Viruses: 16414445
Help
Entry
16414445 CDS
T40000
Symbol
106R, IIV22_106R
Name
(RefSeq) Invertebrate iridescent virus 22; 5'-3' Exoribonuclease 1
KO
K27485
Chloriridovirus 5'-3' exoribonuclease 1
Virus
345198
Invertebrate iridescent virus 22
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
XRN_N
XRN_M
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16414445
NCBI-ProteinID:
YP_008357404
RS:
NC_021901
UniProt:
S6DA78
LinkDB
All DBs
Position
NC_021901:117659..119353
Genome browser
AA seq
564 aa
AA seq
DB search
MGIKYFFKWFKDSFPKTVTKPFGREDQKLQDVLNTDVEQTFLLLLDLNGIIHTSCQKIYK
YGSFEPKSLLKKSPPIVGGEKDLLVFEDVLNSINALVVKINPKEIVLCIDGVAPISKQIQ
QRQRRFLSKKTSGGFDSNCISPGTNFLYQLGLYLKSNLEKKLEEDWLGVTTIYFMDSLVP
GEGEHKLFDFLRSNQAKISDAKMSIVIVGNDADLIMLSLLISTLFFKENSIYILREDLTS
KKSDYVLVNINQFKKNIFNFAMDKPRFKHYDFEFVVCDFVILCFLIGNDFLPQISLFNIY
DGGLDLMMKYYFTTPGYITYKPTVFKEKPKKNFHPKIKINLKNLTGCFNHLINIIIPQAI
QHYKTREYGYPNILLDIASQKESSFLDITLHYLKSYSIHHNITKNLIHLYLEEIKWVFNY
YAYGGFTVDWKMYYPSQFAPTPLDILNYLNNLKVRKNSFEQSNPNLLPFQIDPFYQLLCI
LPPHSADLLPKPLNKVLCEDLSHFHPLEINIDYQGKLNEWEGIPILPALNHDEIFQIYND
NVIHCSKKDLERNKCSNQLMISVE
NT seq
1695 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaattaaatatttttttaagtggtttaaagattctttccctaaaacagttactaaa
ccttttggtagagaagaccaaaaactacaagatgttttaaatacagatgtagaacaaaca
tttttactattattagatttaaacgggattattcatacatcttgccaaaaaatctacaaa
tatggttcttttgaacctaaatctttattaaaaaaatcacctcctattgttggaggtgaa
aaagacctattagtttttgaagatgttttaaacagtattaatgctttagtagttaaaatt
aacccaaaagaaatagttttatgtatagatggtgtggctccaatatctaagcagattcaa
caacgacaacgtcgatttttatctaaaaaaacaagtggtggttttgattctaattgtatt
tctcctggaactaattttttgtatcaacttggattataccttaaatccaatttagaaaaa
aaattagaagaagattggcttggagtaactacaatttattttatggattctttggttcct
ggtgaaggtgaacataaattatttgattttttaaggtcaaatcaagctaaaatttccgat
gctaaaatgtctattgtaattgtgggtaatgatgctgatttaattatgttatcacttctt
atttcaaccttattttttaaagaaaattctatttatattctaagggaagatttaacttct
aaaaaatcagattatgtattagttaatattaaccaatttaaaaaaaatatttttaatttt
gcaatggataaaccaaggtttaaacattatgattttgaatttgttgtatgcgattttgtt
attttatgttttttgattggaaatgactttttacctcaaatttctttatttaatatttat
gatggtggattagatcttatgatgaaatattattttacaactcccggttatataacatac
aaaccaactgtttttaaagaaaaacccaagaagaatttccaccctaaaattaaaataaac
ttaaaaaatttaacaggttgttttaatcatttaataaatataattatcccacaagctatt
caacactataaaacacgtgaatatggatatcctaatattttgttagatattgcatcccaa
aaagaaagttcctttttagatataactctccattatcttaaatcatactccattcatcat
aacattactaaaaacttgattcatttgtaccttgaagaaattaaatgggtatttaattat
tatgcttatggaggatttacagttgattggaaaatgtattatccaagtcaatttgcacct
actcctttagatatattaaattacctgaataatttaaaagtaagaaaaaattcatttgaa
caaagtaaccctaatttattaccatttcaaattgatccattttatcagttgttgtgtata
ttacctccccatagtgctgatttattaccaaaaccattaaacaaagtgttgtgtgaagat
ttaagccattttcatccattagaaataaacattgattaccaaggaaaattaaatgaatgg
gaaggtatacctatcttaccagcattaaaccatgatgaaatttttcaaatttataatgat
aatgttatccattgttctaaaaaagatttagaacgaaataaatgttccaatcaattaatg
atttctgttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system