Viruses: 10329347
Help
Entry
10329347 CDS
T40000
Symbol
SSSM5_015
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-SSM5; endolysin
Virus
445685
Synechococcus phage S-SSM5
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
Phage_lysozyme
Peptidase_M15_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10329347
NCBI-ProteinID:
YP_004324621
RS:
NC_015289
UniProt:
E3SK58
LinkDB
All DBs
Position
NC_015289:9784..12645
Genome browser
AA seq
953 aa
AA seq
DB search
MATVTKGAKINFYKFVDPDGGAGTTAAATGVSKENKALTASIKANTQAINNLGATVNSIG
KVAASMKDAQLKLLKIDEDRLRKSSFKPKFTKAKPIKSKAFDSLFSGKIMGFWESLLNLA
GALLKYFLVIPALKWLSDEKNQDKVVSGLKILAKVFKFIADVAKFSFVNTIEGLYDLLRD
DATWQERIGGFFQALTGLGTAFLAISILRRPGETIRTFTDVLTKFGRGLTNAALKLARHP
LVVATGLFTAGYFIPKLMPGTVSEQERKILEQQGSNEEKIKKLEEQLNNLNFFDRYIRGF
GAEIEEQIRAIREGKVASYGQTFGQDDLPTKSIGGYLKEYAKGGWINGPQSGYPVNISGG
NKPDFIGHGTEYVARKADGGAFIVPFDTPATRVNPSLTASRTLEAKMMGFKLPGFDSGGA
MDSFAKKMIKVHEGLKLQKYLDSRGFPTIGYGHLVRPTDKFPNTISKAFADQLFEKDYKH
HKKAAKGIPGYGTSSPMQKAALIDLTFNMGPAWHEGFPKMMTAYGKGDFETAGNELMDSD
YFNQVKRRGPTIVSLIKNKGLGPESQYLIDAGIIPPSSGTKNPFGNPLNAFGSFVTNSLF
GGPASAAEIATGTEPNDMGRDTANRQNSTTGSFTVIPTSHSETGAGWGIRGVTDKYGRPI
VLSQPAAMAFAKMMQVSKGQVKGSDIASSGRTRRKNTSVGGDPNSVHLYGEGLDISGSSE
KWMKSNASRYGWNFGYNHGPGSGHYDYEGTGSRVTPILAPPGGKSFVYDKAAVTDTGATG
ATNKQTGSGNFLTGLLKSLRGGGQTNRDPSSLFNESAMDTGFGSLFDVDSPLTSGINYSS
AFKNPFSSTSAQRAESIQEQARIRRVTEQRNQARREINAKTSEVVQMALAAVEAQNGSNR
QFIQTAESAIRNLLGAQAGGGTFANVGGTTGTVLRTAVAVLNSFNNPLRGIFQ
NT seq
2862 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacagtcacgaaaggcgctaaaattaatttttacaagttcgtagatcctgatggt
ggtgcgggcactactgctgctgcgacgggagttagtaaagaaaataaagcgttaactgct
tccattaaagcaaatactcaagcaatcaataatttaggagcgactgttaactccattggt
aaggttgctgcgtctatgaaagatgcacaacttaaattactgaagattgatgaagacaga
ctgagaaaatcatcattcaaaccaaagtttacaaaagcaaaacccatcaaatcaaaagca
tttgatagtctattctcaggcaaaataatgggtttctgggagagtctgctgaatttagca
ggtgctttattaaagtattttttagttattcctgctcttaagtggctttctgacgaaaag
aatcaagataaagttgtaagtggtcttaaaatacttgctaaagtattcaaatttattgct
gatgtcgcaaagttttcgtttgttaatactattgaaggtctgtacgatcttctaagagat
gatgccacttggcaagaaagaatcggtggattctttcaggcgctaacaggactaggaaca
gcattcttagcaatatcaatcttaagaagacctggtgaaactatcaggacatttaccgat
gtgttgacaaagttcggtaggggacttacaaatgcagctctcaaactggcaagacatcca
ttagtagttgctactggactgtttactgctggatattttattcctaaactaatgcctggc
actgttagtgaacaggagagaaaaattcttgaacagcaaggatcaaatgaagagaagatt
aaaaaacttgaagaacaactaaacaatttaaatttctttgacagatacatccgtggattc
ggtgctgaaatcgaagaacaaattagggcaataagagagggtaaagttgcttcttatggt
caaactttcggacaggatgatctcccaactaaaagtattggaggatatttaaaggaatat
gctaaaggtggatggattaatggtccccagtcagggtatccagtaaacattagtggtggt
aataaacctgattttattggtcatggtacagagtatgttgctagaaaggcggatggtggt
gcatttattgttccattcgacacacctgcaactagagttaatccaagtttaactgctagt
agaaccctagaagcaaagatgatgggattcaaactaccaggatttgattctggtggtgcg
atggatagttttgcaaagaaaatgattaaggtccatgaaggactgaaattgcaaaagtat
ctggatagtagaggatttcctactattggatatggtcacttagttagacctaccgacaaa
ttcccgaatacaattagtaaagcatttgccgaccaattatttgagaaagattacaaacat
cataaaaaagcagcaaaaggtatacctggatatggtacatcttctccaatgcagaaagca
gcattgattgatcttacatttaatatgggtcctgcatggcatgagggatttcctaagatg
atgacagcatatggcaaaggagactttgaaactgctggtaatgagttgatggatagtgat
tatttcaatcaagttaaacgtcgtggtcctaccatcgtatcacttatcaaaaataaaggt
ctgggtccagaaagtcaatacttaatagatgctggtattataccaccttcatcgggcact
aagaatccttttggaaatccattaaatgcatttggatcattcgttacaaattctttattt
ggcggtcctgcatcagcagcagaaattgctactggaactgaaccaaatgatatgggtaga
gatactgccaatagacaaaatagtactacaggttcatttactgtcattccaacttcacac
tctgaaactggtgctggatggggaatcagaggagttaccgacaaatatggtcgtcccata
gtattatctcaacctgctgctatggcatttgctaaaatgatgcaagtgtctaagggacaa
gtaaagggatctgatattgcaagttctggtagaactagaaggaaaaatacctcagttggt
ggtgatcctaactcagttcacttatatggtgaaggtcttgatatctctggttcttcagaa
aaatggatgaaatcaaacgccagcagatatggttggaattttggatataatcatggacct
ggtagtggtcactatgactatgaaggtacaggttctagagtaacacctatcttagcaccg
cctggtggaaaatcttttgtatatgataaagctgctgtaacggatactggtgcgactggt
gctaccaataaacagactggcagtggtaattttctaactggattacttaaaagtctcaga
ggaggtggtcaaactaatagagatccaagtagtctctttaacgaatctgcaatggacact
ggatttggatccttatttgatgtggactctcctttgacctctggtattaattattcaagt
gctttcaagaatccttttagttctacatcagctcaaagggcagagagtatacaagaacaa
gcaaggattcgtagagtaacagaacaaagaaatcaagcaagaagggaaatcaatgcaaag
acttctgaggtcgtgcagatggcgttggcggctgttgaggcgcaaaatggttccaatagg
caattcattcaaacggctgagtcggcaattaggaatcttctaggtgctcaagcaggtggt
ggtacatttgctaacgtaggaggaacaacgggaaccgttctaaggactgctgttgctgtc
ctaaattcttttaataaccctcttagaggcatcttccaatga
DBGET
integrated database retrieval system
