Viruses: 26628034
Help
Entry
26628034 CDS
T40000
Symbol
AVU56_gp2
Name
(RefSeq) BtRf-AlphaCoV/YN2012; spike glycoprotein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
1503293
BtRf-AlphaCoV/YN2012
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
CoV_S2_C
bCoV_S1_N
CoV_S1_C
Cerato-platanin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26628034
NCBI-ProteinID:
YP_009200735
RS:
NC_028824
UniProt:
A0A0U1WJW4
LinkDB
All DBs
Position
NC_028824:20281..23679
Genome browser
AA seq
1132 aa
AA seq
DB search
MKLLTVLTLLACIRLVCGCTDVNFDLFKTILSTNRGSINGTAVISGAYPSTNISEWFCSG
TVGRPSGIAKGIGIFAQTANVDYGSGGGGYTFSVSPSHSTNLTWELWVHRAWGANKPVTI
RLCKWFQALPFNQTSHQQDAGPTNAIECLVNGSFPSHSALNYMFGVTWYEGLVRVIFPPT
VFEMQLDGLQWEIVRFTGPISGGKMTRFNVIKDISSILVSTDAHGAVDNFVYCDSGFVSA
LQCKLRRFSLPPGVYSNTEVEYPSALYTVVSNMTSCPERPSTSCTSSYCPLKRAVFSNCI
VNYTSWVYDSSVKSNFQHLILPNGLFNPFIECNGLNKIVTNSCVPGFVLRVGRGKALNKT
VTVPYLKTSECFGWAWNDPQDSIFDWWIADFVSSGAYVCTSNPVAPRTGVCMTYTVEKTT
FQGVLYESNFTFSQYYNLLYAGSQLKYVRILGIVYEVAACFEASYDVLFASNSSYGLLYR
SFDCNQIHINAERFRSRLLPQHNGTATALGCLFNATYAPNDTFVNCSNPLGDGFCADLKG
TVAVRRMGFEAHDTTYVANVISERYISLAIDQQLVLTEQFLQTTMPKFSVNCETYICDVS
KACKNLLFRYGGFCQKIEADIRGAGVLLDSDISELYSTIVAKSSSLVPQTDRFNVSQFFL
PKNTAPSPPSPYSSRSAIEDILFSKIETTGPGFYGDYYNCKKNAIQDLTCAQYHNGILVI
PPIMDAETMGMYGGIAAGAVSLGIFGGQAAIATWNTAIAGRLNALGVVQNALVDDVNKLA
NGFNQLTSQVGKLALSTSSALQAIQAVVNQNAAQVESLVSGITENFGAISTNFKVISQRL
DKLEADVQMDRLINGRMNVLQLFVTNYKLKIAELRNTHRYVQSLINECVYAQSLRNGFCG
QGLHVLSLMQNAPSGIMFFHYSLIPNNTITVKTTPGLCESDEIGAKCIVAKNGIFVSANL
SYWQWSPRNIYKPENLTFTNVIAVSRGANYTTLNRTFDIPELNQSFPIDEEFREYFQNMS
SELQALKNLTADMSKLNISEEIKLINEIAHNVSMMHVEVEKFQKYVNYVKWAWWQWLLIF
IALTLLAGLMVWCCLATGCCGMCGCLAATCASCCDCKGTKLQSYEIEKIHIQ
NT seq
3399 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattgcttactgtattaacgttgctagcctgtattaggttagtttgtggttgtaca
gatgttaattttgatttgtttaaaactatactttccactaatcgtggtagtataaatggt
actgcagttatttctggtgcatacccttcaactaatattagtgaatggttttgttctggc
actgtaggtagacctagtggtattgctaaaggtattggcatttttgcacagactgctaat
gttgattatggtagtggtggtggtggttacacttttagtgtctcaccctctcactctact
aacttgacatgggaactttgggtccatcgtgcttggggtgctaataagccagttaccatt
aggttatgcaagtggttccaggctctacccttcaaccaaaccagtcatcaacaagatgct
ggccctactaatgctattgagtgtttagttaatggcagttttccatcccatagtgcatta
aactatatgtttggtgtaacatggtatgagggacttgttagggtcatatttccgcctact
gtgtttgagatgcagttggatggattacagtgggagattgtgcgttttactggtcccatt
agtggtggtaagatgacacgttttaatgttataaaagacatttccagtatacttgtttct
actgatgctcatggtgctgttgacaattttgtttattgtgactctggctttgtatctgca
ttgcaatgcaagttgcgtcggttttctttaccacctggtgtttattctaacactgaagtt
gagtatcctagtgctttatacacagttgttagtaatatgacgtcgtgtccagagcgtcct
agtacatcttgtacatctagttactgtcctcttaaacgtgctgtcttttccaattgtatt
gttaattatactagttgggtttatgactctagcgttaaatcaaactttcaacatttaatt
ttgcctaacggtttatttaacccttttattgaatgtaatggtttgaataagatagtaact
aattcgtgtgtgccaggttttgtattacgtgttggtcgtggtaaggccttaaataagacc
gttacagtgccttatcttaaaacatctgaatgttttggatgggcttggaatgacccacag
gattcaatttttgactggtggatagcagactttgtctccagtggcgcatatgtttgcact
tccaaccctgtagcccctagaactggtgtgtgtatgacatatactgttgagaaaaccacg
tttcagggtgttttatatgagagtaattttacattctcacagtattacaacttactttat
gctggttcacagcttaagtatgttagaatacttggaattgtttatgaagttgctgcttgt
tttgaagcctcttatgatgtcctttttgcttctaattctagttatggcttgttataccgt
agcttcgattgtaatcaaatacacatcaatgcagagcgttttaggagtagattattacct
caacataatggtacagctactgcattaggttgtttgtttaatgctacatatgcacctaat
gacacctttgttaactgctcaaatccattaggtgatggtttttgtgcggatttgaaaggt
acagttgccgttcgtagaatgggttttgaggctcatgatacaacatatgtagctaatgtt
attagtgaacgctatatttcattagctattgaccaacaacttgttttaactgagcaattt
ttacagactactatgcccaagtttagtgttaactgtgaaacatacatttgtgatgtcagt
aaggcttgtaaaaatcttctttttagatatggaggtttttgccaaaagattgaggctgac
attaggggtgcaggtgttttactagatagcgatattagtgagttatactccactatagtc
gctaaaagtagctcgcttgtacctcagactgatagattcaatgtctcacagtttttctta
cctaagaacactgcaccatctccacctagtccttactcatctagatctgctattgaagat
attctttttagcaagatagagacaaccggacctggtttttatggtgactactacaactgc
aagaaaaatgccatacaggaccttacatgtgcacagtatcataatggtatacttgttata
ccacctattatggatgctgagactatgggtatgtatggtggtattgcagctggtgccgtg
tcacttggcatttttggtggtcaggcagctattgctacatggaatactgcgattgctggg
cgtttgaatgcgttaggtgttgtgcaaaatgctcttgttgatgacgttaataagttggct
aatggttttaaccaacttacgtcgcaggtgggcaaattagcgctatccacatcatcagcg
ttgcaggccatacaagctgttgttaatcaaaatgctgcacaagttgaatctctcgttagt
ggtataactgagaattttggtgcaattagtaccaattttaaggtcatatcacagcgtctt
gacaaacttgaagcagacgttcagatggacagactcattaatggtcgtatgaatgttctt
caactgtttgttactaattataagcttaaaatcgctgaactacgtaacacacataggtat
gtacaatcacttattaatgagtgtgtgtatgcccagagtttgaggaacgggttttgtggc
cagggtctacatgtcctatcacttatgcaaaatgcacctagtggtattatgtttttccat
tactccttaatacccaacaacactatcacagttaaaaccacaccaggtctttgtgaaagt
gatgagattggtgcaaaatgcattgtagcgaaaaatggaatttttgtttctgctaatttg
agttattggcaatggtcgccacgtaacatttacaagccagaaaatttgacttttactaat
gtaattgcagtttcgcgtggtgctaattacaccaccctcaacagaacttttgacatacct
gaacttaaccagagttttccaattgatgaagaatttcgtgagtattttcagaatatgtca
agtgagttgcaggcattaaagaatttgactgctgatatgagtaagctcaacattagtgag
gagattaagctcattaatgagatcgctcataatgtctctatgatgcatgttgaggttgaa
aaatttcagaaatatgttaactatgtcaagtgggcttggtggcagtggttacttattttc
attgctttaactttacttgcaggcttgatggtttggtgctgtttagctactggttgttgt
ggtatgtgtggttgtttagctgccacatgtgcttcttgttgtgattgtaaaggaactaaa
cttcaatcttacgagattgaaaagatccacattcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
