Viruses: 15012140
Help
Entry
15012140 CDS
T40000
Symbol
SWTG_00062
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-RIM2 R1_1999; baseplate wedge subunit
Virus
869662
Synechococcus phage S-RIM2 R1_1999
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
YHYH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15012140
NCBI-ProteinID:
YP_007675552
RS:
NC_020859
UniProt:
M4PME7
LinkDB
All DBs
Position
NC_020859:75544..80685
AA seq
1713 aa
AA seq
DB search
MAREVPGSGAVIKPIFDEVFGVRAVELINSGSGYDPADPPRLTIDGCGTPEREALLYPII
DADSGKIIHVRVLERGRGYDPLRLQIVPTSETPSVLDSFDVNRIWQRHPNSLTRGTFQTA
GVPPVKNDRLRIESDNHPKPTWTSAEAVPGGGPLVDRSFDQVFIYRGGKDVPNPGTRTGQ
NNKSLGILANGGLLHTPEWGTVGNAPINFSIDTVKYDYVKDTNANDVIVDNNIHYYQTSK
LINEFKDTNGVFEWGKFEQFVWNIKVEFDNVMLTVNNIDETLSEVEVGRTVTEIGGSARG
EIAKIVRNGQNVITRVYLRDVTGTFEDGDLLLGSTGFGMRVNADPITFPNGIFYIDFGAD
ATEFGPFVPGQYYFAPENVRVKRNYLIVWNQDDSTNQPSAMHTLGHPMQFSTTQDGLLTG
GTLYYNSTGSSAAPATDYENEFRPIFMMNADETNRIYYYCKVHRYMSGYDGDEGYMILDP
TIEDEDIVNNYYVENYYQSDSNDPATIDRSRHVNGHSKVLGMSFDGYPIYGPYGYTTGRT
VGKMISAYRLRTTEELPGTREEVVTASTVTYTITVSNNKFYVGGQEEQLLTLKRGKTYAF
NQDDSSNDSHYLFFSLSNDGWHGTGDPADIGSEAYLYTGEDSVTYHLEGSAVTKLEYLQG
FNTATAREIRITIPVNAPRVAYVFSYLDSGHGIRLVNEGYILGDLTQDYIYDATIGGSSL
DPEYNNGPIVNVVGDGSDFFKREVTSNGVRILGAGTVGGQTAVPDAWLEKVARMVELFTD
VNGAGINETSQRNLIKTLSGDTGTYHAGLPTIQRVARGAGADYTPNFLTDAGIIAWNLTD
LFDTTVQNDMVWYLNSTGDGYGDGDIDAQEVIEHVFHTLHMHGLPADDIKLYPYISSDWN
TGDLYAAMEEAYDAGKWDPSGYQSPSNAWKTDADAFEVAAKEYLFLLNFAMFEYTELWDG
GSLAPEWTDDMRTQAGIQANNPLGYAFHNTYIAPVISKPSLATIRSIFQDGNTPAQDDPS
LAGASGYVVDISSGESLDEFNGKFGPTPEYPNGTYAYFMTEDQSGIPQYPYAIGPKYYSV
PLFEGDTVPDLVSSFPTQASGDIILNNDGTISYIKMTKKGDSFFGSAKAVILGGEGTGAK
ATPVTQTVTGLSLLNQGRSYATPPNLIFEGGGGQGAEGAAQIDTLGKVTSISVVDPGEFY
QEPPFILITGGGGIGAKAEAVISQGEITGINVIDPGEGYTSSPNIVFTKLVNLKRKTRAR
QAFNSTDIYLTGLTKTLGSQDTQIFVTSTDAYAGSGQLIVNKETITYTAKSRGRFTGLTR
GVNFKYDQRIILDTGQNDGDGVSTYGFNVGDRVIRRVENAGNKVAKVYDWDPATRELLVT
FEVDELAFIDAGIPSTEDAIVQFDAGVANSSGTGVLPHTVIEETDSTIITLTYPIGTIQN
RTFEDDDENDGAGDGIPDLLNAGTTFADQINLDGGIYNSLYGIEETQGGQNTTLFQVGDN
IKDASIPFKFATVIAAGGLSDGVEHVAQVVLTLGSGSGTFQVNELVTGDVSGVRGTVVSW
DNNTKKLTLKDIVPYNLNNVALGVNGFLYEFSHNSTIVDFVITDNGTNYTVAPTITVENT
GDIQATGTVNLTAAGDQVASISITNGGYGIPQTVDAGYSLHPTITFTNDVSDTTGSGASA
QAVLGGELAVGNGGGSYRIKSIEYVTLVRSDSA
NT seq
5142 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaagagaagttcctggatctggcgcagtcatcaagccaatcttcgatgaagttttt
ggtgtacgcgcagttgagttaatcaacagtggtagtgggtatgatcctgcagatccacct
agactaactatcgatggttgcgggacgcctgaacgagaggcgttattgtatcctattatc
gacgcagactcgggtaaaatcattcatgtccgtgttcttgaaaggggtagaggatacgac
cccttaagacttcagattgttcctacttccgaaacacccagtgttttagattcttttgat
gtcaatagaatctggcagagacatcctaactcattgactagaggcacttttcaaactgct
ggtgtacctcctgttaagaatgatagacttcgtattgaatcagataaccatcccaaacct
acctggacaagtgcagaggcggttcctggtggtggtcctcttgtagatcgttcttttgat
caggtattcatttacaggggcggtaaagacgttcctaatcctggaactagaacaggacaa
aataataagtcgcttggtattttagcgaacggtggtcttcttcacactcccgaatgggga
acggttggcaatgctccaatcaacttttctattgatactgtaaagtatgattatgtaaag
gatacgaatgctaatgatgttattgttgataacaatattcattattatcaaacaagtaaa
ctgataaatgagtttaaagataccaatggtgtatttgaatggggtaagtttgagcagttt
gtctggaatattaaggtagagtttgataatgtgatgttgacagtcaataatattgacgaa
acattatctgaagttgaagttggtagaactgtaactgaaattggtggaagtgctcgtggt
gagattgcaaagattgttaggaacggtcaaaatgtaatcactagagtttacctcagagac
gttacaggaacatttgaagatggcgaccttcttcttggttctacaggattcggtatgcga
gtcaatgcagatccaataacgttccctaacggtattttctatattgattttggtgccgat
gctaccgaattcggtccttttgttcctggtcagtattattttgctccagaaaatgtcagg
gtcaagagaaactatctgattgtttggaatcaggatgattctacaaatcaacctagtgca
atgcataccttaggtcatccaatgcagttcagcacgactcaagacggtctgctaactggt
ggcactttgtattacaacagcactggttcatctgctgctcctgctactgattacgagaac
gagttcagacctatattcatgatgaatgcggatgaaactaaccgcatctattactattgc
aaagtccatcgttacatgtctggatatgatggtgacgagggttatatgattctcgatccc
actattgaagatgaggacattgtaaataactattatgttgagaactattatcaatctgat
tctaacgatccagcaaccattgaccgttctaggcacgtaaacggtcactctaaggttctg
ggtatgtcctttgatggataccccatctacggtccatatggatacactacaggtagaact
gtaggcaaaatgattagtgcttacagattaagaactacagaagaacttcctggtactaga
gaagaagttgtcactgcaagtacggtaacgtatactattactgtttctaataataagttc
tatgttggtgggcaagaagaacaacttttgactttgaagagaggtaagacatatgccttt
aatcaagacgattcttcaaatgatagtcattatctgttcttctctctgtcgaatgacgga
tggcatggtacaggagatcctgcggacattggcagtgaggcatacttatatactggtgaa
gattcagtaacttaccacctagagggatctgcagttacaaaactagaatatctgcaagga
tttaatactgctacagcaagagaaatcagaatcactattcctgtgaatgcacctcgtgtt
gcatatgtattctcatatctcgattctggtcatggtatccgtcttgttaacgagggatat
attcttggtgatttgactcaagactacatctatgatgctactattggtggtagtagttta
gatccagaatataacaatggtccaattgttaatgttgttggtgatggtagtgatttcttc
aagcgtgaagttacatctaacggtgtaagaatactgggtgctggcacagtaggtggtcaa
acagcagttcccgatgcatggttagaaaaagttgctcgtatggttgaactgtttacagat
gtaaatggtgcaggtattaacgaaacatcccaaagaaacttaatcaaaacactaagtggc
gacacaggaacttatcacgcaggattaccgactatacaaagagtagcaagaggtgcagga
gcagattacactccaaacttcttaactgacgcaggtattattgcttggaacttaactgac
ttatttgacaccactgttcaaaatgacatggtgtggtacttgaactcaactggtgatggg
tatggcgatggtgacattgatgcacaagaagttattgaacacgtattccacacacttcat
atgcacgggttacctgcagatgatataaaactatatccatatataagttccgattggaac
actggtgatttgtatgccgcaatggaagaagcatatgatgcaggcaaatgggatccatca
ggttatcaaagtccatcaaatgcttggaaaacagatgcagatgcatttgaagtagccgca
aaagaatacttgttcctactaaactttgctatgtttgaatacacagaattatgggacggt
ggaagtcttgctccagaatggacagacgacatgcgtacccaagcaggtattcaagcaaat
aacccattaggttatgcattccataacacatacattgctccagttattagtaaaccatca
cttgctactattagaagcatattccaagatggtaatacaccagcacaagacgatccaagt
ttagcaggtgcgtcaggatatgttgttgacatttcttctggggaatctcttgatgagttc
aatggtaagtttggacccactcctgagtatcctaatggtacatatgcatacttcatgact
gaggatcaatctggtattcctcagtatccatatgcgattggtcctaagtattacagcgtt
cctttatttgaaggtgatactgttcccgatcttgtatcttctttcccaacacaggcatct
ggtgacatcattctgaataatgatggaacgatttcatacattaagatgacgaagaagggt
gacagtttcttcggttctgcaaaagcagttattcttggtggtgaaggaacaggggcaaaa
gcaactcccgtaactcaaactgtcactggtctgtctctgctaaatcagggtagaagttat
gctacaccacctaacctcatctttgaaggtggtggtggacaaggtgctgagggtgctgct
caaatcgatactcttggtaaggttacctctatcagtgtggtagatcctggtgagttctat
caagaacctccttttattctcatcactggtggtggtggcattggtgctaaggcagaagca
gtcattagtcaaggtgagattactgggattaatgttattgaccctggtgaaggatacacc
tcttctccaaatattgtcttcacaaaactcgttaatctcaaacgtaagacaagagcacgt
caagcatttaactcaactgacatctatcttactggtcttaccaaaactcttggatctcaa
gacacgcagatttttgtcacatctactgatgcatatgctggttctggtcaacttatcgtt
aataaagagaccattacatatactgcgaagagcaggggtagatttacaggactaactaga
ggtgtaaacttcaaatatgatcagagaatcattcttgacacaggacagaacgatggtgat
ggagtttccacttacggatttaatgttggtgaccgagtaatccgtagggttgagaatgcg
ggcaacaaagttgctaaagtctatgactgggatcctgcgacaagagaactgttagttacg
tttgaagtcgatgaactggcatttattgatgctggtattccttctactgaagatgcaatt
gttcagtttgatgctggcgttgctaatagttctggtactggtgttcttcctcatacagtt
atcgaagaaaccgattccactattattactttgacatatcctatcggaactattcaaaat
agaacctttgaggatgatgatgaaaatgatggtgctggtgatggtattcccgatcttctc
aatgctggaactacctttgccgatcaaatcaatcttgatggtggtatctataactctcta
tatggtattgaagagacacaaggtggtcagaatactacattgttccaagttggcgataat
atcaaagacgcatctataccattcaagtttgcaaccgtcattgcggcaggtggactgagt
gatggcgttgagcacgttgcacaagttgttctaactcttggtagtggtagtggtactttc
caagtaaatgaacttgtcactggtgatgtttctggtgttagaggaacagttgtttcttgg
gataataacactaagaaacttacacttaaggatattgttccttataacttgaataacgtt
gcacttggtgtcaacggattcctgtatgaattctctcataatagcactatcgttgatttt
gttattacagataatggaacaaactatactgttgctccaactattacagttgaaaatact
ggagatattcaggcaactggaacagtaaatcttactgctgcaggtgaccaggttgcgtcg
atttcaatcacaaatggaggatacggaatccctcaaacagttgatgctggttacagtctc
catcctacgatcacctttactaatgatgtatccgatacaactggatctggtgcatctgct
caggcagttcttggcggagaactggcagttggtaacggtggcggttcgtatagaatcaag
agcattgagtatgtgacattggtccgctcagattccgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
