Viruses: 1494811
Help
Entry
1494811 CDS
T40000
Symbol
AMV221
Name
(RefSeq) Betaentomopoxvirus amoorei; putative RNA polymerase largest subunit
KO
K25273
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
28321
Betaentomopoxvirus amoorei
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
1494811
NCBI-ProteinID:
NP_065003
UniProt:
Q9EMI5
LinkDB
All DBs
Position
NC_002520:187007..190912
Genome browser
AA seq
1301 aa
AA seq
DB search
MTTFKYTLLDNSTIDAIPIVIDSIGNDNENSVKSPKLGGTKFNVCSTCNLTRENGDMGHP
GRTPLRDMCIVKSGCIKNVLDTLNTLKLCNSCFMIKNNTIFSEIIEKYNSEYNINLKKEI
LSLLKNNRQGGVKCNNENCQNITGTYKYNQKKSYFYVKKQKDEIILNKTVYTMLLGIPDI
IYKCVTVPYADSQLQPYKAFYANNIIIPVLPSRPPNYFDNKESHVMTTKLGQLVGTSQKS
RDESEVQKIYNDIDNVKPNSPYKTSNMLVTLNIQVGGNKKGSIVRSNIMARRADNTARCV
AGPTMDKIGYIYIPKIVAKTLTSSIYYNRFTENMIKDMLVNDNNKIKYILLYRYDQLKPT
TLLKIKPQSRLNNLLKMKYGDRIEVELEDNDVILFSRQPSLHKFNIQAGICKIWDNNTIA
TPTPIANSMNLDYDGDEMNVYKLKSSVSVESLFTMLSVNMIKNNYNFSPIFGLIQDQIIS
VHMIYNIKEFSLQDVIYILGEYSYYIRDINKKTYSGKELLSLLFPDNLTYEGMFDNGKIT
LSNISSKQVVAQSYESFSNILSQLKNNIYAVYFIDVILYVARNFINLYSFSVSLKDIIPD
IYFIDDVQEYINNCCKVIQYVALQYYIKKDHIIKLTYDEMENIRIQNGNNIISNVKNKIN
NLFKDEKLNTIMMMKNSGYKITLDELVTVLGCTGQQGIDSDDIPKPGIMGRVFDSTLPGS
LDIESLGYVKSSTIKGLKFEELAFHTKYNSIKKILKITCETSSAGSIGRKLVKFMEGVKV
DHLGRSVLNNDIIWYNTNHIKMTGGDISKVEILTPSLEMVNYTLIKEIYNENKKYLLTNF
NTEINKEFIFPINIKLEIQSFYNKKSTPISDIDALKLIDEFIEYVYINIYFYNITIDWFK
YILYTYLDRNTVEKYNKKYSKELLNYIINKIKLKLLNSLNPGYPIGLEYANNIQEKFTQQ
SLSSFHTTKKSGTASTQLGFSDFKDTVELSKKNKRDIVIAFTTHRYKLEDIKKQMEYLCL
KNFNPKINIIEETESDMVISVSIKKYYINDKISLYHYLQMYIEYLENNKIIKGYWITMKL
KDNDITVIFGVKIKTPYNINKIYMIKSIPVSVSKGKISNINLEIEDVKMYNNNLEEQNGY
RLKFYIDSVTDFINFDTRDVYLELGPWFTYNSFGIQFAEYSIRRRLVSSTKEKSMEICYI
ILSKLMCLSSEMYNIKRIREGKQNVIKSAIHGSSDAITTAAYNNIIDPNNDIYSQILSSQ
IMKLGHGYYDCYLNLNRYDSININSVTEQDINITSEIIENF
NT seq
3906 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacttttaaatatactttgttagataatagcacaatagatgctattccaatagtt
attgattctattggaaatgataacgaaaatagtgtaaaaagtcctaaattaggcggaact
aaattcaatgtgtgttcgacatgcaatttaacaagagaaaatggcgacatgggtcatcca
ggaagaactcctttaagagatatgtgtattgtaaaatctggttgtattaaaaatgttttg
gatacactaaatacattaaaattatgtaatagttgttttatgataaaaaataatacaata
ttttcagaaataattgaaaaatataatagcgaatataatattaatttaaaaaaagaaata
ttatcattattaaaaaacaatcgccaaggtggggtaaaatgtaataatgaaaattgtcaa
aatataacaggaacatataaatataatcaaaaaaaatcatatttttacgtaaaaaaacaa
aaagatgaaatcattcttaataaaacagtttatactatgttacttggaattcctgatata
atttataaatgtgttactgtaccatacgcagattctcaattacaaccttataaagcattt
tacgctaataatattataattcctgtattaccatctagacctccaaattattttgataat
aaagaatctcatgttatgacaacaaaattgggtcaattagttggcacatcacaaaaatct
agagatgaaagtgaagttcaaaaaatatataatgatattgataatgttaaaccaaattct
ccatataaaactagtaacatgttagttacgttaaatatacaagttggtggtaacaaaaaa
ggaagtatagttagatctaatataatggctagaagagccgataacacagctagatgtgta
gctggtccaactatggacaaaataggatatatatatataccaaaaatagtggctaagaca
ttaacatcatcaatatattataatagatttactgaaaatatgattaaagatatgttagtt
aatgataataacaaaattaaatatatattattatatagatatgatcaattaaaacccaca
acattattaaaaataaaaccacaatctagactcaataatttattaaaaatgaaatatgga
gatagaatagaagttgaattagaagataatgatgtaatattatttagtagacaaccatct
ttacataaatttaatattcaggcaggtatatgtaaaatatgggataataatacaatagca
acacctacgccgatagcaaattctatgaatttagattatgatggtgatgaaatgaatgta
tataaattaaaatcatctgtgtcagtagaatcattatttactatgttatctgttaatatg
attaaaaataattataatttttcgccaatatttgggttaattcaagatcaaataatatca
gtacatatgatatataatattaaagaattttctctacaagatgttatttatattttagga
gaatatagttattatataagagatataaataaaaaaacatattctggaaaagaattatta
tcattattatttccagataatcttacatatgaaggtatgtttgataatggtaaaattaca
ttatctaatatatcatctaaacaagttgtagctcagtcatatgaatcattttcaaatatt
ctatctcaattaaaaaataatatttatgctgtgtattttatagatgtaatattatatgta
gctagaaattttataaatttgtatagttttagcgtttcgttaaaagatattattccagat
atatattttattgacgatgttcaagaatacattaataattgttgtaaagttatacaatat
gttgcgctacaatattatattaaaaaagatcatataataaaattaacttatgatgaaatg
gaaaatataagaatacaaaacggtaataatataatatctaatgttaaaaataaaataaat
aatctatttaaagatgagaaattaaatactataatgatgatgaaaaattcaggctataaa
ataacattagatgaattagtaacagtgttgggttgtactggacaacaaggaattgattca
gatgatataccgaaacccggaattatgggaagagtatttgattcaacattacctggaagt
ttagacatagaatcattaggatatgtaaaatcatcaactataaaaggtttaaaattcgaa
gaattggcatttcatacaaaatacaattcaattaaaaaaatattaaaaataacatgcgag
acatcatcggcaggtagtattggtagaaaattagttaaatttatggaaggtgttaaagta
gatcatttgggtagatccgtattaaataatgatattatatggtataatacaaatcatatt
aaaatgacaggtggtgatatatctaaagtagaaatattaactcctagtttagaaatggta
aattacacacttataaaagaaatatataacgaaaataaaaaatatttattaactaatttt
aatactgaaataaataaagaatttatttttccaattaatataaaattagagattcaatca
ttttataataaaaaatcaactcctatatctgatatagatgcattaaaattaattgatgaa
tttatagaatatgtctatattaatatatatttttacaacattacaatagattggtttaaa
tatattttatatacatatctagatagaaatacagtagaaaaatataataaaaaatattct
aaagaattattaaattatataataaataaaattaaattaaaattactaaattcattaaat
ccaggttatcctattggattagaatacgcaaataatattcaagaaaaatttacacaacaa
tcattatcgtcttttcacactactaaaaaatcaggaacagcatcaacccaattaggattt
tcggattttaaagatactgtagaattgagtaaaaaaaataaaagagatattgtaattgct
tttacaacacacagatataaattagaagatattaagaagcaaatggaatacttgtgttta
aagaattttaatccaaaaataaatatcatagaagaaactgaatctgatatggtaataagt
gtaagtataaaaaaatactatattaatgacaaaatatctttatatcattacttacaaatg
tatatagaatatttagaaaataataaaattattaaaggctattggataactatgaaatta
aaagataatgatataacagtgatatttggagttaaaattaaaactccttataatataaat
aaaatatatatgataaaaagtataccagtttcggtttctaaaggtaaaataagtaacata
aatttagagatagaagatgttaaaatgtataataataatttggaagaacaaaatggttat
agattaaaattctatattgatagtgtcacagattttattaattttgatacgagagatgtt
tatctggaattaggtccgtggtttacgtataattcgtttggcatacaatttgctgaatat
tctattagacgtagattagtttcgtctacaaaagaaaaaagtatggaaatatgttatata
atattatcgaaattgatgtgtttatcttccgaaatgtataatataaaaagaataagagag
ggtaaacaaaatgttataaaatcagcaatacatggtagttcggatgctataacaacagct
gcatataataatataatagatccaaacaatgatatatattctcaaatattatcaagtcaa
attatgaaattaggacatggatattatgattgttatttaaatttaaatagatatgattct
attaacataaattctgtcaccgaacaagatataaatataacaagtgaaataattgaaaat
ttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
