Viruses: 26624579
Help
Entry
26624579 CDS
T40000
Symbol
AVU02_gp189
Name
(RefSeq) Escherichia phage slur07; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
1720500
Escherichia phage slur07
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
ABC_ATPase
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26624579
NCBI-ProteinID:
YP_009197395
RS:
NC_028780
UniProt:
A0A0M7QCG4
LinkDB
All DBs
Position
NC_028780:129211..130857
Genome browser
AA seq
548 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLITTVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDIALLFTWRDIAEKVS
GVKISCLFLDEVYDGAFDAEGIKNVAKILDGLKDTNFFIISHKDHDPQEYGQHIQMEKVG
RFSLAKIS
NT seq
1647 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttatt
actggacgaaatggcggtggtaagtctactatgctagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaagccatttcgtgatgtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaa
cttttagttgaactgtggatggaatatgatgagaaaaagtactatatcaaaagaggacaa
aaaccgaacgttttcgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcag
attgttgtccttggtacagcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcacga
agaaagcttgtggaagacctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaattcacaaaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggt
gacaaccttactcgtctgcaaaatatgtacgatgatttggcaaaagaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaatgaaagattagttaatattgttttggatgaagacccg
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactca
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcgcaa
ttaagttccggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgcacgcat
tcgtttgaacagctttcaacacatcgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccaacagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctcta
atcacgacggtagataaagctaaaaaagttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgag
tttattgaccatgctgatgaaatagcactgcttcaagaagaacttgataaaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgtgaagattttagttatgcttcattcagtcaaggtgaa
aaagcacgaattgatattgctcttttatttacttggcgtgatattgctgaaaaagtttca
ggtgttaaaataagttgtttatttcttgatgaagtgtatgacggtgcatttgatgctgaa
ggtattaaaaatgtagctaaaattttagatggtttgaaggataccaacttcttcataatt
tcgcataaagaccatgacccacaagaatatggtcagcatattcagatggaaaaagttggt
agatttagtttagctaagattagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
