Viruses: 15613246
Help
Entry
15613246 CDS
T40000
Symbol
CHBEV_256
Name
(RefSeq) Choristoneura biennis entomopoxvirus; RNA polymerase RPO147
KO
K25273
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
10288
Choristoneura biennis entomopoxvirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15613246
NCBI-ProteinID:
YP_008004326
RS:
NC_021248
UniProt:
A0A916KPR9
LinkDB
All DBs
Position
NC_021248:237719..241621
Genome browser
AA seq
1300 aa
AA seq
DB search
MATFKYTLIDNSIIDAIPIVIDSIGNDNENSVKSPKLGGTKFNVCSTCNLTRENGDMGHP
GRTPLRDICIAKSGCIKNVLDTLNKLKLCNSCLMVKNNTLFSSIIEKYNNEYNNNLKKEI
LLLLKNNRQGGIKCNNENCQNVTGTYKYNQKKSYFYVKKQKDEIILNKTIYTMLIGIPDI
IYRCVTPIYADSILQPFKAFYANNIIIPVLPSRPPNYFDNKESHVMTTKLGQLVGISQKS
RDESEVQKIYNDIDNVKPNSPYKTSNMLVTLNIQVGGNKKGSIVRSNIMARRSDNTSRCV
AGPAMDKIGYIYIPRIVAKTLTSSIYYNRFTENMIKDMLINNNDKIKYILLYRYDQLKPT
TLLKIKPQSRLNNLLKMKYGDRIEVELEDNDIILFSRQPSLHKFNIQAGICKIWDNNTIA
TPTPIANSMNLDYDGDEMNVYKLKSSVSVESLFTMLSVNMIKNNYNFSPIFGLIQDQIIA
VHIIYNIKEFSLQDVIYILGEYSYYIRDINKKTYTGKELLSLLFPDNLTYDDMFKNGEII
LQNISSKQVVAQSYESFSNILSQLKNNIYAVYFIDVILYVSRKFINLRSFSVSLKDIIPD
IYFIDDIQEYVNNCCKIIQYVASKYYVKKDHIIKLTYDEMENIRIQNGNNIISNVKNKIN
DLFKNEKLNAIMMMKNSGYKITIDELVTVLGCTGQQGIDSDDIPKPGIMGRVFDSTLPSS
LDIESLGFVKSSILKGLTFKELGFHMKYNAITKILKITCETSSSGTIGRKVVKFMEGVKV
DHLGRSVLNNDIVWYNTNHIKMTGGDISKVEILNPTLQMINYIEIKAMYDKNKKYLLNNF
CTEINREFIFPINIKLEIQSFYSKDNTPISNKDALKIIDDFIEYTYINIYFCNIDITWFK
YILYTYLDRNTVEKYNKIYSEELILYVINKIKLKLLNSLNPGYPIGLEYANNIQEKFTQQ
SLSSFHTTKKSGTASTQLGFSDFKDTVELSKKKRDIVTAFTIYRYKLEEIKKQMEYLCLK
NLNPQIIVLEEADSDMVISVTIKKYYINEKISLYHYLQMYIEYLENNKIIKGFWIRMKLN
NADVSVIFGVKIKIPYTINKLYMIKSIPVSVSKGKINNINLEIEDVKIYNNNLEEQKGYR
LKFYIDSITDLINFDTRDIHLELGPWFTYNSFGIQFAEYSIRRRLVASTKEKSMEICYII
LSKLMCLSSEMYNIKKIREGKQNVIKSAIHGTSDAITTASYNNVIDPNNDIYSQILSSQI
MKLGHGYYECFLNLNRYDSININSVTEQDINIKSEIIENF
NT seq
3903 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacgtttaaatatactttaatagataatagtattatagacgctataccaatagtt
attgattctataggtaatgataatgaaaatagtgttaaaagtcctaaattaggaggtact
aaatttaatgtttgttctacgtgtaatttaaccagagaaaatggtgacatgggccacccc
ggaagaactccattgagagacatatgtattgcaaaatcaggttgtattaaaaatgtttta
gatacattaaataaattaaaattatgtaatagttgtttgatggttaaaaataatacatta
ttttcatctataattgaaaagtataataatgaatataataataatttaaaaaaagaaata
ttattattattaaaaaataataggcaaggtggcataaaatgcaataacgaaaattgtcaa
aacgtaacgggaacatataaatataatcaaaaaaaatcttacttttatgttaaaaaacaa
aaagatgagataattcttaataaaactatttatacaatgctaattggtatacccgatata
atatatagatgcgttacgcctatatatgctgattcaattttacaaccatttaaagcattt
tatgcaaataatattataattcctgtattgccgtctaggccaccaaactattttgataat
aaagaatcacatgtaatgacaacaaaattgggacaattagtaggaatatcacaaaaatct
agagacgagagtgaagtacaaaaaatatataatgatatcgataatgttaaaccaaattct
ccttataaaactagtaatatgttagttacgctaaatatacaggtaggcggtaataaaaaa
ggtagtattgtaagatcaaatataatggctagaagatcagataatacatcaagatgtgtt
gccggtcctgcgatggataaaataggttatatatacatacctagaattgtagctaaaaca
ttaacaagttcaatttattataatagatttacagaaaatatgattaaagatatgttaatt
aataataatgataaaattaaatatatattattatatagatatgatcaattaaaaccaaca
acattattaaaaataaaaccacaatctagacttaataatttattaaaaatgaaatatggt
gatagaatagaagtagaattggaagataatgatataattttattcagtcgacaaccatct
ctacataaatttaatatacaagcaggaatatgtaaaatatgggataataatacgatagca
acgcctactcctatagctaattcaatgaatttggattatgatggcgacgaaatgaatgtt
tataaactaaaatcctctgtatcggttgaatcattatttactatgttgtccgtaaatatg
attaaaaataattataatttctctccaatttttggtttaatacaagatcaaataatagca
gttcatattatatataatataaaagaattttcactacaagatgtaatttatatattaggc
gaatatagttattatataagagatataaataaaaaaacatatactggaaaagaattattg
tcattattatttcccgacaatcttacatacgatgatatgtttaaaaatggagaaattatt
ttacaaaatatatcttctaaacaagttgttgcacaatcttatgaatcgttttctaatatt
ttatcgcaattaaaaaataatatatatgctgtatattttatagatgtaattctatatgtt
tctagaaagtttattaatttacgtagttttagtgtatcactaaaagatattattccagat
atatattttattgatgatatacaagaatatgttaataattgttgtaaaataatacaatat
gtagcatctaaatattacgttaaaaaagatcatattatcaagttgacatatgacgaaatg
gaaaatattagaatacaaaatggtaataatataatttctaatgttaaaaataaaataaat
gatttattcaaaaatgaaaaattaaatgctataatgatgatgaaaaattcaggatataaa
ataactattgatgagcttgttacagtattaggatgtacagggcagcaaggcattgactct
gatgatataccaaaacctggaataatgggtagagtttttgattctacgttaccctcgagt
ttagatattgaatcactaggttttgttaaatcatctatattaaaaggtttaaccttcaaa
gaacttggttttcatatgaaatataacgcaattacaaaaatattaaaaataacatgtgaa
acatcttcttcgggtactattggtagaaaagtagttaaattcatggaaggtgtaaaagtc
gatcatttaggaagatctgtattaaataatgacattgtttggtataatactaatcatata
aaaatgacaggcggcgatatatcaaaagttgaaatattaaatccgacattgcaaatgata
aattatatcgaaataaaagcaatgtatgataaaaataagaaatatttattaaataacttt
tgtacagaaattaatagagaatttatatttcctattaatataaaactcgagatacaatca
ttttatagtaaagacaatacaccaatatctaacaaagatgctttaaaaataattgatgat
tttatagaatatacctatattaatatatatttttgcaatattgacataacgtggtttaaa
tatattttatatacgtacctagatagaaatactgtagaaaaatataataaaatatattct
gaagaattaatattatatgtcataaataaaataaaattaaaactattgaattcattaaac
ccaggttatcctattggattagaatacgctaataatatacaagaaaaatttacacaacaa
tcactatcttcatttcatactactaaaaaatcaggcacagcatcaactcaattaggattt
tctgattttaaagatactgtagaattaagtaaaaagaaaagagatatagttactgctttt
acgatatatagatataaattagaagaaataaagaaacaaatggaatatttatgtttaaaa
aatttaaatccacaaattattgtactagaagaggcagattcagatatggttataagcgta
actataaaaaaatattatattaatgaaaaaatatctttatatcattatttacaaatgtat
atagaatatttggaaaataataaaataattaaaggtttttggatacgtatgaaattaaat
aatgctgatgtttctgttatatttggagttaaaattaaaataccgtatactattaataaa
ctatatatgataaaaagtataccagtttcagtatctaaaggtaaaataaataatataaat
ttagaaatcgaagatgttaaaatatataataataatctagaagaacaaaaaggttataga
ttaaagttttatatagacagtataactgatttaataaactttgatacacgagatattcat
cttgaattaggaccgtggtttacatataattcgtttggtatacaatttgcagaatactct
attagacgtagattagttgcgtcaacaaaagaaaaaagtatggaaatatgttatataatt
ttatctaaattaatgtgtctatcatcagaaatgtataatataaaaaaaatacgtgaaggt
aaacaaaatgtaataaaatcagcaatacatggtacatcagacgcaataactactgcatca
tataataatgtaatagatcctaataatgatatatattctcaaatattatcgagtcaaata
atgaaattaggtcacggatattacgaatgctttttaaatttaaatagatatgattctatt
aatataaattctgttaccgagcaggacataaatataaaaagtgaaataattgaaaatttc
taa
DBGET
integrated database retrieval system