KEGG   Viruses: 1493919
Entry
1493919           CDS       T40000                                 
Symbol
HAVgp2
Name
(RefSeq) Hepatovirus A; hypothetical protein
  KO
K27798  Hepatovirus genome polyprotein
Virus
12092  Hepatovirus A
SSDB
Motif
Pfam: RdRP_1 HAV_VP 2B_soluble Rhv RNA_helicase RdRP_4 Calici_coat Peptidase_C3 RdRP_2 Peptidase_C3G
Other DBs
NCBI-GeneID: 1493919
NCBI-ProteinID: NP_041008
RS: NC_001489
UniProt: P08617
Structure
LinkDB
Position
NC_001489:741..7418
AA seq 2225 aa
MSRQGIFQTVGSGLDHILSLADIEEEQMIQSVDRTAVTGASYFTSVDQSSVHTAEVGSHQ
VEPLRTSVDKPGSKKTQGEKFFLIHSADWLTTHALFHEVAKLDVVKLLYNEQFAVQGLLR
YHTYARFGIEIQVQINPTPFQQGGLICAMVPGDQSYGSIASLTVYPHGLLNCNINNVVRI
KVPFIYTRGAYHFKDPQYPVWELTIRVWSELNIGTGTSAYTSLNVLARFTDLELHGLTPL
STQMMRNEFRVSTTENVVNLSNYEDARAKMSFALDQEDWKSDPSQGGGIKITHFTTWTSI
PTLAAQFPFNASDSVGQQIKVIPVDPYFFQMTNTNPDQKCITALASICQMFCFWRGDLVF
DFQVFPTKYHSGRLLFCFVPGNELIDVSGITLKQATTAPCAVMDITGVQSTLRFRVPWIS
DTPYRVNRYTKSAHQKGEYTAIGKLIVYCYNRLTSPSNVASHVRVNVYLSAINLECFAPL
YHAMDVTTQVGDDSGGFSTTVSTEQNVPDPQVGITTMKDLKGKANRGKMDVSGVQAPVGA
ITTIEDPVLAKKVPETFPELKPGESRHTSDHMSIYKFMGRSHFLCTFTFNSNNKEYTFPI
TLSSTSNPPHGLPSTLRWFFNLFQLYRGPLDLTIIITGATDVDGMAWFTPVGLAVDTPWV
EKESALSIDYKTALGAVRFNTRRTGNIQIRLPWYSYLYAVSGALDGLGDKTDSTFGLVSI
QIANYNHSDEYLSFSCYLSVTEQSEFYFPRAPLNSNAMLSTESMMSRIAAGDLESSVDDP
RSEEDKRFESHIECRKPYKELRLEVGKQRLKYAQEELSNEVLPPPRKMKGLFSQAKISLF
YTEEHEIMKFSWRGVTADTRALRRFGFSLAAGRSVWTLEMDAGVLTGRLIRLNDEKWTEM
KDDKIVSLIEKFTSNKYWSKVNFPHGMLDLEEIAANSKDFPNMSETDLCFLLHWLNPKKI
NLADRMLGLSGVQEIKEQGVGLIAECRTFLDSIAGTLKSMMFGFHHSVTVEIINTVLCFV
KSGILLYVIQQLNQDEHSHIIGLLRVMNYADIGCSVISCGKVFSKMLETVFNWQMDSRMM
ELRTQSFSNWLRDICSGITIFKNFKDAIYWLYTKLKDFYEVNYGKKKDILNILKDNQQKI
EKAIEEADEFCILQIQDVEKFEQYQKGVDLIQKLRTVHSMAQVDPNLMVHLSPLRDCIAR
VHQKLKNLGSINQAMVTRCEPVVCYLYGKRGGGKSLTSIALATKICKHYGVEPEKNIYTK
PVASDYWDGYSGQLVCIIDDIGQNTTDEDWSDFCQLVSGCPMRLNMASLEEKGRHFSSPF
IIATSNWSNPSPKTVYVKEAIDRRLHFKVEVKPASFFKNPHNDMLNVNLAKTNDAIKDMS
CVDLIMDGHNVSLMDLLSSLVMTVEIRKQNMTEFMELWSQGISDDDNDSAVAEFFQSFPS
GEPSNSKLSGFFQSVTNHKWVAVGAAVGILGVLVGGWFVYKHFSRKEEEPIPAEGVYHGV
TKPKQVIKLDADPVESQSTLEIAGLVRKNLVQFGVGEKNGCVRWVMNALGVKDDWLLVPS
HAYKFEKDYEMMEFYFNRGGTYYSISAGNVVIQSLDVGFQDVVLMKVPTIPKFRDITQHF
IKKGDVPRALNRLATLVTTVNGTPMLISEGPLKMEEKATYVHKKNDGTTVDLTVDQAWRG
KGEGLPGMCGGALVSSNQSIQNAILGIHVAGGNSILVAKLVTQEMFQNIDKKIESQRIMK
VEFTQCSMNVVSKTLFRKSPIYHHIDKTMINFPAAMPFSKAEIDPMAVMLSKYSLPIVEE
PEDYKEASIFYQNKIVGKTQLVDDFLDLDMAITGAPGIDAINMDSSPGFPYVQEKLTKRD
LIWLDENGLLLGVHPRLAQRILFNTVMMENCSDLDVVFTTCPKDELRPLEKVLESKTRAI
DACPLDYSILCRMYWGPAISYFHLNPGFHTGVAIGIDPDRQWDELFKTMIRFGDVGLDLD
FSAFDASLSPFMIREAGRIMSELSGTPSHFGTALINTIIYSKHLLYNCCYHVCGSMPSGS
PCTALLNSIINNVNLYYVFSKIFGKSPVFFCQALKILCYGDDVLIVFSRDVQIDNLDLIG
QKIVDEFKKLGMTATSADKNVPQLKPVSELTFLKRSFNLVEDRIRPAISEKTIWSLIAWQ
RSNAEFEQNLENAQWFAFMHGYEFYQKFYYFVQSCLEKEMIEYRLKSYDWWRMRFYDQCF
ICDLS
NT seq 6678 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctagacaaggtattttccagactgttgggagtggtcttgaccacatcctgtctttg
gcagacattgaggaagagcaaatgattcaatcagttgataggactgcagtgactggtgct
tcttattttacttctgtggatcaatcttcagttcatacagctgaggttggatcacaccag
gttgaacctttgagaacctctgttgataaacccggttcaaagaagactcagggagagaaa
tttttcttgattcattctgcagattggcttactacacatgctcttttccatgaagttgca
aaattggatgtggtgaaattattatacaatgagcagtttgctgttcaagggttgttgaga
taccatacatatgcaagatttggcattgaaattcaagttcagataaaccctacacctttc
caacaggggggattgatctgtgctatggttcctggtgaccagagctatggttctatagca
tcattgactgtttatcctcatggtttgttaaattgcaatattaacaatgtggttagaata
aaggttccatttatttacacaagaggtgcttaccactttaaagatccacaatacccagtt
tgggaattgacaattagagtttggtcagaattaaatattgggacaggaacttcagcttat
acttcactcaatgttttagctagatttacagatttggagttgcatggattaactcctctt
tctacacaaatgatgagaaatgaatttagggtcagtactactgagaatgtggtgaatctg
tcaaattatgaagatgcaagagcaaagatgtcttttgctttggatcaggaagattggaaa
tctgatccgtcccagggtggtgggatcaaaattactcattttactacttggacatctatt
ccaactttggctgctcagtttccatttaatgcttcagactcagttggtcaacaaattaaa
gttattccagttgacccatattttttccaaatgacaaatacgaatcctgaccaaaaatgt
ataactgctttggcttctatttgtcagatgttttgtttttggagaggagatcttgtcttt
gattttcaagtttttcccaccaaatatcattcaggtagattactgttttgttttgttcct
ggcaatgagctaatagatgtttctggaatcacattaaagcaagcaactactgctccttgt
gcagtaatggatattacaggagtgcagtcaactttgagatttcgtgttccctggatttct
gacactccttacagagtgaacaggtatacaaagtcagcacatcagaaaggtgagtacact
gccattgggaagcttattgtgtattgttataacagattgacctctccttctaacgttgct
tcccatgtcagagtgaatgtttatctttcagcaattaacttggaatgttttgctcctctt
tatcatgctatggatgttactacacaagttggagatgattctggaggtttttcaacaaca
gtttctacagaacagaatgttccagatccccaagttggtataacaaccatgaaagatttg
aaaggaaaagctaacagagggaaaatggatgtttcaggagtacaagcacctgtgggagct
atcacaacaattgaggatccagttttagcaaagaaagtacctgagacatttcctgaattg
aaacctggagaatccagacatacatcagatcatatgtccatctacaagtttatgggaagg
tctcatttcttgtgcacttttacattcaattcaaataataaagagtacacatttcctata
accttgtcttcaacctctaatcctcctcatggtttgccatcaacactgaggtggtttttc
aacttgtttcagttgtatagagggcctttagatctgacaattattattacaggagcaact
gatgtagatggcatggcctggttcactccagtaggtcttgccgttgatactccttgggta
gagaaggagtcagctttgtctattgactacaaaactgctcttggagctgtcagatttaac
acaaggagaacagggaacattcagattagattaccatggtattcttatttatatgctgtg
tctggagcactggatggtttgggtgacaagacagattctacatttggattggtttctatt
cagattgcaaattacaatcattctgatgaatacttgtcttttagttgttatttgtctgtc
acagaacaatcagagttttattttcccagagctccattgaactcaaatgccatgttatcc
actgaatcaatgatgagcagaattgcagctggagacttggagtcatcagtggatgatcct
agatcagaggaagataaaagatttgagagtcatatagaatgcaggaagccatataaagaa
ctgagattagaagttgggaaacaaagactcaagtatgctcaggaagaattgtcaaatgaa
gtacttccaccccctaggaaaatgaagggactgttttcacaagccaaaatttctcttttt
tatactgaggagcatgaaataatgaagttttcctggagaggtgtgactgctgatactaga
gctttaaggaggtttggattctctttggccgcaggcagaagtgtgtggactcttgaaatg
gatgctggggttcttactgggagactgattagattgaatgatgagaaatggacagaaatg
aaggatgacaagattgtttcattgattgaaaagtttacaagtaacaaatattggtccaaa
gtgaatttcccacatgggatgttggatcttgaagaaattgctgccaattctaaggatttt
cctaacatgtctgaaacggatttgtgtttcttgctgcattggttaaatccaaagaaaatt
aatttagcagatagaatgcttggattgtctggagttcaggaaattaaagaacaaggtgtt
ggattaatagcagagtgtagaactttcttagattctattgctggaactttaaaatctatg
atgtttggatttcatcattctgtgactgttgaaattataaacactgtgctctgttttgtt
aagagtggaattttgctttatgtaatacaacaattgaatcaggatgaacattctcacata
attggtttgttgagagtcatgaattatgcagatattggttgttcagttatttcatgtggc
aaagttttttccaaaatgctggaaacagtctttaattggcaaatggactccagaatgatg
gagttaaggactcagagtttttccaactggttaagagatatttgttctgggatcaccatt
tttaaaaacttcaaggatgcaatttattggctttatacaaaattaaaggacttttatgaa
gtgaattatggcaagaagaaggacattttaaatattcttaaagataaccaacaaaaaata
gagaaagccattgaggaagccgatgaattttgcattttgcaaatccaagatgtggaaaaa
tttgaacagtatcagaaaggggttgacttgatacaaaaattgagaactgttcattcaatg
gctcaggttgatccaaatttaatggttcatttgtcacctttgagagattgtatagcaaga
gttcatcagaaacttaaaaaccttggatctataaatcaggcaatggtaacgagatgtgag
ccagttgtttgttatttatatggcaaaagagggggaggaaagagcttaacatcaattgca
ttggcaaccaaaatttgtaaacattatggtgttgagcctgaaaagaatatctatactaaa
cctgtggcttcagattactgggatggatatagtggacaattagtttgcatcattgatgat
attggccaaaacacaacagatgaggattggtcagatttttgtcagttagtgtcaggatgt
ccaatgagattaaacatggcctctcttgaggagaagggtaggcatttttcttctcctttt
ataatagcaacttcaaattggtcaaatccaagtccaaaaacagtttatgttaaggaagca
attgaccgcagactccatttcaaggttgaagttaaacctgcttcatttttcaaaaatcct
cacaatgatatgttgaatgttaatttagctaaaacaaatgatgcaatcaaagatatgtct
tgtgttgatttgataatggatggacataatgtttcattgatggatttgctcagttcttta
gtcatgacagttgaaattagaaaacaaaacatgactgaattcatggagttgtggtctcag
ggaatttcagatgatgataatgatagtgcagtagctgagtttttccagtcttttccatct
ggtgaaccatcgaactctaaattatctggctttttccaatctgttactaatcacaagtgg
gttgctgtgggagctgcagttggcattcttggagtgctcgttggaggatggtttgtgtat
aagcatttctcccgcaaagaggaggaaccaatcccagctgaaggggtatatcatggtgta
actaagcccaagcaagtgattaaattagatgcagatccagtagaatctcagtcaactttg
gaaatagcaggactggttaggaagaacttggttcagtttggagttggagagaagaatgga
tgtgtgagatgggttatgaatgccttgggagtgaaagatgattggctgcttgtgccttcc
catgcttataaatttgagaaagattatgaaatgatggagttttattttaatagaggtgga
acttactattcaatttcagctggtaatgttgttattcaatctttggatgtgggattccag
gatgttgttctgatgaaggttcctacaattcctaagtttagagatattactcagcatttt
attaagaaaggggatgtgcctagagctttgaatcgcctggcaacattagtgacaactgta
aatggaacccctatgttaatttctgagggcccactaaagatggaagagaaagctacttat
gttcataagaaaaatgatggtacaacagttgatttaactgtggatcaggcatggagagga
aaaggcgaaggtcttcctggaatgtgtggtggggccttggtttcatcgaatcaatctata
cagaatgcaatcttgggcatccatgttgctggaggaaattcaattcttgttgcaaaattg
gttactcaagaaatgttccaaaatattgataagaaaattgaaagtcagagaattatgaaa
gtggagtttactcagtgttcaatgaatgtggtctccaaaacgctttttagaaagagtccc
atttatcatcacattgataaaaccatgattaattttcctgcagctatgcccttttctaaa
gctgaaattgatccaatggctgtgatgttatctaagtattcattacctattgtagaagaa
ccagaggattataaagaggcttcaattttttatcaaaataaaatagtgggtaagactcag
ttagttgatgattttttagatcttgatatggccattacaggggccccaggaattgatgct
atcaacatggattcatctcctggatttccttatgtccaggagaagttgaccaaaagagat
ttaatttggttggatgaaaatggtttattgctgggagttcatccaagattggctcagaga
atcttattcaatactgtcatgatggaaaattgttctgatttggatgttgtttttacaacc
tgtccaaaagatgaattgagaccattagagaaagtgttggaatcaaaaacaagagctatt
gatgcttgtcctctggattactcaattttgtgccgaatgtattggggtccagctattagt
tattttcatttgaatccaggtttccatacaggtgttgctattggcatagatcctgataga
cagtgggatgaattatttaaaacaatgataagattcggagatgttggtcttgatttagat
ttctctgcttttgatgctagtcttagtccatttatgattagagaagcaggtagaatcatg
agtgaactatctggaactccatcccattttggcacagctcttatcaatactatcatttat
tccaagcatttgctgtataactgttgttaccatgtctgtggttcaatgccctctgggtct
ccttgtacagctttgctaaattcaattattaataatgtcaatttgtattatgtgttttcc
aagatatttggaaagtctccagttttcttttgtcaggctttgaagattctctgttatgga
gatgatgttttaatagttttctctcgagatgttcagattgataatcttgatttgattgga
caaaaaattgtagatgagtttaagaaacttggcatgacagctacttctgctgacaagaat
gtacctcagctgaaaccagtttcggaattgacttttctcaaaagatctttcaatttggta
gaggatagaattagacctgcaatttcggaaaaaacaatttggtctttaatagcatggcag
agaagtaacgctgagtttgagcagaatttagaaaatgctcagtggtttgcttttatgcat
ggctatgagttttatcagaaattttattattttgttcagtcctgtttggagaaagagatg
atagaatacagacttaaatcttatgattggtggagaatgagattttatgaccagtgtttc
atttgtgacctttcatga

DBGET integrated database retrieval system