Viruses: 19524736
Help
Entry
19524736 CDS
T40000
Symbol
JS09_0204
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoM_JS09; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
1430444
Escherichia phage vB_EcoM_JS09
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Gp34_trimer
DUF4410
gp12-short_mid
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
19524736
NCBI-ProteinID:
YP_009037527
RS:
NC_024124
UniProt:
A0A060BGX1
LinkDB
All DBs
Position
NC_024124:complement(16624..20499)
Genome browser
AA seq
1291 aa
AA seq
DB search
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGF
VVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGN
DMVFTLPNAPVDGDTIVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLL
FVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPHQAQANDFIVLRFTSAAPINITLPRNANNGDII
SLVDLDKLNPLYHTIIKTFDDTTSIGEVGTHIVEGRTSSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQK
SRLRIIRTDSNIRPNEEVLIFGTNNATAETINLTLPTGILTGDTVKISMNYMRKGQTVKI
KAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDTQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTDSDTH
YWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTA
TEARRGIAKIATTAQVNQNSIASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGL
DDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKDTSTLTISPKAL
DQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAE
TNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSD
RTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQTESNAGTLDDVLITPKKLLG
TKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGS
ITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIR
RDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQT
GTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPI
NINASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASG
DQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRA
PTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVSGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTL
DSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATI
GNLTIRDFLRIGNVRVIPDPVNKSVKFEWIE
NT seq
3876 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgacatcaaacgtaagttcagagccgaagacggtctggacgccggtggcgacaag
attgttaacgtagcattagccgaccgtacagtaggtactgatggcgtaaacgttgacttc
ctggtacaagaaaacaccgttcaagtatatgattctacgcgtggatataacaaaggattt
gttgttctttatgacaaccgtttatatcaagcaataaatgatatcgtgtctccttccggg
gcatttaaccttttacaatggcgtgcagttcgtaccgatgcacaatggataactgtagct
tctgggacttatcaactttcttcaggtgaatcgatttcggttaacactggtgccggcaat
gatatggttttcacgttgccaaatgcgccggttgatggtgacactattgttttagctgat
atcggtggaagaaccgggacagttaaagtacagattaacgcgtctgtgcagagtatttta
aactttagaggtgaacaagttcgtacagttttaatgacgcgcccacgttcacaactattg
tttgtgtttagtaatcgtttgtggcagatgtatatcattgattacggtaaagaatcaatc
actgttacacctgctacaccacatcaagcgcaagcaaacgattttattgttcttcgtttt
actagtgcagcaccaatcaacattacacttccacgtaatgctaacaatggtgatataatc
agcctagttgatttagataaattaaacccactgtatcatacgattattaaaacatttgat
gatacaacgtctattggcgaagtcgggactcatatcgtcgaaggtagaacttcttctgac
gcgttttttgtttttgatgctgcaaatagtttatggcgtatatgggaaggcgaccagaaa
tcacgtcttcgtattatccgtacagattcaaatattcgcccaaatgaagaagttcttatt
tttggtacaaataacgctacagcagaaactattaaccttacgcttcctacaggaattttg
accggtgacactgttaaaatttcaatgaactacatgcgtaaaggccaaacagtaaaaatt
aaagctgccgaaggtgatacaattgcttcttctgtcgcattacttcagttccctaaacgt
tctgaatatccacctgatactcaatgggtctctgttactgaactagaattcaatggcact
acttcatatgttcctgtattagaattagcgtatatcgaagacaccgattctgacactcat
tattgggttgtgcaacagaatgtccctacggtagaacgtgttgatgctggaactgatgct
acacgagctcgtttaggtgttattgctcttgctactcaagcgcaagcaaatgttgattta
gagaatactccagctaaagaagtggctattactcctgaaacgttggcaaatcgtacagca
actgaagctcgacgtggtatcgctaaaattgctacaacagcacaagttaaccagaattcc
atagcatcatttgtggacgatactattgttacgcctaaaaaactaaatgagcgtacagca
actgaaactcgtcgcggtcttgctgaaattgctactcagactgaaaccgatgctggtctt
gatgacacaacgattattacacctaagaaattgcaggcacgtcagggttctgaaacacta
tcaggtatagttaaatatgtatcaactacttctgctactcctgctgaaactcgtggagct
gcaggcactaatgtttataataaagacacatccacgttaactatttctcctaaagccctt
gaccaatataaagcaacttatgctcaacaaggtgcagtaattttagctgttgatagtgaa
gtaattgctggacaatctcaagcaggttattctcacgctgtagtaactcctgaaacacta
cataagaaaacttctactgatggacgtattggtttaattgaaattgctacgcaagcagaa
actaatgctgggactgattatacacgtgcagtaacgcctaagacgttaaatgataggaaa
gctacggaaggattatccggcatagccgaacttgctacgcaagttgaatttgatactgga
actgatgatactcgtatctcaactccactgaaaattaaaactcattttgattcttctgac
cgtaccagtgttaattctgattccggacttattgaagaaggaaccttgtggaaccattat
actcttgatatttctaaagcaaatgaaacacaacgtggtacacttcgagtagcgactcag
acagaatctaatgcaggaactttagatgatgttcttattactcctaaaaagcttttaggg
actaagtccactgaaacgtctgaaggcgtaattaaggttgctactcgggctgaaactgta
acaggaacttctgctaatactgctgtatcgcctaagaatttaaaatggattgtccagaat
gaaccaacatgggctgctactacagcaattcgtggattcgttaaaacttcatccggttct
attacatttgttggtaatgatacagttggttcaacacaacctttagaatcatatgaaaaa
aatagctatgctatatctccatatgaattaaaccgtgtacttgctaactatttgccatta
aaagcaaaagctgctgacgcaaatttattagatggcatagattcatctcagttcattcgt
agggatattgcacagacggttaatggttcactaaccttaacgaaacaaactaatctgagt
gcccctcttgtatcatctagtactgctacgtttggtgggtcagtttcggcaaatagtaca
ttaactatttctaatactggaacggcaactcgtctgatttttgagaaaggacctcaaact
ggaactaatccagcacagacgatgactatcagagtttggggaaatcagtttggtggcgga
tcagatacaacacgttctactgtatttgaagttggtgatgaaacgtctaatcatttttat
tctcaacgtaataaagatgggaatatagcgtttagcattaatggtactgtgatgccaata
aacattaatgcttccggtttgatgaatgttaatggcgttgcaacattcggtcgttcagtt
actgctaatggcgaattcattagtaagtctgcaaatgctttcagagcaattagtggtgat
tacggattctttattcgtaatgacgctgctaatacctattttatgctcactgcatcaggc
gatcagactggcggatttaatggattacgtcctttagctattaataatgcatccggtcaa
gtaacgattggtgaaggcttaatcattgccaaaggtgctactataaattcagatggtttg
actgttaactctagaattcgttctcagggtactaaaacatctgacttatatactcgtgcg
ccaacatccgatactgtaggattctggtcaattgatattaatgattcagccacttataac
cagttccctggttattttaaaatggttgaaaaaactaatgaagtgtctggacttccatac
ttagaacgtggcgaagaagttaaatctcctggtacattgactcagtttggtaacacactt
gattcgctttaccaagattggattacttatccaacaactccggaagcacgtaccactcgc
tggactcgtacatggcagaaaactaaaaattcttggtcaagttttgttcaagtatttgat
gggggtaaccctcctcagccatctgatattggtgctttaccttctgataatgcaacaatc
ggaaacttgacaataagggatttcttaaggattggtaatgtccgcgttattccagaccct
gtgaataaatctgttaaattcgagtggattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
