Viruses: 15613548
Help
Entry
15613548 CDS
T40000
Symbol
CHREV_223
Name
(RefSeq) Choristoneura rosaceana entomopoxvirus 'L'; helicase
Virus
1293539
Choristoneura rosaceana entomopoxvirus 'L'
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PIF1
Viral_helicase1
AAA_19
AAA_30
UvrD_C_2
AAA_22
ATPase_2
AAA_14
Bac_DnaA
NTPase_1
AAA_7
NB-ARC
NACHT
ABC_tran
AAA_24
AAA
NPHP3_N
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15613548
NCBI-ProteinID:
YP_008004627
RS:
NC_021249
LinkDB
All DBs
Position
NC_021249:complement(217662..218966)
Genome browser
AA seq
434 aa
AA seq
DB search
MDCNFEQKNFIDYLDKNIINDNITNLYPIFITGSAGSGKSYLLRCIINKFKDYNINPDIA
AFTAIVSKSIGGRTIHSLFKFDFFGKCLKPNVSLLKNMKVLIIDEISMVSAKYLDSINDM
LMKYKKNTNVFGGVFVIVFGDLYQLEPISNDENEELPVYKSIVWQNFLKYQLYENMRQNE
KEFINALNMIRIGKLDSLDYFNNIYKKSKSNNLEEKEIYSTTIVSTNDEAYIINTRIFDK
IKQNNSEIYYLNNANYKTKYINYDPDVYDYSYDKNNINKIFPNIYICKGTKIMITANCVE
NSCKNSDMGYIDNIVIDEDKNIKYIILNMIDGYKKYLYKSSITFRNKRKDKILSMRGFPI
TYAWAITCHKSQGSTIDNLIIKSNNTFAKGQLYVALSRVKLSDNLILLNAITEKDVLCND
DVNQLYSTMKNLII
NT seq
1305 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattgtaattttgaacaaaaaaatttcatcgattacttggataaaaatataataaat
gataatattacaaatttatatccaatatttattacaggatcagccggatccggcaaaagt
tatcttttaagatgtattataaataaatttaaagattataacattaacccagatattgca
gcatttactgcaatagttagtaaatcaataggaggaagaacaatacattctttatttaaa
tttgattttttcggtaaatgtttaaaacctaatgtctctttattaaaaaatatgaaagta
ttaataatagatgaaatatctatggtttctgccaagtatttagattctattaatgatatg
ttaatgaaatataaaaaaaatactaatgttttcggtggtgtatttgttatagtatttgga
gatttatatcaattagaacctatttctaatgatgaaaatgaagaattgcctgtatataaa
tctattgtatggcaaaattttttaaaatatcaactttatgaaaatatgcgacagaatgaa
aaagaattcattaatgcattaaatatgatacgtataggtaaactagatagtctagattat
tttaataatatatataaaaaatctaaatcaaataatttagaagaaaaagaaatatattca
acaacaatagtatcaactaatgatgaagcttatattataaatactagaatatttgataaa
ataaaacaaaataattcagaaatatattacttgaataatgctaactacaaaacaaaatat
attaattatgatcctgatgtatatgattactcttatgataaaaataatataaataaaata
tttccaaatatatatatttgcaaaggtacaaaaattatgataacagcaaattgtgtagaa
aattcttgtaaaaatagtgatatgggttatattgacaatatagttattgacgaggataaa
aatattaaatatataatattaaatatgatagacggttacaaaaaatatttatataaaagt
agtataacgtttagaaataaacgtaaagataaaatattatcaatgagaggttttcctatt
acgtatgcttgggctataacatgtcacaaatctcaaggttcaactatagacaatttaata
ataaaatctaataatacatttgctaaagggcaattatatgtagcattaagtagagttaaa
ttatcagataatttaatattactaaatgctataacagaaaaagatgtattgtgcaatgat
gacgttaatcaattatattcgacaatgaaaaatttaattatttag
DBGET
integrated database retrieval system
