Viruses: 18501343
Help
Entry
18501343 CDS
T40000
Symbol
149R, IIV30_149R
Name
(RefSeq) Invertebrate iridescent virus 30; DNA topoisomerase II
Virus
345585
Invertebrate iridescent virus 30
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
TOPRIM_C
DNA_gyraseB
Toprim
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18501343
NCBI-ProteinID:
YP_009010443
RS:
NC_023611
UniProt:
W8W2Y4
LinkDB
All DBs
Position
NC_023611:160775..164161
Genome browser
AA seq
1128 aa
AA seq
DB search
MMSAKPKLKYCIKNDIQHVLDCSDVYLGDTSSSIRKEYVYNCELNKIVSQNINISEALVR
IFVEVLTNAVDNVERSKDTETCCKTIKVNLNLETGLTSVWNDGVVIPIIKNKNQVMDKND
SENIFLSKEDKINLKKLNELYIHSLIFGHLRSSSNYSNEEVRETSGKNGVGVKCTNIFSS
YFCVTGVDPNHKLKLVQEWTNNMTKTQDPEITTCNATRGYTEVKYIPDFKRFNLTKYPDE
FLSIAKKLVIDVSSLLPEINVYFNGEKILIKNLNSYSRLYYDDNEPINTLSLKYKGSEVV
IVGSENCAANLPISFVNGQITKDGGQHTQSWTKTVFSSILESLNKSKKDTKLSKGDISPY
FQFFIHSRVNKPKFDGQNKNMLKNPKVESKLEKTQLNKILKWPVITIIKEKVLRSKEFLA
LKKIESTKRKTIPKVDGYDPANTFGLESILIVCEGLSAKSYAVAGIQTGIFGKKGRNYFG
ILPLRGKFLNVKNVSLTKIGSNKVVSDLIKVFNLKFNLDYSLPQNFKTLNYGNLLILTDA
DKDGIHIKGLILNFFHELFPTLFKKEGFIMSMETPIVKIFQKKGKEDLLFYDENTFEEYR
QQKSIKNFKYYKGLGTINPKDVSSFFGKKLVKYRCDSKGEKTINKVFGSENTNERKLWLN
NFNPKESKYCLDTLPEECEEKNNVVVSTINVKVSDFMEHEMIKFSYEDCKRSLGSCIDGL
KESQRKVIYAIRKKFRSKGDFIKVAQLSGYVAEQTDYKHGEQNLCETIIKFAQDFVGTNN
IALLEPDGQFGTRLEGGKDSAASRYIYTKPNKILKYIFREEDDPILNYTVEGEPVHFIPV
IPLILINGSIGIGTGWSCFIPQYNPLELIDAICLKLLNKKNNGINNLYPFYKNFKGKIKA
CDEDMLKFLTYGKMKRLDENTIQVTELPIGMWTDKFKEHCYSLIEKGLLTQLINESTTEN
VNFTLKGLEDLSVLKLTSTLHTTNMVLFNHKSVITKYQTINDILDNYFDTRLHYYNLRKN
YLLQKLKDDINLNENKYNFINKVVESDNFLKQKDKHIIDELENENFLKINDTFNYLLNIP
IRGCTINAVNCLKTTILKLKEDLIELEQLSVEQMWLNELNEVKEQLIN
NT seq
3387 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtctgcaaaacctaaattaaagtattgtataaagaatgatatccaacatgttttg
gattgttctgatgtatatcttggtgatacttcttcttctataagaaaagagtatgtttac
aattgtgaactaaataaaattgtatcccaaaatattaatatatctgaagcattagttaga
atttttgttgaagtattgactaatgcagttgataatgtggaaaggagtaaagatactgaa
acatgttgtaaaacaattaaagttaatttgaatcttgaaacaggactaacaagtgtttgg
aacgatggtgttgttattcctataattaaaaataaaaatcaagttatggataaaaatgac
tctgaaaatatttttttatctaaagaagataaaattaaccttaaaaaattaaacgaatta
tatattcattccttgatttttggtcatcttagatcaagttctaactatagtaatgaagag
gttagagaaacctctggtaaaaatggagttggagttaaatgtactaatattttttcatct
tatttttgtgtgactggagttgaccctaatcataaattaaaattagtccaagaatggact
aacaacatgactaaaactcaagatccagaaataacaacttgtaatgcaactcgtggttat
acagaagttaaatatattccagattttaaaaggtttaatttaactaagtatccagatgaa
tttttatctattgctaaaaaattagtaatagatgtaagttcacttttaccagaaattaat
gtgtattttaatggagaaaaaatattaataaaaaatttaaattcttattctcgtttgtat
tatgatgataatgaacctattaatactttaagcctaaaatataaaggttctgaagtagta
attgtaggatctgaaaattgtgctgccaatttacctatttcttttgtaaatggacaaata
actaaagatggcgggcaacatactcaaagttggacaaaaacagtgttttcaagtatactt
gaaagcttaaacaaatctaaaaaagatacaaaattatctaaaggagatatttctccatat
tttcaattttttattcattcaagagtaaataaacctaaatttgatggccaaaataaaaat
atgttaaaaaatccaaaggttgaatctaaacttgaaaaaacacaattaaacaaaatttta
aaatggcctgttattactataattaaagaaaaagttttaagatctaaagaattcttagca
ttaaaaaaaatcgaaagtacaaagcgtaaaactatccctaaagtagatggatatgatccg
gctaatacttttggtttagaaagtatcttaattgtgtgtgaaggtttatctgctaaatct
tatgctgttgctggtattcaaacaggaatatttggaaaaaaaggacgtaattattttggt
attttaccacttcggggtaaatttttaaatgtaaaaaatgttagtttaactaaaattggc
agtaataaagttgtttctgatttaataaaagtatttaatttaaaatttaatttagactat
tctttacctcaaaattttaaaactttaaactatggtaatcttttaattcttactgatgct
gataaagatggtattcatattaaaggtttaattcttaattttttccatgaactatttcca
acattatttaaaaaagaaggatttataatgagtatggaaaccccaattgttaaaattttt
caaaaaaaaggtaaagaagaccttctattttacgatgaaaatacttttgaagagtatagg
caacaaaaaagtattaaaaattttaaatattataaaggtttaggtaccattaatcctaaa
gatgtttcatctttttttggtaaaaaattagttaaatatagatgtgatagtaaaggtgaa
aaaaccataaataaagtttttggaagcgaaaatacaaatgaaagaaaattatggttaaac
aactttaatcctaaagaatctaaatattgtcttgatactttaccagaagaatgcgaagag
aaaaataatgtagtagtttctaccataaatgttaaagttagtgattttatggagcatgaa
atgattaaattttcatatgaagattgtaaaagaagtcttggaagttgtattgatggtctt
aaagaatctcaaagaaaggttatttatgccataagaaaaaaatttagatcaaaaggggat
tttattaaggttgctcaattaagtgggtatgttgcggaacaaacagactataaacacggt
gaacaaaatttatgtgaaactataattaagtttgcccaagattttgttggtacaaataat
atagcattacttgaacctgatggtcaatttggtaccagattagaaggaggtaaagattct
gcggcatcaagatatatttataccaaaccaaataaaatattaaaatatatatttagagaa
gaagatgaccctattttaaattatactgttgagggtgaacctgttcattttatcccagtg
attccattaattttaattaatggttctattggtattggaacaggatggtcatgttttatc
cctcaatataatcctttggaattaattgatgctatttgtttaaaattgttaaacaaaaaa
aataatggtataaacaatctttatcctttttataaaaattttaaaggtaaaataaaagcg
tgtgatgaagatatgttaaaatttttaacatatggtaaaatgaaacgtctagatgaaaat
actatacaagtaactgagttacctattggaatgtggacagacaaatttaaagaacattgt
tactctttaattgaaaaaggcttgctaactcaattaataaatgaaagtacaacagaaaat
gtaaattttactttaaaaggtttagaagacctttcagttcttaaattaacatctacttta
cataccacaaatatggttttatttaaccacaaatctgtcattacaaaatatcagacaatt
aatgatatacttgataattattttgatactcgattacactactacaatttacgtaaaaat
tacttgttacaaaaattgaaagatgacattaatttaaatgaaaataaatataattttata
aataaagttgtggaaagcgataactttttaaaacaaaaagataaacatatcattgatgag
ttggaaaatgaaaattttctaaagattaatgatacctttaattatcttcttaatattcca
attagaggatgtacaattaatgcagtcaattgtttaaaaacaacaattttaaaacttaaa
gaagacctaattgaattggaacaattaagtgtggaacaaatgtggttaaatgaattaaat
gaagtaaaagaacaattgattaattaa
DBGET
integrated database retrieval system