Viruses: 16045245
Help
Entry
16045245 CDS
T40000
Symbol
SXCG_00054
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-CAM8; tail fiber protein
Virus
754038
Synechococcus phage S-CAM8
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SIC1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16045245
NCBI-ProteinID:
YP_008125563
UniProt:
G8EXV3
LinkDB
All DBs
Position
NC_021530:22899..26867
Genome browser
AA seq
1322 aa
AA seq
DB search
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVG
LSNDEFDAFSIMLYPAEYIVDNRPGEVLYTNVAPIDSNSNLDLTSPNNVLYKFNSVEGGI
IVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTSYGTEILEGQEPPRTSIFKVTGGTYFWQFSFFD
GAEEGVYYRPDSTNTLAPKFSHHRLTCFEFADGLNSLSQLITDGNVPSGDYSAVPNILER
TDLEIYYQKISKAFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEYRILQITRNGQTATA
VTVDELDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGPNSELDVGRYNGSFTVTSASGNVFTYQMQE
EPSGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHADGSKATGFKSMVVAQFT
GLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDAAVAGDGAHLDGFAEYRKGWAHEHIKCSNDSFIQAVSV
FAVGYGTHFTALSGADMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKAFSKDKAGEITHIIPPKALNV
ISTSATGTNGASSITLTNDGSVNGVLQGMIVSGENIGSGATVGSVNTTTGVVTLTASNTG
TVNGNVIFGEETSINWVNVDIQRTKVINQALSGQGGTPGTRLYLFGYQNETSPPTTRVQG
YTIGARQDGIGVNAVADKINVQLVAQGATEPTVQSALISPYGPSVSGLDAGVAGSPLQFD
SATYTISGVAGSVGGWYLTTSATNNAIYQTIANNSGAGGTYQNIAFTPTTFIKRIPDSRD
LQDRTYRVRYVIDKDKSNPLPRDPLSGYVVQPLNTDTTSYKLQRTFYIYDIEIVQEFERG
ISDGIYYLTLLCASIAPSTSNFNDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPLADPDAAISVADNETIG
LVSATDGASPTPNKDPKLSITKEGIQFLLTDTGWELPGTEPAYESVPKELSNVRVTARAG
NEETRKINIRQNAEGVVAPIPVELRRHSIMRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLS
QDQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQIINPVTGQITNEDVAQLNVVGEENTTI
ETFSELVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQLSSTNNIIAKKITYNNQDGTVIKQT
LLAPEDANGQPNFTNISGYDTPADGDLVYNINWNPGKSLGWIYYEGTWYEFGLTDVGDLN
IVNDNGTTRFGLGVAPLSPYVLNVGGSTRVDGDLVVTGRGGVGSDKYVTKSYTGDGSTLT
FAVTTYTGGIQHTDDSVLVFLNGVAQIAGTNYTVDSNGANVVFSSGDAPQTTDTVHILEL
PI
NT seq
3969 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctctaactagacttaagaatattattacgtcccgcacgggacgtattatttacgtt
aaccctgacgattttgatgcatctgatgctattgataacaggggtaactcggcattgcgt
ccatttaagtctctgcaacgagcatttttagaagttgctagattttcgtatcgagtgggt
ttgtcaaacgatgaatttgacgccttctcgatcatgctgtatccagcagaatatattgtt
gataatagacctggagaggttctttatactaacgttgctcctattgattctaactcaaac
ttagatcttacctcaccaaacaacgtattatataagtttaactcggttgaaggtggtatc
attgttcctagaggttgctccctcgttggtactgatcttcgtcgtacaaaaattattccc
aaatatgttccttatcctacaagttacggaacagaaattttagaaggtcaagaacctcct
cgtacttctattttcaaagtaactggtggtacgtacttctggcagttttcattctttgat
ggtgctgaagagggtgtatattatagacctgatagtacaaatactcttgctcctaagttc
tctcatcatagactaacttgttttgagtttgctgatggtcttaacagtttatctcagtta
attactgacggaaatgtaccctctggagattattctgctgttcctaatatcttagaaaga
acagatttagagatttactatcaaaaaatctccaaggcatttgctactattcctgataca
tctggagatcctgcaactgaccaaattcaggcaagagttgaagaaaatagaattgttggt
cctatttccgatgaatatagaattcttcaaattactcgtaatggtcaaactgcaactgcg
gttactgttgatgaacttgataatccaagagatcacggtttctctgtaggtgttaatatt
aatattagtggtgttactggatctactggaccaaactctgaattggatgttggtagatat
aatggttcattcactgtaacttctgcatctggtaatgtgtttacctatcagatgcaagaa
gaaccgtctggtaatgctgtaggttctaacatcactgttaagactgagattgatactgtt
gactctgcatcaccatatgcgtttaacttgtcactgagaagtgtctggggcatgaatggt
atgcacgctgatggtagtaaggcaactggtttcaaatcaatggttgttgctcagttcact
ggattgtccctccaaaaagatgatagagcattcgtaagatataatgcttctactggtaac
tatgatgcagcagttgctggtgatggtgctcacttagatggttttgctgagtatcgtaag
ggttgggcacatgagcacattaagtgtagtaatgactcattcattcaggcagtttcggtg
tttgctgttggatacggcacacactttacagcactcagtggtgctgacatgtcgattaca
aactctaacagtaactttggaaacactgctttaagatctgctggttttaaagcaaaagca
ttctctaaagataaagcaggcgagatcacacatatcatccctcctaaggcactaaatgtt
atctcaacatctgccacaggtactaatggtgcatcttccatcacacttacaaatgatggt
agtgtaaatggcgttcttcagggaatgatcgtaagtggtgaaaatattggttctggtgca
actgtaggttctgtcaatactactactggagttgttacactcactgcttctaatacagga
actgttaatggcaatgttatctttggtgaagaaacttctattaactgggttaacgttgac
attcaaagaaccaaagtaattaaccaagcactttctggtcagggtggaactcctggtaca
agattatatctctttggatatcagaacgaaacgtctccacctacaacaagagttcaaggt
tatactattggtgctcgtcaagatggtataggtgtaaatgctgttgctgataaaattaat
gttcaattagttgctcaaggtgcaaccgaacctaccgtacaatcagcattaatttctcct
tatggtccaagtgtttcaggtttagatgcaggggtagcaggttctccgctacaatttgat
agtgcaacatatactattagtggcgttgctggatctgtaggtggttggtatttgaccaca
agtgctacaaataatgcaatttatcaaactattgctaataatagtggtgctggtggcact
tatcaaaatattgcatttacacctacaacattcattaagagaattcctgatagcagagac
ttgcaggataggacttatcgtgttcgttatgtaatcgataaagacaagagcaatcccttg
cctcgtgatcccctatcaggttatgttgtgcaacctctgaatacggatactacatcctat
aagttacagagaacattctatatctacgacattgaaattgttcaggaatttgaacgaggt
atttccgatggcatctactaccttaccctgctttgtgcatctattgcaccttcaacttct
aattttaacgacagaaagttcagtcaaaacgtcaacgaagtctatcctacgtttgacaga
gacaaccctcttgctgaccctgatgctgcaatatccgtcgctgacaatgaaactatcggt
ctcgtaagtgcaactgatggtgcatcacctacacctaataaagatcccaaactgtctatt
actaaagaagggattcaattccttttgactgatactggttgggaattgcctggaacagaa
cctgcgtatgaatctgttcctaaagaactttctaatgtcagagtaactgctcgtgctggt
aatgaagaaacaagaaagattaatattcgtcagaatgctgaaggtgttgtagcacctatc
ccagtagaacttagaaggcattctattatgcgttctggtaaccatacctttgagtatctt
ggtttcggtcctggtaactactcaactgcattccctcagacacaagtagaaacgttatca
caagaccagattaagttctctcagtctattaaagaggaagcaggtgttgcattctactca
ggtctaaactctaatggagacctattcattggtaaccagattattaaccctgttacgggt
cagattacgaatgaagatgttgctcaattgaatgttgttggtgaagagaatacaacaatt
gaaacattctctgagttggttcttactgataaactcaccgttattggtggtgcatctaac
cagttagaatcaatctttgctggtcctgttactttccaaggtcaattatcttctactaac
aatatcattgctaagaagatcacttacaataaccaagatggtactgtaattaagcagact
cttcttgcacctgaagatgctaatggtcaacctaattttactaatatctcaggatacgat
actcctgctgatggagatttagtttacaacattaactggaaccctggtaaatctcttggt
tggatttactacgaaggaacttggtatgagtttggattgactgatgttggtgatcttaat
attgttaatgacaatggcaccacacgttttggtcttggtgttgccccattatcaccttat
gtattgaatgttggaggcagcactagagttgatggtgacttagttgttactggacgaggt
ggcgttggttctgacaagtatgttaccaagtcttatactggtgacggatcaactctaaca
ttcgctgttactacgtacactggtggtattcagcatactgatgattctgtcctagtattc
ctgaatggtgttgcacagattgctggtacaaactatacagttgattctaatggtgctaac
gttgtctttagttctggagatgcaccacaaactacagacacagttcacattttagaacta
cctatctaa
DBGET
integrated database retrieval system