Viruses: 1497288
Help
Entry
1497288 CDS
T40000
Symbol
TK, LCDV1gp080
Name
(RefSeq) Lymphocystis disease virus 1; major capsid protein
Virus
36363
Lymphocystis disease virus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_NCLDV
Capsid_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
1497288
NCBI-ProteinID:
NP_044812
RS:
NC_001824
UniProt:
P22176
LinkDB
All DBs
Position
NC_001824:complement(71395..72774)
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MTSVAGSSVTSAFIDLATYDTIEKHLYGGDSAVAYFVRETKKCTWFSKLPVLLTRCSGSP
NFDQEFSVNVSRGGDYVLNSWMTVRIPAIKLKADNRMNNNGTIRWCKNLFHNLIKQTSVQ
FNDLVAQKFESYFLDYWAAFSMCGSKRAGYNNMIGNTIDMIQPVDHTGMLPEKVLVLPLP
YFFSRDSGVALPSAALPYNEIRLTFHLRDYTELLIFQHKQDCTIIPITAADLEYGKPDLK
DVQVWITNAVVTNEERRLMGTTPRDILVEQVQTAPKHVFQPLTIPSPNFDIRFSHAIKLL
FFGVRNTTHAAVQSNYTTASPVILEEAYASDLSLVAADPIANVTLVYENSARLNEMGSEY
YSLVQPYYFGGSIPIETGYHMYCYSLNMMDMDPMGSTNYGRLSNVSMKLKTSDKAVVNAG
GGGGNMSGYKDAQKFEFLTMAINHNVIRIKNGSMGFPVL
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttctgtagcaggttcaagcgtcacaagcgcttttatagatttagctacttatgat
acaattgaaaaacatttatatggtggcgattctgccgttgcatattttgtcagagaaaca
aaaaaatgtacttggttcagtaaattaccggttcttttaacacgctgttctggatcacct
aattttgatcaagagttttctgttaatgtttcacgaggaggcgattatgtccttaattcc
tggatgacggttcgtatacctgccattaaattgaaagctgataatagaatgaataataac
ggcaccattcgatggtgcaaaaacttatttcataatctaattaaacaaacgtcggttcag
tttaatgatttagtagcacaaaaatttgaaagttatttcttagattattgggcagcgttc
agtatgtgtggctctaaaagagcaggttataataatatgatcggtaatacaattgatatg
atacaaccggttgaccatacaggaatgttacctgaaaaagttttagtgttaccattaccg
tatttcttttctagggacagcggtgttgcattgcctagtgcagcacttccttataacgaa
ataagattaacgtttcatcttagagattatacggaattacttatttttcagcataaacaa
gattgtaccattataccaattacagctgctgatttagaatatggaaaacctgatttaaaa
gacgttcaagtatggattactaatgcagtggttacaaatgaagaacggcgacttatgggt
acaactcctcgagatatattagtggaacaagttcaaactgcgccaaaacatgtatttcaa
ccgttaactattccaagccctaattttgatattcggttttcacacgctattaaattgtta
ttttttggtgtaagaaatacaactcatgcagctgttcaatctaattatactacagcttct
cctgttattttagaagaagcctatgcaagcgatctatctttagtggcagcagatccaatt
gcaaatgtaacgcttgtttatgaaaatagtgcacggcttaatgaaatgggtagtgaatat
tattcactcgttcaaccatattattttggtggttctattccaatagaaacaggatatcat
atgtattgttattcattaaatatgatggatatggatccaatgggatccacaaattacgga
cgtttatcaaacgttagtatgaaattaaaaacctcagacaaagcagttgtaaatgctggt
ggcggtggcggtaatatgtctggttataaagatgcacaaaagtttgaatttcttactatg
gctattaatcataatgtaattcgtataaagaacggatcaatgggttttccggttttataa
DBGET
integrated database retrieval system