Viruses: 1497357
Help
Entry
1497357 CDS
T40000
Symbol
LCDV1gp069
Name
(RefSeq) Lymphocystis disease virus 1; DNA primase
KO
K27331
Megaviricetes DNA primase
Virus
36363
Lymphocystis disease virus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
AEP_C962R
D5_N
PriCT_2
PPL4
YlzJ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
1497357
NCBI-ProteinID:
NP_078717
RS:
NC_001824
LinkDB
All DBs
Position
NC_001824:complement(57283..59907)
Genome browser
AA seq
874 aa
AA seq
DB search
MLKDSIKTKSMETILKDTKVGKGQTFTHVSIEGGKYLLDAYRYPLFWQTVVNNKAIHLLE
TRYKESPITLDFDIKETQQIYTKEILKKLHKQIINYLKEYLNVADANLIGVFLHKPFKLT
ETNLIKQSFHLHYPKILMNVVDLQQLIIELKEECKTILNGDYLDLNSGKVCWFIYGASKV
ADDPYCIKYVFNEACKSVDFYTSLKGTLYPSCFGSTDDPRILACFYLTIMPQDKEPYLVT
FKTVKLSLVDKIISKKANLLIEPLEKQSKLQKLIDLLPNECSNDRIIWLEIGFCLWQITD
GSNEGFQLWLSFSKRSEKFNQDECFDIWFKQMKPNSFTIASLYWFIKKYNPIGFIDYIRL
YKCSPAKYYTDGSHVGIAKIIHHHFKMEFKCSSIKNHTWFKYDDVVWAECHVGVNLRRII
SDAKGPIFRVLNQQIIVISNLINNEELDDEYYIWQSKLIHLSTEELINFRTQLCKIKKSL
RMTQFKNSVMRECEELFFDPLFNQKIDSNPYLMAFQNGVFDFKQKLFRQGRPDDYCSKKL
TINYVDYGISQLLSCNPEDFINQGLKETLIFLEQVFPDIELRVFFIRQLASAFIGGNSEK
ICLFWTGSGNNGKTITQTLMEQMFGPFAVKLNTSVITGKKLPTGQANPELVRTGGGVRWA
VMEEPDSDERINAGILKSLTGNDTFWARDLYCTGKDTKEIIPMFKLHVICNNLPEIKYAD
QAVWNRVRVIPFESVFKLAEECPDTYKERLNQKIFPVDLKFSEKLSKLIEPLAYYLIYYW
LNMDRLNYNPPTKVLNATKEYQNDNDIYKQFIDNNLIKQDNIILTERLLYIRYKDWLAET
HPYYVVQSRNKAIKRFSDILGPLTNGAWFNLNLI
NT seq
2625 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaggattctattaaaacaaaatcaatggaaactattttaaaagatactaaagta
ggtaaaggacagacatttacgcatgtttctatcgaaggaggtaaatatttattagacgca
tacagatatccattgttttggcaaacagtagtaaataataaagcaattcatttgttagaa
acacgctataaagagagtccaattacattagatttcgacattaaagaaacgcaacaaatt
tacaccaaagaaatattaaaaaaattacataagcaaattataaattatctaaaagaatat
ttaaatgtagctgatgctaatttaatcggtgttttcttacataaaccatttaaactgact
gaaactaatttaattaaacaaagttttcatttacattaccccaaaattttaatgaatgta
gttgatctacaacagttaattatagaattaaaagaagaatgtaaaacaattttgaacgga
gattatttagatcttaatagtggaaaagtttgctggtttatttacggtgcatcaaaagta
gcagatgacccttactgtataaaatacgtgtttaacgaagcatgtaagtctgtagatttt
tatacaagtttaaaaggtacactctatccctcttgttttgggtcaacagatgacccacgt
attttagcatgtttctaccttacaattatgccccaagataaagaaccgtatttagttacg
tttaaaacagttaaattaagtttagttgataaaataataagtaaaaaagccaatctttta
atagaaccgcttgaaaaacaatctaaattgcaaaaattaattgatttactacccaacgaa
tgttcaaacgatcgtattatttggttagaaataggattttgtctatggcaaattactgat
ggttcaaatgaaggttttcagctttggctttcgttctcaaaaagatctgaaaaatttaat
caagacgaatgttttgacatatggtttaaacaaatgaaaccaaactcatttacaattgcg
tcgctatactggtttataaagaaatataatcctattggctttatagattatattcgactg
tataagtgttcacccgctaaatattatacagatggtagtcacgtcggcattgcgaaaatt
atacatcatcattttaagatggaatttaaatgttcttctattaaaaatcatacctggttt
aaatacgatgatgttgtttgggcagaatgtcacgtcggcgttaatttacgcagaattatt
tctgatgctaaagggcctattttccgagttttaaatcaacaaatcatagtaatttctaat
cttataaataatgaagaattggatgatgaatattatatttggcaaagtaaattaatacat
ttatccaccgaagaattgataaattttagaacacaattatgcaaaattaaaaaatcatta
cgtatgactcaatttaagaatagcgtgatgagagaatgcgaagaattattttttgaccca
ttatttaatcaaaaaatagattcaaatccttatttaatggcgtttcaaaatggggtattt
gattttaaacaaaaattattccgtcaaggacgacccgacgattactgttctaaaaaatta
acgatcaattatgttgattacggcatttcacaacttttatcttgtaatccagaggatttt
ataaatcagggtcttaaagaaacactaatatttctcgagcaagtctttccagatattgag
ttacgagtgttttttattcgccaactagcatctgcatttatcggtggcaattctgaaaaa
atatgtttattctggactggttcaggaaataacggtaaaactattacgcaaacattaatg
gaacaaatgtttggcccatttgctgtaaaattaaatacttctgttataacaggtaaaaaa
ttacctacagggcaagcaaatcctgaattagtacgtaccggtggtggtgtaagatgggct
gtcatggaagaacctgactcagatgaacgaattaacgctgggattttaaaaagtttaacg
ggaaatgatactttttgggcacgagacctttattgtacaggaaaagatacaaaagaaatt
attcctatgtttaaattacatgtgatatgtaacaatttaccagaaattaagtatgctgat
caagctgtttggaatcgcgtacgcgttataccatttgaatctgtttttaaattagcggaa
gagtgtccagacacttacaaagaacgtttaaatcaaaaaatttttccggtcgatcttaaa
tttagtgaaaaattatctaaattaatagaacctttagcctattatttaatatattattgg
ttaaatatggatcgcttaaattataatccacctactaaagtattaaatgctacaaaagaa
tatcaaaatgacaatgatatttataaacaatttatcgataacaatttaattaaacaagat
aatattattttaacagaacgcttactttacattcgttataaagactggttagcagaaaca
catccttattacgtagttcaatcacgaaataaagctattaaacgatttagtgatattctg
gggccacttacaaacggcgcatggtttaatttaaatttaatctaa
DBGET
integrated database retrieval system