Viruses: 18499559
Help
Entry
18499559 CDS
T40000
Symbol
16, CF79_gp47
Name
(RefSeq) Citrobacter phage CR8; internal virion protein with endolysin domain
KO
K21508
Autographiviridae peptidoglycan hydrolase [EC:4.2.2.-]
Virus
1455076
Citrobacter phage CR8
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PRD1_P5_spike_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18499559
NCBI-ProteinID:
YP_009004202
RS:
NC_023548
UniProt:
W6Q7I9
LinkDB
All DBs
Position
NC_023548:29304..33200
Genome browser
AA seq
1298 aa
AA seq
DB search
MATRGIRNNNAGNIRVSKDQWQGATGSDGEFVTFETPEHGIRALSKNLLSYQRQGFDSVG
KIISRWAPPNENDTEAYINNVVSATGLQRDQALDLNDPSTLAALARAIMVQENGAANMQY
TDDQIQAGVGMALGKEGITPKSNPVSPADWNYLTEGIKAQPKVKLGEGLQGTVGLSVEGE
APAPANKSFGEMYYNQKGETLDQTADKSTFFGFGDASEAELKNSTLGVAVRAAQFEDSLD
VVSDVFQPTRWNPHRWSREELDQIRNAGVLPDYYGVITGGSPQNLQSLIELALENQKYDQ
EKMKAGTGAQLAAGIVGAGVDPLTYVPMAGYARGGKLVNKMFTIGAQSAVYAGAGEALRS
SVAGGQDHVSEAMIGGALFGGGMTAIADGLGKAFGSKAVNEFHAPSIRLEARETARNTGI
SDPSRLPWQEGEEIFEHNGVRYAEVPNEAGSVRLDDGSILIGENPLNPKSQAEMAKVEPE
KAAMGLQMGGLTEIGLKLLRSDNPEIRGVAADLVRSPTGMESGATGKIGTTASDVFERLK
HQDHRFMNDLDTAVRDVLKDPEFQTNFGRDNKAFRQDVYQRVALAIEDASGDIAKGLTQA
ERKVYDLLQDHFTAKREMMENPAMFGNGEAKGFFPESRHKGTYIPHVYDSQAKQLYSKML
GAEGLQEAIAKSWLTSYHSRPEVKARVDEMILEANPNMKPDELQDAVQKYANDKAYGISH
TDQFDRSSVMEENIEGLVGLENNSFLEARNLFDSDMSITLPNGETFAVNNLRQFDMDKIV
PAYSRRVNGDISIMAGTGKSTKEMKDLVETMMNKAGDDGKAKAEVAVLRDTLKILTGRSR
RNADAAAFDTVMQSMNDLSFFAKNAYMGVQNLTEIGGMLARGNIRAALHGIPVFRDMAFR
TKKMKGAEIKEMHNVIWGKELDDSIRPSKQDVVDRLKKYSDLSDTSANVIGGMKYYTGEL
AVRSPWTKVLNSTTNYIADTARQGVLSDVVEHALTGSRRKFDGRWLKSAGISKEQWNGIK
SLIKEQTYRDADGSMKFKDKKAFSQDPRAMDLWRLGDTVADETILRPHKLSNQDSKAYGA
LAKTALQFKNFVIKSINGRTMRSFYNASKNHRAIDQALSASMSMMLAGFYYVAQAHVRAS
AMQDGADREYLKRALDPTMIGYAALSRSSHLGGPLGVANVLGGVAGFKDTQMLRSTILPK
SEAEKPGRAVMFGAAKSDPVMGFVGNVLEQIPAFGFAANVGAAVYNTKGYLQADRRVDER
EYMTGMYNTFRELVPNDPVTQSLMLGVFEEQGIHIKQK
NT seq
3897 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaactcgtggtatcagaaacaacaacgcagggaacatccgtgtgtctaaagaccag
tggcagggagctactggcagtgacggtgagttcgtgacctttgagactcctgagcatggt
atcagggctttaagtaagaacctgctgtcctatcagcgtcaaggctttgactccgtaggt
aagattatctctcgctgggcaccgcctaatgagaatgatactgaagcctatatcaataac
gtggtctccgccacaggtcttcaacgcgaccaagcgttagatttgaatgaccctagcaca
cttgcagctttggcccgtgctatcatggttcaggagaatggcgcggccaacatgcagtac
acggatgaccagattcaagctggtgtgggtatggctctagggaaagaaggcatcacccca
aagtctaaccctgtaagtcctgctgactggaactatctgaccgaaggcattaaggctcaa
cccaaggtaaaacttggcgagggcttacagggaacagtgggtctctccgttgaaggggag
gctcccgctccagccaataagtcctttggcgagatgtattacaaccagaagggtgagacc
ttagaccagacagccgacaagtctaccttctttgggtttggtgacgcttctgaagctgaa
ctgaagaactcgactttaggtgtggctgtgcgtgctgcgcagtttgaagactcgctggac
gttgtgtctgatgtcttccagcctacccgttggaacccacacagatggtctcgtgaagag
ttggaccagattcgtaatgctggtgttctcccagactactacggtgttatcacaggcggt
tcaccccagaaccttcagtccctcattgagttagctctggagaaccagaagtacgaccaa
gagaagatgaaggctgggactggtgctcaacttgctgctggtatcgtgggtgctggtgtt
gaccctttgacgtatgtgcctatggctggctacgctcgtggtggtaagttggtgaacaag
atgtttactatcggtgctcagtccgctgtctacgcgggtgctggtgaagctttacgttcc
tcagtagctggtggccaagaccatgtgtccgaagcaatgattggtggtgctctgtttggg
ggcggtatgaccgctattgctgacggtctgggtaaggctttcggctccaaggctgtcaat
gagttccatgctccaagtatccgactggaagcacgagagactgcacgtaacactggaatc
tctgaccccagccgtttaccttggcaggagggtgaagaaatctttgagcacaacggcgta
cgatacgctgaagtgcctaacgaagctggctctgttcgacttgatgatggctcaatcctt
attggcgagaacccgctcaaccctaagtcccaagctgagatggctaaagtagagcctgag
aaggctgctatgggtcttcagatgggcggacttactgagattggcctgaagcttctacgc
tcagataaccctgagattcgtggagttgctgccgacttggtacgctcacctacaggcatg
gagtctggagccacaggtaagattggcacgactgcaagtgatgtctttgagcggctgaag
catcaagaccacaggttcatgaatgacctcgacactgctgtccgtgacgtgttgaaagac
cctgagttccagaccaactttggtcgagacaataaggctttccgacaagacgtctaccag
cgtgtagctctagctattgaagatgcctccggtgatattgccaaaggtctgactcaagca
gaacgtaaagtctatgacctgctgcaagaccatttcacagctaaacgtgagatgatggag
aacccggctatgtttggtaatggtgaggccaaaggtttcttccccgagtctcgacacaag
ggtacatatatcccacacgtctatgactctcaggccaagcagttgtactccaagatgctg
ggcgctgaaggactccaagaggctatcgctaagtcttggctaacgtcttaccacagccga
cccgaagtcaaggcacgagtggatgagatgattcttgaggccaacccgaacatgaagcct
gatgaactccaagatgctgtccagaagtatgctaatgataaagcctacggtatttcacac
actgaccagttcgaccgttcgtctgttatggaagagaacattgagggtctggtgggtctt
gagaacaactcgttccttgaggctcgtaacctgtttgattccgatatgtctatcaccctt
cctaatggtgagacctttgctgtgaacaacctgcgtcagtttgatatggacaagattgtt
cctgcttacagtcgccgtgtgaatggtgacatctctatcatggctggtactggtaagtct
accaaggagatgaaagaccttgtagagaccatgatgaacaaagctggtgacgatggcaag
gctaaggctgaagttgctgttctccgtgataccctgaagattctaaccggacgctcaaga
cgtaatgctgatgctgctgcattcgatacggtgatgcaatccatgaatgaccttagcttc
tttgccaagaacgcctacatgggtgtccagaaccttactgaaattggtggtatgttggct
cgtggtaatatccgcgctgccctgcacggtatccctgtcttccgtgacatggctttccgc
accaagaagatgaaaggggctgagattaaggagatgcacaatgtaatctggggcaaggaa
ctggatgactctatacgtccgtccaagcaggatgttgttgaccgtctgaagaagtacagt
gacctgagtgatacctctgccaacgtaattggtggtatgaagtattacactggtgagctt
gcagtcaggtcgccgtggactaaggttctgaactctacgaccaactacattgctgatact
gctcgccaaggcgtactgtctgatgtggtcgaacatgccttaactggaagccgtcgtaag
tttgatggccgatggctgaagtctgctggtatctctaaggaacagtggaatggcattaag
tctctcatcaaggagcagacctatcgtgatgctgatggctccatgaagttcaaggacaag
aaagcctttagtcaagacccaagggctatggacttatggcgactcggggataccgtggct
gacgagactatcttgcgcccacacaaactgagcaaccaagactccaaagcttatggcgct
cttgctaagacagccctacagtttaagaacttcgtcatcaagtctatcaatggtcgtact
atgcgtagcttctacaatgcgtccaagaaccacagggctattgaccaagcgttatcggcc
tctatgtctatgatgctggctggcttctactatgtggctcaggctcatgttagagcttct
gctatgcaggatggggcagaccgagagtacctgaagcgagcattagaccccaccatgatt
ggctatgcggccctgtcccgtagttcccacttgggtggcccactcggtgtggctaacgtc
cttggtggtgtggctggctttaaggatacccagatgttgcgctctaccatcctgcctaag
tctgaagccgagaagcctggccgtgctgtgatgtttggtgccgctaagtctgaccctgtg
atgggcttcgtgggtaacgtattggagcagattccagctttcggctttgctgctaacgtt
ggtgctgctgtgtacaataccaaaggatacctacaggccgaccgccgagtcgatgagagg
gagtatatgactggcatgtataacactttccgcgagcttgtgccgaacgacccagtgact
cagagcctaatgctgggtgtctttgaggagcagggtattcacatcaagcagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
