Viruses: 26645759
Help
Entry
26645759 CDS
T40000
Symbol
AVT71_gp22
Name
(RefSeq) Bacillus phage 250; minor head protein
Virus
2880539
Bacillus phage 250
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
Prophage_tail
Peptidase_S74
Fungal_TACC
DUF4763
HALZ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26645759
NCBI-ProteinID:
YP_009219596
RS:
NC_029024
UniProt:
D2XPZ6
LinkDB
All DBs
Position
NC_029024:20727..24296
Genome browser
AA seq
1189 aa
AA seq
DB search
MKKVSGDLHIVDFKTKQIIATIQPADYFDDLRHWEIKDNVDILDFKLLEDSPFLDYIQQK
NLILKETNPGVITPYVITSIEKDSEAHNFTIYASGEWILLDKEVPLTPREIKSWSAKQYL
TFATSHTDWEVGFIEAVGNRSFKIEKPMSPLQFIQQIATLFDNIEIQYRIEIGTGKPRRF
IDLVKKRGRETNKEVTLGKDLVGIKRIENSENIITALVPYYIGQDADGNDKLITIESVNN
GVQYIVDEAAFQRWNVNGKHQFGFYTPESEKDELTPARLLTLAKTELKKRVSTIVTYEVN
SVDISSVFGYEHEDVREGDTIRIIDEGMTPTLYLEARAIAGDNSYKDKHQNKHTFGNYVE
IVNQDEALRRLYQKMLSMINDKVSKEWFAALEEKANDTAKKANEAVEESKTAKDLATATK
DYMDQNMVDIIESVSPPIAGLKPNKTLWRDISGGKPGILKIWTGEAWDVVVPDVEEVKRD
LELTNESMKSKISEKQMQDYLGGLGSTNILFNSAFEDREINPSSGVIISRTPSLSKWSVT
ATAGTAVTPTTSKRHDGYNSVQIQATGLTGNVFTGISQMTPVASNSGKVVLSAWVFTNSK
DSLDQDGYLEIKFRNGLTVVATANVTLKDKLTNGVWTFISVTADVPSSAVTHAEACIGIN
KNGLIWASQPQFQQGENPSSFMENPKDYANYDQLVGEIAKKVATSEFDSKVSTIETSINQ
QSDRINLKAEKNDVYNKTDSDGRFGSKAIVDNHTSQLSLMSDEINLRVKNNEIASTINQT
AQSVLIQASKIYLDGYIEAKHLKAQTLQGVTIQTAPAGSGANHIRLNAQNLTVYGGGRSR
GYLGFIERTDGNIQSALILGNDYETTGTLNGSLVIDQTTINSNVFTNSVASIGIATGRNG
NDVIKSSYINFYRYDGAMQINSIGDMSLTNTNGNISLTASSTGGTTGFITLSSSKDINLT
AKRGYFNFYTSDNKSFPAMTIKDLAPTAQGDVDFTFANQIMFRMARHPDYVGEGLQIKSA
TGDAFRDIKLRTLRATENISATGRMWAQEFIPNSSRTLKMDIEDLPFSALDKINSVNIKQ
YHFIRDVERFESGESITLPINYGMIAEDTDDVFTTPQKDAIKLYSSVAISIQAIQEVDFK
VENLQFDHGMLKQEVDTLKEQLEAEKLEKISMKAEIDELKVLVQQLLNK
NT seq
3570 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaggtaagcggagatttacacattgtggattttaaaacaaagcaaattatcgct
actattcagccggcggattatttcgatgatctaagacactgggagatcaaagataacgtc
gacatactggacttcaaattattagaagattctccgtttctagattatatccaacaaaag
aatttgatattaaaagaaacgaatccaggtgttattactccctatgtaatcacttctatc
gaaaaagactctgaagctcacaattttactatctatgcatcaggtgagtggattttactt
gataaagaggttcctttgacaccgcgagagattaaaagttggagtgccaaacagtattta
acgtttgctactagtcatactgattgggaagttgggtttatcgaagctgtagggaatcgc
tcgtttaaaatagaaaaacccatgagccctttgcaattcattcagcaaatcgcaactctc
ttcgacaacattgaaatccaatacaggatagaaatcggaacaggaaaaccaagaagattc
atcgaccttgttaagaagcgtggtagagaaacaaataaagaggttacacttggtaaagat
ttagtaggaatcaagcgtatagagaactctgagaacattattacggcattagtcccgtat
tatataggacaagatgcagatggaaacgacaagttaatcactatcgaatcagttaataac
ggagttcaatatattgttgatgaagcagcgtttcaacgttggaatgtgaacgggaagcac
caatttggattttacacaccggaatctgaaaaagatgaacttactccggcccgattgtta
acattagccaaaacggagctgaaaaagcgcgtttctacaatcgtaacttacgaagtgaat
tccgttgacatatctagcgtatttgggtatgagcatgaggatgttagagaaggagacaca
atccgtattatcgacgaaggtatgacgccgactctttacctagaagcgagagctattgca
ggagacaattcctataaggataagcatcaaaacaagcacacatttggaaactatgtagaa
atagtcaaccaagatgaagcgttgcgaagactgtatcaaaagatgctttccatgattaat
gacaaagtatcgaaagaatggtttgctgcattagaagaaaaagcaaatgatacagctaaa
aaggcgaatgaagctgttgaagaatcgaaaacagctaaagatttagctactgctacaaaa
gattatatggatcaaaacatggtcgatattatagaaagtgtttctcctcctatcgcgggt
cttaaaccaaataaaacgctatggcgtgatattagtggtggtaagcctggtattttgaaa
atatggacaggtgaagcgtgggatgttgtcgttccggatgtcgaggaagttaaaagggat
cttgaactcactaacgaatccatgaagtcgaaaatctctgaaaaacaaatgcaagattat
ttaggtggtttaggcagtacaaatattctattcaattctgcatttgaagatagagaaatt
aacccaagttctggtgtgattatctctagaaccccaagccttagtaagtggagcgtgaca
gctactgcaggaacagcggttacacctacaacatccaaaagacatgatgggtataattct
gttcagattcaagctacagggttaacagggaacgtttttacaggaataagccagatgact
cctgttgcatctaactcagggaaagtagtgttatctgcatgggtatttacaaatagtaaa
gatagcttagatcaagatggatatttggaaattaagtttcgaaatggattaactgtagtt
gctactgcgaatgtaactttaaaagataagttaactaatggcgtatggacatttatttct
gttactgctgatgtaccttcaagtgctgttactcatgctgaagcttgtataggaataaat
aaaaacggccttatttgggcttctcaaccacaatttcaacaaggtgagaacccttcaagt
ttcatggaaaaccctaaagattatgctaactacgaccaacttgttggagagattgcaaaa
aaagtggctacttctgaattcgactctaaggtatctactattgaaaccagtataaatcaa
caatctgaccgcattaatctcaaagcagagaaaaatgatgtttacaataaaacagattct
gacggacgttttggaagtaaagctatagtagataatcacacttcacaattatctttaatg
agtgatgagattaacttgcgagttaaaaataacgaaattgcatctacgattaaccaaact
gctcaatccgtattaattcaagcgagtaaaatttatcttgatggttacattgaagcaaaa
caccttaaagcacagacattgcaaggtgttacaatccaaactgctcctgcgggttcaggc
gccaatcatattcgtttaaatgcacagaatttaactgtatacggtggtggacgtagtaga
ggttatttgggattcattgagcgtacagatgggaacattcagtccgctttaattcttggt
aatgattatgagacgacagggacgttaaatggatcattagtaattgaccaaactacaata
aattcaaacgtattcactaactcagtagcttcaattgggattgctacaggtcgtaatgga
aatgacgtcattaaatcttcctatatcaatttctacagatatgatggagcaatgcaaatt
aactctataggcgatatgagtttaactaatacaaacggtaacatctctcttactgctagt
tccacaggtggtactacaggttttatcaccttgagttcttctaaagatatcaatttgacc
gctaagcgtggctactttaatttttatacaagtgataacaagtcattccctgcaatgaca
attaaagacttagctccaactgctcaaggagatgtagattttacttttgcaaatcagatc
atgtttagaatggcaaggcatcctgactatgtaggtgaaggattacagattaaaagtgcg
acaggtgacgccttccgagacattaagctaagaacactacgagctactgaaaatatatct
gctacagggcgtatgtgggcgcaagaatttatccccaattcttctcgtacgcttaaaatg
gacatagaagaccttccattctctgctttagataaaatcaactctgtaaacatcaaacag
tatcactttataagagatgttgaacgcttcgagtcaggggagtctattacacttccaatt
aattacggtatgattgcggaggacactgacgatgtattcaccacaccacagaaagacgct
ataaaactttatagctctgttgcaatttctattcaagcaatacaagaagttgactttaaa
gttgaaaatcttcaatttgaccacggtatgttgaagcaggaagttgacactcttaaagaa
caacttgaagcagaaaaacttgagaagatttcaatgaaagctgaaattgatgaattaaag
gtattagtgcaacaattactaaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
