Viruses: 20041750
Help
Entry
20041750 CDS
T40000
Symbol
JO84_gp155
Name
(RefSeq) Aureococcus anophagefferens virus; putative DNA directed RNA polymerase largest subunit
Virus
1474867
Aureococcus anophagefferens virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
DUF2507
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20041750
NCBI-ProteinID:
YP_009052394
UniProt:
A0A076FGB9
LinkDB
All DBs
Position
NC_024697:304100..307966
Genome browser
AA seq
1288 aa
AA seq
DB search
MTNFNDENDNEFIESIEFSILSTQDMRNIASCTINSHETFQNSVPVANGLFDLRMGTLDS
KNVCESDMLDSRSSAGYFGLIELEVPVFNNLYFTYVQKILKCVCFKCGSLLIENSNNISK
KNKLAYCVEASKKVKYCPNCNVKCFDKIVKTDLCKIHGTFKNEEITIDLNANYVLNLFKQ
LSDNTIESLGFNDKSHPINMILEVLLVIPPCARPSVTSVESGTRMEDDLTLKYSDIIKYN
NLIKKKLTSDSNSHLVIDYSNNLQYHIATLMDNEIAGIMQASQRSGRPLKGIRQRIKGKE
GRIRGNLMGKRVDFSARSVITPDSQISLHELGVPIEIALKLTFPEKVNEKNIKHLRRCVL
NGNSKYPGARAVIKHKQKKTISLNHIDLKQFSKMLEINDIVIRHLNDNDWVLFNRQPSLH
KMSMMAHKVKVLSGLTFRLNVSACTPYNADFDGDEMNMHVPQSKVTMTELSEICSVSKLI
ISPAINAPIIEFVQDICIGYYLMTLKESKKFDLQSTMNIISRLSNKEIVLTKEMYDGFDL
LSFCIPNTLSCILKNKKGHLIEILNGKIEKTHNLDKKFFNNLIHIIFKEFGSKQCSDFFD
SIQIIVNAYLIASPFSVGCSDIINTKSINKKIDKILTDSYENAKDVSHNQLSNYAMKIRS
DCENLLNSYYSNDEENRLMSMIKSGSKGKLINIAQITALLGQQVIDGDRIECLIDTNRTL
PLFSKFDNGLDARGFISSSFKQGLSPSEYFFHAISGRDGVIDTACKTASIGYLQRKLMKT
LEDIHINSSNIVIDSNSNVIQYIYGNDNFDPIFVESMNIPQKKRYHKEIKNISNEYDNSV
KFPINIERILFKFSNECKDNKNIEQIDEDYVISEYNKLFDRLKFKSYNNNTNTLKFLLYV
FAEPKILKQNKFTKENLSNFIEIIETNFKNYIISNYENVGAVAAQSIGEPATQLTLNSFH
TSGAGGKGTVTTGVPRLNELLSNTKNPKATLIKTEYSKELEENIKKVTLNDVLNNRDIKY
NHNVTNNSLDDKNESKYTLILYINQKNIYKNALTLLDVMLKLLQRYKNITINSDYDDYLL
MIKMKKMKSVKSKQKSELLELQEIITNFDKIILKGFADYCFKDTSSGQLLIESSIDDIIF
NDAININDIISSDINEMLYYFGLEIARSALINEIYSLLHEACDIDIRHIELLVDYMINSG
NIVSIDRNGARKNEIMSMIQRITFEESVQNIQKCSVINHIEDIKSTSASILTGTPIKTGT
GSVHVSIDEEAILRSCKLTDDDFDCNFD
NT seq
3867 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgacaaatttcaatgatgaaaatgataatgaattcattgaatcaattgaattttctatc
ttatctacgcaagacatgcgtaacatagcttcttgtactataaattcacacgaaacgttt
caaaattcggttcctgtcgctaatgggttgttcgatctaagaatgggaactcttgattcc
aaaaacgtttgtgaatctgatatgttagattcaagaagctcagcaggttattttgggtta
attgaattagaagttcccgtgtttaataatttatattttacttatgtgcaaaaaatatta
aaatgtgtttgttttaaatgtgggagtcttttaattgaaaatagtaataatatttcaaaa
aagaacaaattagcttactgtgtcgaggcttctaaaaaagttaaatattgtccaaattgt
aatgttaaatgctttgataaaattgtaaaaacagatttatgcaaaattcacggaactttc
aaaaatgaggagataacaattgatttaaatgcgaattatgttttaaatttattcaaacag
ctttcagataatacaattgaaagtttaggattcaatgataaaagtcatccaattaacatg
attttagaagtacttcttgtaattcctccttgtgcaagaccatcagttacatctgtagag
tctggcactagaatggaagatgatttgacattaaaatactctgatatcattaaatataac
aatttaattaagaaaaagttaacgagcgattctaattcacatttggttattgattattca
aacaatttacaatatcatattgcaacattaatggataatgaaattgctggaattatgcag
gcatctcaaagatctggcagacctttaaagggtattaggcaacgcattaaaggtaaagag
ggtcgtattcgaggtaatctaatgggaaaacgtgttgattttagtgcaagaagtgtaatc
acacctgattctcaaattagtcttcatgaattaggagttccaattgaaattgctttaaaa
ctaacatttccagagaaagttaacgagaaaaatattaaacatttgagacgttgtgttctt
aatggaaatagcaagtatccaggtgctcgtgctgttataaaacacaagcaaaagaagaca
atatctttgaaccatatcgatttaaaacaattcagtaaaatgcttgaaattaatgatatt
gttatcagacatttgaatgacaatgattgggttctgttcaataggcaaccatcactgcat
aaaatgtctatgatggctcataaagtcaaagtattatctggattgacatttcgattaaat
gtaagtgcttgtacgccttataatgcggattttgatggagatgaaatgaatatgcatgta
cctcaatcaaaggttacaatgactgaattatcagaaatatgttctgtatcaaaacttatc
atttctcctgctataaatgctccaataatcgaatttgtacaagatatttgtattggttat
tatctaatgacattaaaagaatctaagaaatttgatttacaaagtacaatgaatatcatc
tcaagattatcaaacaaagaaattgtattaacaaaagagatgtatgatggtttcgattta
ctatctttttgcattccaaatacactaagttgtattttgaaaaataagaaaggacacttg
atcgaaattttaaatggaaaaatagaaaaaacacacaacttggataagaaattcttcaat
aatttgattcatattatatttaaggagtttggatctaaacagtgttctgatttctttgat
tcaattcaaataattgtaaatgcttatttaattgcgtctccatttagtgtaggatgctct
gatattattaatactaaatctattaataagaaaatagataagatcttgacagattcttat
gagaatgctaaagatgtttcacataatcaattatctaattatgcaatgaagataagaagt
gattgcgaaaatttattgaactcttattattcaaatgatgaggaaaatcgtttaatgtct
atgattaagtcaggttcaaaaggcaaattaattaatattgctcagatcacagccctatta
ggacagcaagttatcgatggagatcgaattgaatgtctaattgatacgaatagaacatta
ccattatttagtaaatttgataatggtttagatgctcgtggattcatatcaagttcattt
aaacaaggactatctccttctgaatacttctttcatgcaattagcggacgtgacggtgtt
attgatactgcttgtaagacagcaagtattggttatctccaaagaaaattaatgaaaacg
cttgaagatattcatattaattcatcaaatattgtaatcgactctaattctaacgtgatt
caatacatatatggaaatgataattttgatccaatatttgtggaatcaatgaatattcca
cagaaaaaacgttatcataaagaaataaaaaatatttcaaatgaatatgataattctgta
aaatttccaataaatattgaaagaattttattcaaattctcaaatgaatgtaaagataat
aagaatatagaacaaattgatgaagattatgtaatttcagaatacaataaattatttgat
agattgaaattcaaatcatataataataatacaaatacgctcaaattcctattatatgta
tttgcagaaccaaagattttgaaacagaataaatttacaaaagagaatctatcaaatttt
attgaaattattgaaacaaatttcaaaaattatattatctcaaattatgaaaatgtagga
gctgttgcagctcaatcgattggagaaccagcgacacaattaacattgaattcttttcat
acatctggagcaggtggtaaaggtactgtcacaactggtgttccacgtttaaatgagttg
ctttctaatactaagaatccaaaagcgactttaattaaaaccgaatattcaaaagaatta
gaagagaatattaagaaagttacattgaatgatgtattgaataatcgtgatataaaatat
aatcacaatgttactaataattctcttgatgataaaaatgaatcaaaatatacattaatt
ttgtatataaatcaaaaaaatatttataaaaatgcgttaacacttttagatgtaatgtta
aaactattacaaagatataagaatattacgattaatagtgattatgatgactatttatta
atgattaagatgaagaaaatgaaatcagtaaaatcgaaacaaaaatcagaactcttagaa
ttacaagaaattataacaaattttgataagattatattaaagggttttgcagactattgt
tttaaagatacatcatcaggacaattactaatagaatcaagtatcgatgacatcattttt
aacgacgctattaatattaatgatataatttcgagcgatataaatgagatgctttactac
tttggtctcgaaattgcacgtagtgcactaataaatgagatatatagcttattacatgaa
gcttgtgatattgacatcaggcacatcgaattgttggtagattatatgataaattctggt
aatattgtctcaattgatagaaacggtgctcgaaaaaatgaaattatgtcgatgattcag
agaattacatttgaggaatctgttcagaatattcagaaatgttctgttataaatcatatt
gaagatataaaaagtacaagtgcttctattttgacaggaacaccaattaaaactggaact
ggttctgttcatgtatcaatcgatgaagaagctatattgagatcgtgtaaattgactgat
gatgattttgattgtaattttgactaa
DBGET
integrated database retrieval system
