Viruses: 10555577
Help
Entry
10555577 CDS
T40000
Symbol
RNA1, GBLV_s1_gp1
Name
(RefSeq) Grapevine Bulgarian latent virus; polyprotein segment 1
Virus
748667
Grapevine Bulgarian latent virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RdRP_1
RNA_helicase
ATPase_2
RdRP_4
Peptidase_C3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10555577
NCBI-ProteinID:
YP_004429248
RS:
NC_015492
UniProt:
F2Q9W1
LinkDB
All DBs
Position
NC_015492:88..6375
Genome browser
AA seq
2095 aa
AA seq
DB search
MATFKMGSVVLTPCFLAKERELVHQLLRSSSSFAVTFLAQGASLKPIMVARAIINGVIAI
DTENFGFVDQTWSEAARVVRRYSLAHSKYCRKVRERSARRFAERKAARKAAGVKAACKRI
LASLDADLPCSGRLMWAIKRAHREDFASRMKTAEICRMIRASKREERAYRAQYAALEVRR
PVSMRVPYVCPLVANREEVAGEPLRGRAFERTPRSTSFSASPLPRMRSPYEAEIAPLFGA
CDRASRLELHPDIKFFFREAPNHASSLGDVESLARLARCTIAYFKLFPCALYFEPLRRLK
PQSTTDEIDKCANGLEMELDRLREISVSDLHANGLGTFIAGIAAGAATATGAVVGTTVAG
GKYLIDHAAAAFDKSCNKVVETVELATRKFGETMLDMVRKTFDSCLGPYLATVSHAREQI
ETYWRRVTQWIKTMWSKLSIEVQALFDSTWWALGLILCAGVVVLAEHMLVALGVLTHAGA
LTSLFITAFVGYLGWNFAAPATEAEGTLLTTLRALVHIVVEKPMSVFRSDQTANAPNVLE
FPLRVLETLGNGLVSAPLGHSNMLGNMELLWINPQGKDAMKDLLMCFDCIADSWDYMTGR
KDSFFREIASMTKVDIVPWIKSAQQIVLEAQTVAVTDPVLMDTITHLLYKGHILQRTLAG
AKRATSLDYGRVVSSLVQELTKIRAQCARAGIFEGRRCEPFWTYIYGPSHCGKSLFMEEV
TRRLLKENGHALNDIYAKNARDPYWSGYLRQAAVQIDDLSACVTEPSVESEFLQTIGSKD
YKLNMAAVEDKGMSFNSSLFITTSNVFTAPTDARILDKNAYNNRRGAVVQCRRAPGVDFD
ARNPSGSCEARLVDPNDETPKSEWANCSKVLEEVVHLNNAHRLKELMLMANYRERNDTLH
PVHSGARNFLRSCTKSLALGNLVCDGVIYVIDRETATCEATKEKPTSGYEQTAQHFVASL
RQEISNRACDGMLNTFLNGLIEGPCEVKSVDALNEAATSSQKEFFLELPLLERVYLRILQ
RQLSAIREMPDFAFNMNVRERILASLRVGYNTVCEHGGKLLTIVAALVLILVIYSSFFCI
YRTSIAGPTDGVAALVAVGALTANAGSVSSVYSSSDGGLSKFSRNTPINYRSAASSDFRA
NSGGDDEFLMSLLLWLETPGGGLISCIRGKGRYIYLTAHQAEQIPDGARVFARTRSANGV
VHTVQLLWDAKQVRRYSDTEAVTYHDARFTALPEPIKSAFECDIDQLPTLFDMNVVLVKR
KSAMRQVDPTLAALPAEQPIIDCWKSNGKLNREMVGFNTYAYGGSYRNEIPVSIVSKCKT
YAEDCGAILTTMWKGKRRVIGMHVASGYKNGTQNPKDWTSTATLLPGIADLECNSGLNMV
EESGVSYEGYRKIGYLPRMADRPYQSGKTMFVPVPEEMMYIPTNLSERFSDGTERKVEVE
IKQPAILSASDPRIPEGVSYDPLKNGMEKFKKPMDLLDDALCAEIANDIAESWHDCFDSL
EDCSDEVAINGAEDEFFDKFNMTTSEGYPWVKQRGIGESGKLRYFEETVNGQLALRKDTP
VYKAYHDLQELSKVEVPELICIETPKDECLPLRKITLKPKTRLFSILPLEMNLLLRKKFL
SFAANLQQNRDKLPTQVGVDPYSREWGHIYSRLRSKNSVAVNCDYASFDGLITAQILKHI
GIAINSVYVGSPESKRQRANLLMAIVNRKSICGSQVYEVAAGIPSGCALTVLLNSIFNEM
LIRYVWKISVGGVPREMFSTYVTLIVYGDDNLISVHPEFLPHFNGMVIQAKLKEVGVTIT
DGSDKTAEGIYEKPFEKLDFLKRRFAKQSDGTVLAPLDLASIFTSLQNVTLGAGSIPEAV
RINVHVALTELYLHQKREWYDDLRNHYQKTQGWENLPTWAQSHAFHREHLTGALPWAPHR
VMDIPVDKKKLTQAMQSQGGLDFVVQVAERIFVCGPAFRPDATEQGSFVVSHTGSLPRGL
QGCLSPVDFVSEGQGRLPTQLWVNKFRSERHHLTCLIRDAYNRGCNVYFRAEQPYIVNWL
SATSFAMGLGKDYRAILHLYHNVCTPNAQCLDPYFEARRFQRVDAYVAPPFHHRR
NT seq
6288 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacttttaagatgggatccgttgtgcttacaccttgttttcttgcaaaagaacga
gaactggtgcatcaacttttacgttcgtcttcttcttttgccgttacttttttggctcaa
ggtgcctccttgaagcccatcatggtggctcgtgccatcattaacggtgtcattgccatt
gacaccgagaactttggctttgtagaccaaacttggtccgaggctgcacgagtggtgcgc
cgatattcattggcccactcaaagtactgcaggaaggttcgcgagcgctctgcaaggcgc
tttgctgaaaggaaagctgccaggaaggcagctggtgtgaaggccgcctgcaagcggata
ctagcatctcttgatgccgacctcccttgttctgggaggctgatgtgggccattaaaaga
gcccaccgcgaggatttcgcctcgcgaatgaaaacggcagaaatttgccgtatgatcaga
gcctccaaaagggaggaaagagcctatagggctcagtatgccgcacttgaagtgcgaaga
cccgtttcaatgcgggtgccctatgtttgccccctggtggcaaacagagaagaggtggct
ggggagccacttagaggtcgcgcttttgagcgcaccccacgcagcacttcctttagtgca
tctcctctccctcgtatgcggtcaccatatgaggctgaaattgctcctctctttggagct
tgtgatcgtgcatcccgtctggagttgcatccagatataaaatttttctttagagaagcg
cccaatcatgcttcttctttgggggatgtggaaagccttgctcgcttggcgaggtgtaca
attgcgtattttaaactttttccatgcgcattgtactttgagccgctgcgtcgactcaaa
cctcagagcacaactgatgagattgacaagtgtgcaaatggtctagagatggaactggac
cgcctccgtgaaatatcagtttcggatctccatgccaatgggcttggaacgttcatagct
ggtattgcagctggcgctgctactgccactggagccgttgttggcaccaccgtagctggt
ggaaagtatctaattgatcacgcagctgcagcttttgataagagctgcaacaaagtggtt
gaaacagttgaactggccacgcggaagtttggagagaccatgcttgacatggtcaggaaa
acattcgactcttgccttggaccttacttggctactgtgtctcacgcccgtgaacaaatt
gaaacctattggcgtagagtgacacagtggatcaaaacaatgtggagcaagttgtcgatt
gaagttcaagccctatttgattctacatggtgggctcttggactgatcctctgcgctggg
gtggttgtgcttgctgagcatatgctggtggccctcggtgtgttaacgcacgccggagct
ctaacatccttatttatcaccgcatttgtggggtatttgggatggaattttgcagcaccc
gccacagaagcggaaggaacgttactcaccacattgcgtgccctcgtgcatattgtggtt
gagaagccaatgtcggtttttcgctcagaccagacagcaaatgctcccaacgttttggag
tttccactcagggtgctcgaaacactcggtaacgggttagtttctgcgccccttggacac
tccaatatgttgggaaatatggagctgctatggatcaatccgcaagggaaagacgccatg
aaagatttattgatgtgttttgattgcatagcggattcttgggattatatgactggtcgt
aaggatagtttctttcgagaaattgcctcaatgactaaggttgatatagtcccctggatc
aagagcgctcagcagattgtgttggaggcacaaactgttgctgtaacggaccctgtcctt
atggacacgattacacatttactatacaagggtcatatactccaacggacgttggccggt
gcgaagcgcgccacttcactcgattacggacgagtcgtgtcttctcttgttcaagagttg
actaagattcgcgcccagtgtgcgcgcgcaggcatctttgagggtcggaggtgtgagcct
ttttggacttacatctacgggccttcgcattgtggaaagtcactttttatggaggaagtg
acacggcgtttattgaaagagaatggccatgctcttaatgatatatacgccaaaaatgct
cgtgatccatactggtcaggttacttgcgacaggctgctgtacaaattgatgatttatca
gcctgcgtaactgaaccttcggtcgagtctgagtttctccaaacaattggatccaaggac
tacaagcttaacatggctgcggtagaggacaaaggaatgtctttcaatagctccttgttc
atcactacatccaatgtgttcactgcgcctaccgacgctagaattttggataaaaacgct
tacaacaataggcgtggcgcagtagttcagtgtcgtagagccccaggtgtggactttgat
gcaagaaatccttctggatcgtgtgaagcgcggctggtggatcctaatgatgaaacgcct
aagtcagagtgggccaattgttccaaagtgctggaggaggtggtgcacttaaataatgcg
catcgtctcaaggagttaatgctcatggctaattaccgagagcgcaatgacactttgcat
cctgtgcacagtggagcgcgtaatttcctgagatcctgtaccaagagcttggctctcggg
aatttggtctgcgatggagttatatatgtaattgatcgtgagacagcaacatgtgaggcc
acaaaggagaagccaacaagtggctatgagcagacagcacagcacttcgtcgcttcactc
cggcaagaaatttcgaaccgggcgtgtgatggaatgttgaacacctttttgaatgggtta
attgaaggtccttgtgaagtgaagagcgtagatgccttaaatgaggcagctacgtcttcg
cagaaggagtttttccttgaattgcccttactggagagagtgtacctgcgaattttacag
aggcagctgtccgcaatccgtgagatgcccgacttcgcctttaacatgaatgtccgggaa
aggattttagctagccttagagtaggttataacactgtctgtgaacatggtggcaaattg
ctaaccatagttgcagcattagttttgattttggttatatattcgtcattcttttgtata
tatagaacctccattgctggaccgacagatggtgtagctgcacttgttgcggttggcgcg
ctaacagctaatgctggtagtgtgtcaagtgtatatagtagctccgatggcggtttgagt
aagttttctcgcaacacccctatcaattataggagtgctgcaagcagtgattttcgtgcc
aatagtggtggggatgacgaatttttgatgtcattactactgtggttggagactccaggt
ggtggccttatatcgtgtattagagggaagggtcgctacatttatctgaccgcacaccaa
gcggaacaaattcctgatggtgctcgtgtttttgctcgcacgagatccgccaatggtgtt
gtacatacagtgcagcttctatgggatgcaaaacaagtcagacgatacagtgacactgag
gctgttacctatcatgacgcccgtttcactgccctccctgagcctatcaagagtgctttt
gagtgtgatattgatcaactacctactttgtttgatatgaatgtggtattggtcaagcgc
aagagtgctatgcgacaggtggatccaacattagctgccctaccagcggagcaacccatt
attgattgctggaaatccaacgggaagttaaatcgtgagatggtaggttttaatacctac
gcttacggtggtagctatcgtaatgagataccagtgtcaattgtatcgaaatgcaagacg
tatgctgaagattgtggggcaatacttaccactatgtggaaagggaaacgccgcgtgatt
ggaatgcacgtcgcatcggggtacaaaaatgggacccaaaatccaaaagattggacctca
acagccacccttctcccaggcattgcagatttggagtgtaactccggattgaatatggtg
gaagagagtggtgttagttatgaggggtacagaaagattggctatttgccacgaatggcc
gaccgcccttaccaatcagggaaaacaatgttcgttcccgtacctgaagagatgatgtat
ataccgaccaatttgtcggaaagattctcagatggcacggaacgaaaagtggaagtggag
attaagcagccggcaatcctgtctgctagtgatccacgtattcctgagggagtctcctat
gatccgttgaaaaatggtatggagaagtttaagaagcccatggatcttctagatgatgct
ctctgtgcagaaatagctaatgatatagccgagagctggcatgattgttttgactcgttg
gaggattgttcagatgaagttgccatcaatggtgctgaggatgaattcttcgataagttt
aacatgaccacatctgaagggtatccttgggtgaaacagagggggattggagaaagtggg
aaattgcgttactttgaggagaccgttaatggtcaacttgcgttgcgtaaagatacaccc
gtctataaggcataccatgatttgcaagagctttccaaggtagaagtgcctgagctcatt
tgcattgagacgcctaaggatgagtgtttgccactcaggaaaataaccctaaaacccaaa
acacggctcttttccattctgccgctggaaatgaaccttcttctcaggaaaaagttttta
tcttttgcggccaatttacagcaaaatagggataaacttccaacacaagttggtgttgat
ccttattcacgagagtggggccatatttactctcgcctccgttctaaaaattctgtggcc
gtcaattgtgattatgcttcttttgacggattgattacggcccagattttgaaacatatt
ggaattgccattaattctgtatatgttgggagcccggagtcgaaacgacaaagggcgaat
ttgctaatggccattgtgaaccgtaagagcatctgcggttcacaagtgtatgaagttgca
gcaggtattccttcggggtgtgctttgactgttctgctcaactccattttcaatgagatg
ctaattcgttacgtttggaaaatttccgtgggtggagtaccacgcgaaatgttttcaacc
tatgtaactctgattgtgtatggtgatgataatctcatttctgtgcacccagagttcttg
ccccacttcaatggtatggttattcaagcgaaattgaaagaagtgggggtaacgattacg
gacgggagtgacaaaactgctgagggcatttacgaaaagccatttgaaaaattggatttt
cttaaacgccgctttgctaaacaaagtgatggaaccgtccttgctcccctggatttggcg
tcgatatttacttctttacagaatgtgacgctaggtgcaggatctattccagaggctgtg
cgtattaacgtacatgtggcactcacagaattgtaccttcaccagaaacgtgagtggtat
gatgatctgaggaatcactatcaaaaaacccagggttgggagaacctaccaacctgggcg
cagtctcatgctttccacagggaacatcttacgggagccttgccctgggcgccacaccgt
gtcatggatatcccagtggataagaagaaattgactcaagctatgcaaagtcaaggtggt
cttgattttgtagtacaggtcgcagaacgcatttttgtatgtggtcctgcttttcggcct
gatgctacagaacaaggctcatttgttgtgagtcatacaggttcattgccgcgtggtcta
cagggttgtttgagcccagtcgacttcgtgagtgaagggcaaggtcgtttacctactcag
ttgtgggtaaataaattcaggtcagagcgtcatcacctcacgtgtctcatcagggatgcg
tataacagaggttgtaatgtttattttagggcggagcaaccctacatagtgaactggttg
agtgcaactagttttgctatgggacttggaaaagactatagggctatattacatttgtat
cataatgtatgtacgcctaatgctcagtgccttgacccctattttgaggcaaggcgcttc
cagcgggtggacgcttatgttgcaccccctttccatcataggagataa
DBGET
integrated database retrieval system