Viruses: 22113045
Help
Entry
22113045 CDS
T40000
Symbol
RB27_056
Name
(RefSeq) Enterobacteria phage RB27; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
69609
Enterobacteria phage RB27
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
SbcC_Walker_B
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
22113045
NCBI-ProteinID:
YP_009102261
RS:
NC_025448
UniProt:
A0A097J5H9
LinkDB
All DBs
Position
NC_025448:complement(31627..33267)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLITTVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDIALLFTWRDIAEKVS
GVKINTLILDEVFDSATDVEGVKAISTILDSLKNTNVFVISHRDHDPQAYGQHLQMKKVG
RFTVMV
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttatt
actggccgaaatggcggtggtaagtctactatgttagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaaaccatttcgtgacgtaaagaaaggccaattaataaacagcacaaataagaaagaa
cttttagttgaactgtggatggaatatgatgagaaaaagtactatatcaaaagaggacaa
aaaccgaacgttttcgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcag
attgttgtccttggtacagcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcgcga
agaaagcttgtggaagacctgctcgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaattcacaaaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggt
gacaaccttacacgtcttcaaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaatgaaagattagttaatattgttttggatgaagacccg
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcg
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgcccaacctgtttgtcacaa
ttaagttccggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgcacacat
tcatttgaacagctttcaacgcatcgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccaacagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctcta
atcacgacggtagataaagctaaaaaagttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgag
tttattgaccacgctgatgaaatagcattgcttcaagaagaacttgataaaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgtgaagattttagttatgcttcattcagtcaaggtgaa
aaagcacgaattgatattgctcttttatttacttggcgtgatattgctgaaaaagtttca
ggtgttaaaataaacacactaattcttgatgaagtttttgattcagcgaccgacgttgaa
ggtgtaaaagctatttcaactattttagatagtttaaaaaatactaatgtttttgttatt
tcacatagagaccatgacccgcaagcatatggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggt
cgatttactgtaatggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system