Viruses: 26640158
Help
Entry
26640158 CDS
T40000
Symbol
AVU42_gp102
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage P-TIM68; tail sheath
Virus
1542477
Prochlorococcus phage P-TIM68
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Phage_sheath_1C
Phage_sheath_1
Gp18_domIII_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26640158
NCBI-ProteinID:
YP_009213614
RS:
NC_028955
UniProt:
A0A0K0KVG8
LinkDB
All DBs
Position
NC_028955:98723..100945
Genome browser
AA seq
740 aa
AA seq
DB search
MATPQLSPGVLIREVDLTVGRAENVLDNIGGIAGPFKQGPVDEVTQINTSQSLIDTFGKP
QTANAQYEYWMTASSFLSYGGVLKIVRTDDSNLNNANAGVGIASTNAAKIKNFDDYEANF
ATATNFTYAAKNPGSWANNMKVCFIDNAADQTLGITTDDPSNAGMVIGFGVTTALTDVTI
PGAGSTSSFTGYLKGIITGVSTNATTKSSSIDVKIVSRVSSAGTETKIDYAEGDPLKSFE
ANDTLFFVNNSGINTGGGGATGRSEPVATQVDWYDQQTLGLSNATVFWKSVAPKPTTSNF
VQQRSGKNDALHIAVIDDTGSITGIQGNILEKFTNLSKAKDAIADGETGKKIFYKDFLAK
NSTQIYAGSNPSAAGDAFHGTNPIINGFTGSGNSPNYTKIAIGDGLWGSDAQGVNFNSIG
NVSYTFTGGQDYSSGTGNYTATLGSLLTSYNLFENKDDVAVDFLMMGPGLDTQDQSQAKA
NLLISIANARKDCIATVSPHRTNVVNVTNTTTQTNNVLKFFSPLSSSSYCVFDSGYKYMF
DRFNNEFRFIPCNGDIAGLMVRTGILAFPWFSPAGQQRGILNNAIKLAYSPSKDQRDLLY
SSRINPIINQRGAGILLFGDKTGLSYASAFDRINVRRLFLTVEQSLEGAANAQLFELNDA
NTRSNFVNIVEPFLRDVQAKRGLFDFLVVCDETNNTPDVIDNNEFRADIYLKPTKSINFV
TLTFVATRTGVSFEEVVGTV
NT seq
2223 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctactcctcaattatctcctggtgtattaatcagggaagttgatcttacagtagga
agagctgagaatgtattagacaacattggtggtattgcaggtcctttcaaacaaggtcct
gtggatgaagtcacacagattaatacttcacagtcattgattgatacatttggtaaacca
caaactgcaaatgctcaatatgagtattggatgactgcttcatcatttctttcatatggg
ggagtgcttaagatagttagaacagatgattctaatctaaacaatgcaaatgcaggtgtt
ggtattgcttcaacaaacgcagcaaagattaaaaactttgatgattatgaagcaaacttt
gccactgcaactaactttacatatgcagcaaagaaccctggttcttgggcaaacaatatg
aaagtgtgtttcattgataatgctgctgatcagacactaggaataacaactgatgatcca
tcaaatgctggtatggtaattggatttggtgtgacaacagcattaactgatgtaacaata
ccaggtgctggttcaacatcatcatttactggatatctgaaaggaataatcactggtgta
tccacaaacgcaacaactaaatcatcatcaattgatgttaagattgtttctagagtatca
tctgctggtacagagacaaagattgattatgctgaaggtgatccacttaagtcatttgaa
gcaaatgatacattgttctttgtaaacaactctggtattaatactggtggtggtggagca
actggaagatctgaaccagtagcaacacaagttgactggtatgatcaacagactcttgga
ttaagcaatgcgacagttttctggaaatctgtagcacccaaaccaacaactagtaacttt
gttcagcaaagaagtggtaagaatgatgcattgcatattgcagttatagatgatacagga
agcatcacaggtatacaaggtaatattcttgaaaaattcactaatctatctaaggcaaaa
gatgctatagcagatggtgaaacaggtaagaagatcttctataaagatttccttgctaaa
aactcaactcagatctatgctggatctaatccatctgctgctggtgatgcattccatggt
actaatccaataataaatggatttacaggatctggaaatagtccaaactatactaagatt
gcaattggtgatggtttatggggatcagatgcacaaggagtaaacttcaatagtatagga
aatgtgtcatacacattcactggtggacaggattatagttctggcactggaaactataca
gcaactctgggtagtttattaacatcatataacttatttgagaataaggatgatgttgca
gttgacttcttgatgatgggtcctggtttagatactcaagatcaatcacaagcaaaagca
aatctgttgatttctattgctaatgctagaaaggattgcatagcaactgtttctccacat
agaacaaatgttgttaatgtgactaatacaacaacacaaaccaataatgtgttgaagttc
ttcagtcctttatcatcttcatcttactgtgtatttgacagtggatacaaatatatgttt
gatagattcaacaatgagttcagattcatcccgtgtaatggtgatattgctggattaatg
gtaagaactggaatcttagcattcccttggttctcacctgcaggacaacaaagaggaatc
ctgaacaatgctattaaattagcatacagtccaagtaaagatcagagagatctactttac
tcttctagaattaatccaataattaatcagagaggagcaggtatacttctctttggtgat
aaaactggattatcttatgcatctgcatttgatagaatcaatgttaggagattattctta
actgttgaacaatcacttgagggtgctgcaaatgctcaactctttgaactcaatgatgcc
aacacaaggtctaactttgtgaacattgttgaaccattcttaagagatgttcaagctaag
aggggtttatttgacttcttagttgtttgtgatgaaaccaataacactcctgatgttatt
gacaacaatgagtttagagctgatatctacttgaaaccaaccaagtctatcaactttgtg
actctaaccttcgttgctactcgtactggagttagctttgaagaagttgtaggaactgtt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
