Viruses: 19524964
Help
Entry
19524964 CDS
T40000
Symbol
JS09_0246
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoM_JS09; ATP-dependent DNA ligase
KO
K18951
Straboviridae DNA ligase [EC:
6.5.1.1
]
Virus
1430444
Escherichia phage vB_EcoM_JS09
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_ligase_A_M
mRNA_cap_enzyme
UBZ_FAAP20
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
19524964
NCBI-ProteinID:
YP_009037569
RS:
NC_024124
UniProt:
A0A060BE80
LinkDB
All DBs
Position
NC_024124:42358..43851
Genome browser
AA seq
497 aa
AA seq
DB search
MILDILNQIAAIGSTKTKQEILKKNKDNKLLERVYRLTYARGIQYYIKKWPGPGERSQAY
GLLELDDMLDFIEFTLATRKLTGNAAIKELMGYIADGKPDDVEVLRRVMMRDLEVGASVS
IANKVWPGLIQLQPQMLASAYDEKLITKNIKWPAFAQLKADGARCFAEVRDDGVQFFSRA
GNEYHGLTLLADELMEMTKEARERHPNGVLIDGELVYHSFDIKKAVSSGNDLSFLFGDNE
ESEEVQVADRSTSNGLANKSLQGTISPKEAEGMVLQAWDYVPLDEVYSDGKIKGQKYDVR
FAALENMAEGFKRIEPIENQLVRNLDEAKVVYKKYVDQGLEGIILKNRDSYWENKRSKNL
IKFKEVIDIALEVVGYYEHSKDPNKLGGVELVSRCRRITTDCGSGFKDTTHKTVDGVKVL
IPLDERHDLDRERLMAEAREGKLIGRIADCECNGWVHSKGREGTVGIFLPIIKGFRFDKT
EADSFEDVFGPWSQTGL
NT seq
1494 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttagatattttaaaccaaatagctgcgatcggttctactaaaacaaaacaagaa
atccttaagaaaaataaggacaacaaattacttgaacgtgtgtatcgtttaacatatgca
cgtggtatccagtattatattaagaaatggccaggaccaggtgaaaggtctcaagcgtat
ggtcttcttgaattagatgacatgttggattttattgagttcacattagccactcgtaaa
ctcactggtaatgctgcaattaaagagctcatgggttatatcgctgacggtaaacctgat
gatgtagaagtccttcgtcgtgtaatgatgcgcgaccttgaagtaggtgcttcagtgtct
atcgcgaataaggtgtggcctggacttattcaattgcaaccacagatgttagcatctgca
tatgacgagaaattgattactaaaaatattaaatggcctgcatttgctcaattaaaagcc
gatggtgctcgttgttttgctgaagttcgtgatgatggtgttcaattcttttctcgtgct
ggtaatgaataccatggtcttaccctattagcagatgaactaatggaaatgactaaagaa
gctcgtgaaagacaccctaatggggttttaatcgacggtgaattagtttatcattcattt
gatattaaaaaggctgtgagctcaggaaatgacctgtcgttcttatttggtgataatgaa
gaatccgaagaagtacaagttgcagaccgtagcacttcaaatggtttagcaaataaatct
cttcaagggactatttctcctaaagaagcggaaggtatggttcttcaagcctgggactat
gttcctttagatgaagtctattctgatggcaaaattaaaggtcagaaatacgatgttcgt
tttgctgctcttgaaaatatggctgaaggctttaaacgaattgagccaattgaaaatcag
ttagttcgtaatcttgacgaagctaaagtggtttataaaaaatatgttgaccaaggtctt
gaaggtattatccttaaaaaccgtgattcatattgggaaaacaaacgctctaagaatcta
attaaatttaaagaagttattgatatcgctttagaagttgtaggatactatgaacactct
aaagaccctaacaaattaggtggtgtcgaactcgtatcacgttgtcgtcgtattacaact
gattgtggttcaggttttaaagatacaactcataaaacagttgatggtgtaaaggttctt
attcctttagatgagcgtcatgatttagaccgtgaacgattaatggctgaagctcgtgaa
ggtaaattgattggacgtattgctgattgtgaatgcaatggttgggttcattctaaagga
cgtgaaggcactgtaggtattttccttccaattattaaagggttccgttttgataaaaca
gaagcggattcatttgaagacgtatttggaccgtggtcccagacaggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
