Viruses: 11747962
Help
Entry
11747962 CDS
T40000
Symbol
COTV091
Name
(RefSeq) Cotia virus SPAn232; DNA-dependent RNA polymerase associated protein RAP94
KO
K21080
Poxviridae RNA polymerase-associated transcription-specificity factor
Virus
930275
Cotia virus SPAn232
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Pox_Rap94
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11747962
NCBI-ProteinID:
YP_005296279
RS:
NC_016924
UniProt:
H6TA65
LinkDB
All DBs
Position
NC_016924:complement(87107..89500)
Genome browser
AA seq
797 aa
AA seq
DB search
MESKETILIEIIPKIKAYINDPNTGPKSYSDFIDKNKNIFIINLYNVSSITEEDIRLLYN
TIEQNINVDNQTLISIFSYIGYKFEQNIKEDISSLSITEYNNKNDDMTFNLYNLFFNTLD
MFIRQRRINVLVNDDISGDININYRSSDLISDFNTDSDPEIREIPFNMKDMITYVSKNID
QLRFSKKYLDFAYLCRHIGIPISRRKLNMRYIYIYKVDGVSIPIVIKDFLDVKYVYLEET
GKKYKNTFSDDNNNSLLEWGKIIIPLLTNKYLYSYIFLSNQYLRDLFPILIDDDKVVFRD
VIDKQIIEIDEPKSLTYELKIEQPPCEHQIKLIDVLKIDLEYFNKVNNFASEFIYYEDGI
AYCKICGINIPIFNLDAADVIKDNIIVSTYNKSIFLSEPYSYFIHSQRFIFNIIMSFDNI
MKSQTWIMKYNINRIILNFLIEINSRRQIYEKKFANEIKKGIFFLRLSANLFDTHVSSSE
LFHQSKVLNLNYIVVLVIILNSSADFILSYMKSKKKQVEESSIKYILSLIIYDFLLKTKI
CEKGDLDTIILLTDVYTSIMPEELNSHLQRISLELKKLLSIERSKTIQNYDVEIYLEETP
PASIKFFTNYTLIVKMMDFYNNESYYNKISKPININEHDDKTFKDFKDLTTHSDLRVLIR
YNNTNVAKLVIFPTHLKIEIERKKIIISMNNLFVNNILKYYYSLQALYVFRFGDPFPFDE
TLIDNNHLQNKINCYNILRYDLLPDSDVFVYFNDSLNRDDLEYSFYRFLSTYVDDVSIWI
DKNITRIKQLSTYNFNN
NT seq
2394 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcaaaagaaacaattctgatagaaattataccaaagataaaggcatatattaat
gatccaaatacaggacctaaatcatactctgattttatagataaaaataaaaatatattt
attattaatttatataatgtttctagtataacagaagaggatattagactattatataat
acaatagaacaaaatataaatgtagataatcaaacacttatatctatattttcttatatc
ggttataaatttgaacaaaatattaaggaagatatttcatctctatcaataactgaatat
aataataaaaatgatgatatgacatttaacttatataatttgttctttaatactttagat
atgtttattaggcaacgaagaataaatgttttagttaatgatgatataagtggtgatatt
aatataaattacagatccagtgatcttatttctgactttaatacagattcagatccagaa
attagggaaataccatttaatatgaaagatatgattacgtatgtatctaaaaatatagac
caattaagattctcaaaaaaatatttagattttgcttatttatgtagacatataggaata
ccaatttccagaagaaaactaaatatgagatatatttacatatataaagtagatggtgtg
tctataccaatagtaattaaagacttcttagatgtaaaatacgtatatttagaagaaaca
ggaaaaaaatataaaaatacattttccgatgataataataatagtttattagaatggggt
aaaataattatcccattactaacaaataaatatttatatagttatatatttttatctaat
cagtatttacgagatctatttccaattctaatagatgatgataaagtagtatttagagat
gttattgataaacaaataatagaaatagatgaaccaaaatcactaacttatgaattaaaa
attgagcaacctccatgtgaacaccaaataaaacttattgatgtgttaaaaattgatcta
gaatactttaataaagttaataattttgcatctgaattcatatattatgaagatggaata
gcgtattgcaaaatatgtggtataaacataccaatatttaatttagatgctgcagatgtt
ataaaagacaatataatagtgtcaacgtataataagtctatatttttaagtgaaccatat
agttattttattcacagccaacgatttatttttaatattataatgtcatttgataatata
atgaaatcacaaacatggattatgaaatataatataaatagaattatattaaatttttta
atagagataaattctaggagacaaatttatgaaaaaaagtttgctaatgaaataaaaaaa
ggtatattctttttaagattatctgctaatctatttgatacacacgtttcgtcaagtgaa
cttttccatcaatcaaaagttcttaatttaaattatatagttgtacttgtaattatttta
aatagtagcgctgactttattctgtcttatatgaaatcaaagaaaaaacaagtagaagaa
tcatctataaaatatatattgtcattaattatatatgattttttattaaaaacaaaaata
tgtgaaaaaggtgacctagacacaataattctattaacggatgtatacacatcaattatg
ccagaagagttaaatagtcatttacaaagaatttctttagaactaaaaaaattattatca
atagaaagatctaaaacaattcagaattacgatgtagagatatacctggaagaaacacca
ccagcatcaataaaattttttactaattacacattaattgttaaaatgatggatttttat
aataatgaatcatattataataaaatatcaaaacctattaatattaatgaacatgatgat
aaaacattcaaagattttaaagatctaacaacacacagtgatttaagggtacttattaga
tataataatacaaatgttgcaaaattagttatatttccaactcatttaaaaatagagatt
gaaagaaaaaaaataattatatctatgaataatctttttgtaaataatatattaaaatac
tattattcattacaagcattatatgtttttagatttggtgatccatttccattcgatgaa
acattaatcgacaataatcatttacaaaataagatcaattgttataatatattaagatat
gatctattgccagatagtgatgtgtttgtatattttaacgattcgttaaatagagatgat
ttagaatattcattttatagatttttatctacatatgtagatgatgtatccatatggata
gataaaaatataactagaataaaacagttatcaacatataattttaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system