Viruses: 20041424
Help
Entry
20041424 CDS
T40000
Symbol
JO84_gp030
Name
(RefSeq) Aureococcus anophagefferens virus; Holliday junction branch migration helicase
Virus
1474867
Aureococcus anophagefferens virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
DSHCT
DEXQc_Suv3
Helicase_C
IstB_IS21
Tiam_CC_Ex
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20041424
NCBI-ProteinID:
YP_009052108
UniProt:
A0A076FHE1
LinkDB
All DBs
Position
NC_024697:35117..37414
Genome browser
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MNPNFIEELFSFPYKLDDFQIESAHAIVKGKNTLSLGHTGSGKTSIGIIGVANALKQGKK
AIFTTPIKCLSNQKYGDFQKDFPNNSIGILTGDIKINPDADVIVATQEIIANMLFQNKEF
FDDVGVIVIDETHYINSDRGAVYEQTISMMLSHVKFVLLSATISKPEILKNWMEKTRGIE
CVMTKTDFRPVPLQQNVYVDGSLKNIMTNGEFNDSLYKTLFNNWKNQDKKISQATRLKNF
VEMMEEKDLFPALFFVFSRKNCEKFADMFERSLITGKEQTECLKLYDYYVKKMLGEDGMQ
ILQYWRIRKFLSKGVCIHHSGLVPVIKEIIEILFEKKYIKLMMVTETFAVGINMPTRTVV
FTELEKFDGKEKRVLLPSEYTQIAGRAGRRGKDTVGHVIYFQITHKPMILLSEFAEMVSG
KHASIKSKFEIDHNFILKCIDNDINIKEELGKTMLYNEISSQKKGITYEIEELNKKIESI
SINNEDKIHELKKLENKKLICKPKQKQQINVQINQIKNAIDEKDIEQFENRSKLIQDLKK
LNCDLIDNEEYIDNTINNIKDVLINTGYLKDGNTITIQGRSASGFQEVESFLAVEYLHSL
LQSVDYYSIQDYKYIIPFIIGTLVDDRDLNREDLIEHTFEMLNDVFNEKNQIENVKYELS
TLKKFHEQILSEGRLKEPENKLTPMFGLTLYLWVNGRSFNEIKEFIPDIYEGNFCKNILK
CHNICEEIINMFDIYSVKSELKKILTEIQSKLIKDIVIIDSLYIK
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcctaactttattgaagagttgttcagttttccttacaaactcgatgattttcaa
atcgagtcagctcatgctattgtcaaaggcaagaatacacttagtctaggtcatacgggc
agtggtaaaacttccattggaattattggtgtagctaatgctttgaaacaaggcaaaaaa
gctattttcaccactccgataaaatgcctttctaatcaaaaatatggggacttccaaaaa
gattttcccaataattcgattggaattttgacaggagatataaaaatcaaccctgatgca
gatgtaattgtagctacgcaagaaattattgcgaatatgctatttcaaaacaaggaattt
ttcgatgatgttggtgtcattgttatagatgagacccattacattaatagtgatagaggt
gctgtttatgaacaaactatttcaatgatgcttagtcacgttaaattcgttttattgtca
gcgacaatttccaaaccagaaatcttaaaaaattggatggaaaaaactcgaggaattgaa
tgtgttatgacaaagactgattttagacctgttcctttacaacaaaatgtttatgtcgat
ggatcattgaaaaacattatgacaaatggtgaatttaacgattctttgtataaaacacta
tttaacaattggaaaaatcaagacaagaaaatttcacaggctactcgcctgaaaaatttc
gtagagatgatggaagagaaagatctgttcccagctcttttcttcgtattttcccgaaag
aattgtgaaaaatttgcagatatgtttgaaagatcgctaattacgggtaaagagcaaaca
gagtgtttaaaactgtacgattactatgtaaaaaaaatgcttggagaggatgggatgcag
attttgcaatactggcgaattcgaaagttcttgtcaaaaggagtttgtattcaccattcc
ggtcttgtaccggtaatcaaagagatcattgagattctttttgagaaaaagtatatcaaa
ctgatgatggttacagagacattcgctgtcggaatcaacatgcctacaagaacagtagtg
tttactgaacttgagaagtttgatggaaaggaaaaaagagtacttttaccatctgagtat
actcagatcgctggtcgtgctggaagacgaggaaaagataccgtaggccacgtaatttac
tttcaaatcactcataaacctatgattctcttgtctgaatttgctgagatggtctcagga
aagcatgcgagtattaaatcaaaatttgagattgaccataactttattcttaaatgtatt
gacaatgatatcaatattaaggaagagttgggaaaaactatgctttacaatgaaatttca
agtcaaaagaaaggaattacatatgaaattgaagaactcaacaagaaaattgaaagtatt
tcaattaataatgaagataagattcacgaattgaagaaactcgaaaacaaaaaattgata
tgcaaacctaagcaaaaacagcaaattaatgttcagataaatcaaataaagaatgcaatt
gacgagaaagatattgaacaatttgaaaatcgtagtaaactgattcaagatttgaagaaa
ttaaattgcgatttgattgataatgaagaatatatcgataatactattaataacattaaa
gatgtactaattaatacaggatacttgaaagacggtaatactattactattcaaggccgt
tctgcttctgggtttcaagaagttgagtcgtttctagctgttgaatatttgcattctttg
cttcaaagtgtcgattattattcaattcaagattataagtacataataccatttattatc
ggtacattagttgatgatagagatttaaatagggaagaccttatagaacatacatttgaa
atgttgaatgatgtattcaatgaaaaaaatcagattgaaaatgtaaaatatgaattatcc
acattaaaaaaatttcacgaacagatattgagtgaaggaagattgaaagaacctgaaaat
aaattaacgccaatgtttggtcttactttgtatttgtgggtcaacggaagatcgttcaac
gaaattaaggaatttatacctgatatatatgaaggaaatttctgcaagaatattttgaag
tgccataatatttgtgaggaaataatcaatatgtttgacatatattcagtaaaaagtgaa
cttaaaaaaatcttgactgaaattcaatcaaaattgattaaagatattgtaatcattgat
tcactgtatatcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system