Viruses: 10329267
Help
Entry
10329267 CDS
T40000
Symbol
SSSM5_098
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-SSM5; VrlC protein
Virus
445685
Synechococcus phage S-SSM5
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DUF4815
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10329267
NCBI-ProteinID:
YP_004324701
RS:
NC_015289
UniProt:
E3SKD8
LinkDB
All DBs
Position
NC_015289:81844..89301
Genome browser
AA seq
2485 aa
AA seq
DB search
MAQNTNLNVTPYYDDFSTDKNFYRVLFRPGFPIQARELTTMQSIMQNQVENVGAHLFKDG
AMVIPGQVGYDLNVDAIMLQESFLGADVELYRTQLNDKIITGLTTGVKAKVLYSISSTES
DKGYITLYVKYIESGGDNSTQETFANNEQLITDSEITFGTTLIEVGSPFAQLLPTAALQT
GSVAYVQSGVYFIRGFFVDVPYQYILLDQYGSNPSYRIGLDIQESIVTPEDDLSLNDNAA
GTSNYAAPGAHRFRITTNLIKKLLTDDADKNFLELLRINASKVEKLVDRSAYDELEKSIA
LRTFEESGNYVVKDFEITMRENLDDGFNNGVYAAGTTTASGNTAAESKYAVEFGSGVAYV
KGYRIKRLSPAYVDLDKPRETDASQNTIIPFEMGNFTNVKNVYGFPNVSGSTITNAYQTL
ELRDALTSTPGDANGNIIGYARVASLEHVGDPDQVFGNADDQYKLNIFDVQMFSVLELST
AQTIAAGSLVVGATTGARAHLVNAISNDDTLIVYQIEGTFAQGEMITVDGENVETINALH
NYQYSDTRSFVSRDESTNAVEFTCDAILEDLELVEGSTFTYSTSSGNVATVDTISAADGA
RVAGTYTVTTYTTDGTGTGATFSIVIAGNGAATVTILKGGFGYVVNETFTVAAAQIGGAG
AALTFDVATVGPSIEGLQSNFALDLRPGDQIYFNNTQFVTVDTVTQTAINTSGIPNIFNY
GRQLVNVTAGSSPPSVGTYNTIVRYRTKLFGIENADLLSDMPKKYVKSISDESMIVRRTF
DAQTVASNSISITLPENEQFQAISDANYTLTVLAGSNSTHPVGDQITINTTSSGAIGYTT
FTSADRTTLQVDNLTNITSVKVTATISKNVTSRKTKSGNQMFVLKVNKTIKNLDKQNYNL
TYSNLYGTRIQDRDISLGLTDCYRLHAVYESNDDNDPIIPSVTLVEPTFFATGSIVIGRT
SKARAKVVDFSSGTLKLNVVYLSGVFQPGETIDGFDSNNTAINAIINDSVGSIVLGSKVV
TENYFLEVNQTGFLYDISKIVRKKGVAAPVRKLKVVVDYYTHSATGDYFGGQSYLDTNYT
DIPFFGFKFLADYLDFRPGVKNLYSGTGTVASPAFVNCSTFDFKSRVFNVSGSPNATVFD
IPKLDSNFRCDFDWYLPRVDKAFLTPDGEFQIIKGKSSESPIEPDDIRDGMLLGVISHKP
YGFDPEADVVIKRSDNKRYTMRDIGSIERRLDQVEYQTSLNMLEADTFNTQILDSSGKNR
LKNGFMVDDFGDHSKSETSHEDFAAALDFQYGSCRPSHYTTNVPLVINSTLSTNTQQTGP
LITLPYTEVKIIEQPYASRVENINPFNVFTYIGRITMTPGSDDWLDTNRLPVNVQQIEGD
FQAVSSEMNLDQNGFAPIQWRAWETNWTGERVISSTTTRNAGWLAEDVGRSPRPNVWGGR
GMRRINRTTTIQVTGQQTRSGIRTRVIPRIDRQSLGDSVLSSTSIPWIRSRNVELDCARL
KPRTRFYSFFDGKSTIDYQIPKIIEIIKDPTVDSRTNSTPFVIGETVTGLTSGCKFKVAA
PDDFYQFNPYDDTTLPTSYASTTAFLNIDTNALAEQAIGDFYGNMQVQEVLVGTSGARAV
VKDRRLISDRFGKLKASFFIPNPGVDTNPRWATGTRTLRLSTSDTDSRLAGAVASSAETQ
YEARGTLNTVQENVLAVRNAEVVRDTVTQEQSINTTRTESRQIGWYDPLAQSFIVDETGG
VFLTSVDVYFFKKDENIPVSMQIRTMENGYPTTTILPFSDVTLEPTQVQLSESAAVATRF
TFDAPVYIPQSQEHCFVLLSDSNSYQIWISRMGEIDISGDRTISEQPYAGVLFKSQNATT
WTADQYEDLKFIINRAEFSITGQSRLVLNNTALDRGNGGKLNLRSDAIQTFQPELVLTLN
STTLPYTVGARIYQKTTLAEGTVTARTVTNAGVQLTINDISGNWAAGSNTGGTIANRVVS
SKTTATMVVTSASADFTVGETITGNSSTAPTAEVVSWTAGTNTLTLKYVSSAFTASTETI
TGGTSSTTATVSSISYAGDAVESSAIQPSFPTGTPTYATTQRKIRVYHSNHCMHSAENNV
IVEGVVSEVSDTALTASISSTDTSVAVGDATAFHKIINGAAIGTTNVGYIKINDEVMSYS
AISGDNKTITVHERGLDGTTAVSHADESVVQCYNLDGIPLTEINKTHAGLGNTTLDYYEL
STSSIARLGILGGGTNIFATQNIQYSTLVPSVQRMLLPKTDITARVNTISGTSINDGITL
SQASFANDGVFSDVILGQDNDFYSPSLICSAINESSELSGAKSFRLDLTMTSEKSTISPV
IDVDRMSATLVSNRINSPSNPNTAKQAVGDEHEAVYITRVADLTNPSGSIKLYYTGYRPP
NSEIKVLYRVRPIGSSTPIDELGFEFFPSEGSKVPATTEREIYFDYEYEVSGLSFDQYQI
KVVFVSPNQALVPIIKDLRAIALAV
NT seq
7458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacaaaacaccaatttaaacgtcacaccttattacgacgattttagtacggataag
aatttttatcgagtgctgttccgtcctggattccctattcaggcaagggaacttactacg
atgcagagcatcatgcagaatcaggttgagaacgtaggtgctcacctgttcaaagatggt
gccatggttattccaggtcaggtaggttatgatctgaatgtcgatgccatcatgcttcaa
gaatctttcttgggtgctgatgttgaactttatagaactcaattaaatgataagatcatc
actggtcttactacaggtgtaaaggcaaaggtcctttacagcatctcctctacagaatcg
gataaaggttatattactctatatgtaaaatatattgagtctggtggcgacaacagcact
caagaaacttttgcaaacaatgaacagttaattactgactctgaaatcacttttggaacc
actctgattgaagttggttctccttttgctcagttacttcccactgctgctctacaaacg
ggttctgttgcatacgttcaaagtggtgtttattttattaggggattctttgttgatgtc
ccatatcagtatattcttttagatcagtatggatcaaacccctcctatcgtatcggactc
gatatccaagagtcaattgtcaccccagaagatgacttatcactcaatgataacgcagca
ggcacatctaattatgctgctcctggtgctcacaggttcagaataacaactaaccttatc
aagaaacttctcactgatgatgcagataagaacttccttgaacttcttcgtattaatgca
tctaaggtagaaaaacttgtagatagaagtgcatacgacgagttagaaaaaagtattgca
cttagaacttttgaagagtctggcaactatgttgttaaagactttgaaatcaccatgaga
gaaaacctcgatgatggttttaataatggtgtatatgctgcaggcactacaactgcctct
ggtaatactgcagcagaatcgaaatatgctgtggaatttggttctggcgtagcgtacgtt
aaaggatatagaatcaagagattgtctcctgcatatgttgatcttgataaacctcgcgag
actgatgcttctcagaatacaattatcccatttgaaatgggtaacttcacgaatgtgaag
aatgtttatggattccctaatgtttcaggttctacaattactaatgcataccaaacatta
gaattgcgtgatgcattaacatccacacctggtgatgccaatggtaacattattggatat
gcccgtgttgcatctttagagcacgttggcgatcctgatcaagtatttggtaatgctgat
gatcaatataaactgaacattttcgatgttcagatgtttagtgttttagagttatcaact
gcacagacaattgctgcaggttctctggttgttggtgctactactggcgctagagcacat
ttagttaatgctatctctaatgatgatacactaattgtatatcaaatagaaggtacattt
gcccaaggtgaaatgatcaccgttgatggtgagaatgtagaaactattaatgctcttcat
aattatcagtattctgatacacgttcttttgtctctagagatgagagcacaaatgctgtt
gaatttacttgcgatgcaattttagaagatctggaattagttgaaggtagcacatttaca
tacagcacctcttcaggtaatgttgcaactgtagatactatcagtgctgccgatggtgct
agagtagcaggaacatatactgtaactacatacactactgatggaactggaactggagcg
acattctctatcgtaattgctggtaatggtgcagcaactgtaactatccttaagggtggt
tttggatacgttgtaaatgaaacatttaccgttgctgctgcacaaattggtggagcgggc
gctgcattaacatttgatgttgctacagttggtccatctattgaaggtttgcaatcaaac
ttcgctttggatttaagacctggcgatcaaatttacttcaacaatactcagtttgttact
gttgacactgtaactcaaactgcaattaataccagtggtattccaaacatttttaattac
ggaagacaactggtaaatgtaacagcaggttcatctcctccaagtgtaggtacatataat
accattgttagatatagaacaaaactgtttggtattgaaaatgctgatcttcttagcgat
atgcctaagaagtatgtgaagagtatttctgatgaatctatgattgtcagaagaacattt
gatgctcaaactgttgcttctaactctatttctattactttgcctgagaacgaacagttc
caagcaatcagtgatgcgaactatactctcactgtattagcaggatctaactctactcat
cctgtcggtgatcaaattacaatcaatactacttctagcggagcgattggttacactaca
tttacttctgcagatagaacaactctacaggttgataacttaaccaatattacatcagtt
aaagtaacggcaactatttctaaaaacgttacttctagaaagacaaaatctggtaatcag
atgtttgtccttaaagttaacaagacaatcaaaaatcttgacaagcaaaattataacctg
acatattctaacctgtatggtacaagaattcaggacagggatatttctctcggtttaact
gattgttatcgtcttcatgctgtatatgaatctaatgatgataatgatccaattattcct
tctgtcactttagttgaacctaccttctttgctacaggtagtattgttattggtagaact
tccaaggcaagggcaaaggttgttgatttctcctctggaactttaaaactgaatgttgta
tatctctctggtgtgtttcaaccaggtgaaacaattgatggttttgatagtaacaatact
gcaatcaatgcgattattaatgatagtgtaggatctattgttcttggttctaaagttgtt
actgaaaactatttcttagaagtaaatcaaacaggtttcttatacgatatttctaaaatt
gttcgtaagaaaggtgtcgctgctccagttagaaaattaaaagttgttgttgattattat
acacactctgcaactggtgattactttggtggtcaatcttatttggataccaattataca
gatattcctttctttggatttaagttccttgccgattaccttgatttccgaccaggcgtt
aagaacttgtatagcggcacaggtacagtagcatctcctgcttttgttaactgttcgaca
tttgactttaagtcaagagtattcaatgtatctggatctcctaatgcaacagtattcgac
attcctaaacttgatagtaacttccgttgcgactttgattggtatttacctagagttgat
aaagcattcttgacacctgatggtgagttccaaatcattaaaggtaaatcttccgaatct
cctattgaacctgatgacatcagagatggtatgcttctgggagttattagtcacaaacca
tatggtttcgatcctgaagctgacgtagttatcaaacgctctgataacaagcgttatact
atgcgcgatattggttctattgaacgtcgcttagatcaagttgagtatcaaacttcactc
aatatgcttgaagcggatacattcaatactcaaatcttagattctagtggtaagaaccgt
cttaagaacggatttatggttgatgattttggtgatcatagtaaatcggaaactagtcat
gaagattttgctgctgctcttgatttccagtatggatcttgtcgcccatcacactataca
actaacgttccgctagttattaactctactttatcaacaaatactcagcaaactggtcct
ctgattaccttaccgtacactgaggttaagatcattgaacaaccttatgcttctcgtgtt
gagaacattaacccgttcaacgtctttacttacattggacgtatcacaatgacacctggt
tctgatgactggttggatacaaatagactgccagttaatgttcaacagattgaaggtgat
ttccaagcggtatcatctgaaatgaaccttgatcaaaatggtttcgctcctattcaatgg
agagcatgggaaaccaactggactggtgaaagagttatttcttctactactacaagaaat
gctggttggttagcagaagatgtcggcagatctcctcgaccaaacgtttggggtggtcgt
ggtatgcgtcgtattaatagaactactacgattcaagttactggtcagcaaaccagatct
ggtattagaactcgtgttattcctagaattgatcgtcagtctttgggtgatagtgttctt
tctagcacttctattccttggattcgttctagaaacgttgaacttgattgtgctcgtctg
aagcctagaactcgtttctattctttctttgatggtaagagcactattgattatcagatt
cctaagatcattgaaattattaaagatcctacagttgatagtagaacaaactctacacct
tttgttattggtgagactgtaactggtcttactagtggatgtaagtttaaggttgctgca
cctgatgatttctatcagtttaatccttatgatgatacaacacttcctacttcatatgca
tctacaacagcattcctgaatattgatactaatgcacttgcggagcaagcgattggtgat
ttctatggtaatatgcaagttcaggaagtattagttggaacttctggtgcccgtgctgtc
gttaaagatcgtcgtttgatctctgaccgttttggtaaattaaaagcatccttctttatt
cctaatcctggcgtagatacaaatccaagatgggcaactggtactagaactttaagactt
tctacttcagataccgattcgcgtcttgctggtgcagttgcatcttctgcagagacacaa
tatgaagcgagaggtacgttaaatactgttcaagaaaatgtcttagcagttcgtaatgct
gaagttgttcgtgatacagttactcaagaacaatcaattaatacaactagaaccgagagt
agacagattggttggtatgaccctcttgcacaatcatttattgttgatgaaactggtggt
gtattccttacttctgttgatgtttacttcttcaagaaggatgagaatattcctgtttcg
atgcagatcagaacaatggaaaatggttatcctacaacaaccattctacctttctctgac
gtaactttagaaccaacacaggttcagttatctgagtctgctgcagttgcaactaggttt
acttttgacgctcctgtatacattcctcaatcacaagaacattgttttgttcttctttct
gactccaactcttatcagatttggatctctagaatgggtgagattgatatctcgggtgac
agaacaatctctgaacaaccctacgctggtgttttatttaaatctcaaaacgctactact
tggactgctgaccaatatgaagaccttaagttcatcataaacagagcagagtttagtatt
acgggacagagtagacttgtattgaataatactgctctggacagaggaaatggtggtaag
ttgaatcttcgttctgatgctattcagacattccaacctgaattggttcttactcttaac
tccacaacattaccttacaccgttggtgctcgtatctatcagaagactaccttggcagaa
ggtactgttacagcaagaactgtgacaaatgctggtgttcaattgactattaatgatatt
agtggtaactgggcagcaggatctaatactggtggaacaattgctaaccgcgttgtctct
tctaagacgacagcaactatggttgttactagtgcatctgctgacttcacggttggtgaa
acaatcactggtaactcttctactgctcctactgcagaagttgtaagttggactgctgga
actaatacgttgacacttaagtatgtttcttctgcgtttactgcttctacagagacaatt
actggtggaacatctagcacaactgcaactgtaagtagcatctcttatgctggtgatgca
gttgaatctagtgcgattcaaccttccttcccaacaggaacacctacttatgctacaaca
caaagaaagattcgtgtttatcatagcaatcactgtatgcatagtgcagaaaataatgta
attgttgagggtgtggtctcagaagtttctgatactgctctgactgcatctatctcttct
acagatactagtgttgctgttggagatgccactgcattccataagattattaatggtgct
gccattggcacaaccaatgttggttatattaagatcaacgatgaagtcatgtcatatagt
gctatttctggtgacaataagactattactgtacatgaacgtggtcttgatggaacaact
gcagtatctcacgcagatgaatctgtagttcaatgttataaccttgatggtattcctcta
acggaaatcaataagacacacgctggacttggaaacactacgttggattattatgaactt
tctacatcatctattgctagattaggtattcttggtggcggaacaaatattttcgcaaca
cagaatattcagtatagcactctggttccttcagttcaaagaatgcttcttcctaagact
gatattactgctagagtcaacactattagtggaacatctattaatgatggtatcacttta
tctcaagcatcttttgcaaatgatggcgtattctccgacgttatccttggacaggataat
gatttctattctccttcactgatttgttctgcaatcaatgaatcttctgaacttagcggt
gctaagtcattcagattagatttgacaatgacttcagagaagagtacaatttctcctgtt
attgatgtagatagaatgtctgctacattagtatctaaccgcatcaatagtccttctaat
ccaaatactgcaaaacaagcagttggtgatgagcatgaggcagtttacattactagagtt
gcagatctaactaatccttctggttcaattaaattatactatacgggatatcgtcctcct
aacagtgaaattaaggtgctatatagagtgcgtcctattggatcctctacaccgattgat
gaacttggatttgagttcttcccatcagaaggttctaaagttccagctactacagaaaga
gaaatttatttcgattatgagtatgaagtatctggtctaagttttgatcagtatcaaatc
aaggtcgtatttgtgtctcctaatcaggcactcgtacctattatcaaagacttgagagca
atcgcccttgctgtataa
DBGET
integrated database retrieval system