Viruses: 26638163
Help
Entry
26638163 CDS
T40000
Symbol
AVV36_gp178
Name
(RefSeq) Pectobacterium bacteriophage PM2; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
1429794
Pectobacterium bacteriophage PM2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_C
Gp34_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26638163
NCBI-ProteinID:
YP_009211691
UniProt:
A0A0A0Q3M7
LinkDB
All DBs
Position
NC_028940:153670..157398
Genome browser
AA seq
1242 aa
AA seq
DB search
MADLLKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADFDVLSDGVNVDFFIEENTIQQYDPTRGYKED
FAVIYDNRMWISNSEIIKPSGPFASILWRAVRTDPKWIEVTQPVYSLKSGDYVTINSNQR
SSDLSLPSDPQDGDYIVVKDIGNNAGYNRQRIIATAQSIIRWGSARSEVLLSKPLSYNIM
VFSNRQWQFYETAQEDRGTVITSSSGVFRAQAGDNILRRYTNAEPVRLTLPKYANQGDII
RSVDIDGLGPTYHLIISTFDTTSSIGTVGTHEIEFRTSSDGFLVYDELNKLWVVWDADIK
TRLRIIKDDVVLRPNESIMVFGENNAISQTINITLPTSVAIGDTVKIALNYIRKMQTVII
KASPGDEIATDINLLQFPKRSEYPPDAEWVYVTELSFNGDISYTPVVEFSYIENDGKSCW
VVAQNVPTIEQVDPKDNNTRKRLGVISLASQAEANVDFENSPLRQQAITPETLANRTATE
TRRGIARIANTGQVNQDTTFNFQDDIIITPKKLNERTATETRRGVAEISTQAETNAGIDD
TTIITPKKLEARRATENMAGIAPLVSTVNTTMAPSRGNPGTNSYDYNEATKIVTPKAMFQ
AKATNTSQGGVYLALQSEVIAGVTQSGFPNAVVTPETLHAKTSTDSRIGLIEIATQAETD
AGTDYTRAVTPKTLNDRKSSEVLTGIARIATQVEFDAGSLDTVISTPLKVKTHFNNSSRT
SVVSDSGLVETGTLWDHYTLNIQEASITQRGTLKLSTQAQVDSGTDDTTAITPLKLQRKK
STESTEGIIQLSTQAEVIAGTVSNKAFSPLHYKYIVQQEKSWEATPSRRGYVKLTENALT
WAGDNVNGSVANQETFEKTGYAVSPYEMNKALSHYLPIGAKAVDSDKLDGLDSLQFIRRD
INQTVDGSLTLTKSTQFQAAITSTSTAVFSGSVTGAGLVSTNGSLSINNGTNTWGITAAN
NGTTLVLGNSLTLNSNGNASVTGNISSNASIEAKNSYILNGKTIASTITRTPNTLILGDN
TQNTVIKTLDASNLVVSDVADYKVLTEKNAKDIVGTNFVKKEGDTMGGKLTVNAPVLPKI
SETLAMAPLTSANIGFWGAEIVSASIYNTLPGYAVPVMEMSGGQQTGFVDHYEYVKAPGL
MTCSGTSIDYIYRTWSPRPQIAQDNHNANTQYISIWDAARGVWGSWGRVYTNSAPPTASE
IGAVTNSGSAFDNLTIRDWLQIGNVRIEPDESTQTVKFTWVE
NT seq
3729 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgacttattgaaacctgcatttcgtgcaacttctggcctggatgcagcaggtgaa
aaagttatcaatgtcgctaaggcagattttgatgtattaagtgatggtgttaacgttgat
ttcttcattgaagaaaataccattcagcaatatgaccctacaagagggtataaagaagat
tttgctgtaatttatgataacagaatgtggatttctaactcagaaattattaaaccttca
ggaccgtttgcaagtatattatggcgtgctgttagaacagacccaaaatggatcgaagtt
acccaacctgtttattcacttaaatctggcgattatgttactattaatagtaaccaacgt
tctagcgatttatctttacctagcgatccacaagatggcgattatattgttgttaaagat
atcggaaacaacgctggatataatcgtcaaagaataattgcaacagcccaaagtatcatt
cgttggggctcagctcgttctgaagttttattatctaagccattaagctataatattatg
gttttctctaatcgtcaatggcaattctatgaaactgctcaagaagatagaggaacagtt
ataacttcaagtagtggtgtattcagagctcaagcaggcgataatatcttaagacgttat
actaatgcagaaccagtaagattaactttgccaaaatatgctaatcaaggtgatatcatt
agatctgttgatattgatgggcttggtccaacatatcatttaattatttctacctttgat
actacttcatctattggaactgtaggaactcacgaaattgaatttcgtacttcttctgat
ggatttttagtttacgatgaattaaataagctctgggttgtctgggacgctgatattaaa
actcgtctaagaataattaaagacgacgttgttttgagacctaatgaaagtattatggtc
ttcggtgaaaacaatgctatttcgcaaacaattaatatcactttacctactagcgttgct
atcggtgatactgttaaaattgcactgaactacatcagaaaaatgcagacagttattatt
aaagcatctcctggcgatgaaattgctacagacattaatttacttcagttccctaaaagg
tctgagtatccgccggatgcagaatgggtatacgtaactgaattatctttcaatggtgac
attagttatactcctgttgtggaatttagttatatagaaaacgatggtaaaagttgttgg
gttgtggctcaaaacgttcctacaatagaacaagtagaccctaaagataataatactcgt
aagcgtttaggtgttatttctttggcaagccaggctgaagccaatgttgattttgaaaat
tctcctttgagacaacaagctattacgccagaaacacttgcaaatagaactgcaacagaa
acaagacgtggtatcgctcgtattgcaaatacaggacaagttaatcaagatacgacattt
aatttccaagatgatatcattattactcctaaaaaattaaatgaaagaactgcaacagaa
acaagacgtggtgtagctgaaatctctactcaggctgaaactaatgctggcatagatgat
acaactattattactcctaaaaaattagaagcgagaagagctaccgaaaatatggcaggt
attgcgccattagtttctactgttaatacgaccatggctccatcccgtggcaatccagga
actaatagttatgattacaatgaagctacaaaaattgtaactccgaaagctatgttccaa
gctaaagctacaaatacttctcaaggtggcgtttatttagcattgcagtctgaagttatt
gcgggtgtaacccaatcaggttttcctaatgcggttgttacgcctgaaacattacatgca
aaaacttccactgattctagaattggattgattgaaattgccacacaggcagaaactgat
gctggaacggattatacaagagcggttacacctaaaactcttaatgaccgtaaatctagt
gaagtgctaacaggtattgctcgtattgcaacacaagtagaatttgatgctggctcatta
gatactgttatttcaactccgttgaaagttaaaacacattttaataattcatctagaact
tctgttgtcagcgatagtggtttagtagaaacagggaccttatgggaccattatacactt
aatatccaggaagcaagtattacccaacgcgggacacttaagttgagtacccaggcccag
gttgattcaggcaccgatgacacgactgcaattactccattaaaattgcagagaaagaaa
tccactgaaagcactgaaggtattattcagttatctactcaggccgaagttattgctgga
actgtttctaataaagcttttagtccgcttcattacaaatatatagtccaacaagaaaaa
tcttgggaagcgactccttctagaagaggatatgtaaaattaactgaaaacgctttaaca
tgggctggtgataacgttaatggctctgttgctaatcaagaaacatttgagaagacaggc
tatgcggtttctccttatgaaatgaataaagcattaagtcattatttacctattggtgca
aaagcagttgattctgataaattagacggactagattcgcttcagtttattagacgtgat
attaatcagactgttgatggctcattaaccttgaccaaatctacacaattccaggcagca
ataacgtctacatctactgcagtattttctggtagtgtgactggtgctggtttagtgtca
actaatggctctttaagcattaacaatggaactaatacttggggtattacagcagccaat
aatggaacgactttagttttaggaaattcacttacattaaattcaaatggaaatgcttct
gtaacaggaaatatttcttctaatgcaagtatcgaagctaaaaatagttatatcttaaac
ggtaaaactatagcatcaactattaccagaactcctaatactttaatcttaggtgataat
acacaaaataccgttattaaaactcttgatgcaagtaatttagtcgttagcgatgtggca
gattataaagtattgactgaaaagaatgccaaagatattgttggtactaattttgtcaaa
aaagaaggcgacacaatgggtggtaaactcactgttaacgcgccggtattacctaaaata
tctgaaacattggcaatggcaccattaacttctgctaatataggattctggggtgctgaa
atagtttctgcgtctatttacaatacattacctggttatgctgttcctgttatggaaatg
tctggtggtcaacagactggttttgtggaccattatgaatatgttaaagctccaggatta
atgacttgttcaggaacttctattgattatatttaccgcacttggtccccaagaccacaa
attgcacaagataatcataatgctaacacccaatatatttctatttgggatgctgctaga
ggtgtttggggttcatggggaagagtttataccaatagtgctccacctacagcaagtgaa
attggcgctgtaactaattctggttctgcttttgataaccttactattagagattggttg
caaataggtaatgttagaattgaaccagacgaatccactcaaacagttaaatttacttgg
gtagaataa
DBGET
integrated database retrieval system