Viruses: 20041741
Help
Entry
20041741 CDS
T40000
Symbol
JO84_gp189
Name
(RefSeq) Aureococcus anophagefferens virus; hypothetical protein
KO
K18964
Herpesviridae DNA polymerase catalytic subunit [EC:
2.7.7.7
]
Virus
1474867
Aureococcus anophagefferens virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DZR
Zn_ribbon_TFIIB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20041741
NCBI-ProteinID:
YP_009052360
UniProt:
A0A076FFJ4
LinkDB
All DBs
Position
NC_024697:complement(269194..273804)
Genome browser
AA seq
1536 aa
AA seq
DB search
MDQIILKIHTNNTTQSYKFSVNEDTNKSYIVIPQILNYFETIRDFKRKIAVLIDNTLLNS
YIWFDDKNNPFNTDFEILNQEDIAHMTIFKFKSNIINLTTDEISNYENIDETLTKKDKDI
IKKNIEKVTEIENNFDSYTEEDKKKVTIMISNSKYIITNEFQITENEIRYLFDSISTSTK
IPIIAYKNKSKIFKTDEMNTKNYEDWIKEGIDKNTLNDYINNNLLSKDFDIQQSKKKDKK
DKKDKEDDVEDDNDDDDEIEKKSSKNMNLLIFLNFDLEKYKRLRCSLEISTNQIKVELAF
KKNISDPIDLVFNEYDFKKVYDYIKKFLKNDFSKYLINKQFKIEEYEYLKFDTFQSCYQI
NDNSIINQNKEKFNSIIYSLDPYILKYIKINEVVKKNENDVKRKIHVDRLTLIRKINHSC
LSDYFSKISKMISTFAVNSKTYKEKYTNFLLSDNINFEYDQNLYKTKIKKSSTNIYGSKS
NLCSTNRNSNLHTIQFWADTPQEIDLYKNIMIYSLYKTKQKTVSNIEKSSKKPQKTREEL
KKKQKAKLEKQKAKKKRKKQKESQGISDSESESESESESESESDEDKDKEIGQEEEKVEE
EIDNSKDNSKFQVEFSKSIRIKRFHLFFPSSASYCDENNLPEMCEYTKITNGSVKQPLVF
NKLEYDDILKNNEKLQKEYYYPLKNKEDEICPSRIQQFSEYKGYYLLSCDAFCFECNIAL
SIYDFNSKIELKKCPNCKTNDNLLINIETDGTRYFSIDLYKKMFNYPIRSKDKKLCKNDN
NRFEKIINKNTNKNDKDNSDKISYILNADTNIEKGRFGNISENKNSILFKYLNIIKHEQN
QTFLRYSSSNNGCYIHFIKKIYDMETDSNQSMSVFKSNLIKNIKNNMDKLIIINNKYNQQ
FFYDLCNLIHNNENRSLIHDLIHDIACFPGILFKNGLNIFIFKVHNKSVQYFCNKNIYRN
NNLTKYPSYFGIYNETLNRYDHISLVTDKRIKKNNICQYLTKNYKSNLLFNLNNNSMYIL
RQNCNIVFNTDFFNYFKHNKLNIKRRYFKNEINNLDISIMEWANMNNYKIESQLMLNKVI
MSIYVEKDKKIFLVPIKQSFFPFCEIKKTRTKIIEDTTILPSFNDCLTFYSDNIIPNIKK
YIVNDGLIKGILLDTNDKFIIKPTKINERIIPKNLIRSEEPLPTAEKKEKYDITETFKND
YENFWILYEKFLLKVSNEFNIKKSNTDLFDFIETFKANDDELKMLDLLKNEIKYNKSIKR
IIMKEEQPSFLKNNLIKETLYDENNIIIDHKQKIRLIKNKFFTGNLLDKISNIKQRNVYI
NKNEGLKLPTSINDYLHLDFRYFKQNYIENFELEKKDETKLLEILNKEYKEYDTIKSIYK
IFDKKYNIILFNVFGRFDSFNFKENRKNILFYIHSKEKIYPIIYNDDVFIDNSYLSNELL
DILLDEEDTSDLYFLEDINNYSFVEENKQPEPESESESESESGSESESDNSVYCKFIPKS
DYRQRDSCQKTDISSENNREKCKFNRITNRCNLRKF
NT seq
4611 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcaaattatattgaaaattcatacaaataacactactcaatcgtataaattttct
gttaatgaagatacgaataaaagttacattgttattcctcaaattcttaattattttgaa
acgatacgtgattttaaaagaaaaattgctgttttaatagataatacattattaaattcg
tatatatggtttgatgataaaaataatccatttaatacagattttgagattttgaatcaa
gaagatattgctcatatgactatattcaaatttaaaagtaatattatcaatttaacaaca
gatgaaatctcaaactatgaaaatatagacgaaacacttacaaaaaaagataaagatata
ataaagaaaaatattgaaaaggttacagagattgaaaacaattttgattcatatacagag
gaagataaaaaaaaagttactattatgatttctaatagcaaatatataataacaaatgaa
tttcaaattacagaaaatgaaattcgttatttatttgatagtatttcaacaagcacaaaa
ataccaataatagcttataagaacaaatcaaagatttttaaaacagatgaaatgaatact
aaaaattatgaagattggataaaagaaggtattgacaaaaataccttaaatgattatatt
aataataatttattatcaaaagattttgatattcagcaatcgaaaaaaaaagataaaaaa
gataaaaaagataaggaagatgatgttgaggatgataatgatgatgatgatgaaattgaa
aaaaaaagtagtaaaaacatgaatttattaatttttttgaatttcgatttagaaaaatat
aaaagattaagatgctcacttgaaatttcaacaaatcaaataaaggttgaattagctttc
aaaaaaaatataagtgatccaatagatttagtctttaatgaatatgatttcaaaaaagtg
tatgattatattaagaaatttttgaaaaacgattttagtaaatatttaataaataagcaa
ttcaaaattgaagaatacgaatatctaaaatttgatacttttcaatcttgttatcaaatt
aatgataatagtattattaatcaaaataaggagaaatttaatagtattatttatagtctt
gatccatatatattaaaatatataaaaattaatgaagtagtcaagaaaaatgaaaatgat
gttaaaaggaaaatacacgttgatagattaacattaattagaaaaattaatcatagttgt
ttatcagactattttagtaagatatcgaaaatgatatctacgtttgctgtaaattctaaa
acatataaagaaaaatatactaattttttactttctgataatattaattttgaatatgat
caaaatttatataaaacaaaaattaaaaagagctccacaaatatctatggaagcaaatca
aatttatgttcaacaaatcgtaatagcaatttacatacaattcaattttgggctgataca
cctcaagagatagatttatataaaaatataatgatttatagtctttataagacaaagcag
aaaacagtaagtaatatagaaaaatcatcaaaaaaaccacaaaaaacaagagaagaatta
aaaaagaaacaaaaagcaaaactagagaaacaaaaagcaaagaaaaaacgtaaaaagcaa
aaagaatcacaaggaatttcagattctgaatcggaatcagaatctgaatctgaatctgaa
tctgaatctgatgaagataaagataaagaaataggtcaagaagaagaaaaagtagaagaa
gaaatagacaatagtaaagataatagtaaatttcaagttgaattttctaaatcgattaga
attaaacgatttcatttattttttccatcttctgcaagttattgtgacgaaaacaattta
cctgaaatgtgtgaatacactaaaataacaaatggaagtgttaaacagcctttagtattt
aataaacttgaatatgatgatattcttaaaaataatgaaaaattacagaaagaatattat
tatcctttaaaaaataaagaagatgaaatatgtccgagtcgaattcaacaattctcggaa
tataaaggatattatctattatcttgtgatgctttttgttttgaatgtaatattgctttg
tcaatttacgattttaattctaaaatagaattaaaaaaatgtccaaattgtaaaactaat
gataacctattaattaatattgaaacagatggaacgagatatttctcaattgatctatat
aagaaaatgttcaactatccaatcagaagtaaagacaaaaagctatgtaagaatgataat
aacagatttgaaaaaattataaataaaaatactaataaaaatgataaagataatagtgat
aagatatcatatatattaaatgctgatacaaatattgaaaaaggacgttttggtaatata
tctgaaaataaaaatagcatcctttttaaatatttaaacattataaaacatgaacagaat
caaacttttctaagatattcgtcgtctaataatggatgttatatacattttattaaaaaa
atatatgatatggaaacagatagtaatcaaagtatgtctgtttttaaatcaaatttgatt
aaaaacataaaaaataatatggataaattgataataataaataataaatataatcagcaa
tttttttatgatttatgtaatcttattcacaataatgagaatagatctcttatacacgat
ttaatacacgatattgcatgctttcctggaatactattcaaaaatggtttaaatattttt
atttttaaagttcataacaaaagtgttcaatatttttgtaacaaaaatatttacagaaat
aataatcttacaaaatatccttcttactttggaatttataatgaaacattaaatcgatat
gatcatatttcattagtaacagataaaagaattaaaaaaaacaatatatgtcaatatctt
actaaaaattataaatctaatttactatttaatttgaataacaatagtatgtatatatta
cgacaaaattgcaatatagtttttaatacagatttttttaattattttaaacataataaa
ttgaatataaaaagacgctatttcaaaaatgagattaataatttggatatatctattatg
gaatgggcaaatatgaacaattataaaatagaatcacaattgatgctaaataaagttata
atgtcaatttatgttgagaaagataaaaaaatcttcttagtaccgataaagcagtcgttt
tttcccttttgcgagattaaaaaaacacgaactaaaattatagaggatacaacaatatta
ccaagttttaatgattgtttaacattttatagtgataatatcattccaaatattaaaaaa
tatattgttaatgatggtctaataaaaggaatattgttagacaccaatgataaatttata
attaaaccgactaaaattaatgaaaggataattccaaaaaatttaataagatcagaagaa
cctttaccaacagcagaaaagaaagagaaatatgatataacagaaacatttaaaaatgat
tatgaaaatttttggattttatatgagaaatttttattgaaagtatcaaatgaattcaat
atcaaaaaatccaacacagatttatttgattttattgaaacatttaaagcaaatgatgat
gagctaaaaatgcttgatttacttaagaatgaaatcaaatataataaaagtattaaaaga
attattatgaaggaggagcagccatcatttctaaaaaataatcttataaaagaaacatta
tatgatgaaaataatataattatagatcataagcaaaaaattagattaattaaaaataaa
ttctttactggaaatctattagacaaaattagcaatataaaacaacgaaatgtatatata
aataaaaatgaaggtttaaagttacctactagtataaatgattatttgcatcttgatttc
agatattttaaacaaaattatattgaaaattttgaattagaaaaaaaagatgaaacaaaa
ctactcgaaattttaaacaaagaatataaagaatatgatacaataaaaagtatatataag
atttttgataaaaaatataatataatacttttcaacgtgtttggaagatttgactccttt
aattttaaagagaatagaaaaaacattctattttacattcattcgaaagagaagatttac
cctataatatataatgatgatgtgtttattgataattcttatctatcaaatgaactttta
gatatcttattagatgaggaagatacatctgatttatattttttagaagatataaataat
tatagtttcgtagaggaaaataagcagcctgaacctgaatctgaatctgaatctgaatct
gaatctggatctgaatctgaatctgataattcggtttattgtaaatttattccaaaatcg
gattatagacagagagattcttgtcaaaagacagatatttcttcagaaaataatagagaa
aaatgtaaattcaatcgtataacaaatagatgtaatcttagaaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system