactaagattctctggtaataaattc
tcgtcagatgtttctgatattgaaattgcacctaactctggtcaaaaggtattcattaat
gcaacaacatctctcgtaattcctgttggtgataataattctaaaggaaatcctgctcaa
ggtgctatcagatataacactgatgatactacatttgaaggatacgatggtgttcaatgg
ggttctctgggaggagttaaggatattgatggagacactctaatcaaaccagagagtgtt
ccaaatgctgatgaagatactctatttttcgtcaatgcaaattctgagtctatgagactc
actacaaatgaactacaatttgattctgtaagcactattacatctactacatcaaatagt
ttgaacattactgcaggaactttgttcctaggtaataatacagatacaaccctagacaat
acttcatcaacttcaactttcctacatacatctaaagaattctttgacattggtctatct
gttggtttaaacgtagatcctttgttgagactaaatgataatggcgatattctttataac
ctaggattcggaacagcatcatttagtggagtaactttattagatacagatctgagatca
tttgaactagcacacactagacagtttactaccaaatatagtctgactaaaggaactatt
aatcaaggtgcagcgattctatataatccaactactgatgaagctgcaaaagttactatt
actgcacatgatataaacagcacacacaaagagattcttgaatttactgttatagataga
ggatctgacatcttctatacagaaattggtaatatcaaaactggtcaagaaattatcagt
gctgagtttgactttaacgctagcggtgaggttcgcgttaccacaactctagattctgct
ttaatcaataccaacttaatcaatgtaactgtggtttcgcaaatcatcaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system