Viruses: 10329105
Help
Entry
10329105 CDS
T40000
Symbol
Syn1_217
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage Syn1; virion structural protein
Virus
444861
Prochlorococcus phage Syn1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Sialidase
PQQ_2
SBBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10329105
NCBI-ProteinID:
YP_004324583
RS:
NC_015288
UniProt:
E3SPU7
LinkDB
All DBs
Position
NC_015288:complement(173627..177700)
AA seq
1357 aa
AA seq
DB search
MPVGFNSPARNFFLLGSSGLDIVTNFFKTIVTPDQNFDAVYRAEEIRYDYNSDTYTLAGW
GQDNNSTEYGWVENRNYNTATGGSTETWRNLVKSSIANNDLRINALEVDNGYKVVAVGLA
NDFPFIARYDGLNGTLDFQSTSNSGDVNYTGIAVDINQNYYACGNTSAADQIAYVEKYDS
NGNPGWGKSASYEFSNVTLEKISVNSKGEVVAVGTVFDDAGTKGYIVKLDSSTGDVLWDK
TLERSSENQTLDIVLPTAVYIDSADFIYVVGRFEDTTSDKSFIIKYSPEGNLLWQRETVA
GGNPLEYYEVKADGNTGQIIVFGRYFDTFNNDEMGLLTKYSRSGDLVWRRTIKSSYNQAL
NFGFEGGAGIALDFDASFYYLLFTDDILSVAGRTPETYTFGKVSSSGNGLGEFVYNDGLG
ENMTYTIIEIPDRIGRIQDGSVRIETSGLISYPFNANKLLFDDFATSLANKKRQLKDDNV
FQYSGSPAIRVADFQELNLLGDVYSGSGDWLDQSGKGNDGYTSTGEPFYGGGGVLFDGDG
DYLQIVRGSNTDLAFGTQDFTIEFFANFTKTGMRIMSTGDNGNYTTGGWVFETNNQFGVA
DSAGNFAYYGTFTYPTNSWAHISVVRNGSNIYGFVNGVQQWSNTISTNITFSGTNDFSLG
TGRSGSSGLGAYNLSSSFMVEGAISNLRIVKGTALYTANFTPPTTSLTAIAGTELLICQG
NTIADASSNNFAITVNGNPSDTIDGPTHNAAGYWEFDGVDDDIIVNNPDLHYEEMSFEWW
LWNDTTQSINTYIGKRNNSSNGYMIFRWNGGRLFFDYGGAVNRWDTGWVVPNTQWVHCVL
TRDGNGRKLYVNGVEEASSILPGDYITSTLGVGIGDISSADNYYTDGRIGEVRIYPRALT
AAQVFQNYNATKSKYINEAPDTAPKIGPGIVYDSNLLLNYDFGNRATYDRAENLLKYSEQ
VDGLNYTNPDWGRNGSIDFEYPTDILSPFGTSGVSKFTRTGGGTVYVAQDSFATLEAGKQ
YTFSLYIKKGTSGKFGLELGDGGDNIRTNFDIDTLLFSNTSATQDFTSLDETGYTDLGNG
WYRIWITGTVSASPSGGIFAGDGLVNVALYFTANNVGEYGYVWGAQVNEGGIGRYIKTTT
FPITAPTTVKNLSNNLYTATMGVIGNAPDFNSTGYFSFDATNDEVIALDGTVTDPFPKPT
NPSIEVWGWKSNWDDGAEGRIASCTQGGGYQIGVGETLMGSANVGSIMYVNGVYAVTQYA
RSNLSSGWHHFVGTFDGATLRFYVDGTEVDTDSSRSGNVTYPTPTDFLIGGEPGAAGFPD
TAKDLTGRVGQVRVYDRALSSTEVSQNFNATRSKYGV
NT seq
4074 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagtaggttttaatagtcccgccagaaacttttttcttctaggttcttctgggtta
gatatagtaacaaacttcttcaaaactatcgttacccccgatcaaaattttgatgctgtt
tatcgtgctgaagaaattagatatgattataattctgatacatatactctagctggatgg
ggacaagataataactcaacagaatatggttgggttgaaaacagaaattataatacagca
actggtggatccacagaaacgtggagaaatcttgtaaaatcatctattgcaaataacgac
ttacgtatcaatgcattagaagttgataacggatacaaagttgttgctgttggattggca
aatgattttccttttattgcaagatatgatggactcaatggcactctagatttccagtct
actagtaatagcggtgatgtaaattatactgggattgctgtagacatcaaccaaaattat
tatgcatgtggaaacacatcagcagcagatcagattgcttatgtagaaaaatatgatagt
aatggtaatcctggatggggcaaatcagcaagttatgaatttagtaatgtcacactagaa
aaaatttcagtcaactctaaaggagaagttgttgcagtaggcacagtgtttgatgacgct
ggcacgaaaggttatattgttaaacttgattctagcactggagatgttctttgggataaa
actttagaacgatcatctgaaaatcaaactttagatattgtattacctacagcagtttac
atagactctgcagatttcatctatgtagtaggaagatttgaggacactactagtgataaa
tcatttatcattaagtatagtcctgaaggaaatttactgtggcaaagagaaaccgttgca
ggtggtaatcctctagaatactatgaagtaaaggcagatggaaacacaggtcagattatt
gtatttggcagatatttcgacacctttaataatgatgagatgggtctccttactaagtat
agtcgcagtggagatcttgtttggagaagaactatcaaaagttcttacaaccaagcattg
aactttggatttgaaggtggagcaggtatagcattagattttgatgcatctttctactat
ctcctattcacagacgatattctaagcgttgcaggaagaacaccagaaacatatactttt
ggtaaagtaagttcttctggtaacggtctaggagaatttgtatataatgatggtctagga
gaaaatatgacatataccatcatagaaattccagataggattggacgaatacaggatggt
tctgttcgtattgagactagtggtcttatttcatatccattcaacgctaacaaacttctg
tttgatgactttgctacatcactagcaaacaaaaagagacaactcaaagatgataatgtc
ttccaatatagtggtagtcctgctattagagttgctgacttccaagagttgaacctgttg
ggtgatgtttattctggtagtggtgactggttagatcaatcaggtaaaggtaatgatggt
tatacttctactggagaacctttttatggtggtggtggtgtgctttttgatggggatggt
gattatttacaaattgttagaggttctaatacagatcttgcttttggaactcaggatttt
actattgagttttttgcaaattttacaaagactggaatgagaattatgtccactggtgat
aatggaaattatactactggtggatgggtgtttgaaactaataatcagtttggggtggca
gattctgctggtaattttgcatattacggaacatttacatatccaacaaattcttgggca
catatttctgtggttagaaatggtagtaacatctatggatttgtaaatggagttcagcag
tggtcaaatacaatatccacaaatattacattctctggaactaatgatttttctttagga
actggaagaagtggcagcagtggacttggtgcttataatttatcttcgtcttttatggtc
gaaggtgctatctccaatctccgtatagtcaaaggaacagcactctacacagcaaacttc
acaccaccaactacatcactaactgctatcgctggaacagaattactaatatgtcaaggt
aatactattgctgatgctagctccaacaactttgctatcacagtaaatggtaatcctagt
gatactattgacggacccacccacaacgccgctggatactgggagtttgatggggtggat
gatgatattatagtaaataatcccgaccttcattatgaagaaatgtcatttgagtggtgg
ttatggaatgacacgacacaaagtatcaatacttacataggaaaaagaaataatagctct
aatggatatatgatttttagatggaatggtggcagattgttttttgattatggtggagct
gttaatagatgggatactggttgggtagttcctaatacacagtgggtccattgtgtatta
actagagacggtaatggtagaaaactttatgtcaatggagtagaagaagcatcatctatt
ctccctggagattatattacatctaccttaggtgttggtattggagacattagttctgct
gataattactacaccgatggaagaattggcgaagttcgtatctatccaagagctctaaca
gcagcacaagtattccaaaactacaacgctaccaagagtaagtatatcaacgaagcacct
gacacagcacctaagattggtcctggtattgtatatgatagcaacttgctattgaactat
gactttggaaacagagcgacttatgatcgtgctgagaatttattgaagtattcggaacaa
gttgatggtcttaattatactaacccagattggggtagaaatggaagtattgatttcgag
tatccaacagatattctttctccttttggaacatctggtgtctctaaatttacacgaact
ggtggcggaactgtatatgtagcacaagatagtttcgctacattagaagcaggaaaacaa
tatacattttcgttgtatattaaaaagggaacgtctggaaaatttgggttagaactgggt
gatggtggtgataatataagaactaattttgacattgatactctgctattctctaacact
tctgccacacaagattttacttcacttgatgaaactggatatacagatttaggtaatggg
tggtatagaatttggattactggcacagtatcagcatctccctctggtggtatctttgct
ggagatggacttgttaatgttgccctctattttactgctaataatgttggtgaatatggt
tatgtttggggagcacaagtaaatgaaggtggcattggaagatatattaaaacaactaca
ttccccatcacagcaccaaccacagtaaagaacctctcaaataatctttacactgccacc
atgggtgtgattggtaatgctcctgattttaattctactggatacttttcctttgatgct
actaatgacgaagtaattgctttggatggcacagtaactgatccattccctaaacctaca
aatccatcgatagaagtttggggatggaaatctaattgggatgatggagctgagggtcgt
attgcttcttgcactcaaggtggtggatatcaaattggtgttggggaaactttgatggga
tctgctaatgttggatctatcatgtatgttaatggtgtttatgccgttactcaatatgct
agatctaatttgtcttctggatggcatcattttgtgggaacatttgatggagcaacactt
aggttctatgttgatggaactgaagtagatactgatagtagtagatctggaaacgtaact
tatccaacccctactgacttcttgattggtggagaaccaggagcagcaggatttcctgat
actgctaaagatcttactggaagagtaggacaagttcgtgtttacgacagagcactaagt
tccacagaagtatcccaaaacttcaatgccacccgtagtaagtatggtgtctga
DBGET
integrated database retrieval system