Viruses: 15613119
Help
Entry
15613119 CDS
T40000
Symbol
CHBEV_129
Name
(RefSeq) Choristoneura biennis entomopoxvirus; RNA polymerase RPO132
KO
K25274
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 133 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
10288
Choristoneura biennis entomopoxvirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15613119
NCBI-ProteinID:
YP_008004199
RS:
NC_021248
UniProt:
A0A916KPI6
LinkDB
All DBs
Position
NC_021248:complement(115727..119308)
Genome browser
AA seq
1193 aa
AA seq
DB search
MNTNPIEEDIANLFLQDDPRLDVKSKVLINVELPFKNLNYDLPTLFNREEIIYTKISKSG
HEDVIMKITYEGKEDNKKSYLYSSLDNKGFYTYISISISIYRKITSINNNIEYKMISNKT
YSHTEIRIPQYISHGGNTSESDNSITQTNNPGGFFNVSKSLKKMVTTRIEQIYTYPKRMK
TQKAYTYHLAFISKKPSFLMVNEKLNPPQFLTLDIDFNPDKIKCVIDSKKTFIQIDIIAL
IIALSNDNIDVIYNKISSGFNDEISDSIKILVENTKIILSDYNNDAREYVDKIIENNYIK
KFTKNEISTQDYFNNIFNDFLPHVGKGKYKEKCMYLISILRQSFVSIFQSDIYPDKDNLA
TRRISTAADIFENIIRSSIDNSFELARDKYKTYISGSGKNNNINNILSQVKLLPQITQAF
NNFFNMQDTKNSDVVKIGTHSNWAESIYISNAVERGVSIDLTKSLTQRKLHSSSINVLDM
VDTPDHGTKTGLVKRLCISTLISHYPIHIRRQLFKQVKEFIENKVKDTQKEDNISGVFIS
IIDESEHVITRIKNSEIESFIKDLKYAKISGLFVKNDIGIEILKFHDLDINKQIYVPTDR
YFQIRINVGNKRATQPVFRVENGELVFKKYSDLKSDLKESNSYIEFVTKYYDIIEVIDVG
QMLYSNICNTVTEFDSYDINQRKKYDYVRLPNYLYFSYLTSTGCMYDIGKMTGVRGTFGT
AQSKHIITGPPDNVMNKYDTCNYLAYPIERPSITNIPMEISGIARNSIGTHVLVGFFSFN
YNVEDGVIINRESINRGLLSVISLMSVKNELSDTQINNNNPSPENSNNNYSKISATGLPS
IGTVLVQGDALYRCLKPKFKNDDDNRYIFDQSETLSNTYPAIVERTRKQGTDLIKIDMLL
SSYRRLSVGDKIAKSVQKVTVSKIMEEEDMPYNKNGERPDIIFNSPSIISRKTLPLYDEV
SLCNIFSKIPYNDNGNVEFINYPIYTDKSPLDKYNFIKNILKKKYNNTLSDVEMEDIIYS
RQTLYHPYTKKSMTIKEDDKETKSFMGPMLFCRLSQMSADKISVRNRGRLDKYMQAPSGK
KKGGGIKIGEMESDVFATNGSVYAIHELLSDPDEYYLPANICSNCGIFATYEENIEIKRW
KCLQCENLGLSPDIVKMRLTYATKIFITLLNARGISLIPIKYKQPIHYISDGI
NT seq
3582 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatactaatccaatagaagaagatattgcaaatttatttttgcaagacgatccaaga
ttagatgtaaaatctaaagttttaattaatgtagaattaccatttaaaaatttaaattat
gatttacctactttattcaatagagaagaaattatttatacaaaaataagtaaatctgga
cacgaagatgtaataatgaaaataacatatgaaggcaaagaagataataaaaaaagttat
ttatactccagtttggataataaaggattctatacatatatttccatatcaatctctatt
tatagaaaaataacatcaattaataataatatagaatataaaatgatatcaaataaaaca
tattcgcatacagaaattagaatacctcaatatatatcacatggaggcaatacgtcagaa
tctgataattctataacacaaaccaataatcccggtggattttttaatgtttcaaaaagt
ttaaaaaagatggttacaactagaatagaacagatatatacatatcctaaacgtatgaaa
actcaaaaagcatatacatatcatttagcttttattagtaaaaaaccatcatttttaatg
gtaaatgaaaaactaaatccaccacaatttttaactttagatatagattttaatccagat
aaaataaaatgtgtcatagattctaaaaaaacatttatacaaattgatataatagcatta
ataatagcactttctaatgataacatcgatgttatatataataaaataagttctgggttt
aatgatgaaatttctgattcaataaaaatattagtagaaaatacaaaaattattttatca
gattataataatgatgctagggaatatgtagataaaataattgaaaataattatattaaa
aaatttactaaaaatgaaatatctacacaagattattttaataatatattcaatgatttt
cttcctcatgtgggtaaaggaaaatataaagaaaaatgcatgtatctaataagtatatta
agacaatcatttgtatctatatttcaatccgatatttatcctgataaagacaatctggcc
actagaagaatatcgacagctgctgatatttttgagaatataataagaagttctatagat
aattcgtttgaattggcgagagataaatacaaaacttatataagcggttctggtaaaaat
aataatattaataatatattatcacaagttaaattattaccacaaattacacaagcattt
aataattttttcaatatgcaagatactaaaaatagtgatgttgtaaaaataggaacacat
tccaattgggccgaatctatatatatatcaaatgccgttgaacgaggcgttagtatagat
ttgacaaaatctttaacgcaaagaaaattacattcatcatctatcaatgtattagatatg
gtggatacccctgatcatgggacaaaaactggattggtaaaaagactatgtataagtaca
ttaatatcacattatccaatacacataagaagacaattatttaaacaagtcaaagaattt
atagaaaataaagtcaaagatacccaaaaagaagataatatatctggtgtttttatttct
ataatcgatgaatctgaacatgtaataacacgtataaaaaattcagaaattgaatctttt
ataaaagacttaaaatatgcaaaaatatcaggattatttgtaaaaaatgatataggtata
gaaatattaaaattccatgatttggatataaataaacagatttatgttcccacagataga
tattttcagataagaattaacgtaggtaataaaagagcaactcaacctgtgtttagagtt
gaaaatggtgaattggtatttaaaaaatattctgatttaaaatccgatttaaaagaaagt
aattcatatattgaatttgtcactaaatattatgacattatagaagttattgacgtaggt
caaatgttatattctaatatatgtaatacggttactgaatttgatagttatgatattaat
caaagaaaaaaatatgattacgttagattaccaaattatttatattttagttatttgaca
tctaccggttgtatgtatgatattggaaaaatgacaggcgttaggggtacatttggtaca
gcgcaaagcaaacatattataactggtccaccagataatgtaatgaataaatatgatact
tgcaattatttagcatatccaattgaaagaccgtcaataactaatataccaatggaaata
tcaggaatagcaaggaatagtatcggaactcatgttttagtaggattttttagttttaat
tataacgtcgaagatggtgttattattaatagagaatcaataaatagaggattattgtca
gttatatcattgatgtccgtaaaaaacgaattatccgatacacaaataaataataataat
cctagtccagaaaattcaaataataattattctaaaatatcagcaacaggcttaccttct
atcggtactgttttagtccaaggtgatgctttgtatagatgtttgaagccaaaatttaaa
aacgatgatgacaatagatatatatttgatcaatctgaaactttatctaacacatatcct
gctatagtcgaaagaactagaaaacaaggaactgatttaataaagatagatatgttactg
tcgtcatatagaagattaagtgtcggcgataaaatagcaaaatctgttcaaaaagtcaca
gtatccaaaataatggaagaggaagatatgccatataataaaaatggtgaacggccagat
ataatatttaatagtcctagtattataagtagaaaaacattacctttatatgacgaagta
tcattatgtaatatattttctaaaataccatacaatgataatggaaatgtagaatttatt
aattatccaatatataccgataaaagtcctttagataaatataattttattaaaaatata
ttgaagaaaaaatataataatacactatctgatgttgaaatggaagatattatatatagt
aggcaaacattatatcatccttatacaaaaaaatccatgactataaaagaagatgataaa
gagactaaatcgtttatgggtccaatgttattttgtagattatcgcaaatgtcagctgat
aaaatatctgtacgaaatagaggcagattagataaatatatgcaagcgccatcaggtaaa
aagaaaggaggtggaataaaaataggagaaatggaaagtgatgtatttgctactaatggt
tctgtatacgcaatacatgagttactatcagatcctgatgaatactatttaccagcaaat
atatgtagtaattgtggaatatttgctacatatgaagaaaatatagaaataaaaaggtgg
aaatgtttacaatgtgaaaatcttggcctgtctccagatatagtaaaaatgcgtttaaca
tacgctacaaaaatatttataacattattaaatgctagaggtatatcattaattcctata
aaatataaacaacccatacattatatatcagatggtatataa
DBGET
integrated database retrieval system