Viruses: 1485986
Help
Entry
1485986 CDS
T40000
Symbol
CPXV109_CDS, CPXV109
Name
(RefSeq) Cowpox virus; CPXV109 protein
KO
K25273
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
10243
Cowpox virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
RsgA_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
1485986
NCBI-ProteinID:
NP_619894
UniProt:
Q8QMW7
LinkDB
All DBs
Position
NC_003663:100100..103960
Genome browser
AA seq
1286 aa
AA seq
DB search
MAVISKVTYSLYDQKEINATDIIISHVKNDDDIGTVKDGRLGAMDGALCKTCGKTELECF
GHWGKVSIYKTHIVKPEFISEIIRLLNHICIHCGLLRSREPYSDDINLKELSGHALRRLK
DKILSKKKSCWNSECMQPYQKITFSKKKVCFVNKLDDINVPNSLIYQKLISIHEKFWPLL
EIHQYPANLFYTDYFPIPPLIIRPAISFWIDSIPKETNELTYLLGMIVKNCNLNADEQVI
QKAVIEYDDIKIISNNTTSINLSYITSGKNNMIRSYIVARRKDQTARSVIGPSTAITINE
VGMPAYIRNTLTEKIFVNAFTVDKVKQLLASNQVKFYFNKRLNQLTRIRQGKFIKNKIHL
LPGDWVEVAVQEYTSIIFGRQPSLHRYNVIASSIRATEGDTIKISPGIANSQNADFDGDE
EWMILEQNPKAVVEQSILMYPTTLLKHDIHGAPVYGSIQDEIVAAYSLFRIQDLCLDEVL
NILGKYGREFDPKGKCKFSGKDIYTYLIGEKINYPGLLKDGEIIANDVDSNFVVAMRHLS
LAGLLSDHKSNVEGINFIIKSSYVFKRYLAIYGFGVTFKDLRPNSTFTNKLEAINVEKIE
LIKDAYAKYLKDVRDGKIVPLSKALEADYVESMLSNLTNLNIREIEEHMRQTLIDDPDNN
LLKMAKAGYKVNPTELMYILGTYGQQRIDGEPAETRVLGRVLPYYLPDSKDPEGRGYILN
SLTKGLTGSQYYFSMLVARSQSTDIVCETSRTGTLARKIIKKMEDMVVDGYGQVVIGNTL
IKYAANYTKILGSVCKPVDLIYPDESMTWYLEISALWNKIKQGFVYSQKQKLAKKTLAPF
NFLVFVKPTTEDNAIKVKDLYDMIHNVIDDVREKYFFTVSNIDFMEYIFLTHLNPSRIRI
TKETAITIFEKFYEKLNYTLGGGTPIGIISAQVLSEKFTQQALSSFHTTEKSGAVKQKLG
FNEFNNLTNLSKNKTEIITLVSDDISKLQSVKINFEFVCLGELNPDITLRKETGRYVVDI
IVNRLYIKRAEITELVVEYMIERFVSFSVIVKEWGMETFIEDDDNIRFTVYLNFVEPEEL
NLSKFMMVLPGAANKGKISKFKIPISDYTGYDDFNQTKKLNKMTVELMNLKELGSFDLEN
VNVYPGVWNTYDIFGIEAARGYLCEAMLNTYGEGFDYLYQPCDLLASLLCASYEPESVNK
FKFGAASTLKRATFGDNKALLNAALHKKSEPINDNSSCHFFSKVPNIGTGYYKYFIDLGL
LMRMERKLSDKISSQKIKEMEETEDF
NT seq
3861 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgtaatctctaaggttacgtatagtctatatgatcaaaaagagattaatgctaca
gatattatcattagtcatgttaaaaatgacgacgatatcggtaccgttaaagatggtaga
ctaggtgctatggatggggcattatgtaagacttgtgggaaaacggaattggaatgtttc
ggtcactggggtaaagtaagtatttataaaactcatatagttaagcctgaatttatttca
gaaattattcgtttactgaatcatatatgtattcactgcggattattgcgttcacgagaa
ccgtattccgacgatattaacctaaaagagttatcgggacacgctcttaggagattaaag
gataaaatattatccaagaaaaagtcatgttggaacagcgaatgtatgcaaccgtatcaa
aaaattactttttcaaagaaaaaggtttgtttcgtcaacaagttggatgatattaacgtt
cctaattctctcatctatcaaaagttaatttctattcatgaaaagttttggccattatta
gaaattcatcaatatccagctaacttattttatacagactactttcccatccctccgttg
attattagaccggctattagtttttggatagatagtatacccaaagagaccaatgaatta
acttacttattaggtatgatcgttaagaattgtaacttgaatgctgatgaacaggttatc
cagaaggcggtaatagaatacgatgatattaaaattatttctaataatactaccagtatc
aatttatcatatatcacctccggcaaaaataatatgattagaagttatatcgtcgccaga
cgaaaagatcaaacggctagatcggtaatcggtcccagtacagcaatcaccattaatgag
gtaggaatgcccgcatatattagaaatacacttacagaaaagatatttgttaatgccttt
acagtggataaagttaaacaactattagcgtcgaaccaagttaaattttactttaataaa
cgattaaaccaattaacaagaatacgccaaggaaagtttatcaaaaataaaatacattta
ttgcctggtgattgggtagaagtagctgttcaagaatatacaagtattatttttggaaga
cagccgtctctacatagatacaacgtcatcgcttcgtctatcagagctaccgaaggagat
actatcaaaatatctcccggaattgccaactctcaaaatgctgatttcgacggagatgaa
gaatggatgatattggagcaaaatcctaaagctgtagttgaacaaagtattcttatgtat
ccgacgacgttactcaaacacgatattcatggagcccccgtttatggatctattcaagat
gaaatcgtggcagcgtattcattgtttaggatacaagatctttgtttagatgaagtattg
aacatcttggggaaatatggaagagagttcgatcctaaaggtaaatgtaaattcagcggt
aaagatatctatacttacttgataggtgaaaagattaattatccgggtctcttaaaggat
ggtgaaattattgcaaacgacgtagatagtaattttgttgtggctatgcggcatctgtca
ttggctggactcttatccgatcataagtcgaacgtggaaggtatcaactttattatcaag
tcatcttatgtttttaagagatatctagctatatacggatttggtgtaacgttcaaagat
ctgaggccaaattcgacgttcactaataaattggaggccatcaacgtagaaaaaatagaa
cttatcaaagacgcatatgccaaatatctaaaagatgtaagagacgggaaaatagttcca
ttatctaaagctttagaggcggactatgtggaatccatgttatccaacctgacaaatctt
aatatcagagagatagaagaacatatgagacaaacgctgatagatgatccagataataat
ctcctgaaaatggccaaagcgggttataaagtaaatcccacagaactaatgtatattcta
ggtacttatggacaacagaggattgatggtgaaccagcagagactcgagtattgggtaga
gtcttaccttactatcttccagactctaaggatccagaaggaagaggttatattcttaat
tctttaacaaaaggattaacgggttctcaatattacttttcgatgttggttgccagatct
caatctactgatatcgtctgtgaaacatcacgtaccggaacactagctagaaaaatcatt
aaaaagatggaggatatggtggtcgacggatacggacaagtagttataggtaatacgctc
atcaagtacgccgctaattataccaaaattctaggctcagtatgtaaacctgtagatctt
atctatccagatgagtccatgacttggtatttggaaatcagtgccttgtggaacaaaata
aaacagggattcgtttactctcagaaacaaaaacttgcaaagaagacattggcaccgttt
aatttcctagtatttgtcaaacccaccactgaggataatgccattaaggtcaaggatctg
tatgatatgattcataacgtcattgatgatgtgagagagaaatacttctttacggtatct
aatatagattttatggagtatatattcttgacgcatcttaatccttctagaattagaatc
acaaaagaaacggctatcactatctttgaaaagttctatgaaaaactcaattatactcta
ggtggtggaactcctattggaattatttctgcacaggtattgtctgagaagtttacacaa
caagcactgtccagttttcacactactgaaaagagtggtgctgtcaaacaaaaacttggt
ttcaacgagtttaataacttgactaatttgagtaagaataagaccgaaattatcactctg
gtatccgatgatatctctaaacttcaatctgttaagattaatttcgaatttgtgtgtttg
ggagaattaaatccagacatcactcttcgaaaagaaacaggtagatatgtagtagatata
atagtcaatagattatacatcaagagagcagaaattaccgaattagtcgtcgaatatatg
attgaacgatttgtttcctttagcgtcattgtaaaggaatggggtatggagacattcatt
gaggacgatgataatatcagattcactgtctacctaaattttgttgaaccggaggaattg
aatcttagtaagtttatgatggttcttccgggtgccgccaacaagggcaagattagtaaa
ttcaagattcctatctctgactatacgggatatgacgacttcaatcaaacaaaaaagctc
aataagatgactgtagaactcatgaatctaaaagaattgggttctttcgatttggagaac
gtcaacgtgtatcctggagtatggaatacatacgatatcttcggtatcgaggccgctcgt
ggatacttgtgcgaagccatgttaaacacctatggagaaggtttcgattatctgtatcag
ccttgtgatcttcttgctagtttactatgtgctagttacgaaccagaatcagtgaataaa
ttcaagttcggtgcagctagtactcttaagagagctacgttcggagacaataaagcattg
ttaaacgcggctcttcataaaaagtcagaacctattaacgataatagtagctgccacttt
tttagcaaggtccctaatataggaactggatattacaaatactttatcgacttgggtctt
ctcatgagaatggaaaggaaactatctgataagatatcttctcaaaagatcaaggagatg
gaagaaacagaagacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system