Viruses: 20284328
Help
Entry
20284328 CDS
T40000
Symbol
LD34_gp218
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2; RNA ligase
KO
K18962
Straboviridae RNA ligase 2 [EC:
6.5.1.3
]
Virus
1391224
Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_ligase
T4_Rnl2_C
YqeY
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20284328
NCBI-ProteinID:
YP_009056764
RS:
NC_024794
UniProt:
A0A067ZK08
LinkDB
All DBs
Position
NC_024794:complement(109914..110912)
Genome browser
AA seq
332 aa
AA seq
DB search
MFKKYSSLENHYNSKFIEKLYTNGLTTGVWVAREKIHGTNFSLIIERDNVTCAKRTGPIL
PAEDFYGYEIVLKKYDKAIKAVQEFMYTARAVSYQVFGEFAGGGIQKGVDYGEKDFYVFD
ILINTESGDNTYLTDYEMQDFCNEFGFKMAPMLGRGTFDSLIMIPNDLDSVLAAYNATAS
EDLVEANNCVFDANVIGDNTAEGYVLKPCFPKWLPNGTRVAIKCKNSKFSEKKKSDKPIK
TQVPLTEIDKNLLDVLACYVTLNRVNNVISKIGAVTPKDFGKVMGLTVQDILEETSREGI
VLTSSDNPNLVKKELVRMVQDVLRPAWIELVS
NT seq
999 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaagaaatacagcagtcttgaaaaccactacaactctaagtttattgaaaaactc
tacactaatggtttgactactggtgtttgggtagcacgtgagaaaatccatgggactaac
ttctcgttaataattgaacgtgacaacgtcacatgcgccaagcgcacaggccctattctt
ccagcagaagatttttatggttatgaaatcgtactcaagaagtatgataaagctattaaa
gccgttcaggaattcatgtacacagctcgagccgtatcatatcaagtattcggtgaattc
gctggtggtggaatccagaaaggtgttgactacggtgaaaaagatttttatgtgttcgat
atccttatcaatacagaaagtggtgataatacgtatttgaccgattacgaaatgcaagat
ttctgtaatgaattcggttttaaaatggcaccaatgcttggacgtggaacatttgattct
cttatcatgattccaaacgaccttgattctgtcttagccgcttataatgctactgcgtca
gaagaccttgtagaagcaaataattgtgtatttgatgctaatgttattggcgataatacg
gcagaaggttatgttctgaagccctgtttccctaaatggctgccaaacggtactcgtgta
gctattaagtgcaagaactctaaattcagtgaaaagaaaaagtctgataagcctattaaa
actcaggttccattaacagaaattgacaaaaacctgcttgatgttctagcttgttatgtt
acattaaatcgtgttaataatgtgatttctaagattggggctgtaacgccaaaagatttt
ggcaaagtgatgggattaactgttcaagatattctggaagaaacttctcgtgaaggtatt
gtattaacatcatctgataatccgaatcttgttaagaaagaattagtccgaatggtgcaa
gatgttctgcgtcctgcatggattgaattagtatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
