Viruses: 26049232
Help
Entry
26049232 CDS
T40000
Symbol
ceV_365
Name
(RefSeq) Chrysochromulina ericina virus; DNA polymerase B
Virus
455364
Chrysochromulina ericina virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_pol_B
DNA_pol_B_exo1
Intein_splicing
Hom_end
PRTRC_E
LAGLIDADG_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26049232
NCBI-ProteinID:
YP_009173620
RS:
NC_028094
UniProt:
A0A0N9R419
LinkDB
All DBs
Position
NC_028094:complement(340833..345701)
AA seq
1622 aa
AA seq
DB search
MSQWQFKLFEFDIREELETDKNEFIPGRDTKRFIIQMYGIDENGKTACIFVKGFNPFFYV
KVLDEWDNSKVTEFVAFVRKEMGAYFGDSLVSAKIVYRHKFYEFDNKKLYKFVQLKFTSI
GAFNKCKNLWYNETKYGEDRKLKENGLEFLDTKTTLYEAQVPPLLRLFHIRQIKPSGWVA
LKNGHYSQNRKQLTTCDYEFTVNYKNIYPINDERLEKICVPFKILSLDIEASSSHGDFPL
ARKNYLKLATNIVDYLINNNIETCDKDLLSNLIKTGFSYRINKDIEKIYLKKSITEEELD
ELIDNLVDIKPGKKENYIDIKDEDENSDSSDIENDGIVEEFTTKKRQKVTGTKNKDSNIL
EIINDLTCNRNTRILELAKCFGQHNPNRDNKWEGKFPELEGDQVTIIGSTIRRNGEDKPY
LQHAIVVNDCNSIDNVVIESYKTERDALLAWTNFVQRENPDIIIGYNHHGWDEGFMYDRS
IELNCMTQFSKLSRFKNEKCIKEIFQGKNKPKKITIEESSTKLASGQFDLRYFKMSGRLQ
IDFLNLFRREEQLPSYKLDYVAGHFIGDNIKKIEYDENCSILYSKNLTGLSKNDYIVIQE
IGYSTDQYANGKKFKVLDIVDDKIILNDKITPDTNKILRWCLGKDDVGPQDIFRLTNEGP
EGRAIVTKYCIKDCDLVQDLMRKNDTMTSYDEMSNLCWVPKSFLVTRGQGIKLTSYVAQK
CREKNTLMPVIDKGIDGEGYEGAIVLEPKCNLYLKKPVACVDYSSLYPSSIISENISHDS
KVWTKEYDLDDNLINETGEKDENGKFIYDELPEYDYIDITYDTFKWIRKTPKAAATKVKS
GYKTCRYVQFQNNEKAILPSILDELLGARKSTKRQMKNETDPFMQNVLDKRQLSIKITAN
SLYGQAGAKTSTFYDKDIAASTTATGRKLLIYAKELIEACYDNTIEETTNYGEVKCYGEY
IYGDSVASYTPIYVRYNKSIIDICSVEELAEKYGNGWHLESPKEYCELNNIESWTENGWT
ECHRVIRHRLAPYKKMVRILTHTGLVDVTDDHSLVKNTGEEISPKDVSIGTKLLHCTMSE
NESNIESDISIDEARIMGFFFGDGSCGIYDCPSGHKASWALNNSNKELIEKYYNLCKSVY
PEFEWKVYDTLNSSGVYKICFNKKSGSKSKIQFIEKYRSMLYNKKSKIIPSEIINGSIEL
RKSFWEGLYDADGDKDKNGYTRIDQKSQISAAYICWLANSIGYKTSLNIRDDKTDIYRIT
ATKNKQRRDGDKIKKIVNIQNSANIQNSANIQNSVNIQNSVNIQNSKDNQDYVYDLTTEN
HHFAAGIGNMIVHNTDSVFFTFNLKDLDSKEIVGKKALEITIELAKKAGWLATMFLKSPH
DLEYEKTFLPFCLLSKKRYVGILYEEDPNKGKRKEMGLVLKRRDNCAQVKDVYGGAIDIL
MKDQVVHKAVDFVKHSLQDVIDEKISQQKLIITKSLRSYYKNPKQIAHNVLAIRIGERDP
GNKPKPGDRMEFIYIKNSDKKALQGDRIETPLFINENNIEIDYGFYITNQIMKPLQQLFA
LVLEDMEDFVTKRGISMKSWKAEIDKLHEKWTEPDKFSKKYEELRCKEVKSILFDPYIKL
LK
NT seq
4869 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcaatggcagtttaaactatttgagtttgatataagagaagaattagaaactgat
aaaaatgagtttattccaggcagagatacaaaacggtttattattcaaatgtatggtata
gatgaaaatggtaaaaccgcttgtatatttgttaaaggatttaatccattcttttatgta
aaagtattagacgagtgggataatagtaaagtaacagagtttgtagcatttgtgagaaaa
gaaatgggagcatattttggagattcattagtaagtgcaaaaatagtttatcgtcataaa
ttttatgaatttgataataaaaagttatataaatttgtacaattaaaatttactagtatt
ggagcgtttaataaatgtaaaaatttatggtataatgaaactaaatatggtgaagatcgg
aaattaaaagaaaatggtttagaatttttagatacaaaaacaacactatatgaagcacag
gtaccaccattattacgactgtttcatattagacaaattaaaccatctggatgggtagca
ctaaaaaatgggcattatagtcaaaatcgaaaacaattaactacttgtgattatgaattt
acagtaaattataaaaatatttatcctataaatgatgaaagactagaaaagatatgtgta
ccatttaaaatcttaagtttagatattgaagcttctagtagtcacggtgattttccatta
gcaagaaaaaactatcttaaattagcaactaatattgtagactatttaatcaataataat
attgaaacatgtgataaagatctattatcaaatcttattaaaacagggtttagttacaga
attaataaagatattgaaaaaatatatcttaaaaaaagtataacagaagaagaattagat
gaattaattgataatttagtagatataaaaccaggtaaaaaagaaaattatatagatata
aaagatgaagatgaaaatagtgatagtagtgatatagagaatgatggaattgttgaagaa
tttactacaaaaaaacgtcaaaaagtaactggaacaaaaaataaagatagcaatatttta
gaaattataaatgatttaacttgtaatagaaatacaagaattttagaattagcaaaatgt
tttggacaacataatccaaatagagataataaatgggaaggtaaatttcctgaattagaa
ggtgatcaagtaactattattggatcaacaataagacgtaatggcgaagataaaccatat
ttgcaacatgcaattgtagtaaatgattgtaatagtatagataatgtggtaatagaaagt
tataaaaccgaacgggatgcattattagcttggactaattttgtacagcgcgaaaatcca
gatataattataggatataatcatcacggatgggatgaaggatttatgtatgatcgtagt
attgaattaaattgtatgacacaatttagtaaactatcaagattcaaaaatgaaaaatgt
attaaagaaatatttcaaggaaaaaataaacctaagaaaataactattgaagagagtagt
actaaactagcaagtggtcaatttgatctaagatattttaaaatgtcaggtagattacag
atagatttcttgaatttatttagaagagaagaacagttaccaagttataaattagattat
gtagctggacattttataggtgataatataaaaaaaatagaatatgatgaaaattgtagt
attttatatagtaaaaatttaactggattaagtaaaaatgattatattgtaattcaagag
atcggttattcgacagatcaatatgcaaatggtaaaaaatttaaagtattagatatagta
gatgataaaataattttaaatgataaaataacacctgatacaaataaaatattaagatgg
tgtctaggtaaagatgatgttggtcctcaagatatttttagactaacaaatgaaggtcct
gaaggtagagccatagtaacaaaatattgtattaaggattgtgatctagttcaagattta
atgcgtaaaaatgatacaatgacttcatatgatgaaatgtctaatttatgttgggtacct
aaaagcttcttagttactagaggacaaggtattaaactaacatcttatgttgctcaaaag
tgtagagaaaaaaatacacttatgccggttatagataaaggaattgatggtgaaggatat
gaaggtgctattgtattagagccaaaatgtaatttatatcttaagaaaccagttgcatgt
gttgattatagttctttatatccatcatctattattagtgaaaatatttcacacgatagt
aaagtatggactaaagaatatgatttagatgataatttaattaatgaaacaggagaaaaa
gatgaaaatggtaaatttatatatgatgaacttccagaatatgattatattgatattaca
tatgatacatttaaatggataagaaagactccaaaagcagctgcaactaaagtaaaatca
ggttataaaacttgtcgatatgttcaatttcaaaataatgaaaaggctattcttccctca
attttagatgaattattaggagctagaaaatctactaaacgacaaatgaaaaatgaaacc
gatccatttatgcaaaatgtattagacaaaagacaattatctattaaaattacagcaaat
tctctatatggtcaggctggggcaaaaactagtacattttatgataaagatattgcagca
agtacaacagcaactggtagaaaattattaatttatgccaaagaactaatagaagcgtgt
tatgataacacaattgaagaaacaactaattatggtgaagtaaaatgttatggtgaatat
atttatggtgatagtgttgctagttatactccaatatatgtaagatataataaaagtatt
attgatatttgtagtgtagaagaattagcagagaaatatggaaatggttggcatctagaa
tcaccaaaagaatattgtgaattaaataatattgaaagttggacagaaaatggatggaca
gaatgtcatagagtaattagacatcgattagctccatataaaaaaatggtaagaatactt
acgcatacaggtttagttgatgtaacagatgatcattctctagtaaaaaatacaggcgaa
gaaatttctccaaaggatgttagtattggtactaaattactgcattgtactatgagtgaa
aatgagtcaaatatagaaagtgatatatcaattgatgaagccagaattatgggattcttc
tttggagatggtagttgtggaatttatgattgtccatccggacacaaagcaagttgggca
ttaaataattcaaataaagaattaatagaaaaatattataacttgtgtaaatctgtttat
ccagaatttgaatggaaagtgtatgatacacttaatagttctggtgtttataaaatatgt
tttaataaaaaatctggtagtaaaagtaaaatccaatttatagaaaaatatagaagtatg
ttatacaataaaaaaagtaagattataccatctgaaattattaatggaagcatcgaatta
agaaaatcattttgggaaggattatatgatgcagatggtgataaagataaaaatggttac
acaagaatcgatcaaaaaagtcaaattagtgcagcctatatttgttggttagcaaatagt
attggatataaaacatcgctgaatattcgagatgataaaacagatatttatagaataact
gcaactaaaaataaacaacggcgagatggagataaaattaaaaaaattgtaaatattcaa
aatagtgcaaatattcaaaatagtgcaaatattcaaaatagtgtaaatattcaaaatagt
gtaaatattcaaaatagtaaagataaccaagattatgtatatgatttaactacagaaaat
catcattttgcagcaggaatcggaaatatgattgttcataatactgactctgtattcttt
acatttaatttaaaagatcttgatagtaaagaaatagttggtaagaaagctttagagata
actattgaattagcaaaaaaggctggatggctggcaactatgtttttaaaaagtccacac
gatctagaatatgagaaaacatttctaccattctgtttattatcaaaaaaacgttatgtt
ggaatattatatgaagaagaccctaataaaggtaagcgaaaagaaatgggattagtttta
aaacgtagagataactgtgcccaggtaaaagatgtatatggtggtgcaattgatattctt
atgaaagatcaagtagtccataaagcagtcgattttgtaaaacatagtttacaagatgtt
attgatgaaaaaatatcacaacaaaaattaattataacaaaatctttaagatcatattat
aaaaatccaaaacaaatagcacataatgtattggctattcgaattggtgaacgagatcct
ggtaataaacctaaaccaggtgatagaatggaatttatttatattaaaaatagtgataaa
aaagcattacaaggcgataggattgaaaccccattatttataaatgaaaataatattgaa
attgattatggattttatattacaaatcagataatgaaaccactacaacagttatttgca
ctagtattagaagatatggaagattttgtaacaaaacgaggtatttcaatgaaaagttgg
aaagctgaaattgataaattacacgaaaaatggacagaaccagataaatttagtaaaaaa
tatgaagaacttagatgtaaagaggttaaaagtatattatttgatccatatattaaatta
ttaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system