Viruses: 19831528
Help
Entry
19831528 CDS
T40000
Symbol
IJ20_gp5
Name
(RefSeq) Vesicular stomatitis New Jersey virus; L polymerase protein
KO
K26275
Rhabdoviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.6.1.-
2.7.7.88
2.1.1.375
]
Virus
11280
Vesicular stomatitis New Jersey virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Mononeg_RNA_pol
Methyltrans_Mon_2nd
Methyltrans_Mon_1st
Mononeg_mRNAcap
Methyltrans_Mon_3rd
SNaCT8
FtsJ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
19831528
NCBI-ProteinID:
YP_009047085
RS:
NC_024473
UniProt:
I7DDK0
LinkDB
All DBs
Position
NC_024473:4636..10965
Genome browser
AA seq
2109 aa
AA seq
DB search
MDFDLIEDSDNWGDDESDFFLRDILSQEDQMSYLNTADYNLNSPLISDDIVYIVKRMNHE
DVPPIWRSKEWDSPLDMLRGCQAQPMSHQEMHNWFGTWIQNIQHDSAQGFTFLKEVDKES
EMTYDLVSTFLKGWVGKDYPFKPKNKEIDSMALVGPLCQKFLDLHKITLILNAVSLGETK
ELLTTFKGKYRMSCENIPIARLRLPSLGPVFMCKGWTYIHKERVLMDRNFLLMCKDVIIG
RMQTFLSMIGRSDNKFSPDQIYTLANVYRIGDKILEQCGNRAYDLIKMIEPICNLKMMEL
ARAHRPKIPKFPHFEEHVKGSVRELTQRSNRIQTLYDLIMSMKDVDLVLVVYGSFRHWGH
PFIDYFEGLEKLHTQVNMEKHIDKEYPQQLASDLARLVLNKQFSESKKWFVDPSKMSPKH
PFYEHVINKTWPTAAKIQDFGDNWHKLPLIQCFEIPDLIDPSVIYSDKSHSMNKKEVIQH
VRSKPNVPIPSRKVLQTMLTNRATNWKAFLKDIDENGMDDDDLIIGLKGKERELKIAGRF
FSLMSWRLREYFVITEYLIKTYYVPLFKGLTMADDLTSVIKKMMDSSSGQGLDDYSSVCL
ANHIDYEKWNNHQRKESNGPIFRVMGQFLGYPSLIERTHEFFEKSLIYYNGRPDLMTVRN
GTLCNSTKHRVCWNGQKGGLEGLRQKGWSIVNLLVIQREAKIRNTAVKVLAQGDNQVICT
QYKTKKTRSELELRAVLHQMAGNNNKIMEEIKRGTEKLGLIINDDETMQSADYLNYGKIP
IFRGVIRGLETKRWSRVTCVTNDQIPTCANLMSSVSTNALTVAHFAENPINAMIQYNYFG
TFARLLLFMHDPAIRQSLYNVQEKIPGLHTRTFKYAMLYLDPSIGGVCGMALSRFLIRAF
PDPVTESLSFWKFIYEHASEPHLKKMAVMFGDPPIAKFRIEHINKLLEDPTSLNISMGMS
PANLLKSEVKKCLIESRSSIKNEIIKDATIYMHQEEEKLRGFLWSIKPLFPRFLSEFKAG
TFLGVSEGLINLFQNSRTIRNSFKKRYHKDLDELIIKSEISSLSHLGSMHYRLGDNQIWS
CSASRADVLRYKSWTRKVVGTTVPHPLEMHGPPSKKEKPCHLCNSSGLTYISVHCPKGIT
DVFNRRGPLPAYLGSNTSESTSILQPWEKESKIPIIKRATRLRDAISWFIPPESPLSTCI
LNNIRALTGEDWSSKQHGFKRTGSALHRFSTSRMSNGGFASQSPATLTRMIATTDTMRDF
GTKNYDFMFQASLLYGQMTTSISRYGNPGSCTDHYHIRCKGCIREIEEVELNTSLEYKTP
DVYHILEKWRNNTGSWGHQIKQLKPAEGNWESLSPVEQSYQVARCIGFLYGELTHKKSRQ
ADDSSLFPLSIQLKVRGRGFLRGLLDGLMRSSCCQVIHRRSVSTLKRPANAVYGGLIYLI
DKLSASSPFLSLVRTGPIRQELEQVPHKMSTSYPTNIRDLGSIVRNYFKYQCRPVERGHY
KTYYNQIWLFSDVLSTEFIGPMAISSSLLKLLYRPSLTKKDREELRELAALSSNLRSGED
WDDLHIKFFSNDLLFCSQEIRHACKFGIKKDNEDITFYPNWGTEYIGNVIDIPVFYRAQN
VQKDIKVPPRIQNPLMSGLRLGQLPTGAHYKMRTIVSRLKISYHDFLACGDGSGGMTAAL
LRHNRTSRGIFNSLLDLSDTMLRGSSPEPPSALETLGGERVRCVNGDSCWEHPSDLSDEN
TWKYFLHLKKGCGMSINLITMDMEVQDPAISYRIESLVRQYVPVLLESDGCLIYKTYGTY
IATQKDNSLTLVGSLFHSVQLVQTDLSSSNTSELYLVCKRLKDYVDTPFVDWIELYDHWE
KQYAFKSFKDEFNRARSLTPETTLIGIPPQFIPDPGVNLETLFQIAGVPTGVAHGITHHI
LQSKDKLISNAIGSMCVISHFIINTIRTTDSMPGPPSDGDVNKMCSALIGTCFWLSWMES
DLNLYKTCLRSIMKSMPVRWFRVLKNEKWLQKWDCKGDAVPKDSRLGDSLANIGNWIRAW
ELIRDGNKSEPFDSMVAETLTKSVDKSLSWRKISKSTGIPRLLNSDVDLVDQSILNVQID
IVENQAWQN
NT seq
6330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattttgatctaatagaagattctgataactggggagatgatgagtcggactttttc
ctgcgagacattctatctcaagaagatcagatgtcttacttaaacaccgcagattataat
ttgaattccccgctcatttcagatgacatagtttatatagtgaaaagaatgaatcacgaa
gatgtcccccccatttggagatctaaagaatgggattctcctcttgatatgcttagaggt
tgtcaagctcaacccatgtctcatcaagagatgcacaattggtttgggacttggattcaa
aatatccagcatgattctgctcaagggtttacattcttaaaagaagtggacaaagagtca
gaaatgacctatgacttggtctcaacttttctgaaggggtgggttgggaaagattaccca
ttcaagccaaagaacaaagaaattgatagtatggcattagtcggtcctctttgtcaaaaa
ttccttgatttgcataaaatcactctgatattaaatgcagtttctttgggggaaactaag
gaactcctcaccactttcaagggtaagtaccgcatgagttgtgaaaacattcctattgct
cgcttaagacttccaagtctgggccctgtattcatgtgcaaaggttggacttatatccac
aaagaaagagtactaatggaccgaaattttcttctcatgtgtaaagatgtaataatagga
cgcatgcagacatttttgtctatgatcggtcgatcagataacaaattcagtcctgatcaa
atctacactctggcaaatgtataccggattggggataaaattctagaacaatgcggaaat
agagcttatgatttgattaaaatgattgaacccatctgcaatttgaaaatgatggaattg
gctagagcgcatcgtcccaagattccaaagttccctcattttgaagagcatgtcaaaggc
tcagtgcgagaattaacacaaaggtccaatagaatacaaacattgtatgatttgatcatg
tcgatgaaggatgttgacctcgtcttagtggtttacggatcattccgtcattggggtcat
ccattcattgattattttgaggggttggaaaaattgcacactcaggtgaatatggaaaag
catattgacaaggagtacccacagcaattagccagtgatttggccagacttgtgttaaat
aaacaatttagcgagtcaaaaaaatggttcgtggacccttcaaaaatgtctcccaaacac
cctttttatgaacatgtcattaataagacatggcccacagcagccaaaattcaagacttt
ggtgacaattggcacaagcttccattaattcaatgttttgaaatacctgatttaatagac
ccatcggtgatttattcagacaaaagtcattccatgaacaaaaaggaggtaatacagcat
gttcggtcaaagccgaatgttccaatcccaagcaggaaagttctgcaaacaatgcttacc
aatagggcaacaaactggaaagcctttctgaaagatatcgacgaaaatggaatggatgat
gacgatttgataattggattaaagggaaaagaaagagaattgaaaatagctgggagattc
ttctcattgatgtcatggagattaagggaatattttgtgatcacggagtacttaatcaaa
acatactacgttcccttgtttaaggggttaactatggcagatgacctcacatcggtgatt
aagaagatgatggacagttcatcaggtcaagggctcgatgattattcatcagtttgtttg
gctaaccatattgactacgagaagtggaataaccatcaaagaaaggaatctaatggtccc
atcttcagagtcatgggacagtttctgggttatccatcactcatagagagaactcatgaa
ttttttgagaaaagcttaatttattacaatgggcgtcctgatctaatgaccgttcgaaat
ggcacattgtgtaattccactaagcaccgggtttgttggaatgggcaaaaaggaggtttg
gaaggactaagacaaaagggatggagtattgtgaatctcttggttattcaaagggaagcc
aaaattcgaaacacagcagtgaaggtcttagcacagggagataatcaggttatatgcact
caatacaagacaaagaaaaccagatcagaattggaattaagagcagtcttacatcagatg
gcaggaaacaataataaaatcatggaagaaattaagagagggacagagaagttgggccta
atcataaatgatgatgagactatgcaatcagcagactatttaaattacgggaaaattcca
attttccggggagtcataagaggactagaaacaaagagatggtcacgggtaacatgtgtc
actaatgatcagatcccgacatgtgccaatttgatgtcctcagtctccaccaatgctttg
actgttgctcattttgctgaaaatcccataaatgcaatgattcaatacaattattttgga
acctttgcacgattactgctctttatgcatgatcctgcaatacggcaatccttgtacaat
gtccaagaaaaaatacctggtttgcacaccagaacattcaagtacgccatgttatatcta
gatccttcaatcggaggagtatgtggtatggcattatctcggtttttaatcagagcattt
cctgatccggtgacagagagtctctcattctggaagtttatctatgaacatgcgtctgag
cctcatcttaaaaagatggcagtgatgtttggagaccccccaattgccaaattcagaatt
gaacacatcaacaaattgttagaagaccctacctctctaaacatctcaatgggtatgagt
ccagcaaatttattgaagagtgaagtcaaaaaatgtttaatagaatcaagatcatctatc
aaaaatgaaatcataaaagatgctactatctatatgcatcaagaggaagagaagctgaga
ggatttttatggtctatcaaaccattattccctcgtttcctgagcgagttcaaagctgga
acttttttgggagtatctgagggcttgataaatttattccaaaattcacgcactataaga
aactcattcaaaaagagatatcacaaggatcttgatgaattaataatcaagagtgaaata
tcttcattaagtcatctcggatccatgcattatcgattaggggataatcagatatggtcc
tgttctgcatctagagcagatgtgttaagatacaaatcttggaccaggaaggttgtagga
actacagtgcctcatcctttggaaatgcatggaccaccttcaaagaaggaaaaaccctgc
catctgtgtaattcgtctggtcttacatatatttctgtgcattgtccaaaaggaattact
gatgtatttaatcgaagaggacctttgccggcttacttgggatccaacacatctgagtct
acctctattctacagccgtgggaaaaagagagtaaaataccaataatcaaaagagcaact
agattgagggacgccatctcttggtttatcccacccgagtctcctctgtctacatgcatc
ttgaataatattcgggctctaacgggagaagattggagctctaaacagcatggctttaaa
cgaacaggatcagcattacatagattttccacctcccgtatgagcaatggaggatttgcc
tcacagagtccggccactttaactcgcatgattgccactacagatacaatgagagacttt
ggtacgaagaattatgatttcatgttccaagcatctttgctatatgggcaaatgacaaca
agtatttcaagatacggaaatccagggtcttgcacagaccattaccatatcagatgtaag
gggtgcattagagagattgaagaagtagaattgaatactagtctagaatacaagacaccc
gatgtctatcacatactggaaaaatggaggaacaatactggatcgtggggtcatcaaatc
aaacaattgaagcccgctgagggcaactgggaatcattgtctcctgtagagcaatcatat
caagttgcaagatgtattggatttctttatggtgaactgacacacaagaaatcaagacag
gctgatgatagttctctatttcctttaagcattcaactaaaggtaagagggagaggtttc
ttgcgaggtctcctagacggtttaatgagatccagttgctgtcaggtaattcatagacga
agtgtttctaccttaaagagacctgcaaatgcagtctatggtggtctcatatacctcatc
gataaattgagtgcatcaagtcccttcttatcacttgtaagaaccggacccattcgacaa
gaattagaacaggtgccacacaagatgtctacatcttatcctacgaacattagagatttg
ggttccattgtgagaaattattttaaatatcagtgtcgacctgtggagagaggacactat
aagacttattataatcaaatatggttattttcagatgttttgtccactgaatttataggg
ccaatggctatatctagctctcttcttaaactcctttaccgaccttccctgacaaagaag
gatagagaggaattgagggagttagcagcactatcgtccaatttacgaagtggagaagat
tgggatgatttacatatcaaatttttctcaaatgatctcctcttttgttcacaggagata
aggcatgcttgcaaatttggaattaaaaaggacaatgaagatatcactttttacccaaat
tggggaacagagtatattgggaatgtcattgatattcctgtgttttaccgagctcaaaat
gtgcaaaaagatattaaagtacctcctcggatccagaatcctttgatgtcaggactcaga
cttggacaactgccaactggggctcattataagatgagaaccattgtatcccgtcttaaa
atttcatatcatgattttctggcttgtggagatgggtctggaggaatgactgcagcccta
ctccgacataatcggacatctagagggatatttaacagtttgttggatttgtcagacaca
atgctaagaggatcttccccagaacctcccagtgcacttgagaccttggggggagagaga
gtccgatgtgtgaatggagacagttgctgggaacatccttctgatctaagtgatgagaac
acatggaagtattttctccatttgaaaaagggatgtggaatgagtatcaatcttatcact
atggacatggaagtccaagatcctgctatatcttatagaatcgaatcattggtcagacag
tatgttccggttctattggaatctgatggttgccttatttataaaacatatggaacatat
attgccacacaaaaagataattccctgactcttgtgggatcacttttccactctgttcaa
cttgtccaaacggatttaagctctagtaatacatctgaattgtatttagtgtgcaagaga
ttgaaagattatgttgacacgccttttgttgattggatagaattatatgatcattgggaa
aaacagtatgctttcaaaagcttcaaagatgaatttaacagagcccgttcacttacacca
gagacaactctgataggaataccgcctcaatttataccagatcctggagtcaatctggaa
accctgtttcaaatagcaggagttccaaccggagttgcgcatggaatcacacatcacata
ttgcagtctaaggataaattgatatcaaatgccattggaagcatgtgtgttatttctcat
tttatcattaacacaatacggactacagatagcatgcctggacccccatcagatggggat
gtcaacaaaatgtgttcagcattgattgggacatgtttctggttgagctggatggaatca
gatcttaatttatataaaacttgtctaagatcaataatgaagtcgatgcctgtgagatgg
ttcagagtattgaaaaatgagaaatggttgcaaaaatgggattgcaaaggagatgcagtc
ccgaaagattccagactcggagacagccttgctaatatcggcaattggataagagcttgg
gaattaattagggatgggaataagtctgagccttttgattcaatggtagcagaaacgttg
acaaaatctgtggataaatcacttagctggaggaaaatctcaaagtcaaccggaattcca
agacttttaaacagtgatgtcgatttagtggatcaatctatattgaacgttcagatcgac
attgtagaaaatcaagcctggcaaaattga
DBGET
integrated database retrieval system