Viruses: 1486557
Help
Entry
1486557 CDS
T40000
Symbol
B26R, VARVgp194
Name
(RefSeq) Variola virus; hypothetical protein
Virus
10255
Variola virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Poxvirus_B22R_C
Poxvirus_B22R
Poxvirus_B22R_N
DUF6377
DUF2207_C
7TMR-HDED
MLANA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
1486557
NCBI-ProteinID:
NP_042238
RS:
NC_001611
UniProt:
Q89192
LinkDB
All DBs
Position
NC_001611:174369..180059
AA seq
1896 aa
AA seq
DB search
MNLQRLSLAIYLTVTCSWCYETCMRKTALFHDNQLGHAEDNQDSVASLPYKYLQVVNKRE
RSRLLATFNWTSIAEGVKNDFIRICDINGTYLYNYTIAASMIIDSMEELPTITTYEPSTY
NYTFDNSTVSTTEELKVTPSPTTYATVTTPLPTSSVPYDQRSNNNVGTISIQILSKILGV
NETELTNYLITHKNATVDNNTLYGNIGFLEINNCYNISVSNASFRITLVNNTSEEIVIML
TGTSSSDTFISSTNTTECLKTLINNTSNISDVSITQNMNVTSNCDKCSMNLMTSVIPAVK
EFNNTLKKIGVKDDKNNTVYNYYNCKLTTNSTCDELINLDEVINNITLTNIISSSVSTTN
SRKRRDLNGEFEFSTSEELDCLYKSYGVSDDVSHCFSSPRRRRSDDKQEYTEMKLLDHAK
KDLRIDSVIPRGTTHFQVGASGASGGVVGDSSPFQNVKSRASLLAEKIMPRVPTTATEEQ
LYATINRQTKLPAGVKSTPFTEALVSTINQKLSSVKEVTYASSNLPGSSGYVHRPSDSVI
YSTIRRTRLPSDTDSDFEDIQTVVKEYNERYGRRVSRTQSSSSDFEDIDEVVAEYRQKYG
GASRGRTSSSSSSDFEDIDEVVAEYRQKYGNAMTKGRGSSKPDPLYSTVKKTPKSIASGV
DIVSKQTDYSLLPGVNTGSSIVTPLTRRGATRRPKRPSTPPREDLPPLPLNPPYRQLSRG
GDHSLQQVPQRDYSPPHRPPPPLPPKPVPAIPPRDSQPNNKGFSKFVSPRRCRRSTSGVV
CGMIQSRPNDDTYSLLQLPKIEPEYAEVGNGLPKNNVPVIGNKHSKKYTSSMSKISTKFD
KSMAFGTAMLLTGQQAINQQDRSTALIKKDQMSKDEKIFEAVTMTLSTIGSTLTTAGMIA
PPLMIAGIGISLISGIIDTAKDIYYLFSGQEKPVDPVIKFFNTYAGLVSDSSKMGVRKCL
TPGEDTLIYIAYKNDSSFKQNTEAMALYFLDVINSEILYLNTSNLVLEYHLKVACPIGTL
RSVDVDITAYTILYDTADNIKKYKFIRMATLLSKHPVIRLTCGLAATLVIKPYEVPISDM
QLLKMATHGEPESTKSIPSDVCDRYPLKKFYLLAGGCPYDTSQTFIVHTTCSILLRTATW
DQFRNRWVLQNPFRQEGTYKQLFTFSKYDFNDTIIDPNGVAGHASFCTNRSSNQCFWSEP
MILEDVSSCSSRTRKIYVKLGIFNTEGFNSFVLNCPTGSTPTYIKDKNTDSNNVIIELPV
GDYGTAKLYSVTKPSRIAVFCTHNYDKRFKSDIIVLIFNSISGIPFSSIYTGSVNGRNRL
FTTLSKGMPYRSMYCDNRRPGCYYAGIPFNENSVESDLHYGPEIMLKETYDTNSIDPQVI
TKSKTHFPTPISVKFTVDNLGNGYNKPENFWKDAKSKKRTYSAMTIKILPCTVRNKNVDF
GYNYGHIISNMVYAQSTSQDYGDGTNYTFKSVNRSDHECESILDLKAKEVTVMCPAFSIP
RNISAYEGLCFSVTTSKDHCASNKEWLKSYGYGNTDATKQRVCFHHWNYVTTSLDYYCSY
EDIWKSDWPDYDPCKSYIYIEYRDIWIESKVLQQPPYTFEFTHDDSNEYVNKEISNKLND
LYNEYKNIMEYSDGSLPASINRLAKSLTSEGREIASVNIDGNLLDIAYQADKEKMADIQN
KINDITRDLFIHTLSNKDIKDIIESEEGKRCCIIDVKNNRVKKYYPIDNYLCGTLDDYIY
TSVEYNKSYVLINDTYMSYDYLESSGVVVLSCYEMTIISLDTKDAKDAIEDEIVASAVAE
ALNDMFKEFDKNVSVIIIKEEDNYLNSSPNIYHIIYIIGGTILILLVIILILVIYIACNK
YRTRKYKIMKDDTMSIKSEHHNSLETVSMEIMDNRY
NT seq
5691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttacagagattatctctggctatatatcttactgtgacatgttcgtggtgttat
gaaacatgtatgagaaaaactgcgttgtttcatgacaatcaattggggcatgcggaagac
aatcaagatagtgtagcgtcgctaccgtacaagtatctacaagtagtcaataaaagagaa
cgtagtagattgctggctacgtttaattggacaagtatagctgagggtgttaaaaatgat
ttcattagaatatgtgatatcaacggaacatatctatataattatactattgctgctagt
atgattattgattccatggaagaactaccaacaattacaacatatgaaccgtctacctat
aattatactttcgataatagcactgttagtactactgaagaactaaaagtgactccatca
ccaactacatacgcgactgtaacaactcctcttccaacatcatcagttccatatgatcaa
cgatctaataacaatgtaggtactatatctattcagatactgagtaaaatattgggagtc
aatgaaacagaattaactaattatcttattacgcataaaaatgccacggttgacaataac
acattgtatggtaatataggatttttggaaataaataattgctacaatatttctgtatca
aatgctagttttagaataacattagtaaacaatacttctgaagaaattgttataatgcta
acagggactagttcatccgacaccttcatatcttccaccaataccactgaatgtttgaaa
acattaatcaataatacgtcgaatattagtgatgtaagtataacacaaaatatgaatgta
acatctaattgtgataaatgttcaatgaatttgatgacatccgttatccctgccgttaaa
gaatttaacaatacgttgaaaaaaattggtgtaaaagatgataaaaacaatacagtatat
aactattataattgtaaactaactacaaattctacatgtgacgagttaatcaatttagat
gaagtcattaacaatataactttgacaaatattataagtagtagtgtttctacaaccaac
agcagaaaaagacgagatctgaatggtgagtttgaattttctacatccgaggaattagat
tgtctttacaaatcatatggtgtaagtgatgatgtaagtcattgtttttcatcacctaga
cgtagacgatctgacgacaaacaggagtacacagaaatgaaattactcgaccacgcgaaa
aaagatttaagaatagacagtgttattcctagaggtacaactcatttccaagtaggtgca
tctggagcaagtggtggtgttgtaggtgatagttccccatttcaaaatgttaaatcacgg
gccagtctattggcagaaaaaataatgcctagagtacccactactgctaccgaagagcag
ctatatgcaactataaatagacaaacaaagttgcctgcaggtgttaaaagtactccgttt
acagaggcgcttgtgtctacgataaaccaaaagctttctagtgttaaagaggtaacttat
gcttcgtccaatctgccaggatcaagtggttatgttcatagaccatctgattctgttatt
tacagcactataagacggacacgtttacctagtgataccgatagtgattttgaggatata
caaactgttgttaaggaatataatgaaagatatggtagacgagttagtagaacacagtca
tcaagtagtgattttgaagatatagatgaggtggttgcagaatatagacaaaaatatggt
ggagctagccgtggtagaacatcgtcatcaagtagtagtgattttgaagatatagatgag
gtggttgcagaatatagacaaaaatatggcaacgctatgacaaaaggacgtggttcttct
aaaccggatccgttatatagtactgttaagaaaacacctaaaagtatagcatctggagta
gacatagtttcaaaacaaacagactattctttattacccggcgttaatactggcagttct
atcgtaacacctctcaccagaagaggagctactagacgacctaaacgcccatctacacct
ccacgcgaagatctaccaccgcttcctctaaatcctccttatcgacaactttctcgtggt
ggtgatcattctctacaacaagttcctcaacgtgattattctccaccacatagacctcct
ccaccacttcctcctaaaccagttccagctattccacctagagatagtcaaccaaataat
aaaggatttagtaagtttgtatctcctagacggtgtagaagatcaacctctggagtcgta
tgtggtatgatacaatcaagaccaaacgatgatacatattcacttcttcaactaccaaaa
attgaaccagaatatgcggaggtaggtaatggcttacccaagaacaatgttcctgtgata
ggcaataaacatagtaaaaaatatacatcgtcgatgtcaaaaatatcaacaaaatttgat
aaatctatggcatttggaacagcaatgttactaactggtcaacaggctattaaccaacag
gatagatcaactgcgttgattaaaaaagatcaaatgagcaaggacgaaaaaatattcgaa
gcagttacaatgactctatcaactataggttcaacgttgacaactgcaggtatgatagct
ccaccactaatgattgctggaataggtatatcgcttatatcaggtataatagatacggca
aaagatatatattacctattttcaggacaggagaagccagtagatccagttattaagttt
tttaacacatacgctggattagtatccgatagtagtaaaatgggtgtaaggaaatgtttg
acgcctggagaagacacacttatttacatcgcatacaaaaacgattccagttttaaacaa
aatacggaggcaatggctttatatttcttagatgttatcaactcagagatcctatatcta
aacacatcaaatttagttttagagtatcatctaaaggtggcttgtcccataggaacatta
agatctgtagatgtggacataactgcgtatacaatattatatgatacagcggataatatt
aaaaaatacaagtttatcagaatggcaacgctactatccaaacatccagttattagattg
acatgtggtttagcagcaacattggtaattaaaccgtacgaggtacccatcagtgatatg
caactactaaaaatggcaacgcatggtgaaccagaatccactaaatcaataccatctgat
gtctgtgataggtatcctctaaagaaattctatcttttggctggtggttgtccatatgat
acatctcaaacttttattgtacatactacttgcagtattttactaagaacagctacatgg
gatcagtttagaaacagatgggtgttacaaaatccatttaggcaagaagggacatataag
caactgtttacctttagcaaatacgattttaacgacaccataatagatcctaatggtgtg
gcgggtcatgctagcttttgtaccaatagaagcagcaaccaatgtttctggtcagaacct
atgatattggaagatgtatcatcgtgtagttctagaactagaaaaatatacgtaaaactg
ggaatatttaatactgaagggtttaatagttttgtactaaactgtccaactgggtctacg
ccaacatacatcaaagataaaaatacggacagtaacaatgttatcatagagctacctgta
ggtgattacggcactgccaaattgtattcggtaacaaaaccatcgagaatagctgtattc
tgcacacataactatgataaacgattcaaatcagatattatagttctaatatttaatagt
atcagtggtattccattttcgagcatatacacaggaagtgtgaacggtagaaatagactg
ttcaccacattgtctaaaggaatgccatatagatcaatgtattgcgataacagacgacca
ggttgttattatgcaggaataccatttaatgaaaatagtgtagaatcagatctgcattat
ggaccagaaataatgcttaaggaaacatatgacacaaacagtattgatccacaagttata
acaaagtcaaaaacacactttcctactccaataagtgtaaaatttacggttgacaattta
ggaaatgggtataacaaacccgaaaatttttggaaagacgctaaaagtaagaaaaggaca
tatagcgcaatgacaataaaaatcctaccatgtacagtgagaaataaaaatgtagacttt
ggatataactatggacatattatttccaatatggtttatgcacaatctactagtcaggat
tatggagatggtaccaactatacatttaaatctgtaaatagatccgatcatgagtgtgaa
tctattttagatttgaaggctaaggaagtaactgtgatgtgtcccgcgtttagtatacca
agaaatatatcagcgtatgaaggtctatgctttagtgtcactacatctaaagatcattgt
gcctcaaataaggaatggttaaaatcttatggttatgggaatacagatgctactaaacaa
cgtgtctgttttcatcattggaattatgtcacaacgtcgttggattattactgttcatac
gaagatatttggaaaagcgactggcctgactatgatccatgtaagtcatatatttatata
gagtatagagacatatggatagaatctaaagtgttgcagcaacctccttatacattcgaa
ttcacacatgacgattctaatgaatacgtgaataaagaaattagtaacaaattgaatgat
ctgtacaatgaatacaagaacattatggaatatagcgacggatcattgcctgcttctata
aacagattagcaaaatcattaacttcagagggtagagaaatagcaagtgttaatatagat
ggtaatctgttagatattgcatatcaagcagataaggaaaagatggctgatatacagaac
aaaataaatgacatcacaagagatttattcattcacactttatcaaacaaagatataaaa
gacattatagaatccgaagaaggtaagagatgttgtataatagatgttaagaacaatcgt
gttaaaaagtactatcctattgataattatctatgtggtactttagatgattatatatac
acttctgtagaatataacaaatcctatgtgttaataaacgacacttacatgagctatgac
tatcttgaatcatcaggtgtagttgttttatcatgttatgaaatgactataatctccttg
gatacaaaagacgccaaagatgctatagaagatgagatagtagcaagtgctgtagccgaa
gcattgaatgacatgtttaaggaatttgataaaaacgtaagtgttattataataaaagaa
gaagataattatctaaacagttctccgaatatataccatataatatacatcataggcggc
actattctgatactgttagtcattattttaatattggtaatttatatagcatgcaataaa
tacagaaccaggaaatataaaataatgaaagatgatactatgagcattaaatctgagcat
cataatagtcttgaaacagtatctatggaaattatggataatcggtactaa
DBGET
integrated database retrieval system