Viruses: 22807881
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Entry
22807881 CDS
T40000
Symbol
S, SF15_gp04
Name
(RefSeq) Betacoronavirus HKU24; spike glycoprotein
KO
K24325
Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
1590370
Betacoronavirus HKU24
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
HSBP1
Baculo_PEP_C
ATG17_like
Tmemb_cc2
DUF2959
JetA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
22807881
NCBI-ProteinID:
YP_009113025
RS:
NC_026011
UniProt:
A0A0A7UZR7
LinkDB
All DBs
Position
NC_026011:23777..27853
Genome browser
AA seq
1358 aa
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DB search
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nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system