Viruses: 11536123
Help
Entry
11536123 CDS
T40000
Symbol
PaVLD_ORF007R
Name
(RefSeq) Planktothrix phage PaV-LD; DnaB-like replicative helicase
KO
K02314
replicative DNA helicase [EC:
5.6.2.3
]
Virus
994601
Planktothrix phage PaV-LD
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DnaB_C
Intein_splicing
DnaB
AAA_25
ATPase
AAA_16
KTI12
ParA
CbiA
Prominin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11536123
NCBI-ProteinID:
YP_004957280
RS:
NC_016564
LinkDB
All DBs
Position
NC_016564:3659..5398
Genome browser
AA seq
579 aa
AA seq
DB search
METIIMQNVEAEQAVLGAILLDPEAMGRVAETLTAKSFSLRSHQTIYKAALALHSEGVTT
DLMTVTTWLSDQKLLEKAGGQLGLTQLLDRTVSAVNIDQYGLLIADKQTRRNLIESAHKI
IELAEDTSQPLETIIQRSEEQIANISQSKSQQDLVSIGETLIDTFQEIEDRSESKIPPGV
PSGFYDLDAMTGGFQHTDLIIVAGRPAMGKSSLALNFGYNIAKKGLPVAVFSLEMSRGQL
VQRLLSSEAKIESTRIRSGNIQQEEWEPLTTAISSLAELPIFIDDTSNPTVNEIKKKAQK
LQAENDGKLGLILIDYLQLMDGGSDNRVQELSRITRGLKGMAKDLNVPVIALSQLSRAVE
SRTNKRPMLSDLRESGCLTGDSLITLADTGLQVPIKELVGKSGFLVWALNEETMKLENAV
VSNAFSTGVKPVFTLTTRLGRKIKATANHKFLTIEGWKRLDELHGGCPIALPSFTIENSD
VYWDEIVSIIPTGEEEVFDLTVPGLHNFVANNIVVHNSTEQDADLVMMIYRDDYYNPNTS
DEGIAELILAKHRNGPTGTVKLLFDSQFTQFKNLVRGMN
NT seq
1740 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaacaataatcatgcaaaatgttgaggcagaacaagccgttttgggagcgattctc
ttagaccccgaagctatggggcgagttgcagaaacgctaactgctaaatctttttccctg
cgatcgcatcaaacaatctacaaagcggctttagcattacattccgagggagtaaccacg
gatttgatgaccgttacaacctggttatccgatcagaagttgcttgaaaaagcaggagga
caattaggattaacccaattattagaccgcacagtttcagcagttaatatcgatcaatac
gggctgttaattgccgataagcaaactcgaagaaacctaattgaatctgctcacaaaatt
attgaattagcagaggataccagtcaacctttagagacaattatccaaaggtcagaggaa
caaattgctaatatttcccaatcaaaatcacaacaggatttagtttcaattggtgaaact
ttaattgatacctttcaagaaattgaagatcggagcgaaagcaagattccccccggtgtc
ccctctggattttatgacctcgatgctatgactggaggattccaacacaccgacttaatt
atcgtggcaggaagacctgcaatgggcaaatcgagtttggctttaaattttggttataac
attgccaaaaaagggttgcccgttgcagtcttcagtttagagatgtccagaggtcaatta
gtccaaagactattatcgagcgaagccaaaattgaaagtacccgcattcgttcgggaaac
attcagcaagaggaatgggaacctttgacaaccgcaattagttccttagcagaattaccg
atttttattgacgacacctcgaacccaacggttaacgaaatcaagaaaaaagcccaaaaa
ttgcaagccgaaaacgatggaaaattaggattaatcctaatagattatctgcaattaatg
gacggaggaagcgacaatcgggtgcaagaattgtcaagaattacacggggattaaagggg
atggcaaaagatttaaacgttcctgtaattgccttatctcagttaagtcgtgccgttgaa
tctcgcactaacaaacgcccaatgttatctgacttgagagagtcgggttgcttgacgggt
gacagcttaatcacattagcagatactggattacaagtacctattaaggaattggtaggt
aaatcagggtttctagtttgggcattaaacgaagaaacaatgaaactggaaaatgcggtt
gttagcaatgctttttctactggggtcaaacctgtatttaccctaacaactcggctagga
cgaaaaattaaggcaactgccaatcacaaattcttgacaattgagggttggaaaagacta
gatgagttacatggaggctgtcctattgccttacccagttttacaatagaaaatagtgat
gtttattgggatgaaatagtctcaatcatccctactggcgaggaggaagttttcgattta
acggttcctggactacataactttgttgccaataacattgttgttcacaactcaacagaa
caggatgcggatttagtgatgatgatctatcgagatgattattataatcccaacacttca
gacgagggaatagctgaattaattttagccaaacatcgcaacggccccaccggaacagtc
aagctattgtttgattctcaatttacccaatttaaaaatttagtacgggggatgaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
