Viruses: 14295661
Help
Entry
14295661 CDS
T40000
Symbol
g177, BN80_181
Name
(RefSeq) Yersinia phage phiR1-RT; homing endonuclease
Virus
1206558
Yersinia phage phiR1-RT
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
MTES_1575
Vsr
DUF1272
Ribosomal_S21e
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14295661
NCBI-ProteinID:
YP_007236010
RS:
NC_019909
UniProt:
I7K338
LinkDB
All DBs
Position
NC_019909:complement(110306..111820)
AA seq
504 aa
AA seq
DB search
MDISIYKDKNGNLNKNWKRIHKENPSIIDGIISIYSDPKTKLILALNNLDELPKCKKCDK
ELPIEKIMAEYCSRKCSASCQLVKDKKLSSIDIESRNKKISESLKGKPTDKTWVTRKKKY
GENGFSSSGINAIKNNSILSLIKREQTCLNRYGVKNPFQIDTVKASIALKQSISNSSRTH
LPEWLYDKEKFSEKYKSIGLRGISLETGCGLNLLYGLTFEYNLRDKNISVAEIELKEFIN
SLGFACETSRKIIAPFELDIYIPEKNLAIEFNGIYWHSSGSKEEDIHKRNYHLNKTELCE
SKGIQLLHIFENEWLDNTKREIWKSVIKVKLGKATKIHARKCKIKQVSYNDAKKFCELNH
LQGHAVFTEAKGLYYEDDLVQLITIGKGRYQNKPELLRMCSKLNTVVQGGASRLLKGVYC
VSYANRRWSQGNVYNAIGMKQICVTKPCDYYIDKGKLFHRSSFMKHLLDKKLDNYNPELT
AVENCYNNKIRRIWDSGNLVFESI
NT seq
1515 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatatctatttataaagataaaaatggcaatttaaacaaaaattggaaaagaatt
cataaagaaaatccttctataattgacggcattatttctatatattcggacccaaaaact
aagctaatactagctttaaacaaccttgatgaattgcctaaatgtaaaaagtgcgataaa
gaacttcctatagaaaaaatcatggcagaatactgttcaagaaaatgttctgcatcgtgc
caattagttaaagataaaaaacttagttctattgatatagaatctcgtaataaaaagata
tcagaatctttaaaaggcaaaccaacagataaaacatgggttacaagaaagaaaaaatat
ggagaaaacggatttagttcttctgggataaatgcaattaaaaataatagtattttgtct
ttgattaaaagagaacaaacatgtttaaatcgttatggtgttaaaaatccatttcaaata
gatacggttaaagcttctattgctctcaaacaatctatatctaattcttcgagaacccat
ttaccggaatggctgtatgataaagaaaaattctctgaaaaatacaaatctataggactt
cgtggaatttctttagaaacaggctgtggacttaatttattatatggacttacttttgaa
tacaatcttagagacaaaaatatttctgtagctgaaattgagttaaaagaatttattaat
tctctaggttttgcctgtgaaacaagccgaaaaataatagctccttttgaacttgatatc
tatattccagagaaaaatctagctatagaatttaacggtatttattggcattcttctggt
tctaaagaagaagatattcataaaagaaattatcatcttaataaaacagaattatgtgaa
tctaaaggaattcaacttttacatatttttgaaaatgaatggttagataatactaaacgt
gaaatatggaaatctgtaattaaagttaaattaggtaaagctacaaaaattcatgcaaga
aaatgtaaaattaaacaggtttcatataacgatgctaaaaagttttgtgaattaaatcat
ttacaagggcatgctgtttttactgaagctaaaggcctttattacgaagatgatttagtt
caattgataactattggtaaaggacgatatcagaataagccagagttattacgcatgtgt
tctaaattaaatactgtagtgcaaggcggcgcgtctagacttttaaagggtgtatattgt
gtttcatatgccaaccggcgttggtctcaaggcaacgtatacaacgctataggaatgaaa
caaatttgtgtaacaaaaccatgtgattattatattgataaaggcaaattatttcatagg
tcatcatttatgaaacatctattagataaaaaactagataattataacccagaattaaca
gcagtagaaaattgttataataataaaattagacgtatatgggattcaggtaatttagta
tttgaatctatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
