Viruses: 14295493
Help
Entry
14295493 CDS
T40000
Symbol
g009, BN80_009
Name
(RefSeq) Yersinia phage phiR1-RT; DNA topoisomerase II large subunit
KO
K26040
Straboviridae DNA topoisomerase large subunit [EC:
5.6.2.2
]
Virus
1206558
Yersinia phage phiR1-RT
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_gyraseB
HATPase_c
TOPRIM_C
Toprim
HATPase_c_3
DNA_gyraseB_C
AAA_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14295493
NCBI-ProteinID:
YP_007235842
RS:
NC_019909
UniProt:
I7J3V5
LinkDB
All DBs
Position
NC_019909:complement(5659..7479)
Genome browser
AA seq
606 aa
AA seq
DB search
MIKNEIKVLSDIEHIKKRSGMYIGSSSNEAHERFMFGRFIQVNYVPGLVKLIDEIIDNSV
DESIRTNFKFANKIDVKIKDNTVIVEDNGRGIPQDLVIDQTGESIPGPVAAWTIPKAGGN
FGDDAERKTGGMNGVGSSLTNIFSVNFVGETGNGKTAICVNCSNGMDTKEWKETKSNWRG
TRVTFTPDFKTFETDELSQVYLDITLDRLQTLAVIYPDIEFKFNGKKIDGNFKKYSKQFG
EEVVIQETDTVSMAFAISPDGFRQLTYVNNIHTKNGGHHVECVMDDICEHLIPAIKKKYK
GIDVTKARIKECLTMLMFIRDMSNMRFDSQTKERLTSPFGEIRNHIQIDAKKISAAILKS
EELIMPIVEAALARKLAAEKAAETKAAKKASKATVVKHIKANSYGNDKLETTLFLTEGDS
AIGYLIEVRDRALHGGYPLRGKFMNTWGMPASKILENREAFEICAITGLTIGEPAENLGY
RNIAIMTDADVDGTGSIYPSLLAFFTQWPELFEQGRIRFVKTPVIIAQVGKAQKWFYDLP
EYDAVKETMPKHSIRYIKGLGSLTRDEYEKVIQEPVYDVVSLPENWKELFEMLLGKNPEL
RKEWMS
NT seq
1821 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaatgaaattaaagttctttcggatatcgaacatattaaaaaacgtagcggt
atgtacattgggtctagctctaatgaagcgcatgaacggtttatgtttgggcgatttatt
caagtcaattatgttcctggattagttaaacttattgatgaaattatagacaactctgtc
gatgaatctattcgcactaattttaaatttgctaataaaattgatgtgaaaattaaagat
aatacagttattgtcgaagataatgggcgaggtattcctcaagatttagttattgaccaa
acaggtgaatctatccctgggccagttgcagcatggactattcctaaagccggcggtaat
ttcggtgatgatgcagaacgtaaaactggtggaatgaacggagtaggttcttctttaact
aatatttttagtgttaattttgttggtgaaactggtaatggcaaaacagccatatgtgtc
aattgttctaatggcatggacactaaagaatggaaagaaactaagtctaattggcgtggt
actcgtgtaacgtttacacctgattttaagacatttgaaacagacgagttgtcacaagtt
tatcttgatataactctagatcgcttacaaactcttgctgtaatttatccagatattgaa
tttaaattcaatggtaaaaaaatagatggcaattttaaaaaatattctaagcaatttggc
gaagaagtagttatccaagaaactgatactgtttcaatggcttttgctataagcccggat
ggatttagacaattaacgtatgttaataatatccacacaaaaaacggtggccatcacgtt
gaatgcgtaatggatgatatttgtgaacatttaattccagctattaaaaagaaatataaa
ggtattgatgtaactaaagctagaattaaagaatgcttaacaatgctaatgtttattcgc
gacatgagtaatatgcgttttgattctcagactaaagaacgattgacatctccatttggt
gaaattcgtaatcatattcaaatagatgctaaaaagatttctgccgctattctgaaatct
gaagaattaattatgcctattgttgaagctgccttggcccgtaaactagctgctgaaaaa
gctgctgaaactaaggctgctaaaaaagcttctaaagcaactgttgttaagcatatcaaa
gccaactcatatggcaatgataaacttgagactacattgttcttaacggaaggcgactcg
gcaattggttatttgattgaagtccgtgacagagcattgcatggtgggtatccattacgt
ggtaagttcatgaatacatggggtatgcctgcttctaaaattcttgaaaaccgtgaagca
ttcgaaatctgcgcaataactggcttaaccattggtgaaccagcagagaatttaggttat
cgtaatattgctattatgactgatgctgatgttgatggaactggctcgatttatccttca
ttactggcattctttacacaatggccagaattatttgaacaaggccgtataagatttgtt
aaaacaccggttattattgctcaagtaggtaaggctcaaaaatggttctatgatttgcct
gaatatgacgctgtaaaagaaacaatgccaaaacatagtattcgctatattaaaggactt
ggttctctaactcgcgatgaatatgaaaaggttatccaagaacctgtatatgatgtcgta
tctttgccagaaaactggaaagaactatttgaaatgcttttaggcaaaaatcctgaactt
cgaaaagaatggatgtcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
