Viruses: 10328993
Help
Entry
10328993 CDS
T40000
Symbol
Syn1_101
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn1; tail fiber protein
Virus
444861
Prochlorococcus phage Syn1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
10328993
NCBI-ProteinID:
YP_004324472
RS:
NC_015288
UniProt:
E3SPI6
LinkDB
All DBs
Position
NC_015288:92430..102572
AA seq
3380 aa
AA seq
DB search
MSFKFNSDREQIRAISPSLIGGSELTIRGGVGSNEREILRTLLDPGTSLPRVGINRTGQR
IDNISVTNPGGGYTDIPTITVAPPPIGGVQSFASAQISEGRLVGVVIDNPGSGYTSAPAV
SISGGNGVGAAATAFLDTVDFELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIENLVTPDAQYRAP
NLKTFINNTGVPWARDTFIQENTFVYRGANVYQSLNEGTTDSNPLNPPIHSDGIVLNGND
LDDAIPGVQFKHIGFRVSNPNEVYYNETGEAGLYPRSITPLLGDKSDKIATTEYVLNLAT
NDVGGRVYVSQQIGNDENDGRSAVAPVRTIKKAAQIAWTTPGIKETLIVSGGNYVEDNPI
SLPPDCSVVGDNLRLVIIRPNNPRKHIFKFGDKNYVTGVTYRDYVDSDGDEQHTWDFAMV
FDDKQRVTYDYDVNGDFGTSFPVGHQVFGEQIFRATFQSNTGLQNLTANQTLRGENAGGL
ILSRNVNFDLVSGPSAYITGSFDFVVTNGSVSTGETLFFAGAGSQRFQINTAYDLNDLVW
TEDHLYQVTVAGTSSTSNPTHDTGAVTNGTAEFTYLRDTYSLVTTDIISIRAEGEVVFED
TDIQSVLPIFRIDFSQQGQAAIASGGFGDYGTPEDLGGIIFYTNPLVEDDNIHDFKEGQT
IEITGMPTSAPDLSALNGKQRIYKVIEDPDGRSRRFVIPKKYPSLTNDNFTGFSLDASVK
SYAKSVTFSLLNSPFEFNEATPVARRFQDAGLQIKNNREFIADEVVGRINDEFKKDYFAA
YEIGGTPTTTLTPTNTTYNPATGIATFTVASHGLSDGDGVRIVDGSITFTCAMDGNKTEH
SYPDSHHYSSGKSLPVENATTNTFELNVGISGPDQQFTPITASYNPATGDLVLDLDTAHG
LSVGEGIVIADNSLSFTCSMDNYDSTKTYPRPGIDPYAGRSIPITAVPSDTEITLNVGIS
GPNKTFTPTNATYDPVTGDMTVTVGQHGLGVGRGIVIENNSFTFTCATDGNAEQKTYPRS
GEDPYADGKSIPITAVGSTSHTVTNATYNPVSGIVELTIPSHGFTQGDYIKLDDLSLVFS
CELDGNVTNKAYPRAGYDYPSGRWLQISEVAANTFRIDIGSSSYTGAHTFVSAVSNGLKL
QDGTFTVNVGAISSPSDQSAHTFVTAQTNAIRHNPQSAHTFQGATSNAIKHLPQSAHTFI
RSAPDSLVVGGSEFKIFLGTSRFIHEYVSGGTVTFGGTTANITNFVYDNVINGTAVVSMD
QSLGALAEDDIVQIADITLRCVVNGVTTEKTYPSFNIPVSDDKCRRDIRHFLNALVEDLE
FGSNNNIVSAARRYVDGTTTQIDFVDNEIIQTVRAIEYARELAIFAMSKWRTGNRTPTDP
VYTPQYSTLPRYFDATIIDDGQSPACANVASAIDTLSYLFVDVLANDSSGTVLDAAYLIA
RNRHHIADEAYNLAITNYPSLGLINIDERKCRRDINFILSGWIRDLVLGGNSGTVTNAEA
YFNGGQLAGIPQSELGATLFAFEKTRDLAIAAMRNWKTATGTSYPAATHTPIPRFTDATI
LADPNGNPLCADVESSITTLHALLEDILDSTIAPGATTKNTGTLFDIAGIINYADSTITD
ARGNIITVKSTFDDYPIIEASPYTQNASIISRLGGSGALIDGSKVKQPNCPRAGLTQLGE
AKFPNQGKSMVAAAFTIVAEGGIGYKIIEDGYVQLVSVFCIFCQDGVLAESGGYASITNS
ATNFGIFALRSRGFRREAYEFDVATINNVSSTPTGRTIFSVSGLGREPLEHYVVKIDGYE
NANPDIEYFVDVVEGVTVGPPFSAQITLESGSGGSAEFRDLSNNAIVSLASLVGETVRLH
RPSIVNSSSHTWEYAGSGTSYLALPENGGTKVESNEQVSEDYGRTYVSGTDELGDFKVGT
FARIENRTGNITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDNSNTLGGANTTDSKLPTQKAVK
DFVTNNLGPFINKPYSTNPVPRALVELTDSGKISEDQIPPLRPFQVYTVGPGERTTVEGA
LAGDIAIEQSTPPVSFILNNDNDSLFLGFPVDSTLSFTIGDIFTGDLSGGKIQATEYRTG
VLYQINLTDSGSGYITPPVVTIAGTTQAGGIQAAATTQIANGQVVLIEIVAFNGFIGGKG
YTSAPTITIAAPAGSGTQATAVGLIESRLYGDIVNNIKITDTDDIESSDLPAETINITRV
TNTSGSNTLNWISLSSDAISANQITSGIISTARLASNASGETSAANSFTFLRGDQAYAPA
VQTMKGPETRYFGILKTTASTNASQLVFEGSTQFGLGHDVKNNVVGIQADTNIDGILTEN
GETTVSIDKFLTATLPAGTVVEFDRGASPITFESSQTQGEFVDSIVIQNGGSGYDNGPFF
NVPIGGGNGTGLRANIFTTNGAVTGVTIVSGGSDYGQNTQAQSVDFICDIPSELGTNGTG
LVLLAKVTTVLRQYANVAIDINRVTNQTLNQDDFGTLGVARFKKSQFVIGVSGNGSVEIN
TGPDSGLDADTLDGAQGAFYLNAGNLNAGFLKIERLSGTYNIGISGRSGSTIKLITSTNS
PTGNLAPNEFSEGVICDTKNNSADGLFDGGTRHMVMTFRAGGSDIDATFGGVRQLAITDG
SPLNGGNLWLRGSHTSPANAFGGWNLLWHSGNDGIGSGLDADRLDSRQGSWYQNAVNINE
GILANNRIPVHQTARDFNEKIRIVDWTGTPRYQMLIRDELLGGAAPFLPGQSVNLYDAGD
NGVGSISISKVTPYQDVNDSSNNFTIIVGSLTTGDFVDSNGNTIAKFIGTGGVANAYEFQ
DWSISNLDDNADGDVDGTFEVIDMLSDGGNARLKLGRIDGQQSSDPSIYFRSSQSPASNY
NSAFIASGGNAGDGSGSLELKVADEYAFTINGNYFWNQANIAFNATNIAPTTNNQGVITV
RSGVMRDVNGNFEAGTITADLTGAASENVLKAGDTMSGSLTIGGVTAANQALEVSGRADF
LSNITVGDDLTVGSDVFHVDATDNAVGFGTSTPDTGIPIHVFKGSVTNDSIATVMKLETT
RGDFVSTPGGSQIMFKNQDGNNSPNEAFIQAVTVNANTYGDNDEANTNFIFRQTNGGTAQ
DNMIITGDGRVGINEMNPTEKLHVAGNIKVDNSITAIEGLTLGTTANNDEAPIYFLGNTG
GLVGGGPDQLSNFRMGNGILSGDIFEITANDGTVGATSWKSTPALAIQGTNNRVAINTDS
FQGNDPEDNTLRTYTLNIEGDVNFNGTLFQNNGEFVTSRWTEAPNEADIYRPSFVGINFQ
TDRNPEEALEVEGNIEVSGNLQINGDVQWIDTYGVIRTTRQTIDEDISIANSTNALSHGI
VNINNTRTVTVGAGAIWTIV
NT seq
10143 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagctttaagtttaattctgacagagaacaaataagagcaatctctccttctcttatc
ggaggcagcgaactcactattagaggtggggttggatctaatgagagggagattctcaga
actctacttgacccaggaaccagtttgcctcgcgttggtatcaaccgaactggtcaaaga
attgataatatttctgtaactaacccagggggaggttacaccgatatcccgacaatcact
gttgcaccacctcctattggtggtgttcaatcatttgcgtctgctcagatttctgagggc
agacttgttggtgttgttattgataatcctggtagtggatatacatctgctcctgctgta
agtatcagtggtggaaatggtgtaggtgctgctgcaaccgcatttctagacacggttgac
tttgaacttgacattaatggtgctatcagaacatctacgtctatcatttctgatacggcg
cgaattctaaacctagacattgaaaacctagttactcctgacgcacaatacagggcacca
aatctcaaaacattcattaacaatacaggtgttccttgggcgcgtgacacatttattcag
gagaatacttttgtatatcgtggagctaatgtttatcaatcactgaatgaaggaacaact
gattcaaatccactgaatcctcctattcatagtgatggaattgtattgaatggtaacgat
ctggatgatgctattccaggtgttcaatttaagcacattggtttccgtgtatcgaacccc
aacgaagtatactacaacgaaactggagaggctggtctctacccaagatctatcacccct
ctcttgggtgataagtcggacaaaattgctactacagaatacgtcctcaacctagcaaca
aatgacgttggtggtcgtgtctatgtttctcagcagattggtaacgacgaaaacgatgga
cgttctgctgttgctcctgttagaactattaagaaagcagcacaaattgcatggactaca
cctggcattaaagaaacacttattgtttcgggtggtaattatgtagaagataacccaatt
tcactgccaccagattgctcagttgttggtgacaacctgcgtctggttatcattagacca
aataacccaagaaagcacatctttaagttcggtgacaagaactatgtcactggtgttact
tatagagactatgttgactcagatggagacgagcagcatacatgggactttgctatggtc
tttgacgataagcaaagagttacttatgactatgatgttaatggagattttggaactagt
ttcccagttggtcaccaagtttttggtgagcaaatttttagagcaaccttccagtcaaat
actggtctacaaaatctaactgccaaccagacactaagaggtgaaaatgctggtggtctg
attttatctagaaatgtaaactttgatttggtatcaggaccatctgcgtatataacagga
tcatttgattttgttgtaactaacggttctgtttcaactggcgaaacactattttttgct
ggcgcaggatcacaaagattccagattaatactgcatacgatttaaatgatcttgtatgg
actgaagatcatctatatcaagtaacagttgctggaacatcatcaacaagtaacccaaca
catgacactggtgctgtaacaaacggaacagctgaatttacatatttgagagatacttac
tcattagtaactactgatattatctcaattcgagctgaaggtgaggttgtctttgaagac
actgatattcaatctgttcttcctatttttaggattgacttctctcagcaaggtcaggca
gcaattgcttcaggtggttttggagactatggaacaccagaagatcttggtggcattatc
ttctacacaaacccacttgtagaagacgacaacatccatgactttaaagaaggtcagacg
atcgaaatcactggtatgcctactagcgcaccagatctatctgctttgaatggtaagcaa
agaatttacaaggttatcgaggatcctgatggcagatcaagaagatttgttattcctaag
aagtatccatcactaacaaacgacaacttcacaggattttctcttgatgcttctgtcaag
tcatatgccaagtctgtaactttctcccttctaaactctccatttgaatttaatgaagca
actcctgttgcaaggagattccaagatgctggtctgcaaattaagaacaatagagaattt
attgcagatgaagtagttggtcgcatcaatgatgaatttaaaaaagattacttcgctgct
tatgagattggtggaacaccaactacaacattaacaccaacaaatacaacttataatcct
gcaactggtattgcaacatttactgttgcaagtcatggtctctcggatggagatggcgta
agaatcgttgatgggtctatcacgttcacttgtgccatggatggcaacaagactgagcac
tcatatccagattcacatcattattctagcggcaagtctcttcctgtcgaaaacgctact
acaaatacatttgaacttaacgttggtatatctggtcctgaccaacaatttactcctatt
acagcgtcatataatcctgctacaggtgatctagtcttagacttagatactgctcatggt
ctctctgtaggtgaaggtattgttattgccgataattcattgtccttcacttgctcaatg
gacaattatgattctaccaaaacatacccacgtccaggtattgatccttatgctggtaga
tcaattcccatcacagcagttccatctgatactgaaattaccctaaacgttggcatttct
ggtccaaataaaacattcaccccaactaatgcaacgtatgatcctgtaactggtgacatg
actgtcactgtgggtcaacatggtcttggagtcggtcgtggtattgttattgagaacaac
tcatttacatttacgtgtgcaactgatggcaatgcagaacagaagacttatccacgttct
ggtgaggatccatatgcagatgggaagtctatccccattactgcggttggaagcacatca
catacagtaactaatgcaacttataaccctgtatctggtatagtcgaactgactattcca
agtcatggatttactcagggtgattatattaaactagatgatctttcactggtcttctct
tgtgaactagatggtaatgtaactaataaagcatatcctcgtgctggatatgactatcca
tctggtcgctggttacagattagcgaagtagcagcaaatacatttagaatcgatattgga
tcttcatcttatactggagcacacacttttgttagtgcagtttctaatggtctgaaactc
caagatggaacatttactgttaatgttggtgcaatctcaagtccttctgatcagtctgca
catacctttgtaactgctcaaactaacgcgattagacataatccacagtctgctcatact
ttccaaggtgcaacttctaatgcaatcaagcatctaccacagtctgcacatacattcatt
agatctgctcctgattcactagttgtaggtggttctgaattcaagatcttcttaggaact
tctagatttattcatgaatatgtaagcggaggaacagttacatttggaggaactacagca
aatatcacaaactttgtttatgataatgttatcaatggaactgctgtcgtttcgatggat
cagtctctaggagcactagcagaagatgatattgttcagattgcagatattacgctgcgt
tgtgtcgtcaatggagtaactacagaaaaaacttacccaagtttcaatattccagtcagt
gatgataagtgtcgtagagacatcagacacttcctcaatgcactagtagaagaccttgag
tttggaagcaataacaatattgtttctgcagcaagaagatatgtagatggaacaaccact
caaattgatttcgttgataacgagattattcaaactgttcgtgctattgaatatgctaga
gaactagctatctttgctatgagcaaatggagaactggaaacagaactccaacggatcct
gtctacacacctcaatattctactctgccaagatattttgatgccactatcattgatgat
ggacagtcacctgcttgtgctaacgtagcatctgctattgataccctatcgtatctgttt
gttgatgttctagcaaatgattcttcaggaactgttctggatgctgcatatctgattgct
agaaatagacaccatattgcagatgaagcatataacctcgcgattactaattatccatct
cttggtctcattaatattgatgagcgtaagtgccgtagagatatcaactttatccttagt
ggatggattagagaccttgttctcggaggaaactctggcacagtaactaatgctgaagca
tacttcaacggtggtcaacttgctggcattccacaatcagaacttggcgcaactctattt
gcttttgaaaagactagagatctagcaatcgcagcaatgcgtaactggaaaactgctaca
ggaacttcatatcctgctgctacacatacaccaatcccaagatttactgatgccactatc
cttgctgatcctaatggaaacccactatgtgctgatgtagaatcaagtatcacaactcta
catgctcttctagaagatattctagatagcacgattgctcctggtgctacaacgaaaaat
acaggaactctatttgatattgctggcataattaattatgcagatagcactatcactgat
gctagaggcaatatcatcacggtcaaatcaacttttgatgactacccaattattgaagca
tctccatatacccagaacgcttctatcatctcaagacttggtggcagtggtgctctgatt
gatggttctaaggtcaagcaacccaactgcccaagagcaggtcttactcagctgggagaa
gcaaagttccccaaccagggtaagtcgatggttgcagctgccttcactatcgttgctgaa
ggtggtattggatataaaattattgaagatggttatgtgcagttggtttctgtcttctgt
attttctgtcaagatggtgttcttgcagaaagtggaggttatgcatctatcaccaactcc
gctaccaactttggtatctttgctcttagatcgagaggatttagaagagaagcatacgag
tttgacgttgctactattaataatgtatcatctactccaacaggaagaactatctttagt
gttagtggtctcggaagagaaccacttgagcactatgttgtcaagattgatggttatgaa
aatgcaaacccagacattgaatactttgttgatgttgtagaaggcgttactgttggtcct
cctttctctgctcagattactcttgaatctggttctggtggtagtgcagaatttagagat
ctttctaataatgctatcgtcagtcttgcatctctagttggagaaactgtcagactgcac
agaccatctatcgttaactcctcctcacacacttgggaatatgctggttcaggaactagc
taccttgctcttcctgagaacggtggaactaaagttgagtctaacgaacaagtctccgaa
gactatggtagaacatatgtttctggaaccgacgaacttggcgactttaaggttggaact
ttcgcaagaatcgaaaacagaactggtaatattacctttactggaacggttaccatctcg
gaagttgaattcttgaaactgaaaggtggtgacgttgttgttactggttttgataacagt
aacacacttggtggtgctaacaccactgactctaaactgccaactcagaaagcagtcaag
gactttgttacaaataacctcggacccttcatcaacaaaccatactctacgaacccagtt
cctagagctctggttgaacttactgattcgggtaagatctccgaagatcagattccaccc
ctacgtccattccaggtttatactgtaggaccaggagaaagaactacagttgagggagca
cttgctggtgatattgcaattgagcaatctaccccaccagtgtctttcattctgaataat
gataatgatagtctgtttcttggattccctgttgattctactctatcatttactattgga
gatatctttactggcgatttgtctggaggtaagatccaagcaactgaatatagaactggt
gttctctatcaaattaacttgaccgattctggttctggttatattactccacctgttgtt
acgattgctggaaccactcaagcaggtggcattcaagcagctgctactactcaaatcgct
aatggtcaggttgtcctgattgaaattgtagctttcaatggttttattggtggtaaagga
tatacctcagcacctacaattaccattgctgctcctgctggatcaggaacacaagcaacc
gctgttggtttgattgaaagtagactttatggtgatattgtcaataacattaagattacc
gacaccgatgatattgagtcaagtgatcttcctgcagagaccatcaacatcactcgcgtt
accaatacgtctggtagcaatacacttaactggatttcactatcatctgatgccatctct
gcaaaccagattacatctggtattatctcaactgcacgtcttgcatctaacgcatctgga
gaaaccagtgctgctaactccttcactttcctaagaggtgaccaagcatacgcacctgca
gtccaaacaatgaaaggacccgaaacaagatatttcggtattcttaaaacaacagcttct
actaacgcatctcagttggtatttgaaggatcaactcagtttggtctaggtcatgatgtc
aagaataatgtagtaggtattcaggcagataccaatattgatggaattctaacagaaaac
ggagagacgacagttagtattgataaattcctaactgcaactctacctgctggaacagtt
gttgaatttgatagaggtgcttccccaattacattcgagtcttcacagactcagggtgaa
tttgttgattcgattgttattcagaatggcggtagtggttatgataatggtccattcttc
aacgttcctatcggtggtggaaatggaactggactgagagcaaatatctttacaaccaac
ggtgcagttactggagtaactattgtttctggtggttcagactatggtcagaacacccaa
gcacaaagtgttgactttatctgtgacattccatctgaacttggaactaatggaactggt
ctagttctccttgcaaaagttactactgttcttagacagtatgctaatgttgctattgac
atcaacagagttactaatcaaactttaaaccaagatgatttcggaacacttggtgttgct
agatttaagaaatctcagtttgttattggagtgtctggaaatggttctgtagaaattaac
actggacctgactctggtcttgatgctgatacacttgacggcgcacagggtgcattctac
ttgaatgctggtaatttgaacgctggtttccttaagattgaaagactttctggaacatat
aacattggaatttctggtagatctggttctacaattaaactaatcacatcaaccaactct
ccaactggtaacctggcacctaacgaattcagtgaaggtgttatttgtgatactaagaat
aactctgctgatggtctgtttgacggtggcacacgtcacatggtaatgacctttagagca
ggtggttctgacattgatgctacatttggtggtgtcagacagttggcaatcacagatgga
agtcctctaaatggtggtaacctatggttgcgtggttcgcatacaagtcctgctaacgca
tttggtggttggaatcttctctggcattctggaaatgatggtattggatcaggactagac
gctgaccgtttggacagcagacagggttcctggtatcaaaatgctgttaatatcaatgaa
ggaattcttgcaaataacagaattcctgttcatcagacagcaagagatttcaatgaaaag
attagaattgtagattggactggaactcctagataccaaatgctaattcgtgatgaactt
cttggtggtgccgctccattcttgcctggacaaagtgtaaacctctatgatgcaggagat
aatggtgttggttctatttccatatccaaagtaactccttatcaggatgtaaatgattct
tccaataacttcacaattattgttggtagtttaaccactggcgatttcgttgattctaac
ggaaacactatcgctaagtttattggaactggtggcgttgcaaacgcatatgaattccaa
gactggagtatctccaacctagatgataatgctgatggagatgtagatggaacgtttgaa
gtcattgacatgctttcagacggtggcaatgctagactgaaattaggtagaattgatggt
cagcagtcatctgatccatcgatctatttcagatcttcacaatcacctgcatctaactac
aactctgcattcattgcatctggtggtaatgctggtgatggtagtggttctctggaactg
aaagttgctgatgagtatgcattcactatcaatggtaactatttctggaaccaagcaaac
attgccttcaatgctaccaatattgctcctacaactaataatcaaggtgttatcactgta
agatctggcgtaatgcgagatgttaacggtaactttgaagcaggaacaattacagcagac
ctgactggtgctgcttcagaaaacgttctgaaggcaggcgacaccatgtctggttctttg
acaattggaggtgttactgctgctaaccaggcactggaagtttctggtagagcagacttc
ttgagcaacattactgttggtgatgatctaacggttggatctgatgtcttccacgttgat
gctacagataatgctgttggtttcggaacttcaactcctgatactggaattccaattcac
gtattcaagggaagtgtcactaacgacagcatcgctacggtgatgaaactggaaactacc
agaggcgattttgtcagcactcctggtggttctcagattatgttcaagaaccaagatggc
aacaactcacctaatgaagctttcattcaagcagtcaccgtaaatgccaatacatatggt
gataacgatgaagcaaataccaacttcatcttcagacagacaaatggtggcacagcacaa
gataacatgatcatcacgggggatggtcgtgttggtatcaatgaaatgaacccaaccgag
aaactacatgttgctggaaatataaaagttgacaattcaattacagcaattgaaggtctg
acacttggaactactgcaaataatgatgaagctcctatctacttcctaggaaatactggt
ggtcttgtaggtggtggtcctgatcagttgagcaacttccgtatgggcaacggtatcctt
agcggagacatctttgagattactgctaacgatggaactgttggtgctacttcttggaag
tcaaccccagcacttgctatccaaggaaccaacaacagagttgctatcaacactgattcg
ttccaaggcaatgatcccgaagacaacaccctcagaacttacactctaaatattgagggt
gatgtcaacttcaacggaactctgttccagaataacggtgagttcgttacttctcgttgg
actgaagcacctaacgaagcagatatctacagaccatcgtttgttggtattaacttccag
actgatagaaatccagaagaagcactggaagttgaaggtaacattgaagtcagtggaaac
ctacaaatcaatggagatgttcagtggattgatacttacggtgtcatcagaacaactcgt
caaacaattgatgaggacatttcaattgcgaactcaaccaatgcattaagtcacggtatt
gttaatataaataataccaggactgtaacagttggtgctggagcaatctggacaattgta
taa
DBGET
integrated database retrieval system
