KEGG   Viruses: 10555577
Entry
10555577          CDS       T40000                                 
Symbol
RNA1, GBLV_s1_gp1
Name
(RefSeq) Grapevine Bulgarian latent virus; polyprotein segment 1
Virus
748667  Grapevine Bulgarian latent virus
SSDB
Motif
Pfam: RdRP_1 RNA_helicase ATPase_2 RdRP_4 Peptidase_C3
Other DBs
NCBI-GeneID: 10555577
NCBI-ProteinID: YP_004429248
RS: NC_015492
UniProt: F2Q9W1
LinkDB
Position
NC_015492:88..6375
AA seq 2095 aa
MATFKMGSVVLTPCFLAKERELVHQLLRSSSSFAVTFLAQGASLKPIMVARAIINGVIAI
DTENFGFVDQTWSEAARVVRRYSLAHSKYCRKVRERSARRFAERKAARKAAGVKAACKRI
LASLDADLPCSGRLMWAIKRAHREDFASRMKTAEICRMIRASKREERAYRAQYAALEVRR
PVSMRVPYVCPLVANREEVAGEPLRGRAFERTPRSTSFSASPLPRMRSPYEAEIAPLFGA
CDRASRLELHPDIKFFFREAPNHASSLGDVESLARLARCTIAYFKLFPCALYFEPLRRLK
PQSTTDEIDKCANGLEMELDRLREISVSDLHANGLGTFIAGIAAGAATATGAVVGTTVAG
GKYLIDHAAAAFDKSCNKVVETVELATRKFGETMLDMVRKTFDSCLGPYLATVSHAREQI
ETYWRRVTQWIKTMWSKLSIEVQALFDSTWWALGLILCAGVVVLAEHMLVALGVLTHAGA
LTSLFITAFVGYLGWNFAAPATEAEGTLLTTLRALVHIVVEKPMSVFRSDQTANAPNVLE
FPLRVLETLGNGLVSAPLGHSNMLGNMELLWINPQGKDAMKDLLMCFDCIADSWDYMTGR
KDSFFREIASMTKVDIVPWIKSAQQIVLEAQTVAVTDPVLMDTITHLLYKGHILQRTLAG
AKRATSLDYGRVVSSLVQELTKIRAQCARAGIFEGRRCEPFWTYIYGPSHCGKSLFMEEV
TRRLLKENGHALNDIYAKNARDPYWSGYLRQAAVQIDDLSACVTEPSVESEFLQTIGSKD
YKLNMAAVEDKGMSFNSSLFITTSNVFTAPTDARILDKNAYNNRRGAVVQCRRAPGVDFD
ARNPSGSCEARLVDPNDETPKSEWANCSKVLEEVVHLNNAHRLKELMLMANYRERNDTLH
PVHSGARNFLRSCTKSLALGNLVCDGVIYVIDRETATCEATKEKPTSGYEQTAQHFVASL
RQEISNRACDGMLNTFLNGLIEGPCEVKSVDALNEAATSSQKEFFLELPLLERVYLRILQ
RQLSAIREMPDFAFNMNVRERILASLRVGYNTVCEHGGKLLTIVAALVLILVIYSSFFCI
YRTSIAGPTDGVAALVAVGALTANAGSVSSVYSSSDGGLSKFSRNTPINYRSAASSDFRA
NSGGDDEFLMSLLLWLETPGGGLISCIRGKGRYIYLTAHQAEQIPDGARVFARTRSANGV
VHTVQLLWDAKQVRRYSDTEAVTYHDARFTALPEPIKSAFECDIDQLPTLFDMNVVLVKR
KSAMRQVDPTLAALPAEQPIIDCWKSNGKLNREMVGFNTYAYGGSYRNEIPVSIVSKCKT
YAEDCGAILTTMWKGKRRVIGMHVASGYKNGTQNPKDWTSTATLLPGIADLECNSGLNMV
EESGVSYEGYRKIGYLPRMADRPYQSGKTMFVPVPEEMMYIPTNLSERFSDGTERKVEVE
IKQPAILSASDPRIPEGVSYDPLKNGMEKFKKPMDLLDDALCAEIANDIAESWHDCFDSL
EDCSDEVAINGAEDEFFDKFNMTTSEGYPWVKQRGIGESGKLRYFEETVNGQLALRKDTP
VYKAYHDLQELSKVEVPELICIETPKDECLPLRKITLKPKTRLFSILPLEMNLLLRKKFL
SFAANLQQNRDKLPTQVGVDPYSREWGHIYSRLRSKNSVAVNCDYASFDGLITAQILKHI
GIAINSVYVGSPESKRQRANLLMAIVNRKSICGSQVYEVAAGIPSGCALTVLLNSIFNEM
LIRYVWKISVGGVPREMFSTYVTLIVYGDDNLISVHPEFLPHFNGMVIQAKLKEVGVTIT
DGSDKTAEGIYEKPFEKLDFLKRRFAKQSDGTVLAPLDLASIFTSLQNVTLGAGSIPEAV
RINVHVALTELYLHQKREWYDDLRNHYQKTQGWENLPTWAQSHAFHREHLTGALPWAPHR
VMDIPVDKKKLTQAMQSQGGLDFVVQVAERIFVCGPAFRPDATEQGSFVVSHTGSLPRGL
QGCLSPVDFVSEGQGRLPTQLWVNKFRSERHHLTCLIRDAYNRGCNVYFRAEQPYIVNWL
SATSFAMGLGKDYRAILHLYHNVCTPNAQCLDPYFEARRFQRVDAYVAPPFHHRR
NT seq 6288 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaacttttaagatgggatccgttgtgcttacaccttgttttcttgcaaaagaacga
gaactggtgcatcaacttttacgttcgtcttcttcttttgccgttacttttttggctcaa
ggtgcctccttgaagcccatcatggtggctcgtgccatcattaacggtgtcattgccatt
gacaccgagaactttggctttgtagaccaaacttggtccgaggctgcacgagtggtgcgc
cgatattcattggcccactcaaagtactgcaggaaggttcgcgagcgctctgcaaggcgc
tttgctgaaaggaaagctgccaggaaggcagctggtgtgaaggccgcctgcaagcggata
ctagcatctcttgatgccgacctcccttgttctgggaggctgatgtgggccattaaaaga
gcccaccgcgaggatttcgcctcgcgaatgaaaacggcagaaatttgccgtatgatcaga
gcctccaaaagggaggaaagagcctatagggctcagtatgccgcacttgaagtgcgaaga
cccgtttcaatgcgggtgccctatgtttgccccctggtggcaaacagagaagaggtggct
ggggagccacttagaggtcgcgcttttgagcgcaccccacgcagcacttcctttagtgca
tctcctctccctcgtatgcggtcaccatatgaggctgaaattgctcctctctttggagct
tgtgatcgtgcatcccgtctggagttgcatccagatataaaatttttctttagagaagcg
cccaatcatgcttcttctttgggggatgtggaaagccttgctcgcttggcgaggtgtaca
attgcgtattttaaactttttccatgcgcattgtactttgagccgctgcgtcgactcaaa
cctcagagcacaactgatgagattgacaagtgtgcaaatggtctagagatggaactggac
cgcctccgtgaaatatcagtttcggatctccatgccaatgggcttggaacgttcatagct
ggtattgcagctggcgctgctactgccactggagccgttgttggcaccaccgtagctggt
ggaaagtatctaattgatcacgcagctgcagcttttgataagagctgcaacaaagtggtt
gaaacagttgaactggccacgcggaagtttggagagaccatgcttgacatggtcaggaaa
acattcgactcttgccttggaccttacttggctactgtgtctcacgcccgtgaacaaatt
gaaacctattggcgtagagtgacacagtggatcaaaacaatgtggagcaagttgtcgatt
gaagttcaagccctatttgattctacatggtgggctcttggactgatcctctgcgctggg
gtggttgtgcttgctgagcatatgctggtggccctcggtgtgttaacgcacgccggagct
ctaacatccttatttatcaccgcatttgtggggtatttgggatggaattttgcagcaccc
gccacagaagcggaaggaacgttactcaccacattgcgtgccctcgtgcatattgtggtt
gagaagccaatgtcggtttttcgctcagaccagacagcaaatgctcccaacgttttggag
tttccactcagggtgctcgaaacactcggtaacgggttagtttctgcgccccttggacac
tccaatatgttgggaaatatggagctgctatggatcaatccgcaagggaaagacgccatg
aaagatttattgatgtgttttgattgcatagcggattcttgggattatatgactggtcgt
aaggatagtttctttcgagaaattgcctcaatgactaaggttgatatagtcccctggatc
aagagcgctcagcagattgtgttggaggcacaaactgttgctgtaacggaccctgtcctt
atggacacgattacacatttactatacaagggtcatatactccaacggacgttggccggt
gcgaagcgcgccacttcactcgattacggacgagtcgtgtcttctcttgttcaagagttg
actaagattcgcgcccagtgtgcgcgcgcaggcatctttgagggtcggaggtgtgagcct
ttttggacttacatctacgggccttcgcattgtggaaagtcactttttatggaggaagtg
acacggcgtttattgaaagagaatggccatgctcttaatgatatatacgccaaaaatgct
cgtgatccatactggtcaggttacttgcgacaggctgctgtacaaattgatgatttatca
gcctgcgtaactgaaccttcggtcgagtctgagtttctccaaacaattggatccaaggac
tacaagcttaacatggctgcggtagaggacaaaggaatgtctttcaatagctccttgttc
atcactacatccaatgtgttcactgcgcctaccgacgctagaattttggataaaaacgct
tacaacaataggcgtggcgcagtagttcagtgtcgtagagccccaggtgtggactttgat
gcaagaaatccttctggatcgtgtgaagcgcggctggtggatcctaatgatgaaacgcct
aagtcagagtgggccaattgttccaaagtgctggaggaggtggtgcacttaaataatgcg
catcgtctcaaggagttaatgctcatggctaattaccgagagcgcaatgacactttgcat
cctgtgcacagtggagcgcgtaatttcctgagatcctgtaccaagagcttggctctcggg
aatttggtctgcgatggagttatatatgtaattgatcgtgagacagcaacatgtgaggcc
acaaaggagaagccaacaagtggctatgagcagacagcacagcacttcgtcgcttcactc
cggcaagaaatttcgaaccgggcgtgtgatggaatgttgaacacctttttgaatgggtta
attgaaggtccttgtgaagtgaagagcgtagatgccttaaatgaggcagctacgtcttcg
cagaaggagtttttccttgaattgcccttactggagagagtgtacctgcgaattttacag
aggcagctgtccgcaatccgtgagatgcccgacttcgcctttaacatgaatgtccgggaa
aggattttagctagccttagagtaggttataacactgtctgtgaacatggtggcaaattg
ctaaccatagttgcagcattagttttgattttggttatatattcgtcattcttttgtata
tatagaacctccattgctggaccgacagatggtgtagctgcacttgttgcggttggcgcg
ctaacagctaatgctggtagtgtgtcaagtgtatatagtagctccgatggcggtttgagt
aagttttctcgcaacacccctatcaattataggagtgctgcaagcagtgattttcgtgcc
aatagtggtggggatgacgaatttttgatgtcattactactgtggttggagactccaggt
ggtggccttatatcgtgtattagagggaagggtcgctacatttatctgaccgcacaccaa
gcggaacaaattcctgatggtgctcgtgtttttgctcgcacgagatccgccaatggtgtt
gtacatacagtgcagcttctatgggatgcaaaacaagtcagacgatacagtgacactgag
gctgttacctatcatgacgcccgtttcactgccctccctgagcctatcaagagtgctttt
gagtgtgatattgatcaactacctactttgtttgatatgaatgtggtattggtcaagcgc
aagagtgctatgcgacaggtggatccaacattagctgccctaccagcggagcaacccatt
attgattgctggaaatccaacgggaagttaaatcgtgagatggtaggttttaatacctac
gcttacggtggtagctatcgtaatgagataccagtgtcaattgtatcgaaatgcaagacg
tatgctgaagattgtggggcaatacttaccactatgtggaaagggaaacgccgcgtgatt
ggaatgcacgtcgcatcggggtacaaaaatgggacccaaaatccaaaagattggacctca
acagccacccttctcccaggcattgcagatttggagtgtaactccggattgaatatggtg
gaagagagtggtgttagttatgaggggtacagaaagattggctatttgccacgaatggcc
gaccgcccttaccaatcagggaaaacaatgttcgttcccgtacctgaagagatgatgtat
ataccgaccaatttgtcggaaagattctcagatggcacggaacgaaaagtggaagtggag
attaagcagccggcaatcctgtctgctagtgatccacgtattcctgagggagtctcctat
gatccgttgaaaaatggtatggagaagtttaagaagcccatggatcttctagatgatgct
ctctgtgcagaaatagctaatgatatagccgagagctggcatgattgttttgactcgttg
gaggattgttcagatgaagttgccatcaatggtgctgaggatgaattcttcgataagttt
aacatgaccacatctgaagggtatccttgggtgaaacagagggggattggagaaagtggg
aaattgcgttactttgaggagaccgttaatggtcaacttgcgttgcgtaaagatacaccc
gtctataaggcataccatgatttgcaagagctttccaaggtagaagtgcctgagctcatt
tgcattgagacgcctaaggatgagtgtttgccactcaggaaaataaccctaaaacccaaa
acacggctcttttccattctgccgctggaaatgaaccttcttctcaggaaaaagttttta
tcttttgcggccaatttacagcaaaatagggataaacttccaacacaagttggtgttgat
ccttattcacgagagtggggccatatttactctcgcctccgttctaaaaattctgtggcc
gtcaattgtgattatgcttcttttgacggattgattacggcccagattttgaaacatatt
ggaattgccattaattctgtatatgttgggagcccggagtcgaaacgacaaagggcgaat
ttgctaatggccattgtgaaccgtaagagcatctgcggttcacaagtgtatgaagttgca
gcaggtattccttcggggtgtgctttgactgttctgctcaactccattttcaatgagatg
ctaattcgttacgtttggaaaatttccgtgggtggagtaccacgcgaaatgttttcaacc
tatgtaactctgattgtgtatggtgatgataatctcatttctgtgcacccagagttcttg
ccccacttcaatggtatggttattcaagcgaaattgaaagaagtgggggtaacgattacg
gacgggagtgacaaaactgctgagggcatttacgaaaagccatttgaaaaattggatttt
cttaaacgccgctttgctaaacaaagtgatggaaccgtccttgctcccctggatttggcg
tcgatatttacttctttacagaatgtgacgctaggtgcaggatctattccagaggctgtg
cgtattaacgtacatgtggcactcacagaattgtaccttcaccagaaacgtgagtggtat
gatgatctgaggaatcactatcaaaaaacccagggttgggagaacctaccaacctgggcg
cagtctcatgctttccacagggaacatcttacgggagccttgccctgggcgccacaccgt
gtcatggatatcccagtggataagaagaaattgactcaagctatgcaaagtcaaggtggt
cttgattttgtagtacaggtcgcagaacgcatttttgtatgtggtcctgcttttcggcct
gatgctacagaacaaggctcatttgttgtgagtcatacaggttcattgccgcgtggtcta
cagggttgtttgagcccagtcgacttcgtgagtgaagggcaaggtcgtttacctactcag
ttgtgggtaaataaattcaggtcagagcgtcatcacctcacgtgtctcatcagggatgcg
tataacagaggttgtaatgtttattttagggcggagcaaccctacatagtgaactggttg
agtgcaactagttttgctatgggacttggaaaagactatagggctatattacatttgtat
cataatgtatgtacgcctaatgctcagtgccttgacccctattttgaggcaaggcgcttc
cagcgggtggacgcttatgttgcaccccctttccatcataggagataa

DBGET integrated database retrieval system