Viruses: 11748041
Help
Entry
11748041 CDS
T40000
Symbol
COTV170
Name
(RefSeq) Cotia virus SPAn232; MHC class I antigen
Virus
930275
Cotia virus SPAn232
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
C1-set
MHC_I
C2-set_3
Ig_3
MHC_II_beta
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11748041
NCBI-ProteinID:
YP_005296358
RS:
NC_016924
UniProt:
H6TAD8
LinkDB
All DBs
Position
NC_016924:170429..171274
Genome browser
AA seq
281 aa
AA seq
DB search
MNITQIFIPAYFSVYNILEFYYTGIIHNNNVRFIYSAYLNHEEFIRYDSSSDNPRPELLT
PWAKKLKFSQLVDEYNKIKEMERNFKMNLHILSKGDKPSSYNKLQLISDCVKYPTKNSWS
NTYAYNEKTYSHISSYGGNTWIDEVESNLIKMDDYKNYDCFVDLNRYINKKIPRKLSKPR
VCVEAVKYGNDEESLLALNCYASGFFPKDIYVTWMDDKNSDHHQDCLMVFGPNGDGTYSI
RMEKIVSVGEENNFSCEVYHDPHGYLIANMSDPNYNCKNVF
NT seq
846 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataacacaaatatttatacccgcatacttttcagtatataatattttagagttt
tattatactggtattatacataataataatgttagatttatatattctgcttatctaaat
cacgaagaatttatacgatatgatagttcaagtgacaatccacgtccagaactactaaca
ccatgggcaaaaaaattaaaattttcacaacttgtagatgaatataataaaataaaagaa
atggaacgtaactttaaaatgaatcttcatattttatctaaaggtgataaaccttcttct
tataataaactacaactaatttctgattgtgtaaaatatccaactaaaaattcatggtca
aatacttatgcgtataatgaaaaaacatattctcatattagttcatatggaggaaatacg
tggatagatgaggtagaaagtaaccttataaaaatggatgattataaaaactatgattgt
ttcgttgatctaaacagatatattaataaaaaaataccacgtaaactatcaaaaccaagg
gtatgtgttgaagctgttaagtatggaaatgatgaagaatcattacttgcattaaattgt
tacgctagtggattttttccaaaggatatttacgtaacatggatggatgataaaaatagt
gaccatcatcaagattgcctaatggtttttggaccaaatggagacggaacatattcaata
cgtatggaaaaaattgtttcggttggagaggaaaataattttagttgtgaagtatatcac
gatccacatggttatcttatagcaaatatgtcagatcctaactataattgcaaaaacgta
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
