Viruses: 19735797
Help
Entry
19735797 CDS
T40000
Symbol
LP030-3_040
Name
(RefSeq) Listeria phage LP-030-3; tail length tape measure protein
Virus
1458852
Listeria phage LP-030-3
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
TMP_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
19735797
NCBI-ProteinID:
YP_009044686
RS:
NC_024384
UniProt:
A0A059T7P2
LinkDB
All DBs
Position
NC_024384:17934..23300
Genome browser
AA seq
1788 aa
AA seq
DB search
MSDGSVVIEISLDDKKADKQLDAFEKDLEKAGTNAGAALDKAYREAVSDIASQSKRLKDT
FVNAFKSMGSAGSNALKASLNFMRELPSNVQAALSKLASTVKTGFVNAAKASITVIKELG
TSIKNTAVNIKNGFFSIAKTVQSSIVSAVKVSINVIKSIPSAIKSAGISIKSALVSSLQA
AKSAAISFAQTTVKVIKSIPVAAKTAATAVKNSFVVAYKAVVVAAYMSVKGTISAVKAIP
SATKSAALAVSSAMKTAFSAVASASKTTGTTVKSALKTGFSAVKSGAKAAGQAGISALKG
LGNIAKSTGSLIKSGLVSGFNAAKAAAKGAGAGMREALKNSVEKPAEQARFSILRLAAAF
GLIAATKNVVGSAIGRVDTIDTATKSLTVLTGSAKDAQLVMTDLTAAIDGTPIALDAVAL
GAKKMVAAGMKAANVKPVFTAIADAAYGVGNGSESIDQMTDAISALQASGVAYADDINRL
VDAGVPAWQILANSTGKSVGEMKKYVSEGSLESTKAIAMLTKGIEEGTTGMAGNTAKMAG
LAKTAGNTISGSFANMKTAAVKSLANIAENLKGPIIQALDVAKNAFKQFAAVTASPEFQK
KLSDLIQKIKEFIPVLIEWAPVLAKVAAGFIAFNILSSVFSKVAGLIGVFKGLTSSGSLL
GVILNTIKGSFLGLKVALGSATAAFGIVAAVIGAVISVLYGMYAAFKENTANIKGFLSVM
LSSVKKSFGKIVEVFKQLMVALKPVGGVFKDILKSVGVYVWMELAIALAAVVDIIQVLVR
VVLVATKYMQGLYYTIKATFQALKGDLKGALKSVKESQKAFDEAGKAAKDAFNKDNYALT
GTVEAFKQMAGEAEKTGAKTETSGKKIKDTLKLVETTAKQTETTVSKSNQAIDTMLSGSV
DQYGNKLSEKTKSFLNSAKELYSQYQESAKKSQDAYSAAMEKAQDLEGDKRKKAIADANK
TLVDETTKNNSTLLTLQSDYSNMLKTNRWADGQELTAQQKKFLQQQTTDIQTELAKQNQL
YVEANLLRLEQGKSLNEKERNTSLEVQKSLYEEKKKAVETGEKSLADLKKKKADASTETE
KANYQIQIDEQTKKNKTLSTNLKNWATEMNAIIANGGTLNAETFASGLSQLGDISDEQLS
ALWQNFVSTSTSIDNTLSGLAAIMGQRGGEGVQAFVTAIQSKDYTTAALNINNDVLNTLS
SLPNGMFLNGQNGKNQFIAAIKSNEYQEAGKYLVDGVKMGASPLPSELNGIGKQGGNANA
DGIKSTAEANKNAGATIKNNAKNGAFDPNLFQMTGFSNANGFNGGILDGKGNAFSAGTGI
GNSAKSGAASVDSSGVGSYFASGYAQGIASGGVMVAGAASALANKALAAVQKKQDSHSPS
KESKKLGGDFGTGYSLGIADKNKAVTKAANNLVASALGTESQIKKLSSTLKDKISSAIDA
GLHSKNKSAGQLKQAKALNSIEGYIGQQTNKLAATAKKRDKVVAQLKAANTKMADLTKQS
KEYAASITEKMQSYGSISNVDAENPQSIQAEMQKRLKEIKAFQANVEKLRKKGVSKDIIS
DILESGVENGSSYAQALAKSDAKTIKAINSTQNQINSASKSMGNTAANAMYSAGINAAKG
LINGLNSQKKQLENTAKSIANTITNSVKKALRIHSPSRVAIELGKFFTGGLGNGVLAGAK
GAVQSTNKMVDKVVNAASNMTVPTINLPKISAEKALGLKSVDLNRTITVKTIIDNKTKES
SNADLIKAIQQSGDRPIIFNVDGKNLAENANNRIGTMSNLGLYGGGLL
NT seq
5367 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatggatcagtagtaattgagattagtttagacgataaaaaagcagacaaacaa
cttgatgcttttgaaaaagatttggaaaaagcaggaactaacgcgggggcggcattagat
aaagcatatagagaagcggtttcagatattgctagtcaatcgaaacgattaaaagacacg
tttgtaaatgcgtttaaatcgatgggaagcgctggctcaaatgctttaaaagctagtttg
aactttatgcgtgagttgccttcaaatgtacaagccgcactatctaaacttgcatcaaca
gtaaaaactgggttcgtaaacgctgctaaagcatctattacagtgataaaggaacttgga
acaagtatcaaaaacacagcagttaatatcaaaaacggcttcttttcaattgctaagaca
gtgcaaagtagtattgtgtcagctgttaaagtatcaattaatgtcattaaatccatccct
agcgcaattaaaagtgctggaatcagtattaaatccgcattagtaagtagtttgcaagca
gctaaatcggctgctatttcttttgctcaaactactgtaaaagttattaaaagtattcca
gtagctgctaaaacagcggctacagcagtgaaaaacagtttcgtagtagcttacaaagcg
gtggtagttgctgcttatatgagcgtaaaaggaactattagcgctgtgaaagctattcct
agcgccacaaaatcagcggcattagcagtaagtagcgcgatgaaaacagcttttagcgct
gtagcaagcgcgtcgaaaacgacaggaacaacagtgaaatcagcattaaaaacaggcttt
agcgctgtgaaatccggagctaaagcggcaggccaagctggtatttcagcattaaaaggc
ctaggaaacattgcgaaaagcactggttctttaattaaaagtggattagtaagcggattt
aacgcggcaaaagcggcggcgaaaggtgcaggcgctggaatgcgtgaagcacttaaaaat
tcagttgaaaagcccgccgaacaagctcgctttagtattctcagattagcagcagcgttc
ggattaattgcagcaactaaaaatgttgtgggtagcgctattggccgagttgatacgatt
gatactgcaactaaatcgttaacagtccttactggttcagcaaaagatgcgcaactagtt
atgacagaccttacagccgctatcgatggcacaccaatcgcattagatgctgtcgcgtta
ggtgctaaaaaaatggtcgcggctggtatgaaagcggcgaatgtaaaacctgttttcacc
gctattgctgatgcggcgtacggggtcggtaacggttcagaatcaattgaccagatgaca
gatgctatctcagcattgcaagcatctggtgttgcttatgcagatgatatcaataggcta
gttgatgcgggtgttccggcgtggcaaattttagcgaattcgacagggaaaagtgtagga
gaaatgaaaaaatatgtttccgaaggatctttagaatccacaaaagctatcgcaatgttg
acaaaaggcatcgaagaaggaacaactggaatggctgggaatactgccaaaatggcaggt
ctagcaaaaacagcaggtaacactatctctggttcatttgcgaacatgaaaacggcagct
gtgaagagtcttgcgaatatcgccgaaaacttaaaaggcccgattatccaagcactagat
gttgctaaaaacgcatttaaacagtttgcagcagtaacagcaagtccggaattccagaag
aaactttctgatttgattcaaaaaatcaaagagtttataccagttttaatcgagtgggcg
ccggttttggcgaaagttgccgctggatttatagcattcaatattcttagtagcgtgttt
tcgaaagtagccggacttataggtgtatttaaaggcttgacttctagcgggtcactctta
ggggtaatacttaacacgataaaaggttcatttttaggcttgaaggtagcattaggttca
gcaacagcggcttttggaatagttgccgctgtgataggcgcagtgatttcagttctttat
ggtatgtacgcagcatttaaggaaaatactgctaacataaaagggtttttatcagtcatg
ctctcaagtgtgaaaaagtcattcggaaaaatagtagaagtgtttaaacaacttatggtg
gcgctaaaacccgtgggtggagtattcaaagatatattaaaatctgttggtgtatatgtt
tggatggaacttgctatagcattagctgctgtagtcgatattatacaggtattagtcagg
gtagttttagtagcaacaaaatacatgcaaggtctctactatacaatcaaagcaacattc
caagcgctaaaaggtgacttaaaaggcgccctcaaaagtgtaaaagaatctcaaaaagca
tttgatgaagcgggaaaggccgcaaaagatgcatttaacaaagataattatgcactgact
ggaactgttgaagcgtttaaacaaatggccggagaagctgaaaaaactggtgctaaaact
gaaacatccggtaaaaagataaaagacacattaaagcttgtagaaacaactgctaaacaa
acagagacaactgtttcgaagtcgaatcaagcaatcgacacgatgctaagtggcagtgtg
gatcaatacgggaataaacttagcgagaaaactaagtcattcttaaattctgctaaagag
ttatatagccagtatcaagaatcagctaaaaaatctcaagatgcttatagcgctgctatg
gaaaaagctcaggaccttgaaggagataaacgtaaaaaagctatagcagatgcaaataag
actttagtagacgaaacaacaaagaacaatagcacgttactaactttgcaaagcgattat
tcaaatatgctaaaaacaaatcgttgggccgacggacaagagttaacagctcagcagaag
aagtttttacaacaacaaactactgatattcaaacagagttagcaaaacaaaatcagctg
tatgttgaagcgaacttattgcgactagaacaaggtaaaagcttaaatgaaaaggaaaga
aatacgagcttagaagttcaaaagagcttatatgaagaaaagaaaaaagctgttgaaact
ggcgagaaatcgcttgctgatttgaaaaagaaaaaagcggacgcttcaactgaaaccgaa
aaagccaactatcaaattcaaatcgacgaacaaacgaagaaaaacaagacattgtctaca
aacttaaaaaattgggcaactgaaatgaacgcaataatcgcaaatggaggcactttaaac
gctgaaacatttgcgagcggtttatctcaacttggagatattagtgatgaacagttgtct
gcgttgtggcaaaattttgtttctacaagcacttcaattgataatacattgtctggttta
gctgcaatcatgggtcaacgcggtggagaaggtgttcaggcgtttgttacagctatccaa
agtaaagattatactacagcggctttaaacataaataatgatgttttaaacacactttct
agcttgccaaatggcatgttcttgaatggacaaaatggaaaaaatcaatttatagctgct
attaaatctaacgaatatcaagaagcgggcaaatatttagttgatggtgtaaaaatgggt
gcttcacctcttccaagcgaactaaacggcattggtaaacaaggcggaaacgcaaatgct
gacggaataaagagtacagctgaagcaaataaaaacgctggtgctacgattaagaataac
gctaaaaacggtgcttttgaccctaacttgttccaaatgacaggttttagtaatgctaat
ggttttaatggcgggatattagacggaaaaggaaatgctttttcagcagggactggtata
gggaactctgctaaaagcggtgcggcctctgttgattcgtccggcgtcggttcttacttc
gcatctggatatgcccaaggtatagctagcggcggtgtgatggttgctggtgctgcatct
gcattagcaaataaagcactagcagcagttcagaaaaaacaagactcgcattcaccttcc
aaagagtcgaaaaaactaggtggagacttcggaactggttattcattaggtatcgcagac
aaaaataaagcagtgacaaaagcggcaaataatctagtagctagtgcgctaggtactgaa
tcgcaaatcaagaagctgtctagtacgctgaaagataaaatatcatcagcgattgacgcg
ggattacattctaagaataagagtgccgggcaacttaaacaagctaaagcactgaatagc
atagaaggctatatcgggcaacaaacaaacaagctagcggcaacagctaaaaaacgtgat
aaagtagtcgctcaattaaaagccgctaacacaaagatggctgacttgacgaaacaaagt
aaagagtatgctgcttcaatcactgaaaaaatgcaaagctatggatcaattagcaacgta
gacgcagaaaacccgcagtcaatacaagcggaaatgcagaaacgcttaaaagaaatcaaa
gcttttcaagcgaatgtggaaaaattgcgcaaaaaaggcgttagtaaagacattataagc
gacatcttagaatcgggagtagaaaatggttcatcttatgcgcaagctcttgctaaatct
gatgctaagactatcaaggcgattaatagcacgcagaatcaaatcaattcagcgtctaag
tcaatgggtaacacagcggctaatgctatgtattctgctggtattaacgcggcgaaagga
cttataaacgggcttaacagtcagaagaaacaactagaaaacacagctaagagcatcgct
aacacaatcactaattcagtgaaaaaggcgcttagaattcattctccttcacgcgtggcc
atcgagcttgggaaattctttactggtggtcttggaaatggggtattagctggtgctaaa
ggtgcggtgcaatcaactaacaaaatggttgataaagtagtaaatgctgcttctaatatg
actgttccgacaatcaatttgccaaaaatttcggctgaaaaagcgcttggtctaaaaagc
gtagatctaaacagaactatcacagttaagacgattattgataataagacaaaagagtct
agcaatgcagatttaatcaaagcaattcaacaatctggggacagacctatcattttcaac
gtcgatggtaaaaacttagcagaaaacgcaaacaatagaataggtacgatgagtaattta
ggactttatggaggtggcttactttga
DBGET
integrated database retrieval system
