KEGG   Viruses: 1485986
Entry
1485986           CDS       T40000                                 
Symbol
CPXV109_CDS, CPXV109
Name
(RefSeq) Cowpox virus; CPXV109 protein
  KO
K25273  Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:2.7.7.6]
Virus
10243  Cowpox virus
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_4 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_1 RsgA_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 1485986
NCBI-ProteinID: NP_619894
UniProt: Q8QMW7
LinkDB
Position
NC_003663:100100..103960
AA seq 1286 aa
MAVISKVTYSLYDQKEINATDIIISHVKNDDDIGTVKDGRLGAMDGALCKTCGKTELECF
GHWGKVSIYKTHIVKPEFISEIIRLLNHICIHCGLLRSREPYSDDINLKELSGHALRRLK
DKILSKKKSCWNSECMQPYQKITFSKKKVCFVNKLDDINVPNSLIYQKLISIHEKFWPLL
EIHQYPANLFYTDYFPIPPLIIRPAISFWIDSIPKETNELTYLLGMIVKNCNLNADEQVI
QKAVIEYDDIKIISNNTTSINLSYITSGKNNMIRSYIVARRKDQTARSVIGPSTAITINE
VGMPAYIRNTLTEKIFVNAFTVDKVKQLLASNQVKFYFNKRLNQLTRIRQGKFIKNKIHL
LPGDWVEVAVQEYTSIIFGRQPSLHRYNVIASSIRATEGDTIKISPGIANSQNADFDGDE
EWMILEQNPKAVVEQSILMYPTTLLKHDIHGAPVYGSIQDEIVAAYSLFRIQDLCLDEVL
NILGKYGREFDPKGKCKFSGKDIYTYLIGEKINYPGLLKDGEIIANDVDSNFVVAMRHLS
LAGLLSDHKSNVEGINFIIKSSYVFKRYLAIYGFGVTFKDLRPNSTFTNKLEAINVEKIE
LIKDAYAKYLKDVRDGKIVPLSKALEADYVESMLSNLTNLNIREIEEHMRQTLIDDPDNN
LLKMAKAGYKVNPTELMYILGTYGQQRIDGEPAETRVLGRVLPYYLPDSKDPEGRGYILN
SLTKGLTGSQYYFSMLVARSQSTDIVCETSRTGTLARKIIKKMEDMVVDGYGQVVIGNTL
IKYAANYTKILGSVCKPVDLIYPDESMTWYLEISALWNKIKQGFVYSQKQKLAKKTLAPF
NFLVFVKPTTEDNAIKVKDLYDMIHNVIDDVREKYFFTVSNIDFMEYIFLTHLNPSRIRI
TKETAITIFEKFYEKLNYTLGGGTPIGIISAQVLSEKFTQQALSSFHTTEKSGAVKQKLG
FNEFNNLTNLSKNKTEIITLVSDDISKLQSVKINFEFVCLGELNPDITLRKETGRYVVDI
IVNRLYIKRAEITELVVEYMIERFVSFSVIVKEWGMETFIEDDDNIRFTVYLNFVEPEEL
NLSKFMMVLPGAANKGKISKFKIPISDYTGYDDFNQTKKLNKMTVELMNLKELGSFDLEN
VNVYPGVWNTYDIFGIEAARGYLCEAMLNTYGEGFDYLYQPCDLLASLLCASYEPESVNK
FKFGAASTLKRATFGDNKALLNAALHKKSEPINDNSSCHFFSKVPNIGTGYYKYFIDLGL
LMRMERKLSDKISSQKIKEMEETEDF
NT seq 3861 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctgtaatctctaaggttacgtatagtctatatgatcaaaaagagattaatgctaca
gatattatcattagtcatgttaaaaatgacgacgatatcggtaccgttaaagatggtaga
ctaggtgctatggatggggcattatgtaagacttgtgggaaaacggaattggaatgtttc
ggtcactggggtaaagtaagtatttataaaactcatatagttaagcctgaatttatttca
gaaattattcgtttactgaatcatatatgtattcactgcggattattgcgttcacgagaa
ccgtattccgacgatattaacctaaaagagttatcgggacacgctcttaggagattaaag
gataaaatattatccaagaaaaagtcatgttggaacagcgaatgtatgcaaccgtatcaa
aaaattactttttcaaagaaaaaggtttgtttcgtcaacaagttggatgatattaacgtt
cctaattctctcatctatcaaaagttaatttctattcatgaaaagttttggccattatta
gaaattcatcaatatccagctaacttattttatacagactactttcccatccctccgttg
attattagaccggctattagtttttggatagatagtatacccaaagagaccaatgaatta
acttacttattaggtatgatcgttaagaattgtaacttgaatgctgatgaacaggttatc
cagaaggcggtaatagaatacgatgatattaaaattatttctaataatactaccagtatc
aatttatcatatatcacctccggcaaaaataatatgattagaagttatatcgtcgccaga
cgaaaagatcaaacggctagatcggtaatcggtcccagtacagcaatcaccattaatgag
gtaggaatgcccgcatatattagaaatacacttacagaaaagatatttgttaatgccttt
acagtggataaagttaaacaactattagcgtcgaaccaagttaaattttactttaataaa
cgattaaaccaattaacaagaatacgccaaggaaagtttatcaaaaataaaatacattta
ttgcctggtgattgggtagaagtagctgttcaagaatatacaagtattatttttggaaga
cagccgtctctacatagatacaacgtcatcgcttcgtctatcagagctaccgaaggagat
actatcaaaatatctcccggaattgccaactctcaaaatgctgatttcgacggagatgaa
gaatggatgatattggagcaaaatcctaaagctgtagttgaacaaagtattcttatgtat
ccgacgacgttactcaaacacgatattcatggagcccccgtttatggatctattcaagat
gaaatcgtggcagcgtattcattgtttaggatacaagatctttgtttagatgaagtattg
aacatcttggggaaatatggaagagagttcgatcctaaaggtaaatgtaaattcagcggt
aaagatatctatacttacttgataggtgaaaagattaattatccgggtctcttaaaggat
ggtgaaattattgcaaacgacgtagatagtaattttgttgtggctatgcggcatctgtca
ttggctggactcttatccgatcataagtcgaacgtggaaggtatcaactttattatcaag
tcatcttatgtttttaagagatatctagctatatacggatttggtgtaacgttcaaagat
ctgaggccaaattcgacgttcactaataaattggaggccatcaacgtagaaaaaatagaa
cttatcaaagacgcatatgccaaatatctaaaagatgtaagagacgggaaaatagttcca
ttatctaaagctttagaggcggactatgtggaatccatgttatccaacctgacaaatctt
aatatcagagagatagaagaacatatgagacaaacgctgatagatgatccagataataat
ctcctgaaaatggccaaagcgggttataaagtaaatcccacagaactaatgtatattcta
ggtacttatggacaacagaggattgatggtgaaccagcagagactcgagtattgggtaga
gtcttaccttactatcttccagactctaaggatccagaaggaagaggttatattcttaat
tctttaacaaaaggattaacgggttctcaatattacttttcgatgttggttgccagatct
caatctactgatatcgtctgtgaaacatcacgtaccggaacactagctagaaaaatcatt
aaaaagatggaggatatggtggtcgacggatacggacaagtagttataggtaatacgctc
atcaagtacgccgctaattataccaaaattctaggctcagtatgtaaacctgtagatctt
atctatccagatgagtccatgacttggtatttggaaatcagtgccttgtggaacaaaata
aaacagggattcgtttactctcagaaacaaaaacttgcaaagaagacattggcaccgttt
aatttcctagtatttgtcaaacccaccactgaggataatgccattaaggtcaaggatctg
tatgatatgattcataacgtcattgatgatgtgagagagaaatacttctttacggtatct
aatatagattttatggagtatatattcttgacgcatcttaatccttctagaattagaatc
acaaaagaaacggctatcactatctttgaaaagttctatgaaaaactcaattatactcta
ggtggtggaactcctattggaattatttctgcacaggtattgtctgagaagtttacacaa
caagcactgtccagttttcacactactgaaaagagtggtgctgtcaaacaaaaacttggt
ttcaacgagtttaataacttgactaatttgagtaagaataagaccgaaattatcactctg
gtatccgatgatatctctaaacttcaatctgttaagattaatttcgaatttgtgtgtttg
ggagaattaaatccagacatcactcttcgaaaagaaacaggtagatatgtagtagatata
atagtcaatagattatacatcaagagagcagaaattaccgaattagtcgtcgaatatatg
attgaacgatttgtttcctttagcgtcattgtaaaggaatggggtatggagacattcatt
gaggacgatgataatatcagattcactgtctacctaaattttgttgaaccggaggaattg
aatcttagtaagtttatgatggttcttccgggtgccgccaacaagggcaagattagtaaa
ttcaagattcctatctctgactatacgggatatgacgacttcaatcaaacaaaaaagctc
aataagatgactgtagaactcatgaatctaaaagaattgggttctttcgatttggagaac
gtcaacgtgtatcctggagtatggaatacatacgatatcttcggtatcgaggccgctcgt
ggatacttgtgcgaagccatgttaaacacctatggagaaggtttcgattatctgtatcag
ccttgtgatcttcttgctagtttactatgtgctagttacgaaccagaatcagtgaataaa
ttcaagttcggtgcagctagtactcttaagagagctacgttcggagacaataaagcattg
ttaaacgcggctcttcataaaaagtcagaacctattaacgataatagtagctgccacttt
tttagcaaggtccctaatataggaactggatattacaaatactttatcgacttgggtctt
ctcatgagaatggaaaggaaactatctgataagatatcttctcaaaagatcaaggagatg
gaagaaacagaagacttttaa

DBGET integrated database retrieval system