KEGG   Viruses: 13455351
Entry
13455351          CDS       T40000                                 
Symbol
B863_gp1
Name
(RefSeq) Sweet potato C6 virus; replicase
  KO
K26628  Betaflexiviridae RNA replication polyprotein
Virus
1307958  Sweet potato C6 virus
SSDB
Motif
Pfam: Vmethyltransf RdRP_2 Peptidase_C23 Viral_helicase1 DEAD AAA_22 AAA_19 Peptidase_C65 AAA_14 ATPase_2 ResIII
Other DBs
NCBI-GeneID: 13455351
NCBI-ProteinID: YP_006589919
RS: NC_018448
UniProt: J7GS73
LinkDB
Position
NC_018448:78..6083
AA seq 2001 aa
MALSYRSPIEEVLTNFTTSEQSLVNQSALKTLQEKEARDQKFFNFHMSPTGKQKLIASGI
YLSPFSFEPHSHPICKTLENFMLYKVLPNIIDPSFFFVGIXNSKLDFLKQREKSLDLLTC
INRYVTSADKIRYSNAFVVNSAKPIDCLHRQRDFNFDPSLRDLLPKLITSKARNVFLHDE
LHYWPIKTLLNFLDVLKPNKLVGTLVFPPELLIGSKKSLNPWCYEFEKSGPDDFSFFPDG
VREEGYHQKISCGFLLRASKLITASGDVYCVDLLCSKFAHHMVSITKGEALVSPVRFFGN
FNAVSSDDFGRLNKFSDSIIPMSFDVISRIYRYLRTLLKPDQESAMAKLSQLVPEPTGFE
IKFVQDFSKLVIQTQKLNTFFDDNLMGDFLAFMQKFLPGPLARGCKASRVRSLDAFVENL
KPLSFKVATKSFAYSDDLSWSTLRNLEAESSVDLPYLLDNFSSSNTAESRRTPYFIEAYA
DTIDFNETRMLNLLMELMLIAYLRGRTIKPTLEDAKISIRRVIKDLARNKNHWFLSLFLN
LSEAMQDHLLLRAYCMGLARTYHAKGFRKQKRVFLLTNYSEGNHLQRRESCLYAKCIGEI
LGGGLGSFMRYDSTKRKFLSDSTTSDSSEDLSEQSTSEKEIEKEREPEKSQHALLVDIAP
LPFSKLSLEKRPKSPTLSLDCACGVSRLISKVKLVDSLNLVERKRTDHNLYHWFSRFLMN
LLLGSQELQPSKWPSFLQLICKASGIDDMDYSGALIIDFSGGENLDLDDIIFEPYLSKGN
MIIAHLGGGIDISFKGKNCSSSIVLSEPSFIELFTQKSEDHSIQLKPLSPQSCVLILISS
LFQQRRKVVSEASSSFSNCQEECKQESEPEIKQVSGEDPLIFEPKGDDVIEYEYLDTTVE
VTAGSPVGKYKLVPTKGDGNCFWHALAFFLDLDGKQLKEVAKKRAAENNLIDDSVMQQLE
PDVYAEIESVSIAVSFFGWNIIVFNQKDREIWKVTKKANDKFLSLNLSNEHFEPIVPIND
CLLKSIAEALGRPFRDVLRVVSTKGNSMIYQDLINGDGVPKWLIERCFELFGIKGLVNWD
GELTVVNPAGKFEHSFDLTGDHIEYVKASRRSIGGLARNRLKPSSLKANDMILKQAGSTL
QFKLDFARATILSQCFYEGVTGAISSNLFHDQGNLIEQSINPDGVEREITWILGTFGAGK
SYLFKKFMVQNPGKEIIFISPRRALANEIKRDVAKAISFGGEKLQSKVKELSKNWSIMTF
ETAILSANRIKSTSCIILDEVQLFPPGYLDLLVALTPLESSIFAVGDPCQSSYHSSKDEI
YLGPLEGDIMLQLNGKSYKFNAQSLRFKNPDFVGRLPCTFGSLSDLSHNSILIFEGLDSF
LILPQKYKDVFLVSSFDEKKIPETYVGNDAKLLTFGESTGLNFEFGCILLTGIGESVSEN
RWITALSRFSRNLALINLTGHSLDHIKAVYADRTLGKFLNKTFQKSDFLNFLPGNPSFTS
SFNSSVGASHGVKEEKVRGDPWLKGMLNLAQDPDVQDIEVQKVANYSQSSKTHVARATSE
VVRTSWVHKIREKFSREKRIGHLVSNQFAEEHSKNNGIIMTNAAERYESIYPRHKGSDTV
TFLMAVKKRLRFSNPRVEAGKLNTASLYGKFMLNKFLSKIPLKTHLDHDKMDRANREFEE
KKTSKPAATIENHNARSCTDWYADLAQVFMKSQHCTKFENRFRDAKAAQTIVCFHHSVLC
RFAPYIRYIEMKVKEVLPSNFYIHSGLSIESLDDWVRSNDFNGECTESDYEAFDASQDEY
TLAFELALMEYLKLPKDLISDYRFIKLHLGSKLGMFSVMRFTGEASTFLFNTLANMLFTF
LRYDLRGNESICFAGDDMCANRKLKLNLDYEDFLKRIQLKAKVQFTRKPTFCGWNLNSFG
IYKKPQLVFERMKIAQETNNLHNCLDNYAIEMSFAYSLGEVATALMDDEELNSYYCCIRL
IILNKHHLKSSVRLLFEKLRF
NT seq 6006 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctctatcttatagaagtccaattgaggaagtgctgactaatttcaccacttcagag
caaagtcttgtaaatcagagtgcactcaagacacttcaagaaaaagaagcaagagaccag
aaattcttcaacttccatatgtccccaactgggaaacagaagctgatagcctctggaatc
tacttatcccctttttcttttgagcctcactcgcaccctatttgcaaaactctggagaat
tttatgctatataaggtcttgcccaatattatagacccctcttttttctttgttggtatt
aasaatagtaaattagatttcttaaagcaaagagaaaaatctcttgatctcttgacctgt
atcaatagatacgttactagtgctgataaaattagatacagtaatgcttttgtggtaaac
tcagccaaacccatagattgcctgcatcgacagagggatttcaactttgacccttcatta
agagacttgttgcctaaacttattacaagcaaggcgagaaatgtgtttttgcatgatgaa
ttgcattactggcccattaagaccctgcttaatttcctagatgtgttgaaacctaacaaa
cttgttggaacacttgtttttccacctgaattgctgatagggtcaaagaaaagtttaaac
ccatggtgctatgaatttgaaaaatctggtccagatgatttttcatttttccccgatggg
gttagagaagagggctatcatcaaaaaatttcatgtggatttctgttacgtgcaagcaaa
ctcattactgcttcaggggacgtttattgcgttgacctcctatgctccaaatttgcacat
cacatggtgtctataacgaaaggggaggcccttgttagtcctgtaagattttttggcaac
ttcaatgcagttagctcagatgactttggcaggttgaacaaattttctgactctataatt
ccgatgtcatttgatgtaatttccaggatttacaggtacttaaggactttactgaaacca
gatcaggaatcagccatggctaagttaagtcaacttgtgccagaacccactggctttgag
attaaatttgtgcaggatttcagtaagctagtgattcagactcaaaagcttaatactttc
tttgatgacaatcttatgggagactttctggcctttatgcagaaatttttaccaggaccc
ctagctagaggttgcaaggcgtcaagggtgagaagcttggatgcatttgtggaaaacttg
aaacccttgagctttaaggttgcaacaaagagttttgcttactctgatgacttgtcttgg
tccactctcagaaatctggaggctgaaagcagcgtggatttgccttacttgctggataat
ttctcatcttccaacacagcagaatcaagaagaactccttatttcattgaagcttatgcg
gacacaattgattttaatgaaacaaggatgcttaatcttttgatggaattgatgttaatt
gcatacttgagaggaagaaccattaagccaacattggaagatgctaaaatttccatcaga
agagtgattaaagatctggcaagaaataaaaatcattggtttttatcattgtttttgaat
ttgtcagaggccatgcaagatcacttgctgcttagagcctactgtatggggttagccagg
acttatcatgctaagggttttagaaagcaaaagagggtttttctccttaccaattattct
gaaggcaatcaccttcagcggagagaaagctgtttgtatgctaaatgtattggtgagatc
ttgggtggcggcctagggagtttcatgaggtatgatagcacgaaacgcaaatttttgagt
gactcaactacctcggatagctctgaagatttgagcgagcaatcaacatccgaaaaggaa
attgagaaagagagggaacctgaaaaatcccagcatgctttgctagttgacatagctcca
cttccatttagtaagcttagtttggaaaagaggcctaaatcgcccactttgtcacttgat
tgtgcatgtggtgtttctaggctgatctctaaagttaaattggtggactcattaaatttg
gtggaaagaaaaaggactgatcacaatttatatcactggttttctaggttcttaatgaat
cttctcctaggaagtcaagagttgcagccatctaaatggccatctttcttgcaactcata
tgtaaagccagtggtatagatgacatggattactcaggggctttgataattgatttctct
ggaggggagaatcttgatttggatgacataatttttgaaccttacctttctaaaggcaat
atgattatagctcatttaggcggaggaattgacatttctttcaaaggaaaaaattgctct
tcaagtattgtcttatctgagccctcctttattgagctatttacacaaaagtctgaggat
cactctatacaattgaaacctctaagtccgcaatcatgtgtgcttatcttaatcagcagc
ttatttcaacagcgaagaaaagtggttagtgaagcttctagttcattttccaattgccaa
gaggagtgcaagcaggagtcagagcccgagataaagcaggtgtctggagaagatccccta
atttttgaacccaaaggtgatgatgtcattgaatatgaatatttggacacaactgttgaa
gtcactgctggaagcccagtgggaaagtacaagctcgttcctacaaaaggtgatggcaac
tgcttctggcatgccttggccttctttctcgatttggatggcaagcaacttaaggaagtt
gcaaaaaaaagagctgcagaaaataacttgatagatgatagtgtcatgcaacagcttgag
cctgatgtctatgctgagattgaatccgtctcgatagccgtgtctttctttggttggaac
ataattgtcttcaatcaaaaggatcgagaaatctggaaagtaacaaaaaaggccaatgat
aagttcttaagtctcaatctctcaaatgaacactttgaacccatagttccaattaatgat
tgccttctgaaatcaattgctgaagctttagggagaccttttagggacgtgcttcgagtt
gtcagtactaagggcaatagcatgatttaccaagatctgatcaatggagatggggtcccg
aagtggctcattgaaagatgctttgaattatttggcatcaaaggtctagttaactgggat
ggggaattaacagtagtaaatcctgctggaaagtttgagcatagttttgatctaactggg
gatcatattgaatatgttaaagcaagtaggagaagcattggtggcttagccagaaacaga
ctaaagccatcctcacttaaggctaatgatatgattctaaagcaagctggctcaacttta
caattcaagctggattttgctagagccactattctttcacaatgcttttatgagggtgta
acaggtgcaattagttctaatctttttcatgatcaaggcaatttgattgagcagtcaata
aacccagatggtgttgaaagggagatcacatggattcttggaacctttggagccggaaaa
agttacctctttaagaagttcatggttcaaaatcctggcaaagagatcatatttatctca
ccaagaagagctctggctaatgagattaagagagatgtagcaaaagctatttcttttggt
ggagaaaaattgcaaagcaaggtaaaggagttaagcaagaattggtcaataatgaccttt
gaaacagcaattttaagtgcaaacaggatcaaatcaactagttgcatcatacttgatgag
gtccaattattcccacctggctatttggacctacttgttgctctaactccacttgaaagc
tctatatttgctgttggtgacccttgccagagctcataccactccagcaaggacgaaatt
tatttagggcctttggagggcgacataatgcttcaactaaatgggaaatcctataaattt
aatgcccagagtttaagattcaagaatcctgactttgttggtcgcctaccttgcaccttt
ggcagtttgagtgatctgagtcataatagtattctcatctttgaaggcttagacagtttt
ttaatcttgccacagaaatataaggatgttttccttgtgtctagctttgatgagaagaag
ataccagaaacttatgtgggaaatgatgcaaagctcttgacttttggtgaatctactggc
cttaattttgaatttggctgtattttactcacaggaattggggagtcagtgagcgaaaac
agatggattacagccttgtccaggttttccaggaatctagcgttaattaatcttactggt
catagtttggaccacataaaggcagtctatgctgacaggactttgggcaaattcctcaat
aagactttccagaaaagtgatttcctaaatttcttacctggaaatccaagctttacctca
agtttcaattcatctgttggtgcttcccatggagtcaaagaagagaaagttagaggagat
ccatggctaaaaggaatgctcaatcttgctcaagatcctgatgttcaagacatcgaagtg
cagaaggtagccaactactcccaatcaagcaaaactcatgtagctagggcaacatcagag
gttgttagaactagctgggttcacaaaatcagagaaaagttttctagggagaagagaatt
ggacatttggtatcaaaccagtttgctgaggagcacagtaaaaataatgggattataatg
acaaatgctgctgagagatatgagtcaatataccccaggcacaaaggtagcgatactgtt
actttcctgatggctgtcaagaagagattaaggttttctaatccaagagttgaagcaggg
aagttaaatacagcctcattatatggaaagttcatgctcaataagttcttatccaagata
ccccttaagacccatttggaccatgacaagatggatagagctaatagggaatttgaggag
aagaaaactagcaagccagccgcaacaattgaaaatcataacgccagatcttgcacagat
tggtatgctgatcttgctcaagtttttatgaagtcacagcactgtacaaagtttgaaaac
agatttagagatgccaaagctgcccaaactattgtatgttttcaccactctgtactttgc
aggtttgctccttatattaggtatatagagatgaaagtcaaagaagtgctaccatccaat
ttctacatacactctggattgagcatagaaagcttggatgactgggtgaggagcaacgac
tttaatggagaatgcacagagtccgactatgaggcttttgatgcaagccaagatgagtac
actctagcatttgagcttgctttgatggagtatttgaagctgcctaaggatttgataagt
gattaccgattcatcaaattgcatttggggtccaagctaggcatgttttctgttatgaga
ttcactggagaagccagcaccttcttgtttaatactctggccaacatgttgttcactttt
ctccgctatgatcttagaggtaatgaatctatctgctttgcgggagatgacatgtgcgct
aataggaagttgaagctgaatctggattatgaggattttctaaaaagaattcaattgaag
gccaaggtacaattcacgagaaaaccgactttttgtggctggaacttaaattcttttggc
atttacaaaaagcctcaactagtgtttgagaggatgaagatagctcaagagacaaataat
cttcataattgcctggacaattatgccattgaaatgtctttcgcctactcacttggggaa
gttgccacagctcttatggacgatgaagagcttaatagctattattgttgcattagattg
attatattaaataagcatcatttaaaatcctctgttagactcttatttgagaagcttagg
ttttag

DBGET integrated database retrieval system