Viruses: 22220440
Help
Entry
22220440 CDS
T40000
Symbol
EP402R, ASFVgp054
Name
(RefSeq) African swine fever virus; CD2 homolog
Virus
10497
African swine fever virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
LapA_dom
TMEM154
Glycophorin_A
Cytokin-bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
22220440
NCBI-ProteinID:
NP_042752
RS:
NC_001659
UniProt:
Q89501
Q76VU8
LinkDB
All DBs
Position
NC_001659:56243..57451
Genome browser
AA seq
402 aa
AA seq
DB search
MIIIVIFLMCLKIVLNNIIIWSTLNQTVFLNNIFTINDTYGGLFWNTYYDNNRSNFTYCG
IAGNYCSCCGHNISLYNTTNNCSLIIFPNNTEIFNRTYELVYLDKKINYTVKLLKSVDSP
TITYNCTNSLITCKNNNGTNVNIYLIINNTIVNDTNGDILNYYWNGNNNFTATCMINNTI
SSLNETENINCTNPILKYQNYLSTLFYIIIFIVSGLIIGIFISIISVLSIRRKRKKHVEE
IESPPPSESNEEDISHDDTTSIHEPSPREPLLPKPYSRYQYNTPIYYMRPSTQPLNPFPL
PKPCPPPKPCPPPKPCPPPKPCPPPKPCSPPKPCRPPKPCPPPKPCPPPKPCPPPKPCPP
SKPCPSPESYSPPKPLPSIPLLPNIPPLSTQNISLIHVDRII
NT seq
1209 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataataatagttatttttttaatgtgtttaaaaatagttttaaacaatattataata
tggagtactttaaatcaaactgtatttttaaataatatttttacaattaatgatacatat
ggtggtctattttggaatacatattatgataataatcgtagtaattttacttattgtgga
atagcaggaaattattgttcatgttgtggtcataacatatcattgtataatacaacaaat
aattgtagtttaattatttttcctaacaatacagaaatatttaatagaacatatgaatta
gtatatttggacaaaaaaattaattatacagtaaaactattaaaatctgttgattcccca
actattacatataattgtactaattctttaataacatgtaaaaataataatgggacaaat
gttaatatatatttaattattaacaatacaattgttaatgatactaatggagatatcctt
aattattattggaatggtaataataattttacagctacatgtatgattaataatacaatt
agttcattgaatgaaacagaaaatataaattgtactaatccaatattaaaatatcaaaat
tatttatccacattattttatatcataatttttattgtgagtggattaataataggtatt
tttatttcaatcatatctgtattatctatacgaagaaaaagaaaaaaacatgttgaagaa
atagaaagtccaccaccctctgaatctaatgaagaagatatttctcacgatgacaccact
tccatacatgaaccatctcccagagaaccattacttcctaagccttacagtcgttatcag
tataatacacctatttactacatgcgtccctcaacacaaccactcaacccatttccccta
cctaaaccatgcccgccacctaaaccatgtcctccacccaagccatgcccgccacccaaa
ccatgtcctccacctaaaccgtgttctccacccaaaccgtgtcgtccacctaaaccatgt
cctccacctaaaccatgtcctccacctaaaccatgtcctccacctaaaccatgtcctcca
tccaaaccatgtccttcacctgaatcctattctccacccaaaccactacctagtatcccg
ttactacccaatatcccgccattatctacacaaaatatttcgcttattcatgtagataga
attatttaa
DBGET
integrated database retrieval system